MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis RC-F(s)/342

Total Repeats: 20809

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2002	NC_021890	ATG	2	6	109465	109470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527320709
2003	NC_021890	CATAAC	2	12	109503	109514	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	527320709
2004	NC_021890	T	7	7	109553	109559	0 %	100 %	0 %	0 %	527320709
2005	NC_021890	AAG	2	6	109598	109603	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527320709
2006	NC_021890	ATA	2	6	109663	109668	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527320709
2007	NC_021890	T	7	7	109713	109719	0 %	100 %	0 %	0 %	527320710
2008	NC_021890	AGA	2	6	109742	109747	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527320710
2009	NC_021890	GAG	2	6	109764	109769	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527320710
2010	NC_021890	TCT	2	6	109880	109885	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527320710
2011	NC_021890	TC	3	6	109937	109942	0 %	50 %	0 %	50 %	527320710
2012	NC_021890	GCATT	2	10	110034	110043	20 %	40 %	20 %	20 %	527320710
2013	NC_021890	TTC	2	6	110055	110060	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527320710
2014	NC_021890	AT	3	6	110121	110126	50 %	50 %	0 %	0 %	527320711
2015	NC_021890	TGCT	2	8	110137	110144	0 %	50 %	25 %	25 %	527320711
2016	NC_021890	T	6	6	110179	110184	0 %	100 %	0 %	0 %	527320711
2017	NC_021890	CCT	2	6	110187	110192	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527320711
2018	NC_021890	ATA	2	6	110258	110263	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527320711
2019	NC_021890	GCA	2	6	110357	110362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527320711
2020	NC_021890	TCT	2	6	110375	110380	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527320711
2021	NC_021890	GAT	2	6	110437	110442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527320711
2022	NC_021890	TG	3	6	110506	110511	0 %	50 %	50 %	0 %	527320711
2023	NC_021890	GC	3	6	110632	110637	0 %	0 %	50 %	50 %	527320711
2024	NC_021890	T	6	6	110725	110730	0 %	100 %	0 %	0 %	527320711
2025	NC_021890	TTG	2	6	110749	110754	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527320711
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2036	NC_021890	CTA	2	6	111621	111626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527320711
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2041	NC_021890	TTC	2	6	111856	111861	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527320711
2042	NC_021890	GCTT	2	8	111863	111870	0 %	50 %	25 %	25 %	527320711
2043	NC_021890	TCT	2	6	111905	111910	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527320711
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2047	NC_021890	GTT	2	6	112012	112017	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527320711
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2051	NC_021890	AAG	2	6	112047	112052	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527320711
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2053	NC_021890	GTT	3	9	112089	112097	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527320711
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2057	NC_021890	GAT	2	6	112206	112211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527320711
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2064	NC_021890	TCT	2	6	112349	112354	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527320711
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2069	NC_021890	GCA	2	6	112502	112507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527320711
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2103	NC_021890	ACAG	2	8	114510	114517	50 %	0 %	25 %	25 %	527320713
2104	NC_021890	T	6	6	114542	114547	0 %	100 %	0 %	0 %	527320713
2105	NC_021890	T	6	6	114572	114577	0 %	100 %	0 %	0 %	527320713
2106	NC_021890	AACG	2	8	114632	114639	50 %	0 %	25 %	25 %	527320713
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2121	NC_021890	CATGT	2	10	115101	115110	20 %	40 %	20 %	20 %	527320713
2122	NC_021890	TCT	2	6	115262	115267	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527320713
2123	NC_021890	ACA	2	6	115272	115277	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527320713
