MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis RC-F(s)/852

Total Repeats: 20810

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_021888	AAAG	2	8	323176	323183	75 %	0 %	25 %	0 %	527319020
6002	NC_021888	CGT	2	6	323228	323233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527319020
6003	NC_021888	TCCT	2	8	323273	323280	0 %	50 %	0 %	50 %	527319020
6004	NC_021888	GCA	2	6	323320	323325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527319020
6005	NC_021888	GGA	2	6	323345	323350	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527319020
6006	NC_021888	GAT	2	6	323410	323415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527319020
6007	NC_021888	TCC	2	6	323422	323427	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527319020
6008	NC_021888	CGC	2	6	323477	323482	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	527319020
6009	NC_021888	TGTGT	2	10	323489	323498	0 %	60 %	40 %	0 %	527319020
6010	NC_021888	TGA	2	6	323503	323508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527319020
6011	NC_021888	CAT	3	9	323611	323619	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527319020
6012	NC_021888	GTG	2	6	323658	323663	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	527319020
6013	NC_021888	TGC	2	6	323722	323727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527319020
6014	NC_021888	AAG	2	6	323732	323737	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527319020
6015	NC_021888	AAG	2	6	323799	323804	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527319020
6016	NC_021888	TAA	2	6	323833	323838	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527319020
6017	NC_021888	GGA	2	6	323971	323976	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527319020
6018	NC_021888	AAG	2	6	324015	324020	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527319020
6019	NC_021888	CG	4	8	324032	324039	0 %	0 %	50 %	50 %	527319020
6020	NC_021888	AGA	2	6	324046	324051	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527319020
6021	NC_021888	GTT	2	6	324056	324061	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527319020
6022	NC_021888	AGA	3	9	324070	324078	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527319020
6023	NC_021888	TGA	2	6	324130	324135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527319020
6024	NC_021888	CTC	3	9	324155	324163	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527319021
6025	NC_021888	TAAAG	2	10	324376	324385	60 %	20 %	20 %	0 %	527319021
6026	NC_021888	GAT	2	6	324386	324391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527319021
6027	NC_021888	TCC	2	6	324462	324467	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527319021
6028	NC_021888	TAA	2	6	324499	324504	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527319021
6029	NC_021888	TGT	2	6	324532	324537	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527319021
6030	NC_021888	AAT	2	6	324549	324554	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527319021
6031	NC_021888	T	7	7	324636	324642	0 %	100 %	0 %	0 %	527319021
6032	NC_021888	CTT	2	6	324662	324667	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527319021
6033	NC_021888	CTC	2	6	324812	324817	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527319021
6034	NC_021888	AAT	2	6	324821	324826	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527319021
6035	NC_021888	A	6	6	324838	324843	100 %	0 %	0 %	0 %	527319021
6036	NC_021888	CTT	2	6	324864	324869	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527319021
6037	NC_021888	TAA	2	6	324873	324878	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527319021
6038	NC_021888	ATGGA	2	10	325001	325010	40 %	20 %	40 %	0 %	527319021
6039	NC_021888	CAA	2	6	325106	325111	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527319021
6040	NC_021888	CTT	2	6	325128	325133	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527319021
6041	NC_021888	CAA	2	6	325145	325150	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527319021
6042	NC_021888	CTC	2	6	325163	325168	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527319021
6043	NC_021888	CAA	2	6	325178	325183	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527319021
6044	NC_021888	CAT	2	6	325252	325257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527319022
6045	NC_021888	A	7	7	325264	325270	100 %	0 %	0 %	0 %	527319022
6046	NC_021888	A	7	7	325278	325284	100 %	0 %	0 %	0 %	527319022
6047	NC_021888	GCC	2	6	325297	325302	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	527319022
6048	NC_021888	TCAAT	2	10	325333	325342	40 %	40 %	0 %	20 %	527319022
6049	NC_021888	A	9	9	325348	325356	100 %	0 %	0 %	0 %	527319022
6050	NC_021888	A	7	7	325379	325385	100 %	0 %	0 %	0 %	527319022
6051	NC_021888	TAT	2	6	325393	325398	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527319022
6052	NC_021888	ATA	2	6	325402	325407	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527319022
6053	NC_021888	TCA	2	6	325451	325456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527319023
6054	NC_021888	GAG	2	6	325612	325617	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527319023
6055	NC_021888	TGG	2	6	325640	325645	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	527319023
6056	NC_021888	TGC	2	6	325649	325654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527319023
6057	NC_021888	CCA	2	6	325678	325683	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	527319023
6058	NC_021888	A	6	6	325697	325702	100 %	0 %	0 %	0 %	527319023
6059	NC_021888	AAAACA	2	12	325718	325729	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	527319023
6060	NC_021888	AGA	2	6	325733	325738	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527319023
6061	NC_021888	A	8	8	325873	325880	100 %	0 %	0 %	0 %	527319023
6062	NC_021888	AAG	2	6	325888	325893	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527319023
6063	NC_021888	CT	4	8	325962	325969	0 %	50 %	0 %	50 %	527319023
