MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis RC-F(s)/342

Total Repeats: 20809

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_021890	GGAA	2	8	55057	55064	50 %	0 %	50 %	0 %	527320665
1002	NC_021890	GATCTG	2	12	55092	55103	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	527320665
1003	NC_021890	GTGTAA	2	12	55140	55151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527320665
1004	NC_021890	GCA	2	6	55154	55159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527320665
1005	NC_021890	GGTTCA	2	12	55229	55240	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	527320665
1006	NC_021890	TTATC	2	10	55330	55339	20 %	60 %	0 %	20 %	527320665
1007	NC_021890	GGA	2	6	55430	55435	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527320665
1008	NC_021890	TGC	2	6	55465	55470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527320665
1009	NC_021890	GTA	2	6	55508	55513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527320665
1010	NC_021890	GAGT	2	8	55626	55633	25 %	25 %	50 %	0 %	527320665
1011	NC_021890	AT	3	6	55675	55680	50 %	50 %	0 %	0 %	527320665
1012	NC_021890	TTA	2	6	55690	55695	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527320665
1013	NC_021890	CTGG	3	12	55968	55979	0 %	25 %	50 %	25 %	527320666
1014	NC_021890	ATT	2	6	55983	55988	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527320666
1015	NC_021890	GAT	2	6	55996	56001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527320666
1016	NC_021890	TCT	2	6	56014	56019	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527320666
1017	NC_021890	TCC	2	6	56049	56054	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527320666
1018	NC_021890	TTA	2	6	56062	56067	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527320666
1019	NC_021890	TTGC	2	8	56105	56112	0 %	50 %	25 %	25 %	527320666
1020	NC_021890	CGAG	2	8	56147	56154	25 %	0 %	50 %	25 %	527320666
1021	NC_021890	T	6	6	56157	56162	0 %	100 %	0 %	0 %	527320666
1022	NC_021890	GTA	2	6	56188	56193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527320666
1023	NC_021890	GTT	2	6	56299	56304	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527320666
1024	NC_021890	AG	3	6	56311	56316	50 %	0 %	50 %	0 %	527320666
1025	NC_021890	TGG	2	6	56319	56324	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	527320666
1026	NC_021890	GTTGT	2	10	56398	56407	0 %	60 %	40 %	0 %	527320666
1027	NC_021890	T	6	6	56453	56458	0 %	100 %	0 %	0 %	527320666
1028	NC_021890	AGA	2	6	57841	57846	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527320667
1029	NC_021890	CAT	2	6	57939	57944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527320667
1030	NC_021890	CTG	2	6	58032	58037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527320667
1031	NC_021890	TGT	2	6	58099	58104	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527320667
1032	NC_021890	TTG	2	6	58137	58142	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527320667
1033	NC_021890	GAAA	2	8	58172	58179	75 %	0 %	25 %	0 %	527320667
1034	NC_021890	CT	3	6	58182	58187	0 %	50 %	0 %	50 %	527320667
1035	NC_021890	AGGT	2	8	58211	58218	25 %	25 %	50 %	0 %	527320667
1036	NC_021890	AGA	2	6	59170	59175	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527320668
1037	NC_021890	TCT	2	6	59186	59191	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527320668
1038	NC_021890	T	6	6	59218	59223	0 %	100 %	0 %	0 %	527320668
1039	NC_021890	CGTT	2	8	59369	59376	0 %	50 %	25 %	25 %	527320668
1040	NC_021890	GGAG	2	8	59378	59385	25 %	0 %	75 %	0 %	527320668
1041	NC_021890	GTAA	2	8	59430	59437	50 %	25 %	25 %	0 %	527320668
1042	NC_021890	TCCTAA	2	12	59497	59508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527320668
1043	NC_021890	AGT	2	6	59526	59531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527320668
1044	NC_021890	T	6	6	59558	59563	0 %	100 %	0 %	0 %	527320668
1045	NC_021890	AGC	2	6	59606	59611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527320668
1046	NC_021890	GCT	2	6	59618	59623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527320668
1047	NC_021890	GTC	2	6	59644	59649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527320668
1048	NC_021890	ATGG	2	8	59657	59664	25 %	25 %	50 %	0 %	527320668
1049	NC_021890	AGG	2	6	59691	59696	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527320668
1050	NC_021890	GA	3	6	59743	59748	50 %	0 %	50 %	0 %	527320668
1051	NC_021890	CAA	2	6	59766	59771	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527320668
1052	NC_021890	ATAA	2	8	59803	59810	75 %	25 %	0 %	0 %	527320668
1053	NC_021890	GAGCA	2	10	59843	59852	40 %	0 %	40 %	20 %	527320668
1054	NC_021890	GT	3	6	59881	59886	0 %	50 %	50 %	0 %	527320668
1055	NC_021890	TAG	2	6	59893	59898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527320668
1056	NC_021890	AAG	2	6	60078	60083	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527320668
1057	NC_021890	AAC	2	6	60123	60128	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527320668
1058	NC_021890	T	7	7	60142	60148	0 %	100 %	0 %	0 %	527320668
