MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis RC-F(s)/852

Total Repeats: 20810

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_021888	GGAA	2	8	55057	55064	50 %	0 %	50 %	0 %	527318789
1002	NC_021888	GATCTG	2	12	55092	55103	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	527318789
1003	NC_021888	GTGTAA	2	12	55140	55151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527318789
1004	NC_021888	GCA	2	6	55154	55159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527318789
1005	NC_021888	GGTTCA	2	12	55229	55240	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	527318789
1006	NC_021888	TTATC	2	10	55330	55339	20 %	60 %	0 %	20 %	527318789
1007	NC_021888	GGA	2	6	55430	55435	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527318789
1008	NC_021888	TGC	2	6	55465	55470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527318789
1009	NC_021888	GTA	2	6	55508	55513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527318789
1010	NC_021888	GAGT	2	8	55626	55633	25 %	25 %	50 %	0 %	527318789
1011	NC_021888	AT	3	6	55675	55680	50 %	50 %	0 %	0 %	527318789
1012	NC_021888	TTA	2	6	55690	55695	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527318789
1013	NC_021888	CTGG	3	12	55968	55979	0 %	25 %	50 %	25 %	527318790
1014	NC_021888	ATT	2	6	55983	55988	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527318790
1015	NC_021888	GAT	2	6	55996	56001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527318790
1016	NC_021888	TCT	2	6	56014	56019	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527318790
1017	NC_021888	TCC	2	6	56049	56054	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527318790
1018	NC_021888	TTA	2	6	56062	56067	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527318790
1019	NC_021888	TTGC	2	8	56105	56112	0 %	50 %	25 %	25 %	527318790
1020	NC_021888	CGAG	2	8	56147	56154	25 %	0 %	50 %	25 %	527318790
1021	NC_021888	T	6	6	56157	56162	0 %	100 %	0 %	0 %	527318790
1022	NC_021888	GTA	2	6	56188	56193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527318790
1023	NC_021888	GTT	2	6	56299	56304	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527318790
1024	NC_021888	AG	3	6	56311	56316	50 %	0 %	50 %	0 %	527318790
1025	NC_021888	TGG	2	6	56319	56324	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	527318790
1026	NC_021888	GTTGT	2	10	56398	56407	0 %	60 %	40 %	0 %	527318790
1027	NC_021888	T	6	6	56453	56458	0 %	100 %	0 %	0 %	527318790
1028	NC_021888	AGA	2	6	57841	57846	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527318791
1029	NC_021888	CAT	2	6	57939	57944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527318791
1030	NC_021888	CTG	2	6	58032	58037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527318791
1031	NC_021888	TGT	2	6	58099	58104	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527318791
1032	NC_021888	TTG	2	6	58137	58142	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527318791
1033	NC_021888	GAAA	2	8	58172	58179	75 %	0 %	25 %	0 %	527318791
1034	NC_021888	CT	3	6	58182	58187	0 %	50 %	0 %	50 %	527318791
1035	NC_021888	AGGT	2	8	58211	58218	25 %	25 %	50 %	0 %	527318791
1036	NC_021888	AGA	2	6	59170	59175	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527318792
1037	NC_021888	TCT	2	6	59186	59191	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527318792
1038	NC_021888	T	6	6	59218	59223	0 %	100 %	0 %	0 %	527318792
1039	NC_021888	CGTT	2	8	59369	59376	0 %	50 %	25 %	25 %	527318792
1040	NC_021888	GGAG	2	8	59378	59385	25 %	0 %	75 %	0 %	527318792
1041	NC_021888	GTAA	2	8	59430	59437	50 %	25 %	25 %	0 %	527318792
1042	NC_021888	TCCTAA	2	12	59497	59508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527318792
1043	NC_021888	AGT	2	6	59526	59531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527318792
1044	NC_021888	T	6	6	59558	59563	0 %	100 %	0 %	0 %	527318792
1045	NC_021888	AGC	2	6	59606	59611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527318792
1046	NC_021888	GCT	2	6	59618	59623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527318792
1047	NC_021888	GTC	2	6	59644	59649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527318792
1048	NC_021888	ATGG	2	8	59657	59664	25 %	25 %	50 %	0 %	527318792
1049	NC_021888	AGG	2	6	59691	59696	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527318792
1050	NC_021888	GA	3	6	59743	59748	50 %	0 %	50 %	0 %	527318792
1051	NC_021888	CAA	2	6	59766	59771	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527318792
1052	NC_021888	ATAA	2	8	59803	59810	75 %	25 %	0 %	0 %	527318792
1053	NC_021888	GAGCA	2	10	59843	59852	40 %	0 %	40 %	20 %	527318792
1054	NC_021888	GT	3	6	59881	59886	0 %	50 %	50 %	0 %	527318792
1055	NC_021888	TAG	2	6	59893	59898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527318792
1056	NC_021888	AAG	2	6	60078	60083	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527318792
