MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Coding Repeats of Candidatus Tremblaya phenacola PAVE

Total Repeats: 3478

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_021555	ATCA	2	8	98871	98878	50 %	25 %	0 %	25 %	557940204
2002	NC_021555	AGA	2	6	98914	98919	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557940204
2003	NC_021555	TGG	2	6	98928	98933	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557940204
2004	NC_021555	GAA	2	6	98944	98949	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557940204
2005	NC_021555	AGCC	2	8	98974	98981	25 %	0 %	25 %	50 %	557940204
2006	NC_021555	C	6	6	98980	98985	0 %	0 %	0 %	100 %	557940204
2007	NC_021555	AAGT	2	8	99064	99071	50 %	25 %	25 %	0 %	557940204
2008	NC_021555	GA	3	6	99137	99142	50 %	0 %	50 %	0 %	557940204
2009	NC_021555	TCT	2	6	99297	99302	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557940204
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2011	NC_021555	CTT	2	6	99429	99434	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557940204
2012	NC_021555	CAAAA	2	10	99570	99579	80 %	0 %	0 %	20 %	557940205
2013	NC_021555	TAG	2	6	99596	99601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557940205
2014	NC_021555	CTTCT	2	10	99629	99638	0 %	60 %	0 %	40 %	557940205
2015	NC_021555	TGT	2	6	99695	99700	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557940205
2016	NC_021555	TGG	2	6	99725	99730	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557940205
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2021	NC_021555	CTCAAC	2	12	100018	100029	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	557940205
2022	NC_021555	CTG	2	6	100045	100050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557940205
2023	NC_021555	CAT	2	6	100059	100064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557940205
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2124	NC_021555	AGA	2	6	105170	105175	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557940208
2125	NC_021555	AGG	2	6	105176	105181	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557940208
2126	NC_021555	ATCT	2	8	105208	105215	25 %	50 %	0 %	25 %	557940208
2127	NC_021555	T	6	6	105215	105220	0 %	100 %	0 %	0 %	557940208
2128	NC_021555	TTTG	2	8	105264	105271	0 %	75 %	25 %	0 %	557940208
2129	NC_021555	TC	3	6	105299	105304	0 %	50 %	0 %	50 %	557940208
2130	NC_021555	G	6	6	105338	105343	0 %	0 %	100 %	0 %	557940208
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2133	NC_021555	TGA	2	6	105506	105511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557940208
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2135	NC_021555	TGT	2	6	105518	105523	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557940208
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2137	NC_021555	GAA	2	6	105567	105572	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557940208
2138	NC_021555	CCAAA	2	10	105596	105605	60 %	0 %	0 %	40 %	557940208
2139	NC_021555	TG	3	6	105610	105615	0 %	50 %	50 %	0 %	557940208
2140	NC_021555	ACTA	2	8	105765	105772	50 %	25 %	0 %	25 %	557940209
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2142	NC_021555	GTTT	2	8	105875	105882	0 %	75 %	25 %	0 %	557940209
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2144	NC_021555	ATGG	2	8	105971	105978	25 %	25 %	50 %	0 %	557940209
2145	NC_021555	TTG	2	6	106008	106013	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557940209
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2183	NC_021555	TTGT	2	8	107233	107240	0 %	75 %	25 %	0 %	557940211
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2203	NC_021555	CTT	2	6	107899	107904	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557940211
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2228	NC_021555	TGA	2	6	109520	109525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557940212
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2230	NC_021555	ATT	2	6	109698	109703	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557940212
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2232	NC_021555	GGTT	2	8	109804	109811	0 %	50 %	50 %	0 %	557940212
2233	NC_021555	TGT	2	6	109812	109817	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557940212
2234	NC_021555	GA	3	6	109818	109823	50 %	0 %	50 %	0 %	557940212
2235	NC_021555	TGG	2	6	109937	109942	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557940212
2236	NC_021555	GAT	2	6	109971	109976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557940212
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2239	NC_021555	ACA	2	6	110035	110040	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557940212
2240	NC_021555	CCT	2	6	110081	110086	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557940212
2241	NC_021555	TGG	2	6	110176	110181	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557940212
2242	NC_021555	TCA	2	6	110221	110226	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557940212
2243	NC_021555	GTTT	2	8	110485	110492	0 %	75 %	25 %	0 %	557940213
2244	NC_021555	CAAC	2	8	110511	110518	50 %	0 %	0 %	50 %	557940213
2245	NC_021555	TAT	2	6	110545	110550	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557940213
2246	NC_021555	TGA	2	6	110589	110594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557940213
2247	NC_021555	GCA	2	6	110618	110623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557940213
2248	NC_021555	GA	3	6	110639	110644	50 %	0 %	50 %	0 %	557940213
2249	NC_021555	AG	3	6	110736	110741	50 %	0 %	50 %	0 %	557940213
2250	NC_021555	CTT	2	6	110777	110782	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557940213
2251	NC_021555	GA	3	6	110829	110834	50 %	0 %	50 %	0 %	557940213
2252	NC_021555	CTT	2	6	110867	110872	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557940213
2253	NC_021555	ACT	2	6	110954	110959	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557940213
