MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis RC-F(s)/342

Total Repeats: 20809

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_021890	TCAA	2	8	163810	163817	50 %	25 %	0 %	25 %	527320759
3002	NC_021890	CGA	2	6	163819	163824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527320759
3003	NC_021890	ATG	2	6	163840	163845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527320759
3004	NC_021890	TGT	2	6	163972	163977	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527320759
3005	NC_021890	T	7	7	164016	164022	0 %	100 %	0 %	0 %	527320759
3006	NC_021890	ATT	2	6	164036	164041	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527320759
3007	NC_021890	GAG	2	6	164239	164244	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527320759
3008	NC_021890	TTTC	2	8	164250	164257	0 %	75 %	0 %	25 %	527320759
3009	NC_021890	GGA	2	6	164337	164342	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527320759
3010	NC_021890	TCT	2	6	164358	164363	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527320759
3011	NC_021890	GCT	2	6	164370	164375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527320759
3012	NC_021890	A	8	8	164419	164426	100 %	0 %	0 %	0 %	527320759
3013	NC_021890	GGT	2	6	164513	164518	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	527320759
3014	NC_021890	GA	3	6	164530	164535	50 %	0 %	50 %	0 %	527320759
3015	NC_021890	GC	3	6	164546	164551	0 %	0 %	50 %	50 %	527320759
3016	NC_021890	GTC	2	6	164577	164582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527320759
3017	NC_021890	GGA	2	6	164690	164695	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527320759
3018	NC_021890	T	7	7	164755	164761	0 %	100 %	0 %	0 %	527320759
3019	NC_021890	A	8	8	164812	164819	100 %	0 %	0 %	0 %	527320759
3020	NC_021890	AGG	2	6	164855	164860	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527320759
3021	NC_021890	TTG	2	6	164878	164883	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527320759
3022	NC_021890	AG	3	6	164909	164914	50 %	0 %	50 %	0 %	527320759
3023	NC_021890	TGT	2	6	164960	164965	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527320759
3024	NC_021890	G	6	6	165009	165014	0 %	0 %	100 %	0 %	527320759
3025	NC_021890	GA	3	6	165073	165078	50 %	0 %	50 %	0 %	527320759
3026	NC_021890	ATT	2	6	165092	165097	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527320759
3027	NC_021890	AT	3	6	165127	165132	50 %	50 %	0 %	0 %	527320759
3028	NC_021890	AGA	3	9	165143	165151	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527320759
3029	NC_021890	CTT	2	6	165331	165336	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527320759
3030	NC_021890	ATCG	2	8	165383	165390	25 %	25 %	25 %	25 %	527320759
3031	NC_021890	TTC	2	6	165396	165401	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527320759
3032	NC_021890	AG	3	6	165417	165422	50 %	0 %	50 %	0 %	527320759
3033	NC_021890	TCG	2	6	165428	165433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527320759
3034	NC_021890	TTCT	2	8	165457	165464	0 %	75 %	0 %	25 %	527320759
3035	NC_021890	G	6	6	165570	165575	0 %	0 %	100 %	0 %	527320759
3036	NC_021890	A	6	6	165645	165650	100 %	0 %	0 %	0 %	527320759
3037	NC_021890	ATT	2	6	165689	165694	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527320759
3038	NC_021890	CTTT	2	8	165862	165869	0 %	75 %	0 %	25 %	527320760
3039	NC_021890	TGT	2	6	165993	165998	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527320760
3040	NC_021890	A	6	6	166036	166041	100 %	0 %	0 %	0 %	527320760
3041	NC_021890	AT	3	6	166048	166053	50 %	50 %	0 %	0 %	527320760
3042	NC_021890	ATT	2	6	166078	166083	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527320760
3043	NC_021890	CAG	2	6	166213	166218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527320760
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3045	NC_021890	ATC	2	6	166250	166255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527320760
3046	NC_021890	CAA	2	6	166269	166274	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527320760
3047	NC_021890	AG	3	6	166363	166368	50 %	0 %	50 %	0 %	527320760
3048	NC_021890	ATC	2	6	166373	166378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527320760
3049	NC_021890	TCA	2	6	166419	166424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527320760
3050	NC_021890	TAG	2	6	166458	166463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527320760
3051	NC_021890	CAG	2	6	166492	166497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527320760
3052	NC_021890	TGT	2	6	166518	166523	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527320760
3053	NC_021890	AGC	2	6	166578	166583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527320760
3054	NC_021890	TTG	2	6	166621	166626	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527320760
3055	NC_021890	AGT	2	6	166723	166728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527320760
