MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Chlamydia trachomatis RC-L2(s)/46

Total Repeats: 2508

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021887	AGTA	2	8	1489	1496	50 %	25 %	25 %	0 %	527317813
2	NC_021887	ATGA	2	8	1893	1900	50 %	25 %	25 %	0 %	527317814
3	NC_021887	GATA	2	8	1931	1938	50 %	25 %	25 %	0 %	527317814
4	NC_021887	CATG	2	8	3109	3116	25 %	25 %	25 %	25 %	527317815
5	NC_021887	TTCC	2	8	3414	3421	0 %	50 %	0 %	50 %	527317815
6	NC_021887	TTTA	2	8	3812	3819	25 %	75 %	0 %	0 %	527317816
7	NC_021887	ATCC	2	8	4112	4119	25 %	25 %	0 %	50 %	527317816
8	NC_021887	GACG	2	8	4859	4866	25 %	0 %	50 %	25 %	527317816
9	NC_021887	TTGG	2	8	4962	4969	0 %	50 %	50 %	0 %	527317816
10	NC_021887	TGGA	2	8	5323	5330	25 %	25 %	50 %	0 %	527317817
11	NC_021887	CTTT	2	8	5700	5707	0 %	75 %	0 %	25 %	527317817
12	NC_021887	GGGA	2	8	6215	6222	25 %	0 %	75 %	0 %	527317817
13	NC_021887	GGTG	2	8	6518	6525	0 %	25 %	75 %	0 %	527317818
14	NC_021887	AAAT	2	8	6584	6591	75 %	25 %	0 %	0 %	527317818
15	NC_021887	ATTT	2	8	7096	7103	25 %	75 %	0 %	0 %	527317819
16	NC_021887	TTTG	2	8	7188	7195	0 %	75 %	25 %	0 %	527317819
17	NC_021887	AAGC	2	8	7822	7829	50 %	0 %	25 %	25 %	527317820
18	NC_021887	ATTG	2	8	8220	8227	25 %	50 %	25 %	0 %	527317821
19	NC_021887	AGCG	2	8	8687	8694	25 %	0 %	50 %	25 %	527317821
20	NC_021887	AAAG	2	8	8708	8715	75 %	0 %	25 %	0 %	527317821
21	NC_021887	CTTT	2	8	9048	9055	0 %	75 %	0 %	25 %	527317821
22	NC_021887	TTCG	2	8	9422	9429	0 %	50 %	25 %	25 %	527317822
23	NC_021887	AATT	2	8	9527	9534	50 %	50 %	0 %	0 %	527317822
24	NC_021887	ATGG	2	8	9586	9593	25 %	25 %	50 %	0 %	527317822
25	NC_021887	CTTT	2	8	10211	10218	0 %	75 %	0 %	25 %	527317823
26	NC_021887	GCAA	2	8	10428	10435	50 %	0 %	25 %	25 %	527317823
27	NC_021887	AGCC	2	8	10658	10665	25 %	0 %	25 %	50 %	527317823
28	NC_021887	GAAA	2	8	10801	10808	75 %	0 %	25 %	0 %	527317823
29	NC_021887	AATG	2	8	11544	11551	50 %	25 %	25 %	0 %	527317824
30	NC_021887	GTTT	2	8	12576	12583	0 %	75 %	25 %	0 %	527317825
31	NC_021887	ATGC	2	8	13006	13013	25 %	25 %	25 %	25 %	527317825
32	NC_021887	TTGT	2	8	14042	14049	0 %	75 %	25 %	0 %	527317826
33	NC_021887	TTCT	2	8	14213	14220	0 %	75 %	0 %	25 %	527317826
34	NC_021887	ATTT	2	8	14419	14426	25 %	75 %	0 %	0 %	527317826
35	NC_021887	TTTC	2	8	15081	15088	0 %	75 %	0 %	25 %	527317827
36	NC_021887	AAAT	2	8	15563	15570	75 %	25 %	0 %	0 %	527317827
37	NC_021887	CTAT	2	8	16262	16269	25 %	50 %	0 %	25 %	527317828
38	NC_021887	GTAA	2	8	16405	16412	50 %	25 %	25 %	0 %	527317828
39	NC_021887	CTAA	2	8	16598	16605	50 %	25 %	0 %	25 %	527317828
40	NC_021887	AGAA	2	8	16861	16868	75 %	0 %	25 %	0 %	527317828
41	NC_021887	ATTT	2	8	17007	17014	25 %	75 %	0 %	0 %	527317828
