MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chthonomonas calidirosea T49 complete genome

Total Repeats: 59046

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_021487	TGA	3	9	143875	143883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512550212
2502	NC_021487	GT	3	6	143983	143988	0 %	50 %	50 %	0 %	512550212
2503	NC_021487	CG	4	8	144035	144042	0 %	0 %	50 %	50 %	512550212
2504	NC_021487	TGCC	2	8	144199	144206	0 %	25 %	25 %	50 %	512550212
2505	NC_021487	TTG	2	6	144240	144245	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512550212
2506	NC_021487	GAG	2	6	144298	144303	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512550212
2507	NC_021487	CCGA	2	8	144369	144376	25 %	0 %	25 %	50 %	512550212
2508	NC_021487	GCT	2	6	144440	144445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550212
2509	NC_021487	TCA	2	6	144465	144470	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512550212
2510	NC_021487	GAG	2	6	144499	144504	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512550212
2511	NC_021487	T	6	6	144506	144511	0 %	100 %	0 %	0 %	512550212
2512	NC_021487	GAG	2	6	144512	144517	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512550212
2513	NC_021487	ACC	2	6	144522	144527	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512550212
2514	NC_021487	AG	3	6	144563	144568	50 %	0 %	50 %	0 %	512550212
2515	NC_021487	CGT	2	6	144629	144634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550212
2516	NC_021487	TGCT	2	8	144704	144711	0 %	50 %	25 %	25 %	512550212
2517	NC_021487	ACG	3	9	144777	144785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550212
2518	NC_021487	CTC	2	6	144905	144910	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512550212
2519	NC_021487	GTG	2	6	144944	144949	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512550212
2520	NC_021487	GATG	2	8	145003	145010	25 %	25 %	50 %	0 %	512550212
2521	NC_021487	CAG	2	6	145025	145030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550212
2522	NC_021487	AAGA	2	8	145059	145066	75 %	0 %	25 %	0 %	512550212
2523	NC_021487	CAG	2	6	145243	145248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550213
2524	NC_021487	G	6	6	145248	145253	0 %	0 %	100 %	0 %	512550213
2525	NC_021487	ATG	2	6	145351	145356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512550213
2526	NC_021487	ACG	3	9	145426	145434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550213
2527	NC_021487	AGG	2	6	145514	145519	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512550213
2528	NC_021487	GAG	2	6	145529	145534	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512550213
2529	NC_021487	G	6	6	145544	145549	0 %	0 %	100 %	0 %	512550213
2530	NC_021487	CGT	2	6	145566	145571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550213
2531	NC_021487	AG	4	8	145657	145664	50 %	0 %	50 %	0 %	512550213
2532	NC_021487	TCGG	2	8	145759	145766	0 %	25 %	50 %	25 %	512550213
2533	NC_021487	TCA	2	6	145802	145807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512550213
2534	NC_021487	CTG	2	6	145844	145849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550213
2535	NC_021487	CTCC	2	8	145884	145891	0 %	25 %	0 %	75 %	512550213
2536	NC_021487	ACA	2	6	145892	145897	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512550213
2537	NC_021487	CAG	2	6	146015	146020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550214
2538	NC_021487	CGATG	2	10	146077	146086	20 %	20 %	40 %	20 %	512550214
2539	NC_021487	GTG	2	6	146124	146129	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512550214
2540	NC_021487	GGC	2	6	146150	146155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512550214
2541	NC_021487	GC	3	6	146190	146195	0 %	0 %	50 %	50 %	512550214
2542	NC_021487	CA	3	6	146213	146218	50 %	0 %	0 %	50 %	512550214
2543	NC_021487	GCG	2	6	146312	146317	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512550214
2544	NC_021487	GCC	2	6	146381	146386	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512550214
2545	NC_021487	ATG	2	6	146400	146405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512550214
2546	NC_021487	CAC	2	6	146435	146440	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512550214
2547	NC_021487	CATAAA	2	12	146444	146455	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	512550214
