MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Candidatus Tremblaya phenacola PAVE

Total Repeats: 251

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021555	CT	3	6	389	394	0 %	50 %	0 %	50 %	557940107
2	NC_021555	AG	3	6	1620	1625	50 %	0 %	50 %	0 %	557940108
3	NC_021555	TC	3	6	1767	1772	0 %	50 %	0 %	50 %	557940108
4	NC_021555	TG	3	6	1799	1804	0 %	50 %	50 %	0 %	557940108
5	NC_021555	AG	4	8	2252	2259	50 %	0 %	50 %	0 %	557940109
6	NC_021555	GA	3	6	2448	2453	50 %	0 %	50 %	0 %	557940109
7	NC_021555	CT	3	6	2459	2464	0 %	50 %	0 %	50 %	557940109
8	NC_021555	CT	3	6	2855	2860	0 %	50 %	0 %	50 %	557940109
9	NC_021555	GA	3	6	3448	3453	50 %	0 %	50 %	0 %	557940110
10	NC_021555	CT	3	6	3694	3699	0 %	50 %	0 %	50 %	557940110
11	NC_021555	CT	4	8	5894	5901	0 %	50 %	0 %	50 %	557940112
12	NC_021555	TC	3	6	5955	5960	0 %	50 %	0 %	50 %	557940112
13	NC_021555	GT	3	6	6965	6970	0 %	50 %	50 %	0 %	557940114
14	NC_021555	CT	3	6	7018	7023	0 %	50 %	0 %	50 %	557940114
15	NC_021555	AG	3	6	7036	7041	50 %	0 %	50 %	0 %	557940114
16	NC_021555	TC	3	6	8254	8259	0 %	50 %	0 %	50 %	557940115
17	NC_021555	CA	3	6	8578	8583	50 %	0 %	0 %	50 %	557940116
18	NC_021555	GA	3	6	9635	9640	50 %	0 %	50 %	0 %	557940117
19	NC_021555	GA	4	8	9764	9771	50 %	0 %	50 %	0 %	557940117
20	NC_021555	GA	3	6	10076	10081	50 %	0 %	50 %	0 %	557940117
21	NC_021555	GA	3	6	10216	10221	50 %	0 %	50 %	0 %	557940117
22	NC_021555	CT	3	6	11583	11588	0 %	50 %	0 %	50 %	557940119
23	NC_021555	AT	3	6	11818	11823	50 %	50 %	0 %	0 %	557940119
24	NC_021555	TC	3	6	11961	11966	0 %	50 %	0 %	50 %	557940119
25	NC_021555	GA	3	6	12145	12150	50 %	0 %	50 %	0 %	557940120
26	NC_021555	GA	3	6	12307	12312	50 %	0 %	50 %	0 %	557940120
27	NC_021555	GA	3	6	12600	12605	50 %	0 %	50 %	0 %	557940120
28	NC_021555	TC	3	6	12764	12769	0 %	50 %	0 %	50 %	557940120
29	NC_021555	CT	3	6	13246	13251	0 %	50 %	0 %	50 %	557940120
30	NC_021555	CT	3	6	14508	14513	0 %	50 %	0 %	50 %	557940121
31	NC_021555	TC	3	6	15655	15660	0 %	50 %	0 %	50 %	557940122
32	NC_021555	CA	3	6	15771	15776	50 %	0 %	0 %	50 %	557940123
33	NC_021555	TC	3	6	16314	16319	0 %	50 %	0 %	50 %	557940124
34	NC_021555	CT	3	6	16615	16620	0 %	50 %	0 %	50 %	557940125
35	NC_021555	AT	3	6	18237	18242	50 %	50 %	0 %	0 %	557940126
36	NC_021555	CT	3	6	18893	18898	0 %	50 %	0 %	50 %	557940127
37	NC_021555	AG	3	6	20025	20030	50 %	0 %	50 %	0 %	557940128
38	NC_021555	TC	3	6	20210	20215	0 %	50 %	0 %	50 %	557940128
39	NC_021555	CT	3	6	20492	20497	0 %	50 %	0 %	50 %	557940128
40	NC_021555	AG	3	6	22746	22751	50 %	0 %	50 %	0 %	557940130
41	NC_021555	GA	3	6	25185	25190	50 %	0 %	50 %	0 %	557940132
42	NC_021555	CT	3	6	25450	25455	0 %	50 %	0 %	50 %	557940132
43	NC_021555	GT	3	6	25757	25762	0 %	50 %	50 %	0 %	557940132
44	NC_021555	AG	3	6	25766	25771	50 %	0 %	50 %	0 %	557940132
45	NC_021555	CT	5	10	28872	28881	0 %	50 %	0 %	50 %	557940134
46	NC_021555	CA	3	6	29719	29724	50 %	0 %	0 %	50 %	557940135
47	NC_021555	CT	3	6	30277	30282	0 %	50 %	0 %	50 %	557940135