42	NC_021887	GAAG	2	8	19513	19520	50 %	0 %	50 %	0 %	527317830
43	NC_021887	GATG	2	8	21647	21654	25 %	25 %	50 %	0 %	527317832
44	NC_021887	CATT	2	8	22706	22713	25 %	50 %	0 %	25 %	527317832
45	NC_021887	GCTT	2	8	23049	23056	0 %	50 %	25 %	25 %	527317832
46	NC_021887	GGTT	2	8	23097	23104	0 %	50 %	50 %	0 %	527317832
47	NC_021887	TTCT	2	8	23467	23474	0 %	75 %	0 %	25 %	527317832
48	NC_021887	TAAC	2	8	23569	23576	50 %	25 %	0 %	25 %	527317832
49	NC_021887	CATT	2	8	23692	23699	25 %	50 %	0 %	25 %	527317832
50	NC_021887	GGTA	2	8	24062	24069	25 %	25 %	50 %	0 %	527317832
51	NC_021887	TTGA	2	8	25056	25063	25 %	50 %	25 %	0 %	527317833
52	NC_021887	TAGG	2	8	25280	25287	25 %	25 %	50 %	0 %	527317833
53	NC_021887	TTCC	2	8	25404	25411	0 %	50 %	0 %	50 %	527317833
54	NC_021887	TAGG	2	8	25518	25525	25 %	25 %	50 %	0 %	527317833
55	NC_021887	GCTT	2	8	26290	26297	0 %	50 %	25 %	25 %	527317833
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57	NC_021887	TTAA	2	8	26946	26953	50 %	50 %	0 %	0 %	527317834
58	NC_021887	AAAG	2	8	26996	27003	75 %	0 %	25 %	0 %	527317834
59	NC_021887	GGGC	2	8	27276	27283	0 %	0 %	75 %	25 %	527317834
60	NC_021887	GTTT	2	8	27559	27566	0 %	75 %	25 %	0 %	527317835
61	NC_021887	CAGA	2	8	27581	27588	50 %	0 %	25 %	25 %	527317835
62	NC_021887	CTTT	2	8	29553	29560	0 %	75 %	0 %	25 %	527317837
63	NC_021887	TTTG	2	8	29568	29575	0 %	75 %	25 %	0 %	527317837
64	NC_021887	TTGT	2	8	29603	29610	0 %	75 %	25 %	0 %	527317837
65	NC_021887	TGGC	2	8	29766	29773	0 %	25 %	50 %	25 %	527317837
66	NC_021887	AAAG	2	8	30326	30333	75 %	0 %	25 %	0 %	527317838
67	NC_021887	AAAC	2	8	30396	30403	75 %	0 %	0 %	25 %	527317838
68	NC_021887	GATG	2	8	30539	30546	25 %	25 %	50 %	0 %	527317838
69	NC_021887	GATA	2	8	31648	31655	50 %	25 %	25 %	0 %	527317840
70	NC_021887	TGAT	2	8	34143	34150	25 %	50 %	25 %	0 %	527317843
71	NC_021887	AAGA	3	12	34271	34282	75 %	0 %	25 %	0 %	527317843
72	NC_021887	AAGC	2	8	34491	34498	50 %	0 %	25 %	25 %	527317844
73	NC_021887	GTTC	2	8	34524	34531	0 %	50 %	25 %	25 %	527317844
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75	NC_021887	TGCT	2	8	35313	35320	0 %	50 %	25 %	25 %	527317845
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79	NC_021887	ATGA	2	8	37127	37134	50 %	25 %	25 %	0 %	527317846
80	NC_021887	TAGG	2	8	37286	37293	25 %	25 %	50 %	0 %	527317846
81	NC_021887	CAAT	2	8	37470	37477	50 %	25 %	0 %	25 %	527317846
82	NC_021887	AATG	2	8	38257	38264	50 %	25 %	25 %	0 %	527317846
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84	NC_021887	AAGA	2	8	39146	39153	75 %	0 %	25 %	0 %	527317847
85	NC_021887	ATCC	2	8	39154	39161	25 %	25 %	0 %	50 %	527317847
