MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis RC-F(s)/342

Total Repeats: 20809

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_021890	GTGC	2	8	82803	82810	0 %	25 %	50 %	25 %	527320686
1502	NC_021890	TAA	2	6	82853	82858	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527320686
1503	NC_021890	CAT	2	6	82869	82874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527320686
1504	NC_021890	GAA	2	6	82881	82886	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527320686
1505	NC_021890	GA	3	6	82966	82971	50 %	0 %	50 %	0 %	527320686
1506	NC_021890	TAC	2	6	83017	83022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527320687
1507	NC_021890	T	6	6	83041	83046	0 %	100 %	0 %	0 %	527320687
1508	NC_021890	T	7	7	83053	83059	0 %	100 %	0 %	0 %	527320687
1509	NC_021890	T	6	6	83066	83071	0 %	100 %	0 %	0 %	527320687
1510	NC_021890	GTA	2	6	83152	83157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527320687
1511	NC_021890	T	6	6	83163	83168	0 %	100 %	0 %	0 %	527320687
1512	NC_021890	TATG	2	8	83187	83194	25 %	50 %	25 %	0 %	527320687
1513	NC_021890	TAT	2	6	83216	83221	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527320687
1514	NC_021890	GTCTGT	2	12	83230	83241	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	527320687
1515	NC_021890	TCA	2	6	83250	83255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527320687
1516	NC_021890	TCAT	2	8	83258	83265	25 %	50 %	0 %	25 %	527320687
1517	NC_021890	CAA	2	6	83300	83305	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527320687
1518	NC_021890	ACTG	2	8	83310	83317	25 %	25 %	25 %	25 %	527320687
1519	NC_021890	CATT	2	8	83325	83332	25 %	50 %	0 %	25 %	527320687
1520	NC_021890	AGA	2	6	83358	83363	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527320687
1521	NC_021890	AGCA	2	8	83364	83371	50 %	0 %	25 %	25 %	527320687
1522	NC_021890	TC	3	6	83386	83391	0 %	50 %	0 %	50 %	527320687
1523	NC_021890	TTA	2	6	83407	83412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527320687
1524	NC_021890	TAAC	2	8	83519	83526	50 %	25 %	0 %	25 %	527320687
1525	NC_021890	TTTG	2	8	83557	83564	0 %	75 %	25 %	0 %	527320687
1526	NC_021890	TTG	2	6	83654	83659	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527320687
1527	NC_021890	GAT	2	6	83751	83756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527320687
1528	NC_021890	TCTA	2	8	83841	83848	25 %	50 %	0 %	25 %	527320687
1529	NC_021890	CTA	2	6	83869	83874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527320687
1530	NC_021890	TAT	2	6	83922	83927	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527320687
1531	NC_021890	TAAG	2	8	83946	83953	50 %	25 %	25 %	0 %	527320687
1532	NC_021890	AGT	2	6	84035	84040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527320688
1533	NC_021890	TAT	2	6	84062	84067	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527320688
1534	NC_021890	TGC	2	6	84077	84082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527320688
1535	NC_021890	AAG	2	6	84097	84102	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527320688
1536	NC_021890	TC	3	6	84109	84114	0 %	50 %	0 %	50 %	527320688
1537	NC_021890	AG	3	6	84120	84125	50 %	0 %	50 %	0 %	527320688
1538	NC_021890	GAA	2	6	84153	84158	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527320688
1539	NC_021890	CAG	2	6	84292	84297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527320688
1540	NC_021890	TAA	2	6	84338	84343	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527320688
1541	NC_021890	AG	3	6	84387	84392	50 %	0 %	50 %	0 %	527320688
1542	NC_021890	TTC	2	6	84406	84411	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527320688
1543	NC_021890	GAAG	2	8	84450	84457	50 %	0 %	50 %	0 %	527320688
1544	NC_021890	A	6	6	84474	84479	100 %	0 %	0 %	0 %	527320688
1545	NC_021890	AGA	2	6	84524	84529	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527320688
1546	NC_021890	TTC	2	6	84602	84607	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527320688
1547	NC_021890	TAAA	2	8	84616	84623	75 %	25 %	0 %	0 %	527320688
1548	NC_021890	ATCC	2	8	84687	84694	25 %	25 %	0 %	50 %	527320688
1549	NC_021890	TGG	2	6	84715	84720	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	527320688
1550	NC_021890	TGA	2	6	84748	84753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527320688
1551	NC_021890	TCC	2	6	84755	84760	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527320688
