MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chthonomonas calidirosea T49 complete genome

Total Repeats: 59046

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_021487	TGG	2	6	204241	204246	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512550262
3502	NC_021487	GAA	2	6	204259	204264	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512550262
3503	NC_021487	TGC	2	6	204282	204287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550262
3504	NC_021487	TGT	2	6	204300	204305	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512550262
3505	NC_021487	TGA	2	6	204391	204396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512550262
3506	NC_021487	GTTG	2	8	204400	204407	0 %	50 %	50 %	0 %	512550262
3507	NC_021487	GAT	2	6	204476	204481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512550262
3508	NC_021487	A	6	6	204575	204580	100 %	0 %	0 %	0 %	512550262
3509	NC_021487	TGGCA	2	10	204594	204603	20 %	20 %	40 %	20 %	512550262
3510	NC_021487	TCG	2	6	204645	204650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550262
3511	NC_021487	ACG	2	6	204741	204746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550262
3512	NC_021487	GC	3	6	205045	205050	0 %	0 %	50 %	50 %	512550263
3513	NC_021487	GTT	2	6	205058	205063	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512550263
3514	NC_021487	AGA	2	6	205123	205128	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512550263
3515	NC_021487	AAC	2	6	205170	205175	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512550263
3516	NC_021487	GC	3	6	205222	205227	0 %	0 %	50 %	50 %	512550263
3517	NC_021487	CTT	2	6	205244	205249	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512550263
3518	NC_021487	GCC	2	6	205300	205305	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512550263
3519	NC_021487	TGG	2	6	205392	205397	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512550263
3520	NC_021487	TCT	2	6	205441	205446	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512550263
3521	NC_021487	CGC	2	6	205493	205498	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512550263
3522	NC_021487	GT	3	6	205499	205504	0 %	50 %	50 %	0 %	512550263
3523	NC_021487	GAT	2	6	205525	205530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512550263
3524	NC_021487	GAG	2	6	205541	205546	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512550263
3525	NC_021487	AGA	2	6	205599	205604	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512550263
3526	NC_021487	GAAG	2	8	205609	205616	50 %	0 %	50 %	0 %	512550263
3527	NC_021487	TTA	2	6	205641	205646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512550263
3528	NC_021487	GCG	2	6	205822	205827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512550263
3529	NC_021487	GCGCAT	2	12	205843	205854	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	512550263
3530	NC_021487	G	6	6	205862	205867	0 %	0 %	100 %	0 %	512550263
3531	NC_021487	CTC	2	6	205888	205893	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512550263
3532	NC_021487	GGT	2	6	205918	205923	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512550263
3533	NC_021487	ATT	2	6	206030	206035	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512550263
3534	NC_021487	ACC	2	6	206069	206074	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512550263
3535	NC_021487	AT	3	6	206096	206101	50 %	50 %	0 %	0 %	512550263
3536	NC_021487	AATC	2	8	206158	206165	50 %	25 %	0 %	25 %	512550263
3537	NC_021487	GA	3	6	206253	206258	50 %	0 %	50 %	0 %	512550263
3538	NC_021487	GGC	2	6	206293	206298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512550263
3539	NC_021487	TCT	2	6	206316	206321	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512550263
3540	NC_021487	GCC	2	6	206342	206347	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512550263
3541	NC_021487	TGG	2	6	206391	206396	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512550263
3542	NC_021487	GAG	2	6	206468	206473	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512550263
3543	NC_021487	TGA	2	6	206526	206531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512550263
3544	NC_021487	GTG	2	6	206556	206561	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512550263
3545	NC_021487	GAG	2	6	206609	206614	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512550263
3546	NC_021487	GAT	2	6	206623	206628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512550263
3547	NC_021487	AAG	2	6	206742	206747	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512550263
3548	NC_021487	GT	3	6	206754	206759	0 %	50 %	50 %	0 %	512550263
3549	NC_021487	GAG	2	6	206768	206773	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512550263
3550	NC_021487	GAC	2	6	206835	206840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550264
3551	NC_021487	TGC	2	6	206871	206876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550264
3552	NC_021487	CAA	2	6	206926	206931	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512550264
3553	NC_021487	A	6	6	206956	206961	100 %	0 %	0 %	0 %	512550264
3554	NC_021487	GCA	2	6	206983	206988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550264
3555	NC_021487	A	6	6	206998	207003	100 %	0 %	0 %	0 %	512550264
3556	NC_021487	TGC	2	6	207131	207136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550264
3557	NC_021487	TGA	2	6	207266	207271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512550264
3558	NC_021487	CGT	2	6	207307	207312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550264
3559	NC_021487	GCG	2	6	207325	207330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512550264
3560	NC_021487	CTT	2	6	207378	207383	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512550264
3561	NC_021487	CT	3	6	207469	207474	0 %	50 %	0 %	50 %	512550264
3562	NC_021487	GCTG	2	8	207542	207549	0 %	25 %	50 %	25 %	512550264
3563	NC_021487	CT	3	6	207599	207604	0 %	50 %	0 %	50 %	512550264
3564	NC_021487	GGT	2	6	207624	207629	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512550264
3565	NC_021487	A	6	6	207797	207802	100 %	0 %	0 %	0 %	512550264
3566	NC_021487	TGT	2	6	207819	207824	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512550264
3567	NC_021487	CGG	2	6	207836	207841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512550264
3568	NC_021487	AGGAG	2	10	207843	207852	40 %	0 %	60 %	0 %	512550264
3569	NC_021487	ATA	2	6	207911	207916	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512550264
3570	NC_021487	GCG	2	6	207921	207926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512550264