1059	NC_021890	CTT	2	6	60192	60197	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527320668
1060	NC_021890	AAT	2	6	60222	60227	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527320668
1061	NC_021890	TTC	2	6	60233	60238	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527320668
1062	NC_021890	ATGT	2	8	60253	60260	25 %	50 %	25 %	0 %	527320668
1063	NC_021890	CATT	2	8	60282	60289	25 %	50 %	0 %	25 %	527320668
1064	NC_021890	ATG	2	6	60303	60308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527320669
1065	NC_021890	CCT	2	6	60309	60314	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527320669
1066	NC_021890	AGT	2	6	60364	60369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527320669
1067	NC_021890	TCT	2	6	60387	60392	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527320669
1068	NC_021890	TCA	2	6	60399	60404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527320669
1069	NC_021890	TTC	2	6	60520	60525	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527320669
1070	NC_021890	CTTT	2	8	60555	60562	0 %	75 %	0 %	25 %	527320669
1071	NC_021890	TTCT	2	8	60578	60585	0 %	75 %	0 %	25 %	527320669
1072	NC_021890	TTC	2	6	60617	60622	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527320669
1073	NC_021890	TC	3	6	60629	60634	0 %	50 %	0 %	50 %	527320669
1074	NC_021890	T	6	6	60641	60646	0 %	100 %	0 %	0 %	527320669
1075	NC_021890	T	7	7	60701	60707	0 %	100 %	0 %	0 %	527320669
1076	NC_021890	TCA	2	6	61086	61091	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527320670
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1080	NC_021890	CA	3	6	61255	61260	50 %	0 %	0 %	50 %	527320670
1081	NC_021890	TGA	2	6	61267	61272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527320670
1082	NC_021890	TTA	2	6	61280	61285	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527320670
1083	NC_021890	TCA	2	6	61320	61325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527320670
1084	NC_021890	GAA	2	6	61326	61331	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527320670
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1087	NC_021890	CTT	2	6	61384	61389	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527320670
1088	NC_021890	ATT	2	6	61394	61399	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527320670
1089	NC_021890	AT	3	6	61505	61510	50 %	50 %	0 %	0 %	527320670
1090	NC_021890	GA	3	6	61528	61533	50 %	0 %	50 %	0 %	527320670
1091	NC_021890	TTC	2	6	61555	61560	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527320670
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1093	NC_021890	GA	3	6	61654	61659	50 %	0 %	50 %	0 %	527320670
1094	NC_021890	ATG	2	6	61896	61901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527320670
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1097	NC_021890	AAT	2	6	62124	62129	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527320670
1098	NC_021890	ATG	2	6	62196	62201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527320670
1099	NC_021890	TGTGA	2	10	62292	62301	20 %	40 %	40 %	0 %	527320670
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1102	NC_021890	ATT	2	6	62411	62416	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527320670
1103	NC_021890	CGA	2	6	62459	62464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527320670
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1105	NC_021890	CTT	2	6	62586	62591	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527320670
1106	NC_021890	AAG	2	6	62620	62625	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527320670
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1108	NC_021890	GA	3	6	62728	62733	50 %	0 %	50 %	0 %	527320670
1109	NC_021890	TTA	2	6	62778	62783	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527320670
1110	NC_021890	AAG	2	6	62785	62790	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527320670
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1112	NC_021890	CAA	2	6	62985	62990	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527320670
1113	NC_021890	AT	3	6	63065	63070	50 %	50 %	0 %	0 %	527320670
1114	NC_021890	TTC	2	6	63071	63076	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527320670
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1116	NC_021890	CTTC	2	8	63216	63223	0 %	50 %	0 %	50 %	527320670
1117	NC_021890	AG	3	6	63265	63270	50 %	0 %	50 %	0 %	527320670
1118	NC_021890	CT	4	8	63273	63280	0 %	50 %	0 %	50 %	527320670
1119	NC_021890	T	6	6	63292	63297	0 %	100 %	0 %	0 %	527320670
1120	NC_021890	GTTCTT	2	12	63411	63422	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	527320670
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1123	NC_021890	AGA	2	6	63524	63529	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527320670
1124	NC_021890	TATG	2	8	63570	63577	25 %	50 %	25 %	0 %	527320670
1125	NC_021890	AAG	2	6	63583	63588	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527320670
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