MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Coding Repeats of Candidatus Tremblaya phenacola PAVE

Total Repeats: 3478

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_021555	CTTT	2	8	75650	75657	0 %	75 %	0 %	25 %	557940178
1502	NC_021555	ATG	2	6	75679	75684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557940178
1503	NC_021555	GTT	2	6	75685	75690	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557940178
1504	NC_021555	TCT	2	6	75699	75704	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557940178
1505	NC_021555	CT	3	6	75751	75756	0 %	50 %	0 %	50 %	557940178
1506	NC_021555	AGC	2	6	75823	75828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557940178
1507	NC_021555	ATTG	2	8	75865	75872	25 %	50 %	25 %	0 %	557940178
1508	NC_021555	GT	3	6	75904	75909	0 %	50 %	50 %	0 %	557940178
1509	NC_021555	ACA	2	6	75947	75952	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557940178
1510	NC_021555	AAG	2	6	75974	75979	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557940178
1511	NC_021555	CT	3	6	76003	76008	0 %	50 %	0 %	50 %	557940178
1512	NC_021555	TTG	2	6	76022	76027	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557940178
1513	NC_021555	TCT	2	6	76045	76050	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557940178
1514	NC_021555	AGA	2	6	76107	76112	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557940178
1515	NC_021555	CAA	2	6	76308	76313	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557940179
1516	NC_021555	CCA	2	6	76349	76354	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557940179
1517	NC_021555	CAG	2	6	76362	76367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557940179
1518	NC_021555	AGC	2	6	76371	76376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557940179
1519	NC_021555	TAG	2	6	76380	76385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557940179
1520	NC_021555	GAA	3	9	76493	76501	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557940179
1521	NC_021555	TGGG	2	8	76515	76522	0 %	25 %	75 %	0 %	557940179
1522	NC_021555	AAGG	2	8	76556	76563	50 %	0 %	50 %	0 %	557940179
1523	NC_021555	AC	3	6	76640	76645	50 %	0 %	0 %	50 %	557940179
1524	NC_021555	CAGCT	2	10	76686	76695	20 %	20 %	20 %	40 %	557940179
1525	NC_021555	AGG	2	6	77187	77192	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557940180
1526	NC_021555	GTTCA	2	10	77195	77204	20 %	40 %	20 %	20 %	557940180
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1528	NC_021555	ACCA	2	8	77402	77409	50 %	0 %	0 %	50 %	557940180
1529	NC_021555	AAT	2	6	77459	77464	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557940180
1530	NC_021555	TTG	2	6	77479	77484	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557940180
1531	NC_021555	CCA	2	6	77496	77501	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557940180
1532	NC_021555	ATCA	2	8	77570	77577	50 %	25 %	0 %	25 %	557940180
1533	NC_021555	TTTCC	2	10	77581	77590	0 %	60 %	0 %	40 %	557940180
1534	NC_021555	AAGG	2	8	77613	77620	50 %	0 %	50 %	0 %	557940180
1535	NC_021555	TGAAA	2	10	77639	77648	60 %	20 %	20 %	0 %	557940180
1536	NC_021555	CCT	2	6	77654	77659	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557940180
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1538	NC_021555	AGGA	2	8	77714	77721	50 %	0 %	50 %	0 %	557940180
1539	NC_021555	T	6	6	77795	77800	0 %	100 %	0 %	0 %	557940180
1540	NC_021555	ATT	2	6	77874	77879	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557940180
1541	NC_021555	ATT	2	6	77955	77960	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557940180
1542	NC_021555	GTT	3	9	78103	78111	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557940181
1543	NC_021555	GTTT	2	8	78169	78176	0 %	75 %	25 %	0 %	557940181
1544	NC_021555	AGA	2	6	78245	78250	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557940181
1545	NC_021555	ATTC	2	8	78307	78314	25 %	50 %	0 %	25 %	557940181
1546	NC_021555	TTTG	2	8	78353	78360	0 %	75 %	25 %	0 %	557940181
1547	NC_021555	TGG	2	6	78373	78378	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557940181
1548	NC_021555	A	7	7	78401	78407	100 %	0 %	0 %	0 %	557940181
1549	NC_021555	GGT	2	6	78410	78415	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557940181
1550	NC_021555	CT	3	6	78453	78458	0 %	50 %	0 %	50 %	557940181
1551	NC_021555	TTGG	2	8	78461	78468	0 %	50 %	50 %	0 %	557940181
1552	NC_021555	AGG	2	6	78503	78508	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557940181
1553	NC_021555	TTGCTG	2	12	78525	78536	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	557940181
1554	NC_021555	CTG	2	6	78555	78560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557940181
1555	NC_021555	ATG	2	6	78582	78587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557940181
1556	NC_021555	AG	3	6	78656	78661	50 %	0 %	50 %	0 %	557940181
1557	NC_021555	TAC	2	6	78899	78904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557940182
1558	NC_021555	CAG	2	6	78929	78934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557940182
1559	NC_021555	ACAA	2	8	78936	78943	75 %	0 %	0 %	25 %	557940182
1560	NC_021555	AAG	2	6	78949	78954	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557940182
1561	NC_021555	CAA	2	6	78959	78964	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557940182
1562	NC_021555	CAG	2	6	79010	79015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557940182
1563	NC_021555	GAG	2	6	79030	79035	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557940182
1564	NC_021555	TTTTG	2	10	79055	79064	0 %	80 %	20 %	0 %	557940182
1565	NC_021555	TGA	2	6	79088	79093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557940182
1566	NC_021555	CCCCA	2	10	79097	79106	20 %	0 %	0 %	80 %	557940182
1567	NC_021555	AAG	2	6	79117	79122	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557940182
1568	NC_021555	ATG	2	6	79199	79204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557940182
