MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis RC-J/953

Total Repeats: 20283

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1002	NC_021889	TGG	2	6	55087	55092	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	527319744
1003	NC_021889	GGTTCA	2	12	55110	55121	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	527319744
1004	NC_021889	TTATC	2	10	55211	55220	20 %	60 %	0 %	20 %	527319744
1005	NC_021889	AGAA	2	8	55284	55291	75 %	0 %	25 %	0 %	527319744
1006	NC_021889	CTG	2	6	55306	55311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527319744
1007	NC_021889	GAG	2	6	55312	55317	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527319744
1008	NC_021889	AT	3	6	55556	55561	50 %	50 %	0 %	0 %	527319744
1009	NC_021889	TTA	2	6	55571	55576	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527319744
1010	NC_021889	CTGG	3	12	55849	55860	0 %	25 %	50 %	25 %	527319745
1011	NC_021889	ATT	2	6	55864	55869	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527319745
1012	NC_021889	GAT	2	6	55877	55882	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527319745
1013	NC_021889	TCT	2	6	55895	55900	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527319745
1014	NC_021889	TCC	2	6	55909	55914	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527319745
1015	NC_021889	TCC	2	6	55927	55932	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527319745
1016	NC_021889	TTA	2	6	55940	55945	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527319745
1017	NC_021889	TTGC	2	8	55983	55990	0 %	50 %	25 %	25 %	527319745
1018	NC_021889	AGCG	2	8	56023	56030	25 %	0 %	50 %	25 %	527319745
1019	NC_021889	T	6	6	56035	56040	0 %	100 %	0 %	0 %	527319745
1020	NC_021889	GTA	2	6	56066	56071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527319745
1021	NC_021889	GTT	2	6	56177	56182	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527319745
1022	NC_021889	GAT	2	6	56195	56200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527319745
1023	NC_021889	GTTGT	2	10	56276	56285	0 %	60 %	40 %	0 %	527319745
1024	NC_021889	T	6	6	56331	56336	0 %	100 %	0 %	0 %	527319745
1025	NC_021889	GAT	2	6	57628	57633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527319746
1026	NC_021889	TCC	2	6	57645	57650	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527319746
1027	NC_021889	GAG	2	6	57664	57669	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527319746
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1030	NC_021889	CTA	2	6	57793	57798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527319746
1031	NC_021889	CTG	2	6	57965	57970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527319746
1032	NC_021889	TGT	2	6	58032	58037	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527319746
1033	NC_021889	TTG	2	6	58070	58075	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527319746
1034	NC_021889	GAAA	2	8	58105	58112	75 %	0 %	25 %	0 %	527319746
1035	NC_021889	CT	3	6	58115	58120	0 %	50 %	0 %	50 %	527319746
1036	NC_021889	GTT	2	6	58124	58129	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527319746
1037	NC_021889	AGGT	2	8	58144	58151	25 %	25 %	50 %	0 %	527319746
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1041	NC_021889	CGTT	2	8	59302	59309	0 %	50 %	25 %	25 %	527319747
1042	NC_021889	GGAG	2	8	59311	59318	25 %	0 %	75 %	0 %	527319747
1043	NC_021889	GTAA	2	8	59363	59370	50 %	25 %	25 %	0 %	527319747
1044	NC_021889	TCCTAA	2	12	59430	59441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527319747
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1046	NC_021889	T	6	6	59491	59496	0 %	100 %	0 %	0 %	527319747
1047	NC_021889	AGC	2	6	59539	59544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527319747
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1049	NC_021889	GTC	2	6	59577	59582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527319747
1050	NC_021889	ATGG	2	8	59590	59597	25 %	25 %	50 %	0 %	527319747
1051	NC_021889	AGG	2	6	59624	59629	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527319747
1052	NC_021889	GA	3	6	59676	59681	50 %	0 %	50 %	0 %	527319747
1053	NC_021889	CAA	2	6	59699	59704	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527319747
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1055	NC_021889	GAGCA	2	10	59776	59785	40 %	0 %	40 %	20 %	527319747
1056	NC_021889	GT	3	6	59814	59819	0 %	50 %	50 %	0 %	527319747
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1061	NC_021889	T	7	7	60075	60081	0 %	100 %	0 %	0 %	527319747
1062	NC_021889	CTT	2	6	60125	60130	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527319747
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1065	NC_021889	ATGT	2	8	60186	60193	25 %	50 %	25 %	0 %	527319747
1066	NC_021889	CATT	2	8	60215	60222	25 %	50 %	0 %	25 %	527319747
1067	NC_021889	ATG	2	6	60236	60241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527319748
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1069	NC_021889	AGT	2	6	60297	60302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527319748
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1073	NC_021889	CTTT	2	8	60488	60495	0 %	75 %	0 %	25 %	527319748
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1097	NC_021889	GA	3	6	61587	61592	50 %	0 %	50 %	0 %	527319750
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1109	NC_021889	CTT	2	6	62519	62524	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527319750
1110	NC_021889	AAG	2	6	62553	62558	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527319750
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1113	NC_021889	TTA	2	6	62711	62716	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527319750
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1122	NC_021889	CT	4	8	63206	63213	0 %	50 %	0 %	50 %	527319750
1123	NC_021889	T	6	6	63225	63230	0 %	100 %	0 %	0 %	527319750
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1126	NC_021889	AG	3	6	63433	63438	50 %	0 %	50 %	0 %	527319750
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