MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis RC-F(s)/342

Total Repeats: 20809

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_021890	CA	3	6	223989	223994	50 %	0 %	0 %	50 %	527320802
4002	NC_021890	GA	3	6	224016	224021	50 %	0 %	50 %	0 %	527320802
4003	NC_021890	TCT	2	6	224034	224039	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527320802
4004	NC_021890	TAGC	2	8	224082	224089	25 %	25 %	25 %	25 %	527320802
4005	NC_021890	C	6	6	224089	224094	0 %	0 %	0 %	100 %	527320802
4006	NC_021890	AAATA	2	10	224098	224107	80 %	20 %	0 %	0 %	527320802
4007	NC_021890	GAA	2	6	224112	224117	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527320802
4008	NC_021890	ACA	2	6	224198	224203	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527320802
4009	NC_021890	TAA	2	6	224223	224228	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527320802
4010	NC_021890	AAG	3	9	224250	224258	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527320802
4011	NC_021890	AGG	2	6	224356	224361	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527320802
4012	NC_021890	CAA	2	6	224615	224620	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527320803
4013	NC_021890	CT	3	6	224637	224642	0 %	50 %	0 %	50 %	527320803
4014	NC_021890	GCT	2	6	224680	224685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527320803
4015	NC_021890	T	7	7	224691	224697	0 %	100 %	0 %	0 %	527320803
4016	NC_021890	CTT	2	6	224722	224727	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527320803
4017	NC_021890	ATT	2	6	224745	224750	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527320803
4018	NC_021890	GCA	2	6	224797	224802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527320803
4019	NC_021890	CTTT	2	8	224808	224815	0 %	75 %	0 %	25 %	527320803
4020	NC_021890	TCG	2	6	224837	224842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527320803
4021	NC_021890	CT	3	6	224873	224878	0 %	50 %	0 %	50 %	527320803
4022	NC_021890	CTT	2	6	225110	225115	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527320804
4023	NC_021890	GGA	2	6	225118	225123	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527320804
4024	NC_021890	CTG	2	6	225172	225177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527320804
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4027	NC_021890	TATC	2	8	225263	225270	25 %	50 %	0 %	25 %	527320804
4028	NC_021890	GAT	2	6	225475	225480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527320804
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4031	NC_021890	CAA	2	6	225666	225671	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527320804
4032	NC_021890	GAAAC	2	10	225714	225723	60 %	0 %	20 %	20 %	527320804
4033	NC_021890	GCA	2	6	225727	225732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527320804
4034	NC_021890	TTG	2	6	225812	225817	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527320804
4035	NC_021890	ACA	2	6	225833	225838	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527320804
4036	NC_021890	CT	3	6	225870	225875	0 %	50 %	0 %	50 %	527320804
4037	NC_021890	CTT	2	6	225890	225895	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527320804
4038	NC_021890	GA	4	8	225938	225945	50 %	0 %	50 %	0 %	527320804
4039	NC_021890	CA	3	6	225960	225965	50 %	0 %	0 %	50 %	527320804
4040	NC_021890	AGG	2	6	225974	225979	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527320804
4041	NC_021890	TGCT	2	8	226011	226018	0 %	50 %	25 %	25 %	527320804
4042	NC_021890	TCC	2	6	226050	226055	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527320805
4043	NC_021890	CA	3	6	226086	226091	50 %	0 %	0 %	50 %	527320805
4044	NC_021890	GAT	2	6	226110	226115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527320805
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4049	NC_021890	A	6	6	226281	226286	100 %	0 %	0 %	0 %	527320805
4050	NC_021890	T	6	6	226288	226293	0 %	100 %	0 %	0 %	527320805
4051	NC_021890	TTA	2	6	226309	226314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527320805
4052	NC_021890	GTTC	2	8	226329	226336	0 %	50 %	25 %	25 %	527320805
4053	NC_021890	ATG	2	6	226342	226347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527320805
4054	NC_021890	TATT	2	8	226370	226377	25 %	75 %	0 %	0 %	527320805
4055	NC_021890	T	6	6	226419	226424	0 %	100 %	0 %	0 %	527320805
4056	NC_021890	GAT	2	6	226431	226436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527320805
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4059	NC_021890	GCA	2	6	226520	226525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527320805
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4064	NC_021890	TAC	2	6	226626	226631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527320805
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4066	NC_021890	CAT	2	6	226673	226678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527320805
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4069	NC_021890	CAAA	2	8	226780	226787	75 %	0 %	0 %	25 %	527320805
4070	NC_021890	CGA	2	6	226788	226793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527320805
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4083	NC_021890	TTTC	2	8	227277	227284	0 %	75 %	0 %	25 %	527320805
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4095	NC_021890	GTA	2	6	227753	227758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527320806
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4103	NC_021890	TTTTC	2	10	228096	228105	0 %	80 %	0 %	20 %	527320806
4104	NC_021890	TC	3	6	228210	228215	0 %	50 %	0 %	50 %	527320806
4105	NC_021890	CATT	2	8	228258	228265	25 %	50 %	0 %	25 %	527320806
4106	NC_021890	A	7	7	228301	228307	100 %	0 %	0 %	0 %	527320806
4107	NC_021890	TTA	2	6	228317	228322	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527320806
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4110	NC_021890	TTG	2	6	228571	228576	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527320806
