MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Chthonomonas calidirosea T49 complete genome

Total Repeats: 6786

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021487	GTAG	2	8	592	599	25 %	25 %	50 %	0 %	512550082
2	NC_021487	ACCT	2	8	649	656	25 %	25 %	0 %	50 %	512550082
3	NC_021487	TGGT	2	8	698	705	0 %	50 %	50 %	0 %	512550082
4	NC_021487	ATCT	2	8	862	869	25 %	50 %	0 %	25 %	512550082
5	NC_021487	AGGG	2	8	1608	1615	25 %	0 %	75 %	0 %	512550083
6	NC_021487	ATCC	2	8	2318	2325	25 %	25 %	0 %	50 %	512550084
7	NC_021487	ACCT	2	8	2982	2989	25 %	25 %	0 %	50 %	512550085
8	NC_021487	TTCG	2	8	3061	3068	0 %	50 %	25 %	25 %	512550085
9	NC_021487	GGAG	2	8	5618	5625	25 %	0 %	75 %	0 %	512550088
10	NC_021487	CCGC	2	8	7218	7225	0 %	0 %	25 %	75 %	512550090
11	NC_021487	AGCC	2	8	7339	7346	25 %	0 %	25 %	50 %	512550090
12	NC_021487	AGGG	2	8	7487	7494	25 %	0 %	75 %	0 %	512550090
13	NC_021487	AGGC	2	8	7735	7742	25 %	0 %	50 %	25 %	512550090
14	NC_021487	TCCA	2	8	8199	8206	25 %	25 %	0 %	50 %	512550091
15	NC_021487	GGTC	2	8	8246	8253	0 %	25 %	50 %	25 %	512550091
16	NC_021487	ATGA	2	8	8460	8467	50 %	25 %	25 %	0 %	512550091
17	NC_021487	CTTG	2	8	9190	9197	0 %	50 %	25 %	25 %	512550091
18	NC_021487	AGGG	2	8	9472	9479	25 %	0 %	75 %	0 %	512550092
19	NC_021487	AGGT	2	8	9560	9567	25 %	25 %	50 %	0 %	512550092
20	NC_021487	AAGT	2	8	10023	10030	50 %	25 %	25 %	0 %	512550092
21	NC_021487	TGCT	2	8	10352	10359	0 %	50 %	25 %	25 %	512550093
22	NC_021487	TGTT	2	8	11199	11206	0 %	75 %	25 %	0 %	512550094
23	NC_021487	CCAC	2	8	11390	11397	25 %	0 %	0 %	75 %	512550094
24	NC_021487	ATCA	2	8	11550	11557	50 %	25 %	0 %	25 %	512550095
25	NC_021487	GTGC	2	8	11815	11822	0 %	25 %	50 %	25 %	512550095
26	NC_021487	TTCT	2	8	11872	11879	0 %	75 %	0 %	25 %	512550095
27	NC_021487	CTTC	2	8	13591	13598	0 %	50 %	0 %	50 %	512550096
28	NC_021487	CAGG	2	8	13927	13934	25 %	0 %	50 %	25 %	512550096
29	NC_021487	CGCC	2	8	13945	13952	0 %	0 %	25 %	75 %	512550096
30	NC_021487	GGCG	2	8	14107	14114	0 %	0 %	75 %	25 %	512550096
31	NC_021487	GCCG	2	8	14251	14258	0 %	0 %	50 %	50 %	512550096
32	NC_021487	GCTG	2	8	15094	15101	0 %	25 %	50 %	25 %	512550096
33	NC_021487	TGCT	2	8	15465	15472	0 %	50 %	25 %	25 %	512550096
34	NC_021487	CTTA	2	8	16257	16264	25 %	50 %	0 %	25 %	512550097
35	NC_021487	CTCC	2	8	16596	16603	0 %	25 %	0 %	75 %	512550097
36	NC_021487	CCAA	2	8	17266	17273	50 %	0 %	0 %	50 %	512550099
37	NC_021487	CTTC	2	8	17390	17397	0 %	50 %	0 %	50 %	512550099
38	NC_021487	CCAC	2	8	17414	17421	25 %	0 %	0 %	75 %	512550099
39	NC_021487	ATCA	2	8	17975	17982	50 %	25 %	0 %	25 %	512550100
40	NC_021487	TCAC	2	8	18717	18724	25 %	25 %	0 %	50 %	512550100
41	NC_021487	CCTC	2	8	19126	19133	0 %	25 %	0 %	75 %	512550100
42	NC_021487	TGGG	2	8	19218	19225	0 %	25 %	75 %	0 %	512550100
43	NC_021487	GGCC	2	8	19293	19300	0 %	0 %	50 %	50 %	512550100
44	NC_021487	GGCG	2	8	19498	19505	0 %	0 %	75 %	25 %	512550100
45	NC_021487	CGCC	2	8	19744	19751	0 %	0 %	25 %	75 %	512550100
46	NC_021487	TCCC	2	8	20381	20388	0 %	25 %	0 %	75 %	512550101
