MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis RC-F(s)/852

Total Repeats: 20810

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_021888	GAA	2	6	28646	28651	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527318762
502	NC_021888	TGA	2	6	28660	28665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527318762
503	NC_021888	TTC	2	6	28693	28698	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527318762
504	NC_021888	GC	4	8	28864	28871	0 %	0 %	50 %	50 %	527318762
505	NC_021888	AAG	2	6	28872	28877	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527318762
506	NC_021888	TA	3	6	28986	28991	50 %	50 %	0 %	0 %	527318762
507	NC_021888	GAA	2	6	29075	29080	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527318762
508	NC_021888	TGT	2	6	29107	29112	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527318763
509	NC_021888	TCT	2	6	29175	29180	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527318763
510	NC_021888	ACA	2	6	29403	29408	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527318763
511	NC_021888	ATG	2	6	29413	29418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527318763
512	NC_021888	CTTT	2	8	29555	29562	0 %	75 %	0 %	25 %	527318763
513	NC_021888	TTTG	2	8	29570	29577	0 %	75 %	25 %	0 %	527318763
514	NC_021888	TTGT	2	8	29605	29612	0 %	75 %	25 %	0 %	527318763
515	NC_021888	CCTAT	2	10	29624	29633	20 %	40 %	0 %	40 %	527318763
516	NC_021888	T	6	6	29640	29645	0 %	100 %	0 %	0 %	527318763
517	NC_021888	ATC	2	6	29719	29724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527318763
518	NC_021888	TGGC	2	8	29768	29775	0 %	25 %	50 %	25 %	527318763
519	NC_021888	T	8	8	29874	29881	0 %	100 %	0 %	0 %	527318763
520	NC_021888	ATG	2	6	29899	29904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527318763
521	NC_021888	GA	3	6	29937	29942	50 %	0 %	50 %	0 %	527318763
522	NC_021888	AG	3	6	30035	30040	50 %	0 %	50 %	0 %	527318764
523	NC_021888	GTT	2	6	30116	30121	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527318764
524	NC_021888	GAA	2	6	30125	30130	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527318764
525	NC_021888	TC	3	6	30144	30149	0 %	50 %	0 %	50 %	527318764
526	NC_021888	TCT	2	6	30191	30196	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527318764
527	NC_021888	ACT	2	6	30281	30286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527318764
528	NC_021888	TTC	2	6	30309	30314	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527318764
529	NC_021888	AAAG	2	8	30328	30335	75 %	0 %	25 %	0 %	527318764
530	NC_021888	CCT	2	6	30345	30350	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527318764
531	NC_021888	AAAC	2	8	30398	30405	75 %	0 %	0 %	25 %	527318764
532	NC_021888	T	6	6	30415	30420	0 %	100 %	0 %	0 %	527318764
533	NC_021888	GAAGG	2	10	30423	30432	40 %	0 %	60 %	0 %	527318764
534	NC_021888	GGC	2	6	30451	30456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	527318764
535	NC_021888	GAT	2	6	30530	30535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527318764
536	NC_021888	GATG	2	8	30541	30548	25 %	25 %	50 %	0 %	527318764
537	NC_021888	TAG	2	6	30552	30557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527318764
538	NC_021888	GTT	2	6	30626	30631	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527318764
539	NC_021888	TAA	2	6	30736	30741	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527318764
540	NC_021888	GA	3	6	30765	30770	50 %	0 %	50 %	0 %	527318764
541	NC_021888	GAA	2	6	30875	30880	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527318764
542	NC_021888	AGA	2	6	30895	30900	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527318764
543	NC_021888	TCG	2	6	30958	30963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527318764
544	NC_021888	ATG	2	6	30992	30997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527318764
545	NC_021888	TGG	2	6	31006	31011	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	527318764
546	NC_021888	GAA	2	6	31037	31042	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527318764
547	NC_021888	ATT	2	6	31073	31078	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527318764
548	NC_021888	ATG	2	6	31196	31201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527318764
549	NC_021888	AAG	2	6	31208	31213	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527318764
550	NC_021888	T	6	6	31214	31219	0 %	100 %	0 %	0 %	527318764
551	NC_021888	GA	3	6	31233	31238	50 %	0 %	50 %	0 %	527318764
552	NC_021888	A	7	7	31256	31262	100 %	0 %	0 %	0 %	527318764
553	NC_021888	ACA	2	6	31302	31307	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527318765
554	NC_021888	TGT	2	6	31323	31328	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527318765
555	NC_021888	AT	3	6	31374	31379	50 %	50 %	0 %	0 %	527318765
556	NC_021888	T	6	6	31442	31447	0 %	100 %	0 %	0 %	527318765
557	NC_021888	GAGCT	2	10	31463	31472	20 %	20 %	40 %	20 %	527318765
558	NC_021888	A	6	6	31537	31542	100 %	0 %	0 %	0 %	527318765
559	NC_021888	A	6	6	31568	31573	100 %	0 %	0 %	0 %	527318765