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4112	NC_021890	ACAA	2	8	228717	228724	75 %	0 %	0 %	25 %	527320807
4113	NC_021890	TTC	2	6	228778	228783	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527320807
4114	NC_021890	CT	3	6	228912	228917	0 %	50 %	0 %	50 %	527320807
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4121	NC_021890	TAT	2	6	229148	229153	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527320807
4122	NC_021890	TGT	2	6	229192	229197	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527320807
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4124	NC_021890	TCA	2	6	229321	229326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527320807
4125	NC_021890	CCT	2	6	229350	229355	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527320807
4126	NC_021890	CATT	2	8	229388	229395	25 %	50 %	0 %	25 %	527320807
4127	NC_021890	CTT	2	6	229418	229423	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527320807
4128	NC_021890	T	6	6	229434	229439	0 %	100 %	0 %	0 %	527320807
4129	NC_021890	TTA	2	6	229525	229530	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527320808
4130	NC_021890	GTC	2	6	229546	229551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527320808
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4133	NC_021890	GAA	2	6	229776	229781	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527320808
4134	NC_021890	CAT	2	6	229864	229869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527320808
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4136	NC_021890	ATTGCT	2	12	230002	230013	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	527320808
4137	NC_021890	ATT	2	6	230035	230040	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527320808
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4139	NC_021890	CTA	2	6	230131	230136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527320808
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4142	NC_021890	TCCTAG	2	12	230292	230303	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	527320808
4143	NC_021890	CAA	2	6	230330	230335	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527320808
4144	NC_021890	AAC	2	6	230407	230412	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527320809
4145	NC_021890	GAG	2	6	230446	230451	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527320809
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4147	NC_021890	GATT	2	8	230543	230550	25 %	50 %	25 %	0 %	527320809
4148	NC_021890	TCC	2	6	230558	230563	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527320809
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4152	NC_021890	G	6	6	230672	230677	0 %	0 %	100 %	0 %	527320809
4153	NC_021890	AAG	2	6	230698	230703	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527320809
4154	NC_021890	TAA	2	6	230762	230767	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527320809
4155	NC_021890	GCAACG	2	12	230780	230791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527320809
4156	NC_021890	GT	3	6	230814	230819	0 %	50 %	50 %	0 %	527320809
4157	NC_021890	AATT	2	8	230827	230834	50 %	50 %	0 %	0 %	527320809
4158	NC_021890	ATTT	2	8	230890	230897	25 %	75 %	0 %	0 %	527320809
4159	NC_021890	T	6	6	230927	230932	0 %	100 %	0 %	0 %	527320809
4160	NC_021890	TCA	2	6	230935	230940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527320809
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4201	NC_021890	TTAT	2	8	233294	233301	25 %	75 %	0 %	0 %	527320811
4202	NC_021890	CTAT	2	8	233313	233320	25 %	50 %	0 %	25 %	527320811
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4217	NC_021890	TGG	2	6	233881	233886	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	527320812
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4220	NC_021890	GC	3	6	234092	234097	0 %	0 %	50 %	50 %	527320812
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4230	NC_021890	T	6	6	234835	234840	0 %	100 %	0 %	0 %	527320812
4231	NC_021890	GC	3	6	234994	234999	0 %	0 %	50 %	50 %	527320812
4232	NC_021890	GAC	2	6	235021	235026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527320812
4233	NC_021890	A	8	8	235063	235070	100 %	0 %	0 %	0 %	527320812
4234	NC_021890	TAA	2	6	235099	235104	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527320812
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4238	NC_021890	AATG	2	8	235232	235239	50 %	25 %	25 %	0 %	527320812
4239	NC_021890	ATT	2	6	235281	235286	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527320812
4240	NC_021890	ATG	2	6	235327	235332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527320813
4241	NC_021890	CAA	2	6	235333	235338	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527320813
4242	NC_021890	A	6	6	235359	235364	100 %	0 %	0 %	0 %	527320813
4243	NC_021890	A	6	6	235433	235438	100 %	0 %	0 %	0 %	527320813
4244	NC_021890	AAG	2	6	235529	235534	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527320813
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4246	NC_021890	AGG	2	6	235698	235703	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527320813
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4251	NC_021890	A	6	6	235870	235875	100 %	0 %	0 %	0 %	527320813
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4277	NC_021890	CAT	2	6	236859	236864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527320814
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4494	NC_021890	AGG	2	6	248601	248606	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527320823
4495	NC_021890	TCT	2	6	248656	248661	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527320823
4496	NC_021890	CTA	2	6	248677	248682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527320823
4497	NC_021890	CTA	2	6	248692	248697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527320823
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