48	NC_021555	TC	3	6	30378	30383	0 %	50 %	0 %	50 %	557940136
49	NC_021555	AG	3	6	31666	31671	50 %	0 %	50 %	0 %	557940138
50	NC_021555	GA	4	8	31897	31904	50 %	0 %	50 %	0 %	557940138
51	NC_021555	GA	3	6	32167	32172	50 %	0 %	50 %	0 %	557940139
52	NC_021555	AG	3	6	32371	32376	50 %	0 %	50 %	0 %	557940139
53	NC_021555	AG	3	6	34434	34439	50 %	0 %	50 %	0 %	557940141
54	NC_021555	CA	3	6	37066	37071	50 %	0 %	0 %	50 %	557940142
55	NC_021555	CT	3	6	37406	37411	0 %	50 %	0 %	50 %	557940142
56	NC_021555	CT	3	6	38465	38470	0 %	50 %	0 %	50 %	557940143
57	NC_021555	TG	3	6	38743	38748	0 %	50 %	50 %	0 %	557940143
58	NC_021555	TC	3	6	38837	38842	0 %	50 %	0 %	50 %	557940144
59	NC_021555	TC	3	6	38883	38888	0 %	50 %	0 %	50 %	557940144
60	NC_021555	GA	3	6	39734	39739	50 %	0 %	50 %	0 %	557940145
61	NC_021555	GA	3	6	39998	40003	50 %	0 %	50 %	0 %	557940145
62	NC_021555	TC	3	6	40677	40682	0 %	50 %	0 %	50 %	557940145
63	NC_021555	TC	3	6	40749	40754	0 %	50 %	0 %	50 %	557940145
64	NC_021555	AG	3	6	41345	41350	50 %	0 %	50 %	0 %	557940147
65	NC_021555	GA	3	6	42087	42092	50 %	0 %	50 %	0 %	557940148
66	NC_021555	TC	3	6	43142	43147	0 %	50 %	0 %	50 %	557940150
67	NC_021555	CT	3	6	44335	44340	0 %	50 %	0 %	50 %	557940150
68	NC_021555	AG	3	6	45503	45508	50 %	0 %	50 %	0 %	557940152
69	NC_021555	GA	3	6	46656	46661	50 %	0 %	50 %	0 %	557940152
70	NC_021555	CT	3	6	47309	47314	0 %	50 %	0 %	50 %	557940152
71	NC_021555	CT	3	6	47835	47840	0 %	50 %	0 %	50 %	557940152
72	NC_021555	TG	3	6	49059	49064	0 %	50 %	50 %	0 %	557940153
73	NC_021555	GT	3	6	50260	50265	0 %	50 %	50 %	0 %	557940154
74	NC_021555	TC	3	6	50273	50278	0 %	50 %	0 %	50 %	557940154
75	NC_021555	CT	3	6	51471	51476	0 %	50 %	0 %	50 %	557940155
76	NC_021555	TC	3	6	52044	52049	0 %	50 %	0 %	50 %	557940156
77	NC_021555	AG	3	6	53420	53425	50 %	0 %	50 %	0 %	557940157
78	NC_021555	AG	3	6	54046	54051	50 %	0 %	50 %	0 %	557940158
79	NC_021555	CT	3	6	55319	55324	0 %	50 %	0 %	50 %	557940159
80	NC_021555	CT	4	8	55564	55571	0 %	50 %	0 %	50 %	557940159
81	NC_021555	TC	3	6	55657	55662	0 %	50 %	0 %	50 %	557940159
82	NC_021555	AG	3	6	56964	56969	50 %	0 %	50 %	0 %	557940161
83	NC_021555	GT	3	6	57394	57399	0 %	50 %	50 %	0 %	557940162
84	NC_021555	GT	3	6	57548	57553	0 %	50 %	50 %	0 %	557940162
85	NC_021555	CT	3	6	57971	57976	0 %	50 %	0 %	50 %	557940162
86	NC_021555	AG	3	6	59123	59128	50 %	0 %	50 %	0 %	557940163
87	NC_021555	AG	4	8	60005	60012	50 %	0 %	50 %	0 %	557940167
88	NC_021555	CT	3	6	61559	61564	0 %	50 %	0 %	50 %	557940167
89	NC_021555	GA	3	6	61704	61709	50 %	0 %	50 %	0 %	557940167
90	NC_021555	AG	3	6	62336	62341	50 %	0 %	50 %	0 %	557940167
91	NC_021555	AG	3	6	63200	63205	50 %	0 %	50 %	0 %	557940168
92	NC_021555	CT	3	6	63419	63424	0 %	50 %	0 %	50 %	557940168
93	NC_021555	CA	3	6	63906	63911	50 %	0 %	0 %	50 %	557940168
94	NC_021555	GA	3	6	64031	64036	50 %	0 %	50 %	0 %	557940168
95	NC_021555	AC	3	6	64180	64185	50 %	0 %	0 %	50 %	557940169
