MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Chlamydia trachomatis RC-L2(s)/46

Total Repeats: 651

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021887	TGTGA	2	10	3281	3290	20 %	40 %	40 %	0 %	527317815
2	NC_021887	TTGAA	2	10	3637	3646	40 %	40 %	20 %	0 %	527317816
3	NC_021887	GAGAA	2	10	3931	3940	60 %	0 %	40 %	0 %	527317816
4	NC_021887	GAAAA	2	10	4368	4377	80 %	0 %	20 %	0 %	527317816
5	NC_021887	TTACA	2	10	4523	4532	40 %	40 %	0 %	20 %	527317816
6	NC_021887	GTCTT	2	10	5219	5228	0 %	60 %	20 %	20 %	527317817
7	NC_021887	TGGTA	2	10	7692	7701	20 %	40 %	40 %	0 %	527317820
8	NC_021887	CGAAA	2	10	9100	9109	60 %	0 %	20 %	20 %	527317821
9	NC_021887	GGCTG	2	10	9736	9745	0 %	20 %	60 %	20 %	527317822
10	NC_021887	CCTCT	2	10	10528	10537	0 %	40 %	0 %	60 %	527317823
11	NC_021887	AAAGG	2	10	10687	10696	60 %	0 %	40 %	0 %	527317823
12	NC_021887	AAGAA	2	10	11807	11816	80 %	0 %	20 %	0 %	527317824
13	NC_021887	AAAGA	2	10	13205	13214	80 %	0 %	20 %	0 %	527317825
14	NC_021887	GGTGT	2	10	13309	13318	0 %	40 %	60 %	0 %	527317825
15	NC_021887	GATTT	2	10	15052	15061	20 %	60 %	20 %	0 %	527317827
16	NC_021887	CGTTC	2	10	16163	16172	0 %	40 %	20 %	40 %	527317828
17	NC_021887	GCTTC	2	10	16536	16545	0 %	40 %	20 %	40 %	527317828
18	NC_021887	GAAGG	2	10	16907	16916	40 %	0 %	60 %	0 %	527317828
19	NC_021887	GTTGT	2	10	20333	20342	0 %	60 %	40 %	0 %	527317831
20	NC_021887	AAGAT	2	10	21445	21454	60 %	20 %	20 %	0 %	527317832
21	NC_021887	TTTGC	2	10	22056	22065	0 %	60 %	20 %	20 %	527317832
22	NC_021887	GGAAA	2	10	23810	23819	60 %	0 %	40 %	0 %	527317832
23	NC_021887	AGAGG	2	10	25534	25543	40 %	0 %	60 %	0 %	527317833
24	NC_021887	GGAGA	2	10	27313	27322	40 %	0 %	60 %	0 %	527317834
25	NC_021887	GGATA	2	10	27339	27348	40 %	20 %	40 %	0 %	527317834
26	NC_021887	ATCCG	2	10	28064	28073	20 %	20 %	20 %	40 %	527317836
27	NC_021887	AGGGT	2	10	28582	28591	20 %	20 %	60 %	0 %	527317836
28	NC_021887	CCTAT	2	10	29622	29631	20 %	40 %	0 %	40 %	527317837
29	NC_021887	GAAGG	2	10	30421	30430	40 %	0 %	60 %	0 %	527317838
30	NC_021887	GAGCT	2	10	31461	31470	20 %	20 %	40 %	20 %	527317839
31	NC_021887	CTATT	2	10	36135	36144	20 %	60 %	0 %	20 %	527317845
32	NC_021887	TCCTA	2	10	36182	36191	20 %	40 %	0 %	40 %	527317845
33	NC_021887	ACGAT	2	10	38097	38106	40 %	20 %	20 %	20 %	527317846
34	NC_021887	AATTT	2	10	38988	38997	40 %	60 %	0 %	0 %	527317847
35	NC_021887	AGCAA	2	10	42112	42121	60 %	0 %	20 %	20 %	527317849
36	NC_021887	CGATG	2	10	42169	42178	20 %	20 %	40 %	20 %	527317849
37	NC_021887	TTTAT	2	10	44172	44181	20 %	80 %	0 %	0 %	527317853
38	NC_021887	CTTTC	2	10	46267	46276	0 %	60 %	0 %	40 %	527317855
39	NC_021887	AGTTT	2	10	46806	46815	20 %	60 %	20 %	0 %	527317855
40	NC_021887	CTATT	2	10	49523	49532	20 %	60 %	0 %	20 %	527317858
41	NC_021887	CTTTT	2	10	49974	49983	0 %	80 %	0 %	20 %	527317859
42	NC_021887	CCGTA	2	10	53808	53817	20 %	20 %	20 %	40 %	527317862
43	NC_021887	TTATC	2	10	55211	55220	20 %	60 %	0 %	20 %	527317863
44	NC_021887	GTTGT	2	10	56276	56285	0 %	60 %	40 %	0 %	527317864
45	NC_021887	GAGCA	2	10	59776	59785	40 %	0 %	40 %	20 %	527317866