47	NC_021487	CCCG	2	8	20969	20976	0 %	0 %	25 %	75 %	512550101
48	NC_021487	AGGT	2	8	21088	21095	25 %	25 %	50 %	0 %	512550101
49	NC_021487	CATT	2	8	23697	23704	25 %	50 %	0 %	25 %	512550103
50	NC_021487	CTTG	2	8	23865	23872	0 %	50 %	25 %	25 %	512550103
51	NC_021487	ATGG	2	8	24058	24065	25 %	25 %	50 %	0 %	512550103
52	NC_021487	GGTG	2	8	24331	24338	0 %	25 %	75 %	0 %	512550103
53	NC_021487	GGCA	2	8	24409	24416	25 %	0 %	50 %	25 %	512550103
54	NC_021487	GGCA	2	8	24809	24816	25 %	0 %	50 %	25 %	512550104
55	NC_021487	GAAC	2	8	25453	25460	50 %	0 %	25 %	25 %	512550105
56	NC_021487	ATTC	2	8	26050	26057	25 %	50 %	0 %	25 %	512550106
57	NC_021487	GTCG	2	8	27036	27043	0 %	25 %	50 %	25 %	512550108
58	NC_021487	AGGG	2	8	27254	27261	25 %	0 %	75 %	0 %	512550108
59	NC_021487	GTTC	2	8	27584	27591	0 %	50 %	25 %	25 %	512550108
60	NC_021487	AGCC	2	8	27758	27765	25 %	0 %	25 %	50 %	512550108
61	NC_021487	CCAC	2	8	27767	27774	25 %	0 %	0 %	75 %	512550108
62	NC_021487	CGCT	2	8	27787	27794	0 %	25 %	25 %	50 %	512550108
63	NC_021487	CAGC	2	8	28451	28458	25 %	0 %	25 %	50 %	512550110
64	NC_021487	TGCA	2	8	28770	28777	25 %	25 %	25 %	25 %	512550110
65	NC_021487	AGGA	2	8	29024	29031	50 %	0 %	50 %	0 %	512550110
66	NC_021487	TAGA	2	8	29046	29053	50 %	25 %	25 %	0 %	512550110
67	NC_021487	TGGT	2	8	29075	29082	0 %	50 %	50 %	0 %	512550110
68	NC_021487	CGGG	2	8	29433	29440	0 %	0 %	75 %	25 %	512550111
69	NC_021487	GCCA	2	8	30537	30544	25 %	0 %	25 %	50 %	512550111
70	NC_021487	CAGA	2	8	30556	30563	50 %	0 %	25 %	25 %	512550111
71	NC_021487	TGGG	2	8	31039	31046	0 %	25 %	75 %	0 %	512550112
72	NC_021487	CGCA	2	8	32070	32077	25 %	0 %	25 %	50 %	512550112
73	NC_021487	CAAG	2	8	32192	32199	50 %	0 %	25 %	25 %	512550112
74	NC_021487	CGTT	2	8	32521	32528	0 %	50 %	25 %	25 %	512550113
75	NC_021487	CTCA	2	8	32746	32753	25 %	25 %	0 %	50 %	512550113
76	NC_021487	AAGA	2	8	32900	32907	75 %	0 %	25 %	0 %	512550113
77	NC_021487	TCTT	2	8	33400	33407	0 %	75 %	0 %	25 %	512550113
78	NC_021487	GCGT	2	8	33926	33933	0 %	25 %	50 %	25 %	512550114
79	NC_021487	GGCC	2	8	34446	34453	0 %	0 %	50 %	50 %	512550114
80	NC_021487	GGAA	2	8	34985	34992	50 %	0 %	50 %	0 %	512550115
81	NC_021487	GCGT	2	8	35392	35399	0 %	25 %	50 %	25 %	512550116
82	NC_021487	GGCG	2	8	35660	35667	0 %	0 %	75 %	25 %	512550116
83	NC_021487	GATA	2	8	36315	36322	50 %	25 %	25 %	0 %	512550116
84	NC_021487	CGCT	2	8	36822	36829	0 %	25 %	25 %	50 %	512550117
85	NC_021487	TCAC	2	8	39557	39564	25 %	25 %	0 %	50 %	512550119
86	NC_021487	GCTT	2	8	39706	39713	0 %	50 %	25 %	25 %	512550119
87	NC_021487	CCAT	2	8	40170	40177	25 %	25 %	0 %	50 %	512550119
88	NC_021487	GCCA	2	8	40194	40201	25 %	0 %	25 %	50 %	512550119
89	NC_021487	TTTA	2	8	41065	41072	25 %	75 %	0 %	0 %	512550120
90	NC_021487	CCAT	2	8	42223	42230	25 %	25 %	0 %	50 %	512550120
91	NC_021487	GCAA	2	8	42323	42330	50 %	0 %	25 %	25 %	512550120
92	NC_021487	ACCT	2	8	42868	42875	25 %	25 %	0 %	50 %	512550120
93	NC_021487	ACCA	2	8	43403	43410	50 %	0 %	0 %	50 %	512550120
94	NC_021487	AAAG	2	8	43692	43699	75 %	0 %	25 %	0 %	512550120
