MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis RC-F(s)/342

Total Repeats: 20809

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_021890	GAA	2	6	28646	28651	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527320638
502	NC_021890	TGA	2	6	28660	28665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527320638
503	NC_021890	TTC	2	6	28693	28698	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527320638
504	NC_021890	GC	4	8	28864	28871	0 %	0 %	50 %	50 %	527320638
505	NC_021890	AAG	2	6	28872	28877	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527320638
506	NC_021890	TA	3	6	28986	28991	50 %	50 %	0 %	0 %	527320638
507	NC_021890	GAA	2	6	29075	29080	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527320638
508	NC_021890	TGT	2	6	29107	29112	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527320639
509	NC_021890	TCT	2	6	29175	29180	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527320639
510	NC_021890	ACA	2	6	29403	29408	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527320639
511	NC_021890	ATG	2	6	29413	29418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527320639
512	NC_021890	CTTT	2	8	29555	29562	0 %	75 %	0 %	25 %	527320639
513	NC_021890	TTTG	2	8	29570	29577	0 %	75 %	25 %	0 %	527320639
514	NC_021890	TTGT	2	8	29605	29612	0 %	75 %	25 %	0 %	527320639
515	NC_021890	CCTAT	2	10	29624	29633	20 %	40 %	0 %	40 %	527320639
516	NC_021890	T	6	6	29640	29645	0 %	100 %	0 %	0 %	527320639
517	NC_021890	ATC	2	6	29719	29724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527320639
518	NC_021890	TGGC	2	8	29768	29775	0 %	25 %	50 %	25 %	527320639
519	NC_021890	T	8	8	29874	29881	0 %	100 %	0 %	0 %	527320639
520	NC_021890	ATG	2	6	29899	29904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527320639
521	NC_021890	GA	3	6	29937	29942	50 %	0 %	50 %	0 %	527320639
522	NC_021890	AG	3	6	30035	30040	50 %	0 %	50 %	0 %	527320640
523	NC_021890	GTT	2	6	30116	30121	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527320640
524	NC_021890	GAA	2	6	30125	30130	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527320640
525	NC_021890	TC	3	6	30144	30149	0 %	50 %	0 %	50 %	527320640
526	NC_021890	TCT	2	6	30191	30196	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527320640
527	NC_021890	ACT	2	6	30281	30286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527320640
528	NC_021890	TTC	2	6	30309	30314	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527320640
529	NC_021890	AAAG	2	8	30328	30335	75 %	0 %	25 %	0 %	527320640
530	NC_021890	CCT	2	6	30345	30350	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527320640
531	NC_021890	AAAC	2	8	30398	30405	75 %	0 %	0 %	25 %	527320640
532	NC_021890	T	6	6	30415	30420	0 %	100 %	0 %	0 %	527320640
533	NC_021890	GAAGG	2	10	30423	30432	40 %	0 %	60 %	0 %	527320640
534	NC_021890	GGC	2	6	30451	30456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	527320640
535	NC_021890	GAT	2	6	30530	30535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527320640
536	NC_021890	GATG	2	8	30541	30548	25 %	25 %	50 %	0 %	527320640
537	NC_021890	TAG	2	6	30552	30557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527320640
538	NC_021890	GTT	2	6	30626	30631	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527320640
539	NC_021890	TAA	2	6	30736	30741	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527320640
540	NC_021890	GA	3	6	30765	30770	50 %	0 %	50 %	0 %	527320640
541	NC_021890	GAA	2	6	30875	30880	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527320640
542	NC_021890	AGA	2	6	30895	30900	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527320640
543	NC_021890	TCG	2	6	30958	30963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527320640
544	NC_021890	ATG	2	6	30992	30997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527320640
545	NC_021890	TGG	2	6	31006	31011	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	527320640
546	NC_021890	GAA	2	6	31037	31042	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527320640
547	NC_021890	ATT	2	6	31073	31078	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527320640
548	NC_021890	ATG	2	6	31196	31201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527320640
549	NC_021890	AAG	2	6	31208	31213	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527320640
550	NC_021890	T	6	6	31214	31219	0 %	100 %	0 %	0 %	527320640
551	NC_021890	GA	3	6	31233	31238	50 %	0 %	50 %	0 %	527320640
552	NC_021890	A	7	7	31256	31262	100 %	0 %	0 %	0 %	527320640
553	NC_021890	ACA	2	6	31302	31307	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527320641
554	NC_021890	TGT	2	6	31323	31328	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527320641
555	NC_021890	AT	3	6	31374	31379	50 %	50 %	0 %	0 %	527320641
556	NC_021890	T	6	6	31442	31447	0 %	100 %	0 %	0 %	527320641
557	NC_021890	GAGCT	2	10	31463	31472	20 %	20 %	40 %	20 %	527320641
558	NC_021890	A	6	6	31537	31542	100 %	0 %	0 %	0 %	527320641
559	NC_021890	A	6	6	31568	31573	100 %	0 %	0 %	0 %	527320641
560	NC_021890	TGC	2	6	31596	31601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527320641
561	NC_021890	AGC	2	6	31614	31619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527320641
562	NC_021890	TC	3	6	31659	31664	0 %	50 %	0 %	50 %	527320642
