MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Candidatus Tremblaya phenacola PAVE

Total Repeats: 3478

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_021555	T	8	8	23750	23757	0 %	100 %	0 %	0 %	557940131
502	NC_021555	A	8	8	23767	23774	100 %	0 %	0 %	0 %	557940131
503	NC_021555	AAT	2	6	23795	23800	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557940131
504	NC_021555	T	6	6	23807	23812	0 %	100 %	0 %	0 %	557940131
505	NC_021555	A	6	6	23853	23858	100 %	0 %	0 %	0 %	557940131
506	NC_021555	TCT	2	6	23868	23873	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557940131
507	NC_021555	TCTT	2	8	23901	23908	0 %	75 %	0 %	25 %	557940131
508	NC_021555	T	6	6	23954	23959	0 %	100 %	0 %	0 %	557940131
509	NC_021555	TGG	2	6	24054	24059	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557940131
510	NC_021555	GAGGTT	2	12	24257	24268	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	557940131
511	NC_021555	C	6	6	24279	24284	0 %	0 %	0 %	100 %	557940131
512	NC_021555	TTTC	2	8	24375	24382	0 %	75 %	0 %	25 %	557940131
513	NC_021555	TAATT	2	10	24505	24514	40 %	60 %	0 %	0 %	557940132
514	NC_021555	AAC	2	6	24526	24531	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557940132
515	NC_021555	AGC	2	6	24535	24540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557940132
516	NC_021555	TTC	2	6	24551	24556	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557940132
517	NC_021555	TTCG	2	8	24673	24680	0 %	50 %	25 %	25 %	557940132
518	NC_021555	GAT	2	6	24682	24687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557940132
519	NC_021555	AGC	2	6	24775	24780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557940132
520	NC_021555	CATCAA	2	12	24795	24806	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	557940132
521	NC_021555	CATC	2	8	24819	24826	25 %	25 %	0 %	50 %	557940132
522	NC_021555	AGC	2	6	24886	24891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557940132
523	NC_021555	AAC	2	6	24910	24915	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557940132
524	NC_021555	TAAG	2	8	24922	24929	50 %	25 %	25 %	0 %	557940132
525	NC_021555	C	6	6	24930	24935	0 %	0 %	0 %	100 %	557940132
526	NC_021555	TTGA	2	8	24943	24950	25 %	50 %	25 %	0 %	557940132
527	NC_021555	CCCT	2	8	24959	24966	0 %	25 %	0 %	75 %	557940132
528	NC_021555	TCA	2	6	24977	24982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557940132
529	NC_021555	CCT	2	6	25078	25083	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557940132
530	NC_021555	TTG	2	6	25104	25109	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557940132
531	NC_021555	TGGTT	2	10	25135	25144	0 %	60 %	40 %	0 %	557940132
532	NC_021555	GA	3	6	25185	25190	50 %	0 %	50 %	0 %	557940132
533	NC_021555	TAA	2	6	25266	25271	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557940132
534	NC_021555	GTT	2	6	25284	25289	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557940132
535	NC_021555	AAT	2	6	25369	25374	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557940132
536	NC_021555	TTA	2	6	25419	25424	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557940132
537	NC_021555	CT	3	6	25450	25455	0 %	50 %	0 %	50 %	557940132
538	NC_021555	TGT	2	6	25486	25491	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557940132
539	NC_021555	GTT	2	6	25531	25536	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557940132
540	NC_021555	AACC	2	8	25584	25591	50 %	0 %	0 %	50 %	557940132
541	NC_021555	CCAA	2	8	25639	25646	50 %	0 %	0 %	50 %	557940132
542	NC_021555	CCT	2	6	25674	25679	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557940132
543	NC_021555	CCAGA	2	10	25701	25710	40 %	0 %	20 %	40 %	557940132
544	NC_021555	GT	3	6	25757	25762	0 %	50 %	50 %	0 %	557940132
545	NC_021555	AG	3	6	25766	25771	50 %	0 %	50 %	0 %	557940132
546	NC_021555	TAG	2	6	25776	25781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557940132
547	NC_021555	AATT	2	8	25791	25798	50 %	50 %	0 %	0 %	557940132
548	NC_021555	TTTGA	2	10	25816	25825	20 %	60 %	20 %	0 %	557940132
549	NC_021555	TTG	2	6	25844	25849	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557940132
550	NC_021555	AAC	2	6	25879	25884	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557940132
551	NC_021555	GTT	2	6	25911	25916	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557940132
552	NC_021555	GCT	2	6	25939	25944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557940132
553	NC_021555	GAA	2	6	26014	26019	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557940132
554	NC_021555	TGT	2	6	26020	26025	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557940132
