MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis RC-F(s)/852

Total Repeats: 20810

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_021888	GAT	2	6	163634	163639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527318883
3002	NC_021888	AAT	2	6	163664	163669	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527318883
3003	NC_021888	GAT	2	6	163752	163757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527318884
3004	NC_021888	TAT	2	6	163800	163805	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527318884
3005	NC_021888	TCAA	2	8	163810	163817	50 %	25 %	0 %	25 %	527318884
3006	NC_021888	CGA	2	6	163819	163824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527318884
3007	NC_021888	ATG	2	6	163840	163845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527318884
3008	NC_021888	TGT	2	6	163972	163977	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527318884
3009	NC_021888	T	7	7	164016	164022	0 %	100 %	0 %	0 %	527318884
3010	NC_021888	ATT	2	6	164036	164041	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527318884
3011	NC_021888	GAG	2	6	164239	164244	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527318884
3012	NC_021888	TTTC	2	8	164250	164257	0 %	75 %	0 %	25 %	527318884
3013	NC_021888	GGA	2	6	164337	164342	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527318884
3014	NC_021888	TCT	2	6	164358	164363	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527318884
3015	NC_021888	GCT	2	6	164370	164375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527318884
3016	NC_021888	A	8	8	164419	164426	100 %	0 %	0 %	0 %	527318884
3017	NC_021888	GGT	2	6	164513	164518	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	527318884
3018	NC_021888	GA	3	6	164530	164535	50 %	0 %	50 %	0 %	527318884
3019	NC_021888	GC	3	6	164546	164551	0 %	0 %	50 %	50 %	527318884
3020	NC_021888	GTC	2	6	164577	164582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527318884
3021	NC_021888	GGA	2	6	164690	164695	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527318884
3022	NC_021888	T	7	7	164755	164761	0 %	100 %	0 %	0 %	527318884
3023	NC_021888	A	8	8	164812	164819	100 %	0 %	0 %	0 %	527318884
3024	NC_021888	AGG	2	6	164855	164860	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527318884
3025	NC_021888	TTG	2	6	164878	164883	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527318884
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3027	NC_021888	TGT	2	6	164960	164965	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527318884
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3029	NC_021888	GA	3	6	165073	165078	50 %	0 %	50 %	0 %	527318884
3030	NC_021888	ATT	2	6	165092	165097	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527318884
3031	NC_021888	AT	3	6	165127	165132	50 %	50 %	0 %	0 %	527318884
3032	NC_021888	AGA	3	9	165143	165151	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527318884
3033	NC_021888	CTT	2	6	165331	165336	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527318884
3034	NC_021888	ATCG	2	8	165383	165390	25 %	25 %	25 %	25 %	527318884
3035	NC_021888	TTC	2	6	165396	165401	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527318884
3036	NC_021888	AG	3	6	165417	165422	50 %	0 %	50 %	0 %	527318884
3037	NC_021888	TCG	2	6	165428	165433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527318884
3038	NC_021888	TTCT	2	8	165457	165464	0 %	75 %	0 %	25 %	527318884
3039	NC_021888	G	6	6	165570	165575	0 %	0 %	100 %	0 %	527318884
3040	NC_021888	A	6	6	165645	165650	100 %	0 %	0 %	0 %	527318884
3041	NC_021888	ATT	2	6	165689	165694	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527318884
3042	NC_021888	CTTT	2	8	165862	165869	0 %	75 %	0 %	25 %	527318885
3043	NC_021888	TGT	2	6	165993	165998	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527318885
3044	NC_021888	A	6	6	166036	166041	100 %	0 %	0 %	0 %	527318885
3045	NC_021888	AT	3	6	166048	166053	50 %	50 %	0 %	0 %	527318885
3046	NC_021888	ATT	2	6	166078	166083	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527318885
3047	NC_021888	CAG	2	6	166213	166218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527318885
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3049	NC_021888	ATC	2	6	166250	166255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527318885
3050	NC_021888	CAA	2	6	166269	166274	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527318885
3051	NC_021888	AG	3	6	166363	166368	50 %	0 %	50 %	0 %	527318885
3052	NC_021888	ATC	2	6	166373	166378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527318885
3053	NC_021888	TCA	2	6	166419	166424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527318885
3054	NC_021888	TAG	2	6	166458	166463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527318885
3055	NC_021888	CAG	2	6	166492	166497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527318885
3056	NC_021888	TGT	2	6	166518	166523	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527318885
3057	NC_021888	AGC	2	6	166578	166583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527318885
3058	NC_021888	TTG	2	6	166621	166626	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527318885
3059	NC_021888	AGT	2	6	166723	166728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527318885