563	NC_021890	AAG	2	6	31863	31868	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527320642
564	NC_021890	AAG	2	6	31870	31875	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527320642
565	NC_021890	CTT	2	6	31909	31914	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527320642
566	NC_021890	CGT	2	6	31940	31945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527320642
567	NC_021890	TGA	2	6	31986	31991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527320642
568	NC_021890	GAG	2	6	32017	32022	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527320642
569	NC_021890	GCG	2	6	32059	32064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	527320642
570	NC_021890	CT	3	6	32139	32144	0 %	50 %	0 %	50 %	527320642
571	NC_021890	AGA	2	6	32237	32242	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527320642
572	NC_021890	AG	3	6	32271	32276	50 %	0 %	50 %	0 %	527320642
573	NC_021890	AAG	2	6	32425	32430	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527320642
574	NC_021890	ATT	2	6	32475	32480	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527320642
575	NC_021890	T	6	6	32580	32585	0 %	100 %	0 %	0 %	527320642
576	NC_021890	GGA	2	6	32605	32610	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527320642
577	NC_021890	AGG	2	6	32830	32835	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527320643
578	NC_021890	GGT	2	6	32885	32890	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	527320643
579	NC_021890	GCT	2	6	33047	33052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527320643
580	NC_021890	GCT	2	6	33080	33085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527320643
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583	NC_021890	TGT	2	6	33285	33290	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527320644
584	NC_021890	TGA	2	6	33336	33341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527320644
585	NC_021890	A	6	6	33346	33351	100 %	0 %	0 %	0 %	527320644
586	NC_021890	GTT	2	6	33424	33429	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527320644
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589	NC_021890	T	6	6	33519	33524	0 %	100 %	0 %	0 %	527320644
590	NC_021890	GTT	2	6	33537	33542	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527320644
591	NC_021890	TGA	2	6	33644	33649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527320644
592	NC_021890	CAG	2	6	33707	33712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527320644
593	NC_021890	CAT	2	6	33751	33756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527320644
594	NC_021890	TC	3	6	33767	33772	0 %	50 %	0 %	50 %	527320644
595	NC_021890	AG	3	6	33780	33785	50 %	0 %	50 %	0 %	527320644
596	NC_021890	CTG	2	6	33877	33882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527320645
597	NC_021890	ACA	2	6	33894	33899	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527320645
598	NC_021890	AG	3	6	33918	33923	50 %	0 %	50 %	0 %	527320645
599	NC_021890	GTC	2	6	33950	33955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527320645
600	NC_021890	ATT	2	6	33997	34002	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527320645
601	NC_021890	T	6	6	34049	34054	0 %	100 %	0 %	0 %	527320645
602	NC_021890	TTA	2	6	34079	34084	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527320645
603	NC_021890	TGAT	2	8	34144	34151	25 %	50 %	25 %	0 %	527320645
604	NC_021890	GAA	2	6	34172	34177	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527320645
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607	NC_021890	AAGA	3	12	34272	34283	75 %	0 %	25 %	0 %	527320645
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610	NC_021890	ATG	2	6	34342	34347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527320645
611	NC_021890	AAG	2	6	34373	34378	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527320645
612	NC_021890	GAA	2	6	34392	34397	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527320645
613	NC_021890	AAGC	2	8	34492	34499	50 %	0 %	25 %	25 %	527320646
614	NC_021890	GTTC	2	8	34525	34532	0 %	50 %	25 %	25 %	527320646
615	NC_021890	GAT	2	6	34603	34608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527320646
616	NC_021890	AG	3	6	34611	34616	50 %	0 %	50 %	0 %	527320646
617	NC_021890	GA	4	8	34634	34641	50 %	0 %	50 %	0 %	527320646
618	NC_021890	AGA	2	6	34669	34674	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527320646
619	NC_021890	TTA	2	6	34732	34737	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527320647
620	NC_021890	TGA	2	6	34865	34870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527320647
621	NC_021890	GGCA	2	8	34904	34911	25 %	0 %	50 %	25 %	527320647
622	NC_021890	GAA	2	6	34964	34969	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527320647
623	NC_021890	ATC	2	6	35014	35019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527320647
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625	NC_021890	TGT	2	6	35132	35137	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527320647
626	NC_021890	TCGA	2	8	35161	35168	25 %	25 %	25 %	25 %	527320647
627	NC_021890	GAG	2	6	35173	35178	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527320647
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