555	NC_021555	GCT	2	6	26111	26116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557940132
556	NC_021555	TCA	2	6	26120	26125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557940132
557	NC_021555	GATC	2	8	26136	26143	25 %	25 %	25 %	25 %	557940132
558	NC_021555	GAA	2	6	26196	26201	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557940132
559	NC_021555	TAC	2	6	26269	26274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557940132
560	NC_021555	TGG	2	6	26285	26290	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557940132
561	NC_021555	TCA	2	6	26312	26317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557940132
562	NC_021555	GGT	2	6	26344	26349	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557940132
563	NC_021555	TAGT	2	8	26381	26388	25 %	50 %	25 %	0 %	557940132
564	NC_021555	GCT	2	6	26438	26443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557940132
565	NC_021555	CTAA	2	8	26501	26508	50 %	25 %	0 %	25 %	557940132
566	NC_021555	TAA	2	6	26556	26561	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557940132
567	NC_021555	TGA	2	6	26621	26626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557940132
568	NC_021555	TGGTGC	2	12	26646	26657	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	557940132
569	NC_021555	AAAC	2	8	26673	26680	75 %	0 %	0 %	25 %	557940132
570	NC_021555	TTG	3	9	26936	26944	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557940133
571	NC_021555	TCT	2	6	26980	26985	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557940133
572	NC_021555	TAG	2	6	27015	27020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557940133
573	NC_021555	GGT	2	6	27106	27111	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557940133
574	NC_021555	TTC	2	6	27162	27167	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557940133
575	NC_021555	TCAA	2	8	27183	27190	50 %	25 %	0 %	25 %	557940133
576	NC_021555	CAA	2	6	27303	27308	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557940133
577	NC_021555	TGG	2	6	27402	27407	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557940133
578	NC_021555	ATC	2	6	27461	27466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557940133
579	NC_021555	GAA	2	6	27553	27558	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557940133
580	NC_021555	A	8	8	27673	27680	100 %	0 %	0 %	0 %	557940133
581	NC_021555	A	7	7	27703	27709	100 %	0 %	0 %	0 %	557940133
582	NC_021555	GAA	2	6	27748	27753	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557940133
583	NC_021555	TTG	2	6	27794	27799	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557940133
584	NC_021555	AAC	2	6	28026	28031	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557940133
585	NC_021555	AAGG	2	8	28094	28101	50 %	0 %	50 %	0 %	557940133
586	NC_021555	GAT	2	6	28150	28155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557940133
587	NC_021555	TTA	2	6	28219	28224	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557940133
588	NC_021555	AGA	2	6	28227	28232	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557940133
589	NC_021555	A	6	6	28311	28316	100 %	0 %	0 %	0 %	557940133
590	NC_021555	TGA	2	6	28335	28340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557940133
591	NC_021555	ATT	2	6	28374	28379	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557940133
592	NC_021555	AAT	2	6	28489	28494	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557940133
593	NC_021555	TAA	2	6	28535	28540	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557940133
594	NC_021555	TGA	2	6	28551	28556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557940133
595	NC_021555	CTT	2	6	28649	28654	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557940133
596	NC_021555	GTTA	2	8	28684	28691	25 %	50 %	25 %	0 %	557940133
597	NC_021555	TTC	2	6	28722	28727	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557940134
598	NC_021555	AAAC	2	8	28737	28744	75 %	0 %	0 %	25 %	557940134
599	NC_021555	G	6	6	28771	28776	0 %	0 %	100 %	0 %	557940134
600	NC_021555	AGAAAG	2	12	28814	28825	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557940134
601	NC_021555	GTTG	2	8	28861	28868	0 %	50 %	50 %	0 %	557940134
602	NC_021555	CT	5	10	28872	28881	0 %	50 %	0 %	50 %	557940134
603	NC_021555	T	7	7	28888	28894	0 %	100 %	0 %	0 %	557940134
604	NC_021555	TGT	2	6	28906	28911	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557940134
605	NC_021555	AAG	2	6	28918	28923	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557940134