2124	NC_021890	CGA	2	6	115284	115289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527320713
2125	NC_021890	ATC	2	6	115337	115342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527320713
2126	NC_021890	TCT	2	6	115354	115359	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527320713
2127	NC_021890	GGAA	2	8	115380	115387	50 %	0 %	50 %	0 %	527320713
2128	NC_021890	ACC	2	6	115415	115420	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	527320713
2129	NC_021890	TTG	2	6	115501	115506	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527320713
2130	NC_021890	AAC	2	6	115523	115528	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527320713
2131	NC_021890	ACTTCG	2	12	115563	115574	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	527320713
2132	NC_021890	ACA	3	9	115653	115661	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527320713
2133	NC_021890	CAA	2	6	115678	115683	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527320713
2134	NC_021890	TTC	3	9	115727	115735	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527320713
2135	NC_021890	TCT	2	6	115788	115793	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527320713
2136	NC_021890	AAGC	2	8	115797	115804	50 %	0 %	25 %	25 %	527320713
2137	NC_021890	TATCG	2	10	115805	115814	20 %	40 %	20 %	20 %	527320713
2138	NC_021890	T	6	6	115821	115826	0 %	100 %	0 %	0 %	527320713
2139	NC_021890	A	6	6	116120	116125	100 %	0 %	0 %	0 %	527320714
2140	NC_021890	GGTT	2	8	116129	116136	0 %	50 %	50 %	0 %	527320714
2141	NC_021890	T	7	7	116145	116151	0 %	100 %	0 %	0 %	527320714
2142	NC_021890	GCT	2	6	116271	116276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527320714
2143	NC_021890	TTTCT	2	10	116321	116330	0 %	80 %	0 %	20 %	527320714
2144	NC_021890	ACA	2	6	116358	116363	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527320714
2145	NC_021890	TAT	2	6	116546	116551	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527320714
2146	NC_021890	TATC	2	8	116578	116585	25 %	50 %	0 %	25 %	527320714
2147	NC_021890	TTTG	2	8	116675	116682	0 %	75 %	25 %	0 %	527320714
2148	NC_021890	AGG	3	9	116687	116695	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527320714
2149	NC_021890	AGA	2	6	116708	116713	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527320714
2150	NC_021890	GA	3	6	116762	116767	50 %	0 %	50 %	0 %	527320714
2151	NC_021890	A	6	6	116815	116820	100 %	0 %	0 %	0 %	527320714
2152	NC_021890	GTTC	2	8	116871	116878	0 %	50 %	25 %	25 %	527320714
2153	NC_021890	TAA	2	6	116891	116896	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527320714
2154	NC_021890	ACC	2	6	116907	116912	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	527320714
2155	NC_021890	GCT	2	6	116925	116930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527320714
2156	NC_021890	AGG	2	6	116975	116980	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527320714
2157	NC_021890	ATT	2	6	117009	117014	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527320714
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2159	NC_021890	TGC	2	6	117056	117061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527320714
2160	NC_021890	CTG	2	6	117103	117108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527320714
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2162	NC_021890	TGC	2	6	117319	117324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527320715
2163	NC_021890	AAG	2	6	117327	117332	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527320715
2164	NC_021890	GAAA	2	8	117379	117386	75 %	0 %	25 %	0 %	527320715
2165	NC_021890	GTT	2	6	117422	117427	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527320715
2166	NC_021890	TAT	2	6	117438	117443	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527320715
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2172	NC_021890	GTAG	2	8	118236	118243	25 %	25 %	50 %	0 %	527320716
2173	NC_021890	G	6	6	118284	118289	0 %	0 %	100 %	0 %	527320716
2174	NC_021890	TGCT	2	8	118290	118297	0 %	50 %	25 %	25 %	527320716
2175	NC_021890	T	6	6	118307	118312	0 %	100 %	0 %	0 %	527320716
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2179	NC_021890	TCC	2	6	118469	118474	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527320716
2180	NC_021890	A	8	8	118510	118517	100 %	0 %	0 %	0 %	527320716