2548	NC_021487	GAGCT	2	10	146462	146471	20 %	20 %	40 %	20 %	512550214
2549	NC_021487	CTT	2	6	146491	146496	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512550214
2550	NC_021487	GAA	2	6	146525	146530	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512550214
2551	NC_021487	C	6	6	146555	146560	0 %	0 %	0 %	100 %	512550214
2552	NC_021487	AGC	2	6	146592	146597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550214
2553	NC_021487	GCC	2	6	146598	146603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512550214
2554	NC_021487	TGG	2	6	146612	146617	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512550214
2555	NC_021487	TCG	2	6	146631	146636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550214
2556	NC_021487	AAAC	2	8	146674	146681	75 %	0 %	0 %	25 %	512550214
2557	NC_021487	TCT	2	6	146703	146708	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512550214
2558	NC_021487	GGCA	2	8	146735	146742	25 %	0 %	50 %	25 %	512550214
2559	NC_021487	GAG	2	6	146807	146812	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512550214
2560	NC_021487	AGC	2	6	146874	146879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550214
2561	NC_021487	CAC	2	6	146906	146911	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512550214
2562	NC_021487	GCT	2	6	146953	146958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550214
2563	NC_021487	TC	3	6	146963	146968	0 %	50 %	0 %	50 %	512550214
2564	NC_021487	TGT	2	6	146981	146986	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512550214
2565	NC_021487	GGTT	2	8	147089	147096	0 %	50 %	50 %	0 %	512550215
2566	NC_021487	GC	3	6	147106	147111	0 %	0 %	50 %	50 %	512550215
2567	NC_021487	TAG	3	9	147254	147262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512550215
2568	NC_021487	AGC	2	6	147268	147273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550215
2569	NC_021487	TGG	2	6	147291	147296	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512550215
2570	NC_021487	AGG	2	6	147408	147413	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512550215
2571	NC_021487	GCC	2	6	147439	147444	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512550215
2572	NC_021487	GCC	2	6	147463	147468	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512550215
2573	NC_021487	ATG	2	6	147539	147544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512550215
2574	NC_021487	ATC	2	6	147631	147636	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512550215
2575	NC_021487	GCC	2	6	147658	147663	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512550215
2576	NC_021487	GAT	2	6	147739	147744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512550215
2577	NC_021487	AG	3	6	147774	147779	50 %	0 %	50 %	0 %	512550215
2578	NC_021487	CAT	2	6	147781	147786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512550215
2579	NC_021487	GTC	2	6	147832	147837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550215
2580	NC_021487	CAG	2	6	147894	147899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550215
2581	NC_021487	AGG	2	6	147929	147934	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512550215
2582	NC_021487	GGT	2	6	147952	147957	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512550215
2583	NC_021487	TGC	2	6	148060	148065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550215
2584	NC_021487	AC	3	6	148113	148118	50 %	0 %	0 %	50 %	512550215
2585	NC_021487	T	6	6	148306	148311	0 %	100 %	0 %	0 %	512550216
2586	NC_021487	CCG	2	6	148318	148323	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512550216
2587	NC_021487	GGCATC	2	12	148346	148357	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	512550216
2588	NC_021487	CG	3	6	148368	148373	0 %	0 %	50 %	50 %	512550216
2589	NC_021487	TCC	2	6	148504	148509	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512550216
2590	NC_021487	CTG	2	6	148537	148542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550216
2591	NC_021487	CTT	2	6	148543	148548	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512550216
2592	NC_021487	GCC	2	6	148691	148696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512550216
2593	NC_021487	CCACT	2	10	148714	148723	20 %	20 %	0 %	60 %	512550216
2594	NC_021487	TGG	2	6	148855	148860	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512550216