606	NC_021555	AAT	2	6	28933	28938	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557940134
607	NC_021555	GTT	2	6	28970	28975	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557940134
608	NC_021555	CCCAA	2	10	28990	28999	40 %	0 %	0 %	60 %	557940134
609	NC_021555	TAG	2	6	29031	29036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557940134
610	NC_021555	TTA	2	6	29052	29057	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557940134
611	NC_021555	CAAA	2	8	29090	29097	75 %	0 %	0 %	25 %	557940134
612	NC_021555	ATT	2	6	29174	29179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557940134
613	NC_021555	GTTA	2	8	29212	29219	25 %	50 %	25 %	0 %	557940134
614	NC_021555	AGG	2	6	29318	29323	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557940134
615	NC_021555	AAG	2	6	29385	29390	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557940134
616	NC_021555	AGAC	2	8	29476	29483	50 %	0 %	25 %	25 %	557940135
617	NC_021555	GGCA	2	8	29593	29600	25 %	0 %	50 %	25 %	557940135
618	NC_021555	AGC	2	6	29625	29630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557940135
619	NC_021555	CTT	2	6	29639	29644	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557940135
620	NC_021555	TTTTG	2	10	29673	29682	0 %	80 %	20 %	0 %	557940135
621	NC_021555	CAT	2	6	29702	29707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557940135
622	NC_021555	CA	3	6	29719	29724	50 %	0 %	0 %	50 %	557940135
623	NC_021555	ATCAG	2	10	29734	29743	40 %	20 %	20 %	20 %	557940135
624	NC_021555	T	6	6	29814	29819	0 %	100 %	0 %	0 %	557940135
625	NC_021555	AAC	2	6	29848	29853	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557940135
626	NC_021555	TCA	2	6	29873	29878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557940135
627	NC_021555	TTA	2	6	29884	29889	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557940135
628	NC_021555	TCCAA	2	10	29895	29904	40 %	20 %	0 %	40 %	557940135
629	NC_021555	CTCAG	2	10	29932	29941	20 %	20 %	20 %	40 %	557940135
630	NC_021555	TCA	2	6	29983	29988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557940135
631	NC_021555	ATTA	2	8	29997	30004	50 %	50 %	0 %	0 %	557940135
632	NC_021555	CAA	2	6	30035	30040	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557940135
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642	NC_021555	TTTGA	2	10	30288	30297	20 %	60 %	20 %	0 %	557940135
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645	NC_021555	TTA	2	6	30388	30393	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557940136
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660	NC_021555	TAA	2	6	30830	30835	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557940137
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662	NC_021555	GGCT	2	8	31734	31741	0 %	25 %	50 %	25 %	557940138
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665	NC_021555	GA	4	8	31897	31904	50 %	0 %	50 %	0 %	557940138
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739	NC_021555	T	7	7	37248	37254	0 %	100 %	0 %	0 %	557940142
740	NC_021555	ATA	2	6	37299	37304	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557940142
741	NC_021555	A	6	6	37376	37381	100 %	0 %	0 %	0 %	557940142
742	NC_021555	CT	3	6	37406	37411	0 %	50 %	0 %	50 %	557940142
743	NC_021555	GTT	2	6	37467	37472	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557940142
744	NC_021555	TAA	2	6	37512	37517	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557940143
745	NC_021555	CTT	2	6	37600	37605	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557940143
746	NC_021555	AGA	2	6	37644	37649	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557940143
747	NC_021555	CAT	2	6	37656	37661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557940143
748	NC_021555	C	6	6	37670	37675	0 %	0 %	0 %	100 %	557940143
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750	NC_021555	AAC	2	6	37755	37760	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557940143
751	NC_021555	TTTTG	2	10	37783	37792	0 %	80 %	20 %	0 %	557940143
752	NC_021555	CTC	2	6	37818	37823	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557940143
753	NC_021555	TAA	3	9	37919	37927	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557940143
754	NC_021555	C	6	6	37929	37934	0 %	0 %	0 %	100 %	557940143
755	NC_021555	CCAT	2	8	38056	38063	25 %	25 %	0 %	50 %	557940143
756	NC_021555	ACAA	2	8	38169	38176	75 %	0 %	0 %	25 %	557940143
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758	NC_021555	CTG	2	6	38323	38328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557940143
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