MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chthonomonas calidirosea T49 complete genome

Total Repeats: 59046

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_021487	CTG	2	6	88063	88068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550163
1502	NC_021487	GAC	2	6	88092	88097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550163
1503	NC_021487	GGT	3	9	88098	88106	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512550163
1504	NC_021487	CACG	2	8	88110	88117	25 %	0 %	25 %	50 %	512550163
1505	NC_021487	CGT	2	6	88209	88214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550163
1506	NC_021487	AAG	2	6	88260	88265	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512550164
1507	NC_021487	GCG	2	6	88385	88390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512550164
1508	NC_021487	GATC	2	8	88411	88418	25 %	25 %	25 %	25 %	512550164
1509	NC_021487	AGG	2	6	88518	88523	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512550164
1510	NC_021487	GC	3	6	88607	88612	0 %	0 %	50 %	50 %	512550164
1511	NC_021487	TTC	2	6	88643	88648	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512550164
1512	NC_021487	AAG	2	6	88655	88660	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512550164
1513	NC_021487	ACA	2	6	88675	88680	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512550164
1514	NC_021487	AGG	2	6	88744	88749	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512550164
1515	NC_021487	TTG	2	6	88770	88775	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512550164
1516	NC_021487	GC	3	6	88820	88825	0 %	0 %	50 %	50 %	512550164
1517	NC_021487	CAT	2	6	88840	88845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512550164
1518	NC_021487	TGG	2	6	88851	88856	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512550164
1519	NC_021487	CCT	2	6	88866	88871	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512550164
1520	NC_021487	GCC	2	6	88952	88957	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512550164
1521	NC_021487	CGC	2	6	88992	88997	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512550164
1522	NC_021487	CAGC	2	8	89083	89090	25 %	0 %	25 %	50 %	512550164
1523	NC_021487	ATC	2	6	89143	89148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512550165
1524	NC_021487	TGCT	2	8	89164	89171	0 %	50 %	25 %	25 %	512550165
1525	NC_021487	CTC	2	6	89195	89200	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512550165
1526	NC_021487	TCC	2	6	89205	89210	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512550165
1527	NC_021487	GC	3	6	89275	89280	0 %	0 %	50 %	50 %	512550165
1528	NC_021487	GAAA	2	8	89291	89298	75 %	0 %	25 %	0 %	512550165
1529	NC_021487	GTGC	2	8	89347	89354	0 %	25 %	50 %	25 %	512550165
1530	NC_021487	GTT	2	6	89395	89400	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512550165
1531	NC_021487	AGC	2	6	89414	89419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550165
1532	NC_021487	GCA	2	6	89428	89433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550165
1533	NC_021487	GGT	2	6	89490	89495	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512550165
1534	NC_021487	AAG	2	6	89521	89526	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512550165
1535	NC_021487	TTA	2	6	89605	89610	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512550165
1536	NC_021487	AGAT	2	8	89720	89727	50 %	25 %	25 %	0 %	512550165
1537	NC_021487	CAA	2	6	89758	89763	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512550165
1538	NC_021487	AGC	2	6	89783	89788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550165
1539	NC_021487	GAA	2	6	89790	89795	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512550165
1540	NC_021487	AGG	3	9	89822	89830	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512550165
1541	NC_021487	GAA	3	9	89866	89874	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512550165
1542	NC_021487	CGAGGC	2	12	89892	89903	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	512550165
1543	NC_021487	TTTC	2	8	89923	89930	0 %	75 %	0 %	25 %	512550165
1544	NC_021487	GGA	2	6	89940	89945	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512550165
1545	NC_021487	GAG	3	9	89956	89964	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512550165
1546	NC_021487	GCAT	2	8	90131	90138	25 %	25 %	25 %	25 %	512550165
1547	NC_021487	CGC	2	6	90153	90158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512550165
1548	NC_021487	CCT	2	6	90209	90214	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512550165
1549	NC_021487	ATC	2	6	90331	90336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512550165
1550	NC_021487	TGC	2	6	90509	90514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550166
1551	NC_021487	GCT	2	6	90558	90563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550166
1552	NC_021487	CTT	2	6	90564	90569	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512550166
1553	NC_021487	CAT	2	6	90585	90590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512550166
1554	NC_021487	GAC	2	6	90612	90617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550166
1555	NC_021487	CGG	2	6	90694	90699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512550166
1556	NC_021487	GAA	2	6	90780	90785	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512550166
1557	NC_021487	GGT	2	6	90794	90799	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512550166
1558	NC_021487	A	7	7	90812	90818	100 %	0 %	0 %	0 %	512550166
1559	NC_021487	CACG	2	8	90827	90834	25 %	0 %	25 %	50 %	512550166
1560	NC_021487	TCG	2	6	90844	90849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550166
1561	NC_021487	CG	3	6	90905	90910	0 %	0 %	50 %	50 %	512550166
1562	NC_021487	ATCGC	2	10	90917	90926	20 %	20 %	20 %	40 %	512550166
1563	NC_021487	TCT	2	6	90985	90990	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512550166
1564	NC_021487	GA	3	6	90993	90998	50 %	0 %	50 %	0 %	512550166
1565	NC_021487	GTT	2	6	91030	91035	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512550167
1566	NC_021487	GTC	2	6	91040	91045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550167
1567	NC_021487	TTC	2	6	91046	91051	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512550167
1568	NC_021487	ATC	2	6	91155	91160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512550167
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1570	NC_021487	ACG	2	6	91245	91250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550167
1571	NC_021487	CGG	2	6	91265	91270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512550167
1572	NC_021487	TCT	2	6	91380	91385	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512550167
1573	NC_021487	GA	3	6	91453	91458	50 %	0 %	50 %	0 %	512550167
1574	NC_021487	CCT	2	6	91459	91464	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512550167
1575	NC_021487	AG	3	6	91472	91477	50 %	0 %	50 %	0 %	512550167
1576	NC_021487	GTTG	2	8	91500	91507	0 %	50 %	50 %	0 %	512550167
1577	NC_021487	A	6	6	91607	91612	100 %	0 %	0 %	0 %	512550167
1578	NC_021487	CGTT	2	8	91710	91717	0 %	50 %	25 %	25 %	512550167
1579	NC_021487	GCA	2	6	91794	91799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550167
1580	NC_021487	GAC	2	6	91807	91812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550167
1581	NC_021487	TGC	2	6	91875	91880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550168
1582	NC_021487	GCT	2	6	91899	91904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550168
1583	NC_021487	AGGGC	2	10	91934	91943	20 %	0 %	60 %	20 %	512550168
1584	NC_021487	GTA	2	6	91993	91998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512550168
1585	NC_021487	GGGCTT	2	12	92045	92056	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	512550168
1586	NC_021487	CAG	2	6	92085	92090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550168
1587	NC_021487	CTG	2	6	92126	92131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550168
1588	NC_021487	GAAA	2	8	92203	92210	75 %	0 %	25 %	0 %	512550168
1589	NC_021487	GC	3	6	92257	92262	0 %	0