2595	NC_021487	A	6	6	149020	149025	100 %	0 %	0 %	0 %	512550216
2596	NC_021487	CTC	2	6	149075	149080	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512550216
2597	NC_021487	AGT	2	6	149095	149100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512550216
2598	NC_021487	TGG	2	6	149104	149109	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512550216
2599	NC_021487	CGC	2	6	149154	149159	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512550216
2600	NC_021487	CTC	2	6	149186	149191	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512550216
2601	NC_021487	GAT	2	6	149216	149221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512550216
2602	NC_021487	CGG	2	6	149247	149252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512550216
2603	NC_021487	CAA	2	6	149273	149278	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512550217
2604	NC_021487	AACGA	2	10	149289	149298	60 %	0 %	20 %	20 %	512550217
2605	NC_021487	TC	3	6	149333	149338	0 %	50 %	0 %	50 %	512550217
2606	NC_021487	ATC	2	6	149392	149397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512550217
2607	NC_021487	GT	3	6	149522	149527	0 %	50 %	50 %	0 %	512550217
2608	NC_021487	GCGA	2	8	149574	149581	25 %	0 %	50 %	25 %	512550217
2609	NC_021487	ATC	2	6	149598	149603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512550217
2610	NC_021487	G	6	6	149660	149665	0 %	0 %	100 %	0 %	512550217
2611	NC_021487	CTC	2	6	149730	149735	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512550217
2612	NC_021487	ACA	2	6	149756	149761	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512550217
2613	NC_021487	TGG	2	6	149762	149767	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512550217
2614	NC_021487	CGTG	2	8	149796	149803	0 %	25 %	50 %	25 %	512550217
2615	NC_021487	TCCA	2	8	149809	149816	25 %	25 %	0 %	50 %	512550217
2616	NC_021487	TCC	2	6	149880	149885	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512550217
2617	NC_021487	GCC	2	6	149908	149913	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512550217
2618	NC_021487	GCA	2	6	149924	149929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550217
2619	NC_021487	CCT	2	6	149930	149935	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512550217
2620	NC_021487	CCA	2	6	149975	149980	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512550217
2621	NC_021487	GGTAA	2	10	150050	150059	40 %	20 %	40 %	0 %	512550217
2622	NC_021487	CCAC	2	8	150073	150080	25 %	0 %	0 %	75 %	512550217
2623	NC_021487	AAG	2	6	150117	150122	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512550217
2624	NC_021487	CGT	2	6	150127	150132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550217
2625	NC_021487	T	6	6	150171	150176	0 %	100 %	0 %	0 %	512550217
2626	NC_021487	TTG	2	6	150205	150210	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512550217
2627	NC_021487	TAAT	2	8	150223	150230	50 %	50 %	0 %	0 %	512550217
2628	NC_021487	TCGC	2	8	150354	150361	0 %	25 %	25 %	50 %	512550217
2629	NC_021487	GAT	2	6	150769	150774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512550218
2630	NC_021487	GC	3	6	150797	150802	0 %	0 %	50 %	50 %	512550218
2631	NC_021487	ACC	2	6	150872	150877	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512550218
2632	NC_021487	AGC	2	6	150952	150957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550218
2633	NC_021487	CAATGG	2	12	150975	150986	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	512550218
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2635	NC_021487	ATG	2	6	151103	151108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512550218
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2637	NC_021487	ACC	2	6	151123	151128	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512550218
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2642	NC_021487	GTC	2	6	151452	151457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550218
2643	NC_021487	GAC	2	6	151486	151491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550218
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2647	NC_021487	AAC	2	6	151953	151958	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512550219
2648	NC_021487	TG	3	6	151971	151976	0 %	50 %	50 %	0 %	512550219
