MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis RC-F(s)/342

Total Repeats: 20809

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_021890	TGA	2	6	322942	322947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527320896
6002	NC_021890	AGA	2	6	322950	322955	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527320896
6003	NC_021890	ACA	2	6	322984	322989	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527320896
6004	NC_021890	GAA	2	6	323006	323011	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527320896
6005	NC_021890	TGA	2	6	323026	323031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527320896
6006	NC_021890	AGT	2	6	323047	323052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527320896
6007	NC_021890	AAAG	2	8	323134	323141	75 %	0 %	25 %	0 %	527320896
6008	NC_021890	CGT	2	6	323186	323191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527320896
6009	NC_021890	TCCT	2	8	323231	323238	0 %	50 %	0 %	50 %	527320896
6010	NC_021890	GCA	2	6	323278	323283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527320896
6011	NC_021890	GGA	2	6	323303	323308	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527320896
6012	NC_021890	GAT	2	6	323368	323373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527320896
6013	NC_021890	TCC	2	6	323380	323385	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527320896
6014	NC_021890	CGC	2	6	323435	323440	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	527320896
6015	NC_021890	TGTGT	2	10	323447	323456	0 %	60 %	40 %	0 %	527320896
6016	NC_021890	TGA	2	6	323461	323466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527320896
6017	NC_021890	CAT	3	9	323569	323577	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527320896
6018	NC_021890	GTG	2	6	323616	323621	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	527320896
6019	NC_021890	TGC	2	6	323680	323685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527320896
6020	NC_021890	AAG	2	6	323690	323695	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527320896
6021	NC_021890	AAG	2	6	323757	323762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527320896
6022	NC_021890	TAA	2	6	323791	323796	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527320896
6023	NC_021890	GGA	2	6	323929	323934	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527320896
6024	NC_021890	AAG	2	6	323973	323978	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527320896
6025	NC_021890	CG	4	8	323990	323997	0 %	0 %	50 %	50 %	527320896
6026	NC_021890	AGA	2	6	324004	324009	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527320896
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6028	NC_021890	AGA	3	9	324028	324036	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527320896
6029	NC_021890	TGA	2	6	324088	324093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527320896
6030	NC_021890	CTC	3	9	324113	324121	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527320897
6031	NC_021890	TAAAG	2	10	324334	324343	60 %	20 %	20 %	0 %	527320897
6032	NC_021890	GAT	2	6	324344	324349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527320897
6033	NC_021890	TCC	2	6	324420	324425	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527320897
6034	NC_021890	TAA	2	6	324457	324462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527320897
6035	NC_021890	TGT	2	6	324490	324495	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527320897
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6037	NC_021890	T	7	7	324594	324600	0 %	100 %	0 %	0 %	527320897
6038	NC_021890	CTT	2	6	324620	324625	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527320897
6039	NC_021890	CTC	2	6	324770	324775	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527320897
6040	NC_021890	AAT	2	6	324779	324784	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527320897
6041	NC_021890	A	6	6	324796	324801	100 %	0 %	0 %	0 %	527320897
6042	NC_021890	CTT	2	6	324822	324827	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527320897
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6044	NC_021890	ATGGA	2	10	324959	324968	40 %	20 %	40 %	0 %	527320897
6045	NC_021890	CAA	2	6	325064	325069	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527320897
6046	NC_021890	CTT	2	6	325086	325091	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527320897
6047	NC_021890	CAA	2	6	325103	325108	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527320897
6048	NC_021890	CTC	2	6	325121	325126	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527320897
6049	NC_021890	CAA	2	6	325136	325141	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527320897
6050	NC_021890	CAT	2	6	325210	325215	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527320898
6051	NC_021890	A	7	7	325222	325228	100 %	0 %	0 %	0 %	527320898
6052	NC_021890	A	7	7	325236	325242	100 %	0 %	0 %	0 %	527320898
6053	NC_021890	GCC	2	6	325255	325260	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	527320898
6054	NC_021890	TCAAT	2	10	325291	325300	40 %	40 %	0 %	20 %	527320898
6055	NC_021890	A	9	9	325306	325314	100 %	0 %	0 %	0 %	527320898
6056	NC_021890	A	7	7	325337	325343	100 %	0 %	0 %	0 %	527320898
6057	NC_021890	TAT	2	6	325351	325356	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527320898
6058	NC_021890	ATA	2	6	325360	325365	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527320898
6059	NC_021890	TCA	2	6	325409	325414	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527320899
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6061	NC_021890	TGG	2	6	325598	325603	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	527320899
6062	NC_021890	TGC	2	6	325607	325612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527320899
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6065	NC_021890	AAAACA	2	12	325676	325687	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	527320899
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6068	NC_021890	AAG	2	6	325846	325851	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527320899
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6070	NC_021890	GAG	2	6	325954	325959	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527320899
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6074	NC_021890	TA	3	6	326110	326115	50 %	50 %	0 %	0 %	527320899
6075	NC_021890	GCT	2	6	326160	326165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527320899
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6097	NC_021890	CT	3	6	327036	327041	0 %	50 %	0 %	50 %	527320899
6098	NC_021890	ACA	2	6	327047	327052	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527320899
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6111	NC_021890	TCT	2	6	327762	327767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527320900
6112	NC_021890	AGC	3	9	327785	327793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527320900
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6491	NC_021890	ATC	2	6	347471	347476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527320917
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6493	NC_021890	ATGA	2	8	347762	347769	50 %	25 %	25 %	0 %	527320917
6494	NC_021890	GAA	2	6	347816	347821	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527320917
6495	NC_021890	CAA	2	6	347830	347835	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527320917
6496	NC_021890	ATCCC	2	10	347842	347851	20 %	20 %	0 %	60 %	527320917
6497	NC_021890	C	6	6	347849	347854	0 %	0 %	0 %	100 %	527320917
6498	NC_021890	AAT	2	6	347855	347860	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527320917
6499	NC_021890	AGC	2	6	347882	347887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527320917
6500	NC_021890	AGA	3	9	347921	347929	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527320917

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