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2182	NC_021890	AAAGA	2	10	118566	118575	80 %	0 %	20 %	0 %	527320716
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2188	NC_021890	TTTA	2	8	118852	118859	25 %	75 %	0 %	0 %	527320717
2189	NC_021890	CTG	2	6	119050	119055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527320717
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2191	NC_021890	TTGCCA	2	12	119102	119113	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	527320717
2192	NC_021890	GA	4	8	119125	119132	50 %	0 %	50 %	0 %	527320717
2193	NC_021890	GAA	2	6	119139	119144	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527320717
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2195	NC_021890	TACT	2	8	119240	119247	25 %	50 %	0 %	25 %	527320717
2196	NC_021890	GTT	2	6	119284	119289	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527320717
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2201	NC_021890	AG	3	6	119560	119565	50 %	0 %	50 %	0 %	527320718
2202	NC_021890	GCTA	2	8	119582	119589	25 %	25 %	25 %	25 %	527320718
2203	NC_021890	GA	3	6	119593	119598	50 %	0 %	50 %	0 %	527320718
2204	NC_021890	AAG	2	6	119601	119606	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527320718
2205	NC_021890	GCT	3	9	119607	119615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527320718
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2208	NC_021890	TC	3	6	119681	119686	0 %	50 %	0 %	50 %	527320718
2209	NC_021890	GCTA	2	8	119714	119721	25 %	25 %	25 %	25 %	527320718
2210	NC_021890	CGGC	2	8	119763	119770	0 %	0 %	50 %	50 %	527320718
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2215	NC_021890	GA	4	8	119914	119921	50 %	0 %	50 %	0 %	527320718
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2217	NC_021890	T	6	6	120053	120058	0 %	100 %	0 %	0 %	527320718
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2219	NC_021890	GA	3	6	120247	120252	50 %	0 %	50 %	0 %	527320718
2220	NC_021890	ATC	2	6	120341	120346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527320718
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2224	NC_021890	T	6	6	122829	122834	0 %	100 %	0 %	0 %	527320719
2225	NC_021890	AGCT	2	8	122862	122869	25 %	25 %	25 %	25 %	527320719
2226	NC_021890	CAA	2	6	122931	122936	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527320719
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2229	NC_021890	ATA	2	6	123087	123092	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527320719
2230	NC_021890	TAA	2	6	123216	123221	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527320719
2231	NC_021890	TGA	2	6	123305	123310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527320719
2232	NC_021890	TCC	2	6	123365	123370	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527320719
2233	NC_021890	GAT	2	6	123397	123402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527320719
2234	NC_021890	T	7	7	123504	123510	0 %	100 %	0 %	0 %	527320719
2235	NC_021890	AGA	2	6	123541	123546	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527320719
2236	NC_021890	T	6	6	123649	123654	0 %	100 %	0 %	0 %	527320720
2237	NC_021890	GA	3	6	123727	123732	50 %	0 %	50 %	0 %	527320720
2238	NC_021890	GGGTTT	2	12	123750	123761	0 %	50 %	50 %	0 %	527320720
2239	NC_021890	CAA	2	6	123776	123781	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527320720
2240	NC_021890	GTG	2	6	123794	123799	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	527320720
2241	NC_021890	T	6	6	123808	123813	0 %	100 %	0 %	0 %	527320720
2242	NC_021890	TGGA	2	8	123818	123825	25 %	25 %	50 %	0 %	527320720
2243	NC_021890	GCAA	2	8	123853	123860	50 %	0 %	25 %	25 %	527320720
2244	NC_021890	TTA	2	6	123898	123903	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527320720
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2492	NC_021890	CAG	2	6	135428	135433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527320729
2493	NC_021890	A	6	6	135506	135511	100 %	0 %	0 %	0 %	527320729
2494	NC_021890	AAC	2	6	135673	135678	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527320730
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2496	NC_021890	ATT	2	6	135728	135733	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527320730
2497	NC_021890	ATTGG	2	10	135791	135800	20 %	40 %	40 %	0 %	527320730
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