3060	NC_021888	GTG	2	6	166743	166748	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	527318885
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3062	NC_021888	CAAAA	2	10	166918	166927	80 %	0 %	0 %	20 %	527318885
3063	NC_021888	CT	3	6	166941	166946	0 %	50 %	0 %	50 %	527318885
3064	NC_021888	GCT	2	6	167011	167016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527318885
3065	NC_021888	CA	3	6	167040	167045	50 %	0 %	0 %	50 %	527318885
3066	NC_021888	CTT	2	6	167074	167079	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527318885
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3068	NC_021888	TTG	2	6	167150	167155	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527318885
3069	NC_021888	AAG	2	6	167204	167209	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527318885
3070	NC_021888	AG	3	6	167214	167219	50 %	0 %	50 %	0 %	527318885
3071	NC_021888	ACT	2	6	167239	167244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527318885
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3073	NC_021888	CTG	2	6	167390	167395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527318885
3074	NC_021888	CTG	2	6	167456	167461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527318885
3075	NC_021888	GTTT	2	8	167487	167494	0 %	75 %	25 %	0 %	527318885
3076	NC_021888	GA	3	6	167532	167537	50 %	0 %	50 %	0 %	527318885
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3078	NC_021888	A	6	6	167720	167725	100 %	0 %	0 %	0 %	527318885
3079	NC_021888	AAGAG	2	10	167751	167760	60 %	0 %	40 %	0 %	527318885
3080	NC_021888	AGCT	2	8	167780	167787	25 %	25 %	25 %	25 %	527318885
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3088	NC_021888	GATTG	2	10	168096	168105	20 %	40 %	40 %	0 %	527318885
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3090	NC_021888	AG	3	6	168153	168158	50 %	0 %	50 %	0 %	527318885
3091	NC_021888	GCT	2	6	168193	168198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527318885
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3094	NC_021888	GGT	2	6	168249	168254	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	527318885
3095	NC_021888	TCA	2	6	168264	168269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527318885
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3099	NC_021888	TC	3	6	168393	168398	0 %	50 %	0 %	50 %	527318885
3100	NC_021888	TCT	2	6	168428	168433	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527318885
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3102	NC_021888	AGTT	2	8	168563	168570	25 %	50 %	25 %	0 %	527318885
3103	NC_021888	GAA	2	6	168578	168583	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527318885
3104	NC_021888	AGA	2	6	168629	168634	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527318885
3105	NC_021888	AGC	2	6	168684	168689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527318885
3106	NC_021888	TTA	2	6	168691	168696	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527318885
3107	NC_021888	GCGG	2	8	168759	168766	0 %	0 %	75 %	25 %	527318885
3108	NC_021888	TAA	2	6	168780	168785	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527318885
3109	NC_021888	AAG	2	6	168793	168798	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527318885
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3111	NC_021888	GCTT	2	8	168934	168941	0 %	50 %	25 %	25 %	527318885
3112	NC_021888	TCA	2	6	169044	169049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527318885
3113	NC_021888	AGT	2	6	169068	169073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527318885
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3115	NC_021888	GA	3	6	169155	169160	50 %	0 %	50 %	0 %	527318885
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3118	NC_021888	ATA	2	6	169220	169225	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527318885
3119	NC_021888	CAG	2	6	169246	169251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527318885
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3121	NC_021888	AG	4	8	169358	169365	50 %	0 %	50 %	0 %	527318885
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3251	NC_021888	T	6	6	176183	176188	0 %	100 %	0 %	0 %	527318891
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3367	NC_021888	AAC	2	6	183104	183109	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527318894
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3492	NC_021888	ATC	2	6	197334	197339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527318902
3493	NC_021888	AAAC	2	8	197383	197390	75 %	0 %	0 %	25 %	527318903
3494	NC_021888	GGC	2	6	197448	197453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	527318903
3495	NC_021888	AGG	2	6	197469	197474	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527318903
3496	NC_021888	AAG	2	6	197621	197626	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527318903
3497	NC_021888	TA	3	6	197639	197644	50 %	50 %	0 %	0 %	527318903
3498	NC_021888	CTA	2	6	197646	197651	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527318903
3499	NC_021888	GT	3	6	197714	197719	0 %	50 %	50 %	0 %	527318903
3500	NC_021888	T	6	6	197767	197772	0 %	100 %	0 %	0 %	527318903

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