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3057	NC_021890	AGA	2	6	166898	166903	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527320760
3058	NC_021890	CAAAA	2	10	166918	166927	80 %	0 %	0 %	20 %	527320760
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3060	NC_021890	GCT	2	6	167011	167016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527320760
3061	NC_021890	CA	3	6	167040	167045	50 %	0 %	0 %	50 %	527320760
3062	NC_021890	CTT	2	6	167074	167079	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527320760
3063	NC_021890	AAG	2	6	167123	167128	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527320760
3064	NC_021890	TTG	2	6	167150	167155	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527320760
3065	NC_021890	AAG	2	6	167204	167209	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527320760
3066	NC_021890	AG	3	6	167214	167219	50 %	0 %	50 %	0 %	527320760
3067	NC_021890	ACT	2	6	167239	167244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527320760
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3070	NC_021890	CTG	2	6	167456	167461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527320760
3071	NC_021890	GTTT	2	8	167487	167494	0 %	75 %	25 %	0 %	527320760
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3074	NC_021890	A	6	6	167720	167725	100 %	0 %	0 %	0 %	527320760
3075	NC_021890	AAGAG	2	10	167751	167760	60 %	0 %	40 %	0 %	527320760
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3081	NC_021890	AAG	2	6	167912	167917	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527320760
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3083	NC_021890	AGC	2	6	167978	167983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527320760
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3087	NC_021890	GCT	2	6	168193	168198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527320760
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3090	NC_021890	GGT	2	6	168249	168254	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	527320760
3091	NC_021890	TCA	2	6	168264	168269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527320760
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3095	NC_021890	TC	3	6	168393	168398	0 %	50 %	0 %	50 %	527320760
3096	NC_021890	TCT	2	6	168428	168433	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527320760
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3098	NC_021890	AGTT	2	8	168563	168570	25 %	50 %	25 %	0 %	527320760
3099	NC_021890	GAA	2	6	168578	168583	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527320760
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3103	NC_021890	GCGG	2	8	168759	168766	0 %	0 %	75 %	25 %	527320760
3104	NC_021890	TAA	2	6	168780	168785	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527320760
3105	NC_021890	AAG	2	6	168793	168798	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527320760
3106	NC_021890	AGA	2	6	168906	168911	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527320760
3107	NC_021890	GCTT	2	8	168934	168941	0 %	50 %	25 %	25 %	527320760
3108	NC_021890	TCA	2	6	169044	169049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527320760
3109	NC_021890	AGT	2	6	169068	169073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527320760
3110	NC_021890	AGA	2	6	169134	169139	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527320760
3111	NC_021890	GA	3	6	169155	169160	50 %	0 %	50 %	0 %	527320760
3112	NC_021890	TGT	2	6	169163	169168	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527320760
3113	NC_021890	GAT	2	6	169174	169179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527320760
3114	NC_021890	ATA	2	6	169220	169225	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527320760
3115	NC_021890	CAG	2	6	169246	169251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527320760
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3119	NC_021890	CTT	2	6	169402	169407	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527320760
3120	NC_021890	GATC	2	8	169447	169454	25 %	25 %	25 %	25 %	527320760
3121	NC_021890	GTTT	2	8	169467	169474	0 %	75 %	25 %	0 %	527320760
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3123	NC_021890	AAG	2	6	169542	169547	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527320760
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3126	NC_021890	AGA	2	6	169773	169778	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527320760
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3243	NC_021890	CCAC	2	8	176031	176038	25 %	0 %	0 %	75 %	527320766
3244	NC_021890	GTA	2	6	176049	176054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527320766
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3493	NC_021890	AAG	2	6	197621	197626	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527320778
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3495	NC_021890	CTA	2	6	197646	197651	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527320778
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