MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis RC-J/953

Total Repeats: 20283

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_021889	TCA	2	6	261802	261807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527319932
5002	NC_021889	CT	3	6	261814	261819	0 %	50 %	0 %	50 %	527319932
5003	NC_021889	TCT	2	6	261840	261845	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527319932
5004	NC_021889	GT	3	6	261926	261931	0 %	50 %	50 %	0 %	527319932
5005	NC_021889	CTT	2	6	262003	262008	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527319932
5006	NC_021889	ATA	2	6	262023	262028	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527319932
5007	NC_021889	TCA	2	6	262053	262058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527319932
5008	NC_021889	AAC	2	6	262068	262073	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527319932
5009	NC_021889	TTG	2	6	262091	262096	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527319932
5010	NC_021889	CTA	2	6	262232	262237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527319933
5011	NC_021889	ACA	2	6	262238	262243	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527319933
5012	NC_021889	AGA	2	6	262302	262307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527319933
5013	NC_021889	GCT	2	6	262309	262314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527319933
5014	NC_021889	ATA	2	6	262387	262392	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527319933
5015	NC_021889	TGA	2	6	262405	262410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527319933
5016	NC_021889	GCA	2	6	262468	262473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527319933
5017	NC_021889	TCG	2	6	262482	262487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527319933
5018	NC_021889	CTT	2	6	262505	262510	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527319933
5019	NC_021889	TGA	2	6	262534	262539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527319933
5020	NC_021889	CCT	2	6	262576	262581	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527319933
5021	NC_021889	CAA	2	6	262667	262672	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527319933
5022	NC_021889	AC	3	6	262700	262705	50 %	0 %	0 %	50 %	527319933
5023	NC_021889	CA	3	6	262764	262769	50 %	0 %	0 %	50 %	527319933
5024	NC_021889	GCA	2	6	262891	262896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527319933
5025	NC_021889	ATACA	2	10	262934	262943	60 %	20 %	0 %	20 %	527319933
5026	NC_021889	GCC	2	6	262990	262995	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	527319933
5027	NC_021889	CTC	2	6	263019	263024	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527319933
5028	NC_021889	T	6	6	263093	263098	0 %	100 %	0 %	0 %	527319933
5029	NC_021889	TCATT	2	10	263334	263343	20 %	60 %	0 %	20 %	527319934
5030	NC_021889	A	6	6	263347	263352	100 %	0 %	0 %	0 %	527319934
5031	NC_021889	CAG	2	6	263376	263381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527319934
5032	NC_021889	A	6	6	263382	263387	100 %	0 %	0 %	0 %	527319934
5033	NC_021889	ATT	2	6	263398	263403	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527319934
5034	NC_021889	TC	3	6	263499	263504	0 %	50 %	0 %	50 %	527319934
5035	NC_021889	TTC	3	9	263542	263550	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527319934
5036	NC_021889	TTG	2	6	263559	263564	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527319934
5037	NC_021889	ACTT	2	8	263634	263641	25 %	50 %	0 %	25 %	527319934
5038	NC_021889	AGC	2	6	263691	263696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527319934
5039	NC_021889	TC	3	6	263839	263844	0 %	50 %	0 %	50 %	527319934
5040	NC_021889	TTG	2	6	263853	263858	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527319934
5041	NC_021889	GAA	2	6	263889	263894	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527319934
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5043	NC_021889	A	7	7	264295	264301	100 %	0 %	0 %	0 %	527319935
5044	NC_021889	TTCT	2	8	264348	264355	0 %	75 %	0 %	25 %	527319935
5045	NC_021889	GA	3	6	264410	264415	50 %	0 %	50 %	0 %	527319935
5046	NC_021889	TAAAA	2	10	264441	264450	80 %	20 %	0 %	0 %	527319935
5047	NC_021889	GTT	2	6	264465	264470	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527319935
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5050	NC_021889	AG	3	6	264598	264603	50 %	0 %	50 %	0 %	527319935
5051	NC_021889	ATT	2	6	264690	264695	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527319935
5052	NC_021889	TAC	2	6	264742	264747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527319935
5053	NC_021889	TCATAA	2	12	264768	264779	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	527319935
5054	NC_021889	AAG	2	6	264818	264823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527319935
5055	NC_021889	A	7	7	264840	264846	100 %	0 %	0 %	0 %	527319935
5056	NC_021889	CAA	2	6	264920	264925	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527319935
5057	NC_021889	ATC	2	6	264953	264958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527319935
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5059	NC_021889	GAGT	2	8	265325	265332	25 %	25 %	50 %	0 %	527319935
5060	NC_021889	TTAA	2	8	265357	265364	50 %	50 %	0 %	0 %	527319935
5061	NC_021889	ATG	2	6	265391	265396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527319935
5062	NC_021889	AAGTGT	2	12	265494	265505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527319935
5063	NC_021889	ATTT	2	8	265631	265638	25 %	75 %	0 %	0 %	527319935
5064	NC_021889	ATTT	2	8	265670	265677	25 %	75 %	0 %	0 %	527319935
5065	NC_021889	A	6	6	265696	265701	100 %	0 %	0 %	0 %	527319935
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5075	NC_021889	TCTA	2	8	266176	266183	25 %	50 %	0 %	25 %	527319935
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5101	NC_021889	ATCT	2	8	267013	267020	25 %	50 %	0 %	25 %	527319936
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5105	NC_021889	AAG	2	6	267136	267141	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527319936
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5113	NC_021889	CA	3	6	267391	267396	50 %	0 %	0 %	50 %	527319937
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5123	NC_021889	GAC	2	6	267912	267917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527319937
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5369	NC_021889	TCT	2	6	279305	279310	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527319945
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5475	NC_021889	TA	3	6	284688	284693	50 %	50 %	0 %	0 %	527319950
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5487	NC_021889	TCA	2	6	285234	285239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527319951
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