6064	NC_021888	GAG	2	6	325996	326001	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527319023
6065	NC_021888	CTC	2	6	326029	326034	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527319023
6066	NC_021888	GGT	2	6	326100	326105	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	527319023
6067	NC_021888	T	6	6	326107	326112	0 %	100 %	0 %	0 %	527319023
6068	NC_021888	TA	3	6	326152	326157	50 %	50 %	0 %	0 %	527319023
6069	NC_021888	GCT	2	6	326202	326207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527319023
6070	NC_021888	ATC	2	6	326211	326216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527319023
6071	NC_021888	TTC	2	6	326218	326223	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527319023
6072	NC_021888	GCCT	2	8	326230	326237	0 %	25 %	25 %	50 %	527319023
6073	NC_021888	A	6	6	326362	326367	100 %	0 %	0 %	0 %	527319023
6074	NC_021888	GAGC	2	8	326468	326475	25 %	0 %	50 %	25 %	527319023
6075	NC_021888	CTT	2	6	326477	326482	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527319023
6076	NC_021888	AT	3	6	326536	326541	50 %	50 %	0 %	0 %	527319023
6077	NC_021888	TAA	2	6	326555	326560	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527319023
6078	NC_021888	ACA	2	6	326567	326572	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527319023
6079	NC_021888	CTTA	2	8	326608	326615	25 %	50 %	0 %	25 %	527319023
6080	NC_021888	TAA	2	6	326627	326632	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527319023
6081	NC_021888	CGA	2	6	326633	326638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527319023
6082	NC_021888	TAAA	2	8	326710	326717	75 %	25 %	0 %	0 %	527319023
6083	NC_021888	ACG	2	6	326738	326743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527319023
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6086	NC_021888	CTC	2	6	326880	326885	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527319023
6087	NC_021888	AGA	2	6	326888	326893	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527319023
6088	NC_021888	GGC	2	6	326957	326962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	527319023
6089	NC_021888	ATG	2	6	327027	327032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527319023
6090	NC_021888	AC	3	6	327057	327062	50 %	0 %	0 %	50 %	527319023
6091	NC_021888	CT	3	6	327078	327083	0 %	50 %	0 %	50 %	527319023
6092	NC_021888	ACA	2	6	327089	327094	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527319023
6093	NC_021888	CCT	4	12	327228	327239	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527319024
6094	NC_021888	GAG	2	6	327246	327251	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527319024
6095	NC_021888	ACC	2	6	327318	327323	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	527319024
6096	NC_021888	TACA	2	8	327328	327335	50 %	25 %	0 %	25 %	527319024
6097	NC_021888	AAG	2	6	327370	327375	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527319024
6098	NC_021888	GAA	2	6	327396	327401	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527319024
6099	NC_021888	TGA	2	6	327414	327419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527319024
6100	NC_021888	TAT	2	6	327445	327450	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527319024
6101	NC_021888	TTGG	2	8	327501	327508	0 %	50 %	50 %	0 %	527319024
6102	NC_021888	TCA	2	6	327537	327542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527319024
6103	NC_021888	CAT	2	6	327676	327681	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527319024
6104	NC_021888	TCT	2	6	327768	327773	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527319024
6105	NC_021888	TCT	2	6	327804	327809	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527319024
6106	NC_021888	AGC	3	9	327827	327835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527319024
6107	NC_021888	TGC	2	6	327839	327844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527319024
6108	NC_021888	TTC	2	6	327860	327865	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527319024
6109	NC_021888	CTTT	2	8	327908	327915	0 %	75 %	0 %	25 %	527319024
6110	NC_021888	ATC	2	6	327917	327922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527319024
6111	NC_021888	TTCT	2	8	327953	327960	0 %	75 %	0 %	25 %	527319024
6112	NC_021888	T	6	6	327980	327985	0 %	100 %	0 %	0 %	527319024
6113	NC_021888	ACT	2	6	327999	328004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527319024
6114	NC_021888	T	6	6	328034	328039	0 %	100 %	0 %	0 %	527319024
6115	NC_021888	GCT	2	6	328051	328056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527319024
6116	NC_021888	AAGAA	2	10	328090	328099	80 %	0 %	20 %	0 %	527319024
6117	NC_021888	AAG	2	6	328114	328119	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527319024
6118	NC_021888	T	7	7	328150	328156	0 %	100 %	0 %	0 %	527319024
6119	NC_021888	T	6	6	328163	328168	0 %	100 %	0 %	0 %	527319024
6120	NC_021888	TAG	2	6	328231	328236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527319024
6121	NC_021888	CAT	2	6	328331	328336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527319024
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6123	NC_021888	AAG	2	6	328584	328589	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527319025
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6245	NC_021888	A	6	6	334643	334648	100 %	0 %	0 %	0 %	527319032
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6495	NC_021888	T	6	6	347983	347988	0 %	100 %	0 %	0 %	527319041
6496	NC_021888	ATCA	2	8	348014	348021	50 %	25 %	0 %	25 %	527319041
6497	NC_021888	GTTC	2	8	348029	348036	0 %	50 %	25 %	25 %	527319041
6498	NC_021888	ACC	2	6	348239	348244	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	527319041
6499	NC_021888	TA	3	6	348397	348402	50 %	50 %	0 %	0 %	527319041
6500	NC_021888	TTC	2	6	348478	348483	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527319042

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