2649	NC_021487	TTCAC	2	10	152042	152051	20 %	40 %	0 %	40 %	512550219
2650	NC_021487	TCT	2	6	152076	152081	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512550219
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2652	NC_021487	CT	3	6	152210	152215	0 %	50 %	0 %	50 %	512550219
2653	NC_021487	CAC	2	6	152259	152264	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512550219
2654	NC_021487	TCGG	2	8	152274	152281	0 %	25 %	50 %	25 %	512550219
2655	NC_021487	AGC	2	6	152298	152303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550219
2656	NC_021487	GAAC	2	8	152349	152356	50 %	0 %	25 %	25 %	512550219
2657	NC_021487	GCTG	2	8	152412	152419	0 %	25 %	50 %	25 %	512550219
2658	NC_021487	CTG	2	6	152521	152526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550219
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2661	NC_021487	TC	3	6	152733	152738	0 %	50 %	0 %	50 %	512550219
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2668	NC_021487	CG	3	6	153284	153289	0 %	0 %	50 %	50 %	512550220
2669	NC_021487	CG	3	6	153307	153312	0 %	0 %	50 %	50 %	512550220
2670	NC_021487	GC	3	6	153327	153332	0 %	0 %	50 %	50 %	512550220
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2703	NC_021487	ATGG	2	8	158033	158040	25 %	25 %	50 %	0 %	512550222
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2707	NC_021487	CTG	2	6	158197	158202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550222
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2726	NC_021487	TGGA	2	8	160236	160243	25 %	25 %	50 %	0 %	512550224
2727	NC_021487	AGC	2	6	160282	160287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550224
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2730	NC_021487	GATA	2	8	160415	160422	50 %	25 %	25 %	0 %	512550224
2731	NC_021487	TGC	2	6	160442	160447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550224
2732	NC_021487	ACC	2	6	160450	160455	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512550224
2733	NC_021487	AGG	2	6	160462	160467	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512550224
2734	NC_021487	GC	3	6	160497	160502	0 %	0 %	50 %	50 %	512550224
2735	NC_021487	GTGC	2	8	160545	160552	0 %	25 %	50 %	25 %	512550224
2736	NC_021487	GAA	3	9	160569	160577	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512550224
2737	NC_021487	ATC	2	6	160639	160644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512550224
2738	NC_021487	GAGG	2	8	160675	160682	25 %	0 %	75 %	0 %	512550224
2739	NC_021487	AG	3	6	160790	160795	50 %	0 %	50 %	0 %	512550224
2740	NC_021487	ACG	2	6	160798	160803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550224
2741	NC_021487	GGA	2	6	160855	160860	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512550224
2742	NC_021487	C	6	6	160943	160948	0 %	0 %	0 %	100 %	512550224
2743	NC_021487	TGGGC	2	10	160971	160980	0 %	20 %	60 %	20 %	512550224
2744	NC_021487	CCGCCA	2	12	160987	160998	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	512550224
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2977	NC_021487	CT	3	6	173165	173170	0 %	50 %	0 %	50 %	512550234
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2988	NC_021487	ACG	2	6	173509	173514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550234
2989	NC_021487	GAT	2	6	173524	173529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512550234
2990	NC_021487	TCG	2	6	173582	173587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550234
2991	NC_021487	TGG	2	6	173671	173676	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512550234
2992	NC_021487	GA	3	6	173735	173740	50 %	0 %	50 %	0 %	512550234
2993	NC_021487	AGGT	2	8	173867	173874	25 %	25 %	50 %	0 %	512550234
2994	NC_021487	GC	3	6	173947	173952	0 %	0 %	50 %	50 %	512550234
2995	NC_021487	CTCGA	2	10	173969	173978	20 %	20 %	20 %	40 %	512550234
2996	NC_021487	GTA	2	6	174064	174069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512550234
2997	NC_021487	AGC	2	6	174131	174136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550234
2998	NC_021487	CG	3	6	174144	174149	0 %	0 %	50 %	50 %	512550234
2999	NC_021487	GAT	2	6	174190	174195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512550234
3000	NC_021487	CG	3	6	174279	174284	0 %	0 %	50 %	50 %	512550234

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