86	NC_021887	TAAT	2	8	39365	39372	50 %	50 %	0 %	0 %	527317847
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90	NC_021887	AAAC	2	8	43163	43170	75 %	0 %	0 %	25 %	527317851
91	NC_021887	CAAT	2	8	43367	43374	50 %	25 %	0 %	25 %	527317851
92	NC_021887	ATTT	2	8	44123	44130	25 %	75 %	0 %	0 %	527317853
93	NC_021887	GCTC	2	8	44431	44438	0 %	25 %	25 %	50 %	527317853
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99	NC_021887	CTAT	2	8	45700	45707	25 %	50 %	0 %	25 %	527317854
100	NC_021887	AAGA	2	8	46194	46201	75 %	0 %	25 %	0 %	527317855
101	NC_021887	AAGA	2	8	46251	46258	75 %	0 %	25 %	0 %	527317855
102	NC_021887	AAAG	2	8	46291	46298	75 %	0 %	25 %	0 %	527317855
103	NC_021887	AAGA	2	8	46406	46413	75 %	0 %	25 %	0 %	527317855
104	NC_021887	ACTT	2	8	46667	46674	25 %	50 %	0 %	25 %	527317855
105	NC_021887	ATGG	2	8	47293	47300	25 %	25 %	50 %	0 %	527317855
106	NC_021887	AGGA	2	8	47324	47331	50 %	0 %	50 %	0 %	527317855
107	NC_021887	GAAC	2	8	47871	47878	50 %	0 %	25 %	25 %	527317855
108	NC_021887	AACA	2	8	48118	48125	75 %	0 %	0 %	25 %	527317856
109	NC_021887	CTTT	2	8	48314	48321	0 %	75 %	0 %	25 %	527317856
110	NC_021887	CTTT	2	8	49199	49206	0 %	75 %	0 %	25 %	527317857
111	NC_021887	GTAG	2	8	49217	49224	25 %	25 %	50 %	0 %	527317857
112	NC_021887	GAAG	2	8	50647	50654	50 %	0 %	50 %	0 %	527317859
113	NC_021887	TTCA	2	8	51069	51076	25 %	50 %	0 %	25 %	527317859
114	NC_021887	TCTA	2	8	51286	51293	25 %	50 %	0 %	25 %	527317859
115	NC_021887	GGAA	2	8	52403	52410	50 %	0 %	50 %	0 %	527317861
116	NC_021887	TTAA	2	8	53144	53151	50 %	50 %	0 %	0 %	527317861
117	NC_021887	CCTT	2	8	53351	53358	0 %	50 %	0 %	50 %	527317862
118	NC_021887	TTTA	2	8	53518	53525	25 %	75 %	0 %	0 %	527317862
119	NC_021887	AAAG	2	8	53742	53749	75 %	0 %	25 %	0 %	527317862
120	NC_021887	GATT	2	8	53879	53886	25 %	50 %	25 %	0 %	527317862
121	NC_021887	AATC	2	8	53934	53941	50 %	25 %	0 %	25 %	527317862
122	NC_021887	TATT	2	8	53995	54002	25 %	75 %	0 %	0 %	527317862
123	NC_021887	TCGA	2	8	54383	54390	25 %	25 %	25 %	25 %	527317863
124	NC_021887	CTTC	2	8	54477	54484	0 %	50 %	0 %	50 %	527317863
125	NC_021887	GAAT	2	8	54512	54519	50 %	25 %	25 %	0 %	527317863
126	NC_021887	TTGA	2	8	54582	54589	25 %	50 %	25 %	0 %	527317863
127	NC_021887	GGAA	2	8	54938	54945	50 %	0 %	50 %	0 %	527317863
128	NC_021887	AGAA	2	8	55284	55291	75 %	0 %	25 %	0 %	527317863
129	NC_021887	CTGG	3	12	55849	55860	0 %	25 %	50 %	25 %	527317864
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131	NC_021887	AGCG	2	8	56023	56030	25 %	0 %	50 %	25 %	527317864
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139	NC_021887	ATGT	2	8	60186	60193	25 %	50 %	25 %	0 %	527317866
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