46	NC_021887	TGTGA	2	10	62225	62234	20 %	40 %	40 %	0 %	527317869
47	NC_021887	AGTGA	2	10	63746	63755	40 %	20 %	40 %	0 %	527317870
48	NC_021887	CCTTC	2	10	64020	64029	0 %	40 %	0 %	60 %	527317870
49	NC_021887	AGGAG	2	10	66248	66257	40 %	0 %	60 %	0 %	527317872
50	NC_021887	GTTAA	2	10	66378	66387	40 %	40 %	20 %	0 %	527317872
51	NC_021887	CAAGC	2	10	68744	68753	40 %	0 %	20 %	40 %	527317874
52	NC_021887	GGAGC	2	10	69614	69623	20 %	0 %	60 %	20 %	527317875
53	NC_021887	GCGAT	2	10	69804	69813	20 %	20 %	40 %	20 %	527317875
54	NC_021887	CTCTT	2	10	70158	70167	0 %	60 %	0 %	40 %	527317875
55	NC_021887	AGGGG	2	10	70804	70813	20 %	0 %	80 %	0 %	527317875
56	NC_021887	AAGAA	2	10	70846	70855	80 %	0 %	20 %	0 %	527317875
57	NC_021887	ATTGG	2	10	72136	72145	20 %	40 %	40 %	0 %	527317877
58	NC_021887	GAAAA	2	10	73208	73217	80 %	0 %	20 %	0 %	527317877
59	NC_021887	TGGGA	2	10	73625	73634	20 %	20 %	60 %	0 %	527317878
60	NC_021887	TATTT	2	10	76152	76161	20 %	80 %	0 %	0 %	527317879
61	NC_021887	TGTCT	2	10	79947	79956	0 %	60 %	20 %	20 %	527317883
62	NC_021887	TTACT	2	10	80454	80463	20 %	60 %	0 %	20 %	527317883
63	NC_021887	AGAAA	2	10	81844	81853	80 %	0 %	20 %	0 %	527317885
64	NC_021887	GGAAG	2	10	82357	82366	40 %	0 %	60 %	0 %	527317885
65	NC_021887	AGCGA	2	10	84823	84832	40 %	0 %	40 %	20 %	527317887
66	NC_021887	GATCC	2	10	85908	85917	20 %	20 %	20 %	40 %	527317888
67	NC_021887	AGAGC	2	10	87243	87252	40 %	0 %	40 %	20 %	527317889
68	NC_021887	TTTTC	2	10	90975	90984	0 %	80 %	0 %	20 %	527317892
69	NC_021887	GGATG	2	10	91235	91244	20 %	20 %	60 %	0 %	527317893
70	NC_021887	CAACA	2	10	92774	92783	60 %	0 %	0 %	40 %	527317894
71	NC_021887	ACAGC	2	10	93819	93828	40 %	0 %	20 %	40 %	527317896
72	NC_021887	GGAAC	2	10	94531	94540	40 %	0 %	40 %	20 %	527317897
73	NC_021887	GGATT	2	10	95431	95440	20 %	40 %	40 %	0 %	527317897
74	NC_021887	CAATC	2	10	96533	96542	40 %	20 %	0 %	40 %	527317899
75	NC_021887	TTTGC	2	10	96667	96676	0 %	60 %	20 %	20 %	527317899
76	NC_021887	ATTCA	2	10	96931	96940	40 %	40 %	0 %	20 %	527317899
77	NC_021887	GATCC	2	10	97190	97199	20 %	20 %	20 %	40 %	527317899
78	NC_021887	GTTTT	2	10	97611	97620	0 %	80 %	20 %	0 %	527317899
79	NC_021887	AAGCT	2	10	98815	98824	40 %	20 %	20 %	20 %	527317900
80	NC_021887	ATAGC	2	10	99867	99876	40 %	20 %	20 %	20 %	527317901
81	NC_021887	TTCCC	2	10	100471	100480	0 %	40 %	0 %	60 %	527317902
82	NC_021887	AGCGA	2	10	102795	102804	40 %	0 %	40 %	20 %	527317904
83	NC_021887	TTTCT	2	10	103153	103162	0 %	80 %	0 %	20 %	527317904
84	NC_021887	CTTCT	2	10	103207	103216	0 %	60 %	0 %	40 %	527317904
85	NC_021887	ATCAT	2	10	104359	104368	40 %	40 %	0 %	20 %	527317905
86	NC_021887	GGCAT	2	10	105067	105076	20 %	20 %	40 %	20 %	527317905
87	NC_021887	AAAGC	2	10	108793	108802	60 %	0 %	20 %	20 %	527317908
88	NC_021887	GCATT	2	10	109953	109962	20 %	40 %	20 %	20 %	527317910
89	NC_021887	TGTTT	2	10	114642	114651	0 %	80 %	20 %	0 %	527317913
90	NC_021887	CATGT	2	10	115020	115029	20 %	40 %	20 %	20 %	527317913
91	NC_021887	TATCG	2	10	115724	115733	20 %	40 %	20 %	20 %	527317913