560	NC_021888	TGC	2	6	31596	31601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527318765
561	NC_021888	AGC	2	6	31614	31619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527318765
562	NC_021888	TC	3	6	31659	31664	0 %	50 %	0 %	50 %	527318766
563	NC_021888	AAG	2	6	31863	31868	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527318766
564	NC_021888	AAG	2	6	31870	31875	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527318766
565	NC_021888	CTT	2	6	31909	31914	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527318766
566	NC_021888	CGT	2	6	31940	31945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527318766
567	NC_021888	TGA	2	6	31986	31991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527318766
568	NC_021888	GAG	2	6	32017	32022	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527318766
569	NC_021888	GCG	2	6	32059	32064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	527318766
570	NC_021888	CT	3	6	32139	32144	0 %	50 %	0 %	50 %	527318766
571	NC_021888	AGA	2	6	32237	32242	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527318766
572	NC_021888	AG	3	6	32271	32276	50 %	0 %	50 %	0 %	527318766
573	NC_021888	AAG	2	6	32425	32430	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527318766
574	NC_021888	ATT	2	6	32475	32480	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527318766
575	NC_021888	T	6	6	32580	32585	0 %	100 %	0 %	0 %	527318766
576	NC_021888	GGA	2	6	32605	32610	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527318766
577	NC_021888	AGG	2	6	32830	32835	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527318767
578	NC_021888	GGT	2	6	32885	32890	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	527318767
579	NC_021888	GCT	2	6	33047	33052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527318767
580	NC_021888	GCT	2	6	33080	33085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527318767
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583	NC_021888	TGT	2	6	33285	33290	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527318768
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586	NC_021888	GTT	2	6	33424	33429	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527318768
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589	NC_021888	T	6	6	33519	33524	0 %	100 %	0 %	0 %	527318768
590	NC_021888	GTT	2	6	33537	33542	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527318768
591	NC_021888	TGA	2	6	33644	33649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527318768
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593	NC_021888	CAT	2	6	33751	33756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527318768
594	NC_021888	TC	3	6	33767	33772	0 %	50 %	0 %	50 %	527318768
595	NC_021888	AG	3	6	33780	33785	50 %	0 %	50 %	0 %	527318768
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597	NC_021888	ACA	2	6	33894	33899	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527318769
598	NC_021888	AG	3	6	33918	33923	50 %	0 %	50 %	0 %	527318769
599	NC_021888	GTC	2	6	33950	33955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527318769
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602	NC_021888	TTA	2	6	34079	34084	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527318769
603	NC_021888	TGAT	2	8	34144	34151	25 %	50 %	25 %	0 %	527318769
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607	NC_021888	AAGA	3	12	34272	34283	75 %	0 %	25 %	0 %	527318769
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610	NC_021888	ATG	2	6	34342	34347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527318769
611	NC_021888	AAG	2	6	34373	34378	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527318769
612	NC_021888	GAA	2	6	34392	34397	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527318769
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614	NC_021888	GTTC	2	8	34525	34532	0 %	50 %	25 %	25 %	527318770
615	NC_021888	GAT	2	6	34603	34608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527318770
616	NC_021888	AG	3	6	34611	34616	50 %	0 %	50 %	0 %	527318770
617	NC_021888	GA	4	8	34634	34641	50 %	0 %	50 %	0 %	527318770
618	NC_021888	AGA	2	6	34669	34674	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527318770
619	NC_021888	TTA	2	6	34732	34737	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527318771
620	NC_021888	TGA	2	6	34865	34870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527318771
621	NC_021888	GGCA	2	8	34904	34911	25 %	0 %	50 %	25 %	527318771
622	NC_021888	GAA	2	6	34964	34969	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527318771
623	NC_021888	ATC	2	6	35014	35019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527318771
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625	NC_021888	TGT	2	6	35132	35137	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527318771
626	NC_021888	TCGA	2	8	35161	35168	25 %	25 %	25 %	25 %	527318771
627	NC_021888	GAG	2	6	35173	35178	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527318771
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