2254	NC_021555	GGA	2	6	110977	110982	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557940213
2255	NC_021555	CCCT	2	8	111011	111018	0 %	25 %	0 %	75 %	557940213
2256	NC_021555	GTCA	2	8	111038	111045	25 %	25 %	25 %	25 %	557940213
2257	NC_021555	TC	3	6	111107	111112	0 %	50 %	0 %	50 %	557940213
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2260	NC_021555	C	6	6	111267	111272	0 %	0 %	0 %	100 %	557940213
2261	NC_021555	TGT	2	6	111292	111297	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557940213
2262	NC_021555	TGAAA	2	10	111305	111314	60 %	20 %	20 %	0 %	557940213
2263	NC_021555	TGG	2	6	111348	111353	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557940213
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2265	NC_021555	TTTA	2	8	111374	111381	25 %	75 %	0 %	0 %	557940213
2266	NC_021555	ACA	2	6	111384	111389	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557940213
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2270	NC_021555	GT	3	6	111550	111555	0 %	50 %	50 %	0 %	557940213
2271	NC_021555	CAT	2	6	111562	111567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557940213
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2276	NC_021555	AACCTC	2	12	111872	111883	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	557940214
2277	NC_021555	TGA	2	6	111912	111917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557940214
2278	NC_021555	AATAT	2	10	111978	111987	60 %	40 %	0 %	0 %	557940214
2279	NC_021555	TCCAA	2	10	112040	112049	40 %	20 %	0 %	40 %	557940214
2280	NC_021555	CAT	2	6	112098	112103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557940214
2281	NC_021555	ACC	2	6	112108	112113	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557940214
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2284	NC_021555	AGG	2	6	112361	112366	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557940214
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2287	NC_021555	CCCA	2	8	112510	112517	25 %	0 %	0 %	75 %	557940214
2288	NC_021555	TTA	2	6	112670	112675	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557940214
2289	NC_021555	ATG	2	6	112679	112684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557940214
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2292	NC_021555	ATA	2	6	112862	112867	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557940214
2293	NC_021555	CTA	2	6	112868	112873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557940214
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2297	NC_021555	AGCTG	2	10	113079	113088	20 %	20 %	40 %	20 %	557940215
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2335	NC_021555	GCT	2	6	114678	114683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557940217
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2346	NC_021555	A	7	7	115371	115377	100 %	0 %	0 %	0 %	557940218
2347	NC_021555	CA	3	6	115379	115384	50 %	0 %	0 %	50 %	557940218
2348	NC_021555	CTG	2	6	115453	115458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557940218
2349	NC_021555	CTG	2	6	115510	115515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557940218
2350	NC_021555	CAT	2	6	115551	115556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557940218
2351	NC_021555	TGTTT	2	10	115590	115599	0 %	80 %	20 %	0 %	557940219
2352	NC_021555	ACA	3	9	115671	115679	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557940219
2353	NC_021555	CAG	2	6	115696	115701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557940219
2354	NC_021555	CCT	2	6	115773	115778	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557940219
2355	NC_021555	TAAT	2	8	115791	115798	50 %	50 %	0 %	0 %	557940219
2356	NC_021555	GAA	2	6	115912	115917	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557940219
2357	NC_021555	AGG	2	6	115920	115925	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557940219
2358	NC_021555	TGATTT	2	12	115961	115972	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	557940219
2359	NC_021555	C	7	7	116040	116046	0 %	0 %	0 %	100 %	557940219
2360	NC_021555	TTC	2	6	116048	116053	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557940219
2361	NC_021555	TC	3	6	116061	116066	0 %	50 %	0 %	50 %	557940219
2362	NC_021555	AAG	2	6	116078	116083	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557940219
2363	NC_021555	CCTGT	2	10	116088	116097	0 %	40 %	20 %	40 %	557940219
2364	NC_021555	CCA	2	6	116136	116141	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557940219
2365	NC_021555	AAC	2	6	116170	116175	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557940219
2366	NC_021555	ACC	2	6	116211	116216	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557940219
2367	NC_021555	GTT	2	6	116289	116294	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557940220
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2369	NC_021555	ATT	2	6	116358	116363	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557940220
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2490	NC_021555	CAT	2	6	121539	121544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557940227
2491	NC_021555	T	6	6	121552	121557	0 %	100 %	0 %	0 %	557940227
2492	NC_021555	T	7	7	121742	121748	0 %	100 %	0 %	0 %	557940228
2493	NC_021555	GTTT	2	8	121840	121847	0 %	75 %	25 %	0 %	557940228
2494	NC_021555	CT	3	6	121917	121922	0 %	50 %	0 %	50 %	557940228
2495	NC_021555	GTTTT	2	10	121976	121985	0 %	80 %	20 %	0 %	557940228
2496	NC_021555	TCT	2	6	122039	122044	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557940228
2497	NC_021555	ATTA	2	8	122068	122075	50 %	50 %	0 %	0 %	557940228
2498	NC_021555	ACA	2	6	122093	122098	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557940228
2499	NC_021555	GT	3	6	122124	122129	0 %	50 %	50 %	0 %	557940228
2500	NC_021555	CAG	2	6	122142	122147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557940228

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