MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Candidatus Tremblaya phenacola PAVE

Total Repeats: 3478

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_021555	CTTT	2	8	50601	50608	0 %	75 %	0 %	25 %	557940154
1002	NC_021555	ACC	2	6	50657	50662	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557940154
1003	NC_021555	ATA	2	6	50673	50678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557940154
1004	NC_021555	TTG	2	6	50745	50750	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557940154
1005	NC_021555	TCA	2	6	50756	50761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557940154
1006	NC_021555	ATT	2	6	50882	50887	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557940154
1007	NC_021555	TAA	2	6	50929	50934	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557940154
1008	NC_021555	AGA	2	6	51024	51029	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557940155
1009	NC_021555	GTT	2	6	51033	51038	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557940155
1010	NC_021555	GTG	2	6	51094	51099	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557940155
1011	NC_021555	TTG	2	6	51109	51114	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557940155
1012	NC_021555	GAA	2	6	51168	51173	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557940155
1013	NC_021555	TGT	2	6	51200	51205	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557940155
1014	NC_021555	GAT	2	6	51206	51211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557940155
1015	NC_021555	TGA	2	6	51221	51226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557940155
1016	NC_021555	TTA	2	6	51349	51354	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557940155
1017	NC_021555	CT	3	6	51471	51476	0 %	50 %	0 %	50 %	557940155
1018	NC_021555	TGG	3	9	51491	51499	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557940155
1019	NC_021555	AAT	2	6	51509	51514	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557940155
1020	NC_021555	TTTG	2	8	51548	51555	0 %	75 %	25 %	0 %	557940155
1021	NC_021555	TAG	2	6	51616	51621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557940155
1022	NC_021555	AAT	2	6	51624	51629	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557940155
1023	NC_021555	GTG	2	6	51709	51714	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557940155
1024	NC_021555	TAA	2	6	51731	51736	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557940155
1025	NC_021555	AGC	2	6	51791	51796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557940155
1026	NC_021555	CTT	2	6	51845	51850	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557940155
1027	NC_021555	AAAC	2	8	51858	51865	75 %	0 %	0 %	25 %	557940155
1028	NC_021555	ATC	2	6	51876	51881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557940155
1029	NC_021555	TTG	2	6	51922	51927	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557940155
1030	NC_021555	GATG	2	8	51952	51959	25 %	25 %	50 %	0 %	557940155
1031	NC_021555	ACA	2	6	51980	51985	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557940156
1032	NC_021555	AGA	2	6	52029	52034	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557940156
1033	NC_021555	TC	3	6	52044	52049	0 %	50 %	0 %	50 %	557940156
1034	NC_021555	GCA	2	6	52094	52099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557940156
1035	NC_021555	TTTGTA	2	12	52140	52151	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	557940156
1036	NC_021555	GCC	2	6	52199	52204	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557940156
1037	NC_021555	AAG	2	6	52274	52279	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557940156
1038	NC_021555	TGA	2	6	52351	52356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557940156
1039	NC_021555	AGA	2	6	52372	52377	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557940156
1040	NC_021555	CAG	3	9	52378	52386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557940156
1041	NC_021555	TGG	2	6	52492	52497	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557940156
1042	NC_021555	AAC	2	6	52543	52548	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557940156
1043	NC_021555	ATG	2	6	52563	52568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557940156
1044	NC_021555	TAT	2	6	52603	52608	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557940156
1045	NC_021555	TGC	2	6	52669	52674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557940156
1046	NC_021555	TAA	2	6	52804	52809	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557940156
1047	NC_021555	TCA	2	6	52852	52857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557940156
1048	NC_021555	AGA	2	6	52903	52908	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557940156
1049	NC_021555	AGATG	2	10	53005	53014	40 %	20 %	40 %	0 %	557940156
1050	NC_021555	TGG	2	6	53043	53048	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557940156
1051	NC_021555	GAA	2	6	53116	53121	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557940157
1052	NC_021555	AAGA	2	8	53125	53132	75 %	0 %	25 %	0 %	557940157
1053	NC_021555	A	6	6	53290	53295	100 %	0 %	0 %	0 %	557940157
1054	NC_021555	GTT	2	6	53301	53306	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557940157
1055	NC_021555	ATG	2	6	53347	53352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557940157
1056	NC_021555	AG	3	6	53420	53425	50 %	0 %	50 %	0 %	557940157
1057	NC_021555	AAG	2	6	53858	53863	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557940158
1058	NC_021555	TGG	2	6	53886	53891	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557940158
1059	NC_021555	C	7	7	53972	53978	0 %	0 %	0 %	100 %	557940158
1060	NC_021555	TTA	2	6	54025	54030	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557940158