92	NC_021887	TTTCT	2	10	116240	116249	0 %	80 %	0 %	20 %	527317914
93	NC_021887	GGAGA	2	10	116436	116445	40 %	0 %	60 %	0 %	527317914
94	NC_021887	AAAGA	2	10	118487	118496	80 %	0 %	20 %	0 %	527317917
95	NC_021887	TACAA	2	10	126299	126308	60 %	20 %	0 %	20 %	527317923
96	NC_021887	ATCCA	2	10	128707	128716	40 %	20 %	0 %	40 %	527317926
97	NC_021887	GAAGA	2	10	130257	130266	60 %	0 %	40 %	0 %	527317926
98	NC_021887	AAAAG	2	10	132170	132179	80 %	0 %	20 %	0 %	527317928
99	NC_021887	GATTC	2	10	132501	132510	20 %	40 %	20 %	20 %	527317928
100	NC_021887	ATTGT	2	10	135818	135827	20 %	60 %	20 %	0 %	527317931
101	NC_021887	TGTTT	2	10	136244	136253	0 %	80 %	20 %	0 %	527317932
102	NC_021887	TCCAG	2	10	139989	139998	20 %	20 %	20 %	40 %	527317938
103	NC_021887	GTACA	2	10	140720	140729	40 %	20 %	20 %	20 %	527317939
104	NC_021887	TAGAT	2	10	141093	141102	40 %	40 %	20 %	0 %	527317939
105	NC_021887	AAAAG	2	10	141505	141514	80 %	0 %	20 %	0 %	527317940
106	NC_021887	AAAAC	2	10	141985	141994	80 %	0 %	0 %	20 %	527317941
107	NC_021887	TGCTA	2	10	143071	143080	20 %	40 %	20 %	20 %	527317943
108	NC_021887	GGAGC	2	10	143118	143127	20 %	0 %	60 %	20 %	527317943
109	NC_021887	CTGGG	2	10	144532	144541	0 %	20 %	60 %	20 %	527317945
110	NC_021887	GTTTT	2	10	145279	145288	0 %	80 %	20 %	0 %	527317946
111	NC_021887	GAACC	2	10	149013	149022	40 %	0 %	20 %	40 %	527317947
112	NC_021887	ATTCT	2	10	152510	152519	20 %	60 %	0 %	20 %	527317951
113	NC_021887	CTGTG	2	10	152714	152723	0 %	40 %	40 %	20 %	527317951
114	NC_021887	TTCTT	2	10	155187	155196	0 %	80 %	0 %	20 %	527317954
115	NC_021887	AGGAA	2	10	159746	159755	60 %	0 %	40 %	0 %	527317958
116	NC_021887	AGAGA	2	10	162986	162995	60 %	0 %	40 %	0 %	527317961
117	NC_021887	AGCAA	2	10	163421	163430	60 %	0 %	20 %	20 %	527317961
118	NC_021887	TATGA	2	10	163845	163854	40 %	40 %	20 %	0 %	527317962
119	NC_021887	CAAAA	2	10	166924	166933	80 %	0 %	0 %	20 %	527317963
120	NC_021887	AAGAG	2	10	167757	167766	60 %	0 %	40 %	0 %	527317963
121	NC_021887	GATTG	2	10	168102	168111	20 %	40 %	40 %	0 %	527317963
122	NC_021887	GTTTT	2	10	174581	174590	0 %	80 %	20 %	0 %	527317967
123	NC_021887	TATTG	2	10	174604	174613	20 %	60 %	20 %	0 %	527317967
124	NC_021887	CAGCA	2	10	174963	174972	40 %	0 %	20 %	40 %	527317967
125	NC_021887	TAGGA	2	10	175268	175277	40 %	20 %	40 %	0 %	527317968
126	NC_021887	TGATT	2	10	177195	177204	20 %	60 %	20 %	0 %	527317969
127	NC_021887	TCAAT	2	10	177836	177845	40 %	40 %	0 %	20 %	527317969
128	NC_021887	TTTTC	2	10	177875	177884	0 %	80 %	0 %	20 %	527317969
129	NC_021887	AGAGT	2	10	180821	180830	40 %	20 %	40 %	0 %	527317971
130	NC_021887	TTGAA	2	10	181511	181520	40 %	40 %	20 %	0 %	527317972
131	NC_021887	TGAGT	2	10	182325	182334	20 %	40 %	40 %	0 %	527317972
132	NC_021887	TTGAG	2	10	183075	183084	20 %	40 %	40 %	0 %	527317973
133	NC_021887	ATAGA	2	10	183097	183106	60 %	20 %	20 %	0 %	527317973
134	NC_021887	AGAGA	2	10	185178	185187	60 %	0 %	40 %	0 %	527317977
135	NC_021887	ACGAT	2	10	187124	187133	40 %	20 %	20 %	20 %	527317979
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