MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis RC-J/953

Total Repeats: 20283

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_021889	ACC	2	6	211238	211243	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	527319883
4002	NC_021889	CTTG	2	8	211266	211273	0 %	50 %	25 %	25 %	527319883
4003	NC_021889	GAAATA	2	12	211322	211333	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	527319883
4004	NC_021889	AAC	2	6	211354	211359	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527319883
4005	NC_021889	CCA	2	6	211404	211409	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	527319883
4006	NC_021889	CGT	2	6	211515	211520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527319883
4007	NC_021889	TTTCT	2	10	211522	211531	0 %	80 %	0 %	20 %	527319883
4008	NC_021889	TAA	2	6	211551	211556	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527319884
4009	NC_021889	CTG	2	6	211589	211594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527319884
4010	NC_021889	CTT	2	6	211719	211724	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527319884
4011	NC_021889	ACG	2	6	211857	211862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527319884
4012	NC_021889	ACA	2	6	212105	212110	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527319885
4013	NC_021889	AATA	2	8	212150	212157	75 %	25 %	0 %	0 %	527319885
4014	NC_021889	CTT	2	6	212200	212205	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527319885
4015	NC_021889	CAG	2	6	212210	212215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527319885
4016	NC_021889	TTG	2	6	212333	212338	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527319885
4017	NC_021889	TCC	2	6	212343	212348	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527319885
4018	NC_021889	AAG	2	6	212383	212388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527319885
4019	NC_021889	CTT	2	6	212389	212394	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527319885
4020	NC_021889	CTT	2	6	212416	212421	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527319885
4021	NC_021889	CTG	2	6	212475	212480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527319885
4022	NC_021889	CCA	2	6	212538	212543	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	527319885
4023	NC_021889	CAAA	2	8	212558	212565	75 %	0 %	0 %	25 %	527319885
4024	NC_021889	CCA	2	6	212577	212582	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	527319885
4025	NC_021889	GCA	2	6	212589	212594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527319885
4026	NC_021889	CAA	2	6	212602	212607	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527319885
4027	NC_021889	TAC	2	6	212653	212658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527319885
4028	NC_021889	CTT	2	6	212716	212721	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527319885
4029	NC_021889	TA	3	6	212842	212847	50 %	50 %	0 %	0 %	527319886
4030	NC_021889	ATG	2	6	212895	212900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527319886
4031	NC_021889	TGT	2	6	212903	212908	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527319886
4032	NC_021889	GC	3	6	212968	212973	0 %	0 %	50 %	50 %	527319886
4033	NC_021889	AGA	2	6	213030	213035	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527319886
4034	NC_021889	ATT	2	6	213045	213050	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527319886
4035	NC_021889	CTG	2	6	213197	213202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527319886
4036	NC_021889	CAC	2	6	213225	213230	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	527319886
4037	NC_021889	TCT	2	6	213295	213300	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527319886
4038	NC_021889	C	6	6	213339	213344	0 %	0 %	0 %	100 %	527319886
4039	NC_021889	ATGA	2	8	213345	213352	50 %	25 %	25 %	0 %	527319886
4040	NC_021889	T	6	6	213379	213384	0 %	100 %	0 %	0 %	527319886
4041	NC_021889	GCA	2	6	213467	213472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527319886
4042	NC_021889	GAA	2	6	213485	213490	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527319886
4043	NC_021889	GAAA	2	8	213538	213545	75 %	0 %	25 %	0 %	527319886
4044	NC_021889	TCA	2	6	213586	213591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527319886
4045	NC_021889	ATG	2	6	213601	213606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527319886
4046	NC_021889	TCC	2	6	213612	213617	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527319886
4047	NC_021889	T	6	6	213618	213623	0 %	100 %	0 %	0 %	527319886
4048	NC_021889	TAA	2	6	213698	213703	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527319886
4049	NC_021889	AGC	2	6	213744	213749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527319886
4050	NC_021889	GAT	2	6	213779	213784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527319886
4051	NC_021889	T	7	7	213921	213927	0 %	100 %	0 %	0 %	527319886
4052	NC_021889	AGA	2	6	214211	214216	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527319887
4053	NC_021889	AGT	2	6	214236	214241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527319887
4054	NC_021889	CTC	2	6	214295	214300	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527319887
4055	NC_021889	AAC	2	6	214309	214314	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527319887
4056	NC_021889	ACA	2	6	214335	214340	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527319887
4057	NC_021889	TC	3	6	214412	214417	0 %	50 %	0 %	50 %	527319887
4058	NC_021889	TTC	2	6	214418	214423	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527319887
4059	NC_021889	AAAG	2	8	214429	214436	75 %	0 %	25 %	0 %	527319887
4060	NC_021889	TAC	2	6	214451	214456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527319887
4061	NC_021889	TGC	2	6	214469	214474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527319887