1569	NC_021555	AAC	2	6	79285	79290	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557940182
1570	NC_021555	AGT	2	6	79294	79299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557940182
1571	NC_021555	GTTGG	2	10	79369	79378	0 %	40 %	60 %	0 %	557940183
1572	NC_021555	TGCC	2	8	79426	79433	0 %	25 %	25 %	50 %	557940183
1573	NC_021555	AG	3	6	79442	79447	50 %	0 %	50 %	0 %	557940183
1574	NC_021555	CTA	2	6	79495	79500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557940183
1575	NC_021555	CAA	2	6	79518	79523	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557940183
1576	NC_021555	CTC	2	6	79528	79533	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557940183
1577	NC_021555	TAA	2	6	79593	79598	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557940183
1578	NC_021555	ATGA	2	8	79867	79874	50 %	25 %	25 %	0 %	557940184
1579	NC_021555	TAGAT	2	10	79900	79909	40 %	40 %	20 %	0 %	557940184
1580	NC_021555	CTTC	2	8	79945	79952	0 %	50 %	0 %	50 %	557940184
1581	NC_021555	CTT	2	6	80017	80022	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557940184
1582	NC_021555	TCT	2	6	80063	80068	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557940184
1583	NC_021555	TTG	2	6	80100	80105	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557940184
1584	NC_021555	AAGA	2	8	80119	80126	75 %	0 %	25 %	0 %	557940184
1585	NC_021555	TCACT	2	10	80254	80263	20 %	40 %	0 %	40 %	557940184
1586	NC_021555	TTCT	2	8	80376	80383	0 %	75 %	0 %	25 %	557940184
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1588	NC_021555	CAA	2	6	80462	80467	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557940184
1589	NC_021555	GACCA	2	10	80485	80494	40 %	0 %	20 %	40 %	557940184
1590	NC_021555	GTT	3	9	80519	80527	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557940184
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1593	NC_021555	AAT	2	6	80591	80596	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557940184
1594	NC_021555	A	6	6	80669	80674	100 %	0 %	0 %	0 %	557940184
1595	NC_021555	TGC	2	6	80699	80704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557940184
1596	NC_021555	G	6	6	80728	80733	0 %	0 %	100 %	0 %	557940184
1597	NC_021555	AAG	2	6	80757	80762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557940184
1598	NC_021555	CAG	2	6	80779	80784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557940184
1599	NC_021555	ACCCCA	2	12	80850	80861	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557940184
1600	NC_021555	GAAC	2	8	80877	80884	50 %	0 %	25 %	25 %	557940184
1601	NC_021555	CAA	2	6	80890	80895	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557940184
1602	NC_021555	TGCC	2	8	80952	80959	0 %	25 %	25 %	50 %	557940184
1603	NC_021555	TGT	2	6	80978	80983	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557940184
1604	NC_021555	GA	3	6	80989	80994	50 %	0 %	50 %	0 %	557940184
1605	NC_021555	GCT	2	6	81116	81121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557940184
1606	NC_021555	TTTG	2	8	81128	81135	0 %	75 %	25 %	0 %	557940184
1607	NC_021555	TC	3	6	81255	81260	0 %	50 %	0 %	50 %	557940184
1608	NC_021555	TTG	2	6	81282	81287	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557940184
1609	NC_021555	TGT	2	6	81325	81330	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557940184
1610	NC_021555	GCC	2	6	81392	81397	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557940184
1611	NC_021555	GGT	2	6	81537	81542	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557940184
1612	NC_021555	CAT	2	6	81543	81548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557940184
1613	NC_021555	TTGG	2	8	81638	81645	0 %	50 %	50 %	0 %	557940184
1614	NC_021555	TAA	2	6	81652	81657	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557940184
1615	NC_021555	AGG	2	6	81691	81696	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557940184
1616	NC_021555	GAG	3	9	81712	81720	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557940184
1617	NC_021555	G	8	8	81767	81774	0 %	0 %	100 %	0 %	557940184
1618	NC_021555	TTCT	2	8	81801	81808	0 %	75 %	0 %	25 %	557940184
1619	NC_021555	GTT	2	6	81811	81816	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557940184
1620	NC_021555	AATG	2	8	82052	82059	50 %	25 %	25 %	0 %	557940184
1621	NC_021555	GGT	2	6	82061	82066	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557940184
1622	NC_021555	TGCC	2	8	82114	82121	0 %	25 %	25 %	50 %	557940184
1623	NC_021555	TC	4	8	82123	82130	0 %	50 %	0 %	50 %	557940184
1624	NC_021555	TTTTTG	2	12	82146	82157	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	557940184
1625	NC_021555	TCCA	2	8	82182	82189	25 %	25 %	0 %	50 %	557940184
1626	NC_021555	TCA	2	6	82214	82219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557940184
1627	NC_021555	GTTGGG	2	12	82256	82267	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557940184
1628	NC_021555	CATT	2	8	82311	82318	25 %	50 %	0 %	25 %	557940184
1629	NC_021555	TGC	2	6	82341	82346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557940184
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1881	NC_021555	TC	3	6	93510	93515	0 %	50 %	0 %	50 %	557940198
1882	NC_021555	TC	3	6	93519	93524	0 %	50 %	0 %	50 %	557940198
1883	NC_021555	ATC	2	6	93546	93551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557940198
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1996	NC_021555	A	6	6	98679	98684	100 %	0 %	0 %	0 %	557940203
1997	NC_021555	CAG	2	6	98726	98731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557940203
1998	NC_021555	AGC	2	6	98751	98756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557940203
1999	NC_021555	AGG	3	9	98775	98783	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557940203
2000	NC_021555	CTG	2	6	98784	98789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557940203

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