1552	NC_021890	ACA	2	6	84779	84784	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527320688
1553	NC_021890	TTTC	2	8	84834	84841	0 %	75 %	0 %	25 %	527320688
1554	NC_021890	AGAT	2	8	84875	84882	50 %	25 %	25 %	0 %	527320688
1555	NC_021890	CTT	2	6	84912	84917	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527320688
1556	NC_021890	T	6	6	84938	84943	0 %	100 %	0 %	0 %	527320688
1557	NC_021890	GAA	2	6	85065	85070	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527320688
1558	NC_021890	AAT	2	6	85319	85324	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527320689
1559	NC_021890	AT	3	6	85323	85328	50 %	50 %	0 %	0 %	527320689
1560	NC_021890	AGC	2	6	85391	85396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527320689
1561	NC_021890	AG	3	6	85418	85423	50 %	0 %	50 %	0 %	527320689
1562	NC_021890	GAAA	2	8	85456	85463	75 %	0 %	25 %	0 %	527320689
1563	NC_021890	T	6	6	85593	85598	0 %	100 %	0 %	0 %	527320689
1564	NC_021890	TGG	2	6	85694	85699	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	527320689
1565	NC_021890	CTT	2	6	85750	85755	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527320689
1566	NC_021890	CAA	2	6	85761	85766	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527320689
1567	NC_021890	TCT	2	6	85839	85844	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527320689
1568	NC_021890	CTT	2	6	85845	85850	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527320689
1569	NC_021890	GAAA	2	8	85851	85858	75 %	0 %	25 %	0 %	527320689
1570	NC_021890	GCA	2	6	85874	85879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527320689
1571	NC_021890	CTG	2	6	85971	85976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527320689
1572	NC_021890	GATCC	2	10	85984	85993	20 %	20 %	20 %	40 %	527320689
1573	NC_021890	TAG	2	6	86014	86019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527320689
1574	NC_021890	ATGG	3	12	86051	86062	25 %	25 %	50 %	0 %	527320689
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1578	NC_021890	TTG	2	6	86299	86304	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527320689
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1584	NC_021890	TTA	2	6	86711	86716	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527320689
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1586	NC_021890	TA	3	6	87024	87029	50 %	50 %	0 %	0 %	527320689
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1593	NC_021890	ATG	2	6	87409	87414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527320690
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1599	NC_021890	AGG	2	6	87672	87677	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527320690
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1607	NC_021890	A	6	6	88084	88089	100 %	0 %	0 %	0 %	527320690
1608	NC_021890	TTC	2	6	88090	88095	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527320690
1609	NC_021890	GAG	2	6	88266	88271	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527320691
1610	NC_021890	TGT	2	6	88315	88320	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527320691
1611	NC_021890	TAG	2	6	88341	88346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527320691
1612	NC_021890	GGAT	2	8	88445	88452	25 %	25 %	50 %	0 %	527320691
1613	NC_021890	CTT	2	6	88461	88466	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527320691
1614	NC_021890	GAA	2	6	88491	88496	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527320691
1615	NC_021890	GTT	2	6	88635	88640	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527320691
1616	NC_021890	GTA	2	6	88642	88647	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527320691
1617	NC_021890	GA	3	6	88690	88695	50 %	0 %	50 %	0 %	527320691
1618	NC_021890	TAT	2	6	88731	88736	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527320691
1619	NC_021890	CATT	2	8	88775	88782	25 %	50 %	0 %	25 %	527320691
1620	NC_021890	AAG	2	6	88787	88792	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527320691
1621	NC_021890	CAAT	2	8	88812	88819	50 %	25 %	0 %	25 %	527320691
1622	NC_021890	TTCTGA	2	12	88844	88855	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	527320691
1623	NC_021890	AG	3	6	88896	88901	50 %	0 %	50 %	0 %	527320691
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1882	NC_021890	TCA	2	6	103121	103126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527320704
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