4062	NC_021889	GAA	2	6	214518	214523	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527319887
4063	NC_021889	T	6	6	214553	214558	0 %	100 %	0 %	0 %	527319887
4064	NC_021889	TAA	2	6	214604	214609	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527319887
4065	NC_021889	TCT	2	6	214669	214674	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527319887
4066	NC_021889	GTC	2	6	214675	214680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527319887
4067	NC_021889	TCT	2	6	214714	214719	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527319887
4068	NC_021889	TTC	2	6	214767	214772	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527319887
4069	NC_021889	CTT	2	6	214823	214828	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527319887
4070	NC_021889	AAT	2	6	214902	214907	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527319887
4071	NC_021889	ATT	2	6	214989	214994	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527319887
4072	NC_021889	CTT	2	6	215012	215017	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527319887
4073	NC_021889	GTT	2	6	215023	215028	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527319887
4074	NC_021889	A	6	6	215043	215048	100 %	0 %	0 %	0 %	527319887
4075	NC_021889	TTCC	2	8	215077	215084	0 %	50 %	0 %	50 %	527319887
4076	NC_021889	TTC	2	6	215141	215146	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527319887
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4079	NC_021889	TA	3	6	215381	215386	50 %	50 %	0 %	0 %	527319887
4080	NC_021889	CTG	2	6	215423	215428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527319887
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4082	NC_021889	TCA	2	6	215467	215472	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527319887
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4086	NC_021889	AAC	2	6	216081	216086	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527319888
4087	NC_021889	C	6	6	216127	216132	0 %	0 %	0 %	100 %	527319888
4088	NC_021889	T	7	7	216149	216155	0 %	100 %	0 %	0 %	527319888
4089	NC_021889	A	6	6	216159	216164	100 %	0 %	0 %	0 %	527319888
4090	NC_021889	CTC	2	6	216174	216179	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527319888
4091	NC_021889	CGAA	2	8	216181	216188	50 %	0 %	25 %	25 %	527319888
4092	NC_021889	ATT	2	6	216196	216201	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527319888
4093	NC_021889	GCT	2	6	216281	216286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527319888
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4095	NC_021889	AACA	2	8	216348	216355	75 %	0 %	0 %	25 %	527319888
4096	NC_021889	TGTC	2	8	216375	216382	0 %	50 %	25 %	25 %	527319888
4097	NC_021889	ACG	2	6	216494	216499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527319888
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4100	NC_021889	CTT	2	6	216624	216629	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527319888
4101	NC_021889	CA	3	6	216633	216638	50 %	0 %	0 %	50 %	527319888
4102	NC_021889	GA	3	6	216660	216665	50 %	0 %	50 %	0 %	527319888
4103	NC_021889	TCT	2	6	216678	216683	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527319888
4104	NC_021889	TAGC	2	8	216726	216733	25 %	25 %	25 %	25 %	527319888
4105	NC_021889	C	6	6	216733	216738	0 %	0 %	0 %	100 %	527319888
4106	NC_021889	AAATA	2	10	216742	216751	80 %	20 %	0 %	0 %	527319888
4107	NC_021889	GAA	2	6	216756	216761	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527319888
4108	NC_021889	ACA	2	6	216823	216828	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527319888
4109	NC_021889	ACA	2	6	216842	216847	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527319888
4110	NC_021889	ACA	2	6	216857	216862	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527319888
4111	NC_021889	TAA	2	6	216867	216872	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527319888
4112	NC_021889	AAG	3	9	216894	216902	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527319888
4113	NC_021889	AGG	2	6	217000	217005	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527319888
4114	NC_021889	CAA	2	6	217259	217264	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527319889
4115	NC_021889	CT	3	6	217281	217286	0 %	50 %	0 %	50 %	527319889
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4117	NC_021889	T	7	7	217335	217341	0 %	100 %	0 %	0 %	527319889
4118	NC_021889	ATC	2	6	217343	217348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527319889
4119	NC_021889	CTT	2	6	217366	217371	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527319889
4120	NC_021889	ATT	2	6	217389	217394	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527319889
4121	NC_021889	GCA	2	6	217441	217446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527319889
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4123	NC_021889	CT	3	6	217517	217522	0 %	50 %	0 %	50 %	527319889
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4492	NC_021889	CTT	2	6	236726	236731	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527319905
4493	NC_021889	CTG	2	6	236732	236737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527319905
4494	NC_021889	T	6	6	236751	236756	0 %	100 %	0 %	0 %	527319905
4495	NC_021889	AAT	2	6	236817	236822	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527319905
4496	NC_021889	ATTA	2	8	236859	236866	50 %	50 %	0 %	0 %	527319905
4497	NC_021889	T	7	7	236917	236923	0 %	100 %	0 %	0 %	527319906
4498	NC_021889	AAT	2	6	236989	236994	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527319906
4499	NC_021889	TC	3	6	237113	237118	0 %	50 %	0 %	50 %	527319906
4500	NC_021889	AGA	2	6	237160	237165	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527319906

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