1061	NC_021555	CTT	2	6	54037	54042	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557940158
1062	NC_021555	AG	3	6	54046	54051	50 %	0 %	50 %	0 %	557940158
1063	NC_021555	AGTT	2	8	54110	54117	25 %	50 %	25 %	0 %	557940158
1064	NC_021555	ATG	2	6	54149	54154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557940158
1065	NC_021555	CAG	2	6	54191	54196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557940158
1066	NC_021555	TTG	2	6	54274	54279	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557940158
1067	NC_021555	CAT	2	6	54372	54377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557940158
1068	NC_021555	GTT	2	6	54418	54423	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557940158
1069	NC_021555	ATG	2	6	54425	54430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557940158
1070	NC_021555	GTTA	2	8	54453	54460	25 %	50 %	25 %	0 %	557940158
1071	NC_021555	ATC	2	6	54537	54542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557940158
1072	NC_021555	AAG	2	6	54547	54552	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557940158
1073	NC_021555	AAC	2	6	54613	54618	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557940158
1074	NC_021555	A	6	6	54652	54657	100 %	0 %	0 %	0 %	557940158
1075	NC_021555	GTTA	2	8	54666	54673	25 %	50 %	25 %	0 %	557940158
1076	NC_021555	CCCCAA	2	12	54723	54734	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557940159
1077	NC_021555	T	6	6	54745	54750	0 %	100 %	0 %	0 %	557940159
1078	NC_021555	CAGCT	2	10	54756	54765	20 %	20 %	20 %	40 %	557940159
1079	NC_021555	AAC	2	6	54826	54831	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557940159
1080	NC_021555	TTGGG	2	10	54850	54859	0 %	40 %	60 %	0 %	557940159
1081	NC_021555	AAGGC	2	10	54880	54889	40 %	0 %	40 %	20 %	557940159
1082	NC_021555	TAA	2	6	54905	54910	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557940159
1083	NC_021555	TAA	2	6	54957	54962	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557940159
1084	NC_021555	CAG	2	6	55019	55024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557940159
1085	NC_021555	TGT	2	6	55080	55085	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557940159
1086	NC_021555	AAG	2	6	55126	55131	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557940159
1087	NC_021555	TAG	2	6	55221	55226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557940159
1088	NC_021555	CT	3	6	55319	55324	0 %	50 %	0 %	50 %	557940159
1089	NC_021555	CTTC	2	8	55327	55334	0 %	50 %	0 %	50 %	557940159
1090	NC_021555	TGG	2	6	55416	55421	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557940159
1091	NC_021555	ATCAG	2	10	55438	55447	40 %	20 %	20 %	20 %	557940159
1092	NC_021555	ATC	2	6	55460	55465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557940159
1093	NC_021555	GTT	2	6	55468	55473	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557940159
1094	NC_021555	TCA	2	6	55553	55558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557940159
1095	NC_021555	CT	4	8	55564	55571	0 %	50 %	0 %	50 %	557940159
1096	NC_021555	TC	3	6	55657	55662	0 %	50 %	0 %	50 %	557940159
1097	NC_021555	AGCATT	2	12	55678	55689	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	557940159
1098	NC_021555	TCT	2	6	55690	55695	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557940159
1099	NC_021555	CTGC	2	8	55700	55707	0 %	25 %	25 %	50 %	557940159
1100	NC_021555	TTCA	2	8	55716	55723	25 %	50 %	0 %	25 %	557940159
1101	NC_021555	CAG	2	6	55829	55834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557940159
1102	NC_021555	CCT	2	6	55860	55865	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557940159
1103	NC_021555	TGAG	2	8	55902	55909	25 %	25 %	50 %	0 %	557940159
1104	NC_021555	CAGAAA	2	12	55923	55934	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	557940160
1105	NC_021555	GTT	2	6	55964	55969	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557940160
1106	NC_021555	TTGT	2	8	56010	56017	0 %	75 %	25 %	0 %	557940160
1107	NC_021555	GTCT	2	8	56061	56068	0 %	50 %	25 %	25 %	557940160
1108	NC_021555	G	6	6	56070	56075	0 %	0 %	100 %	0 %	557940160
1109	NC_021555	T	6	6	56114	56119	0 %	100 %	0 %	0 %	557940160
1110	NC_021555	AGGC	2	8	56127	56134	25 %	0 %	50 %	25 %	557940160
1111	NC_021555	TAG	2	6	56152	56157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557940160
1112	NC_021555	ACC	2	6	56183	56188	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557940160
1113	NC_021555	CAAA	2	8	56193	56200	75 %	0 %	0 %	25 %	557940160
1114	NC_021555	CCT	2	6	56238	56243	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557940160
1115	NC_021555	CCT	2	6	56272	56277	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557940160
1116	NC_021555	A	7	7	56318	56324	100 %	0 %	0 %	0 %	557940160
1117	NC_021555	TGG	2	6	56828	56833	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557940161
1118	NC_021555	ACA	2	6	56884	56889	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557940161
1119	NC_021555	AG	3	6	56964	56969	50 %	0 %	50 %	0 %	557940161
1120	NC_021555	GAGG	2	8	57037	57044	25 %	0 %	75 %	0 %	557940161
1121	NC_021555	AATTG	2	10	57064	57073	40 %	40 %	20 %	0 %	557940161
1122	NC_021555	GGTT	2	8	57094	57101	0 %	50 %	50 %	0 %	557940161
1123	NC_021555	GATCT	2	10	57224	57233	20 %	40 %	20 %	20 %	557940162
1124	NC_021555	GCC	2	6	57269	57274	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557940162
1125	NC_021555	CAA	2	6	57295	57300	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557940162
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1499	NC_021555	CAATT	2	10	75586	75595	40 %	40 %	0 %	20 %	557940178
1500	NC_021555	ACTT	2	8	75624	75631	25 %	50 %	0 %	25 %	557940178

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