96	NC_021555	CT	3	6	65710	65715	0 %	50 %	0 %	50 %	557940170
97	NC_021555	GT	3	6	65915	65920	0 %	50 %	50 %	0 %	557940170
98	NC_021555	CA	3	6	66772	66777	50 %	0 %	0 %	50 %	557940171
99	NC_021555	CT	3	6	67072	67077	0 %	50 %	0 %	50 %	557940171
100	NC_021555	AG	3	6	67245	67250	50 %	0 %	50 %	0 %	557940171
101	NC_021555	GA	3	6	67637	67642	50 %	0 %	50 %	0 %	557940172
102	NC_021555	GA	3	6	67911	67916	50 %	0 %	50 %	0 %	557940172
103	NC_021555	TC	4	8	69170	69177	0 %	50 %	0 %	50 %	557940174
104	NC_021555	AG	3	6	70056	70061	50 %	0 %	50 %	0 %	557940174
105	NC_021555	AG	3	6	71553	71558	50 %	0 %	50 %	0 %	557940175
106	NC_021555	GA	3	6	72090	72095	50 %	0 %	50 %	0 %	557940175
107	NC_021555	CT	3	6	72432	72437	0 %	50 %	0 %	50 %	557940175
108	NC_021555	CT	3	6	72863	72868	0 %	50 %	0 %	50 %	557940176
109	NC_021555	CT	3	6	72958	72963	0 %	50 %	0 %	50 %	557940176
110	NC_021555	CT	3	6	73869	73874	0 %	50 %	0 %	50 %	557940177
111	NC_021555	CT	3	6	75751	75756	0 %	50 %	0 %	50 %	557940178
112	NC_021555	GT	3	6	75904	75909	0 %	50 %	50 %	0 %	557940178
113	NC_021555	CT	3	6	76003	76008	0 %	50 %	0 %	50 %	557940178
114	NC_021555	AC	3	6	76640	76645	50 %	0 %	0 %	50 %	557940179
115	NC_021555	CT	3	6	78453	78458	0 %	50 %	0 %	50 %	557940181
116	NC_021555	AG	3	6	78656	78661	50 %	0 %	50 %	0 %	557940181
117	NC_021555	AG	3	6	79442	79447	50 %	0 %	50 %	0 %	557940183
118	NC_021555	GA	3	6	80989	80994	50 %	0 %	50 %	0 %	557940184
119	NC_021555	TC	3	6	81255	81260	0 %	50 %	0 %	50 %	557940184
120	NC_021555	TC	4	8	82123	82130	0 %	50 %	0 %	50 %	557940184
121	NC_021555	AG	3	6	82592	82597	50 %	0 %	50 %	0 %	557940185
122	NC_021555	AG	3	6	84548	84553	50 %	0 %	50 %	0 %	557940187
123	NC_021555	GA	3	6	85418	85423	50 %	0 %	50 %	0 %	557940187
124	NC_021555	GA	3	6	86273	86278	50 %	0 %	50 %	0 %	557940188
125	NC_021555	AG	3	6	87081	87086	50 %	0 %	50 %	0 %	557940191
126	NC_021555	TG	3	6	87137	87142	0 %	50 %	50 %	0 %	557940191
127	NC_021555	AG	3	6	87742	87747	50 %	0 %	50 %	0 %	557940191
128	NC_021555	CT	3	6	87827	87832	0 %	50 %	0 %	50 %	557940192
129	NC_021555	AG	3	6	89218	89223	50 %	0 %	50 %	0 %	557940192
130	NC_021555	TC	3	6	89297	89302	0 %	50 %	0 %	50 %	557940192
131	NC_021555	CA	3	6	89607	89612	50 %	0 %	0 %	50 %	557940193
132	NC_021555	GA	3	6	90050	90055	50 %	0 %	50 %	0 %	557940194
133	NC_021555	AG	3	6	90631	90636	50 %	0 %	50 %	0 %	557940194
134	NC_021555	GA	3	6	91241	91246	50 %	0 %	50 %	0 %	557940194
135	NC_021555	AG	3	6	91630	91635	50 %	0 %	50 %	0 %	557940195
136	NC_021555	AG	3	6	91792	91797	50 %	0 %	50 %	0 %	557940196
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138	NC_021555	TC	3	6	93519	93524	0 %	50 %	0 %	50 %	557940198
139	NC_021555	AG	3	6	93583	93588	50 %	0 %	50 %	0 %	557940198
140	NC_021555	CA	3	6	94079	94084	50 %	0 %	0 %	50 %	557940199
141	NC_021555	TC	3	6	94312	94317	0 %	50 %	0 %	50 %	557940199
142	NC_021555	AC	3	6	94818	94823	50 %	0 %	0 %	50 %	557940199
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.