1057	NC_021888	AAC	2	6	60123	60128	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527318792
1058	NC_021888	T	7	7	60142	60148	0 %	100 %	0 %	0 %	527318792
1059	NC_021888	CTT	2	6	60192	60197	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527318792
1060	NC_021888	AAT	2	6	60222	60227	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527318792
1061	NC_021888	TTC	2	6	60233	60238	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527318792
1062	NC_021888	ATGT	2	8	60253	60260	25 %	50 %	25 %	0 %	527318792
1063	NC_021888	CATT	2	8	60282	60289	25 %	50 %	0 %	25 %	527318792
1064	NC_021888	ATG	2	6	60303	60308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527318793
1065	NC_021888	CCT	2	6	60309	60314	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527318793
1066	NC_021888	AGT	2	6	60364	60369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527318793
1067	NC_021888	TCT	2	6	60387	60392	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527318793
1068	NC_021888	TCA	2	6	60399	60404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527318793
1069	NC_021888	TTC	2	6	60520	60525	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527318793
1070	NC_021888	CTTT	2	8	60555	60562	0 %	75 %	0 %	25 %	527318793
1071	NC_021888	TTCT	2	8	60578	60585	0 %	75 %	0 %	25 %	527318793
1072	NC_021888	TTC	2	6	60617	60622	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527318793
1073	NC_021888	TC	3	6	60629	60634	0 %	50 %	0 %	50 %	527318793
1074	NC_021888	T	6	6	60641	60646	0 %	100 %	0 %	0 %	527318793
1075	NC_021888	T	7	7	60701	60707	0 %	100 %	0 %	0 %	527318793
1076	NC_021888	CAGA	2	8	60815	60822	50 %	0 %	25 %	25 %	527318794
1077	NC_021888	GA	3	6	60857	60862	50 %	0 %	50 %	0 %	527318794
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1082	NC_021888	A	6	6	61248	61253	100 %	0 %	0 %	0 %	527318795
1083	NC_021888	CA	3	6	61255	61260	50 %	0 %	0 %	50 %	527318795
1084	NC_021888	TGA	2	6	61267	61272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527318795
1085	NC_021888	TTA	2	6	61280	61285	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527318795
1086	NC_021888	TCA	2	6	61320	61325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527318795
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1090	NC_021888	CTT	2	6	61384	61389	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527318795
1091	NC_021888	ATT	2	6	61394	61399	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527318795
1092	NC_021888	AT	3	6	61505	61510	50 %	50 %	0 %	0 %	527318795
1093	NC_021888	GA	3	6	61528	61533	50 %	0 %	50 %	0 %	527318795
1094	NC_021888	TTC	2	6	61555	61560	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527318795
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1096	NC_021888	GA	3	6	61654	61659	50 %	0 %	50 %	0 %	527318795
1097	NC_021888	ATG	2	6	61896	61901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527318795
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1101	NC_021888	ATG	2	6	62196	62201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527318795
1102	NC_021888	TGTGA	2	10	62292	62301	20 %	40 %	40 %	0 %	527318795
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1105	NC_021888	ATT	2	6	62411	62416	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527318795
1106	NC_021888	CGA	2	6	62459	62464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527318795
1107	NC_021888	GA	3	6	62469	62474	50 %	0 %	50 %	0 %	527318795
1108	NC_021888	CTT	2	6	62586	62591	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527318795
1109	NC_021888	AAG	2	6	62620	62625	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527318795
1110	NC_021888	TTA	2	6	62697	62702	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527318795
1111	NC_021888	GA	3	6	62728	62733	50 %	0 %	50 %	0 %	527318795
1112	NC_021888	TTA	2	6	62778	62783	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527318795
1113	NC_021888	AAG	2	6	62785	62790	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527318795
1114	NC_021888	TC	3	6	62884	62889	0 %	50 %	0 %	50 %	527318795
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1116	NC_021888	AT	3	6	63065	63070	50 %	50 %	0 %	0 %	527318795
1117	NC_021888	TTC	2	6	63071	63076	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527318795
1118	NC_021888	GTT	2	6	63210	63215	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527318795
1119	NC_021888	CTTC	2	8	63216	63223	0 %	50 %	0 %	50 %	527318795
1120	NC_021888	AG	3	6	63265	63270	50 %	0 %	50 %	0 %	527318795
1121	NC_021888	CT	4	8	63273	63280	0 %	50 %	0 %	50 %	527318795
1122	NC_021888	T	6	6	63292	63297	0 %	100 %	0 %	0 %	527318795
1123	NC_021888	GTTCTT	2	12	63411	63422	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	527318795
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1125	NC_021888	AG	3	6	63500	63505	50 %	0 %	50 %	0 %	527318795
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