3571	NC_021487	CT	3	6	207991	207996	0 %	50 %	0 %	50 %	512550264
3572	NC_021487	TCG	2	6	208121	208126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550265
3573	NC_021487	AGC	2	6	208149	208154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550265
3574	NC_021487	CGG	2	6	208202	208207	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512550265
3575	NC_021487	GCC	2	6	208272	208277	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512550265
3576	NC_021487	GAA	2	6	208338	208343	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512550265
3577	NC_021487	GCCGG	2	10	208432	208441	0 %	0 %	60 %	40 %	512550265
3578	NC_021487	TGA	2	6	208461	208466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512550265
3579	NC_021487	AGT	2	6	208493	208498	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512550265
3580	NC_021487	A	7	7	208504	208510	100 %	0 %	0 %	0 %	512550266
3581	NC_021487	AG	3	6	208517	208522	50 %	0 %	50 %	0 %	512550266
3582	NC_021487	ATC	2	6	208558	208563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512550266
3583	NC_021487	TCG	2	6	208580	208585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550266
3584	NC_021487	TC	3	6	208648	208653	0 %	50 %	0 %	50 %	512550266
3585	NC_021487	GCC	2	6	208752	208757	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512550266
3586	NC_021487	AC	3	6	208766	208771	50 %	0 %	0 %	50 %	512550266
3587	NC_021487	CAA	2	6	208783	208788	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512550266
3588	NC_021487	CGA	2	6	208836	208841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550266
3589	NC_021487	GCTC	2	8	208889	208896	0 %	25 %	25 %	50 %	512550266
3590	NC_021487	G	6	6	208897	208902	0 %	0 %	100 %	0 %	512550266
3591	NC_021487	GC	3	6	208943	208948	0 %	0 %	50 %	50 %	512550266
3592	NC_021487	CTG	2	6	208987	208992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550266
3593	NC_021487	CAA	2	6	209003	209008	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512550266
3594	NC_021487	GAT	2	6	209090	209095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512550267
3595	NC_021487	GCT	2	6	209105	209110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550267
3596	NC_021487	GCG	2	6	209130	209135	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512550267
3597	NC_021487	CAG	2	6	209191	209196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550267
3598	NC_021487	GAGCTG	2	12	209223	209234	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	512550267
3599	NC_021487	AGG	2	6	209308	209313	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512550267
3600	NC_021487	AACC	2	8	209376	209383	50 %	0 %	0 %	50 %	512550267
3601	NC_021487	GGGA	2	8	209388	209395	25 %	0 %	75 %	0 %	512550267
3602	NC_021487	CAA	2	6	209418	209423	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512550267
3603	NC_021487	CCT	2	6	209434	209439	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512550267
3604	NC_021487	TCA	2	6	209451	209456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512550267
3605	NC_021487	TCA	2	6	209523	209528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512550268
3606	NC_021487	CAT	2	6	209536	209541	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512550268
3607	NC_021487	CCG	2	6	209544	209549	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512550268
3608	NC_021487	GGC	2	6	209662	209667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512550268
3609	NC_021487	GCC	2	6	209675	209680	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512550268
3610	NC_021487	CT	3	6	209692	209697	0 %	50 %	0 %	50 %	512550268
3611	NC_021487	TTG	2	6	209700	209705	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512550268
3612	NC_021487	GCC	2	6	209734	209739	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512550268
3613	NC_021487	GAA	2	6	209769	209774	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512550268
3614	NC_021487	ACC	2	6	209780	209785	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512550268
3615	NC_021487	GGT	2	6	209935	209940	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512550268
3616	NC_021487	CAA	2	6	210089	210094	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512550268
3617	NC_021487	GCA	2	6	210100	210105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550268
3618	NC_021487	CAG	2	6	210113	210118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550268
3619	NC_021487	CGA	2	6	210153	210158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550268
3620	NC_021487	ACC	2	6	210161	210166	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512550268
3621	NC_021487	ACG	2	6	210176	210181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550268
3622	NC_021487	ACG	2	6	210260	210265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550268
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3624	NC_021487	CAG	2	6	210313	210318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550268
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3985	NC_021487	TGC	2	6	228987	228992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550283
3986	NC_021487	GTT	2	6	228995	229000	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512550283
3987	NC_021487	GTA	2	6	229034	229039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512550283
3988	NC_021487	GTCT	2	8	229139	229146	0 %	50 %	25 %	25 %	512550283
3989	NC_021487	CTC	2	6	229176	229181	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512550283
3990	NC_021487	GGA	2	6	229201	229206	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512550283
3991	NC_021487	GCT	2	6	229238	229243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550283
3992	NC_021487	ACG	2	6	229275	229280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550283
3993	NC_021487	TGCCGG	2	12	229281	229292	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	512550283
3994	NC_021487	CCAA	2	8	229330	229337	50 %	0 %	0 %	50 %	512550283
3995	NC_021487	GCT	2	6	229352	229357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550283
3996	NC_021487	CAA	2	6	229425	229430	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512550283
3997	NC_021487	TTTG	2	8	229436	229443	0 %	75 %	25 %	0 %	512550283
3998	NC_021487	GCT	2	6	229453	229458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550283
3999	NC_021487	GGA	2	6	229519	229524	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512550283
4000	NC_021487	ATC	2	6	229533	229538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512550283

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