95	NC_021487	ACCC	2	8	44907	44914	25 %	0 %	0 %	75 %	512550121
96	NC_021487	CGCC	2	8	45332	45339	0 %	0 %	25 %	75 %	512550122
97	NC_021487	CTTT	2	8	45858	45865	0 %	75 %	0 %	25 %	512550123
98	NC_021487	ATCA	2	8	46471	46478	50 %	25 %	0 %	25 %	512550124
99	NC_021487	GGAT	2	8	46919	46926	25 %	25 %	50 %	0 %	512550124
100	NC_021487	CCAG	2	8	47102	47109	25 %	0 %	25 %	50 %	512550124
101	NC_021487	CGTG	2	8	47377	47384	0 %	25 %	50 %	25 %	512550125
102	NC_021487	CTTT	2	8	47555	47562	0 %	75 %	0 %	25 %	512550125
103	NC_021487	CCTG	2	8	47905	47912	0 %	25 %	25 %	50 %	512550126
104	NC_021487	CTCC	2	8	48203	48210	0 %	25 %	0 %	75 %	512550126
105	NC_021487	AGCC	2	8	48935	48942	25 %	0 %	25 %	50 %	512550127
106	NC_021487	ACCA	2	8	49045	49052	50 %	0 %	0 %	50 %	512550127
107	NC_021487	GAGC	2	8	50347	50354	25 %	0 %	50 %	25 %	512550128
108	NC_021487	GTTC	2	8	51486	51493	0 %	50 %	25 %	25 %	512550129
109	NC_021487	CACC	2	8	51668	51675	25 %	0 %	0 %	75 %	512550130
110	NC_021487	TATC	2	8	51968	51975	25 %	50 %	0 %	25 %	512550130
111	NC_021487	TGAA	2	8	52027	52034	50 %	25 %	25 %	0 %	512550130
112	NC_021487	AAGG	2	8	52119	52126	50 %	0 %	50 %	0 %	512550130
113	NC_021487	AGTA	2	8	52129	52136	50 %	25 %	25 %	0 %	512550130
114	NC_021487	GAAG	2	8	52688	52695	50 %	0 %	50 %	0 %	512550130
115	NC_021487	CTCA	2	8	52828	52835	25 %	25 %	0 %	50 %	512550130
116	NC_021487	TGGA	2	8	53123	53130	25 %	25 %	50 %	0 %	512550131
117	NC_021487	CACT	2	8	54986	54993	25 %	25 %	0 %	50 %	512550132
118	NC_021487	GCCG	2	8	55188	55195	0 %	0 %	50 %	50 %	512550132
119	NC_021487	CGAA	2	8	56477	56484	50 %	0 %	25 %	25 %	512550134
120	NC_021487	GACG	2	8	56947	56954	25 %	0 %	50 %	25 %	512550134
121	NC_021487	AGCC	2	8	57234	57241	25 %	0 %	25 %	50 %	512550134
122	NC_021487	ACGA	2	8	57888	57895	50 %	0 %	25 %	25 %	512550134
123	NC_021487	TCGG	2	8	59979	59986	0 %	25 %	50 %	25 %	512550135
124	NC_021487	GGCC	2	8	61087	61094	0 %	0 %	50 %	50 %	512550136
125	NC_021487	GCAG	2	8	61950	61957	25 %	0 %	50 %	25 %	512550137
126	NC_021487	CTTT	2	8	62233	62240	0 %	75 %	0 %	25 %	512550137
127	NC_021487	ATGG	2	8	62460	62467	25 %	25 %	50 %	0 %	512550138
128	NC_021487	TTTA	2	8	64214	64221	25 %	75 %	0 %	0 %	512550140
129	NC_021487	AAGA	2	8	64578	64585	75 %	0 %	25 %	0 %	512550140
130	NC_021487	GTTG	2	8	65576	65583	0 %	50 %	50 %	0 %	512550141
131	NC_021487	TGCA	2	8	66692	66699	25 %	25 %	25 %	25 %	512550141
132	NC_021487	GTTG	2	8	68119	68126	0 %	50 %	50 %	0 %	512550143
133	NC_021487	GGTA	2	8	68151	68158	25 %	25 %	50 %	0 %	512550143
134	NC_021487	CAGA	2	8	68791	68798	50 %	0 %	25 %	25 %	512550143
135	NC_021487	CAGC	2	8	69097	69104	25 %	0 %	25 %	50 %	512550144
136	NC_021487	CGTA	2	8	69207	69214	25 %	25 %	25 %	25 %	512550144
137	NC_021487	GGAG	2	8	69317	69324	25 %	0 %	75 %	0 %	512550144
138	NC_021487	ACCG	2	8	69696	69703	25 %	0 %	25 %	50 %	512550144
139	NC_021487	GCGT	2	8	70609	70616	0 %	25 %	50 %	25 %	512550145
140	NC_021487	GCGA	2	8	71802	71809	25 %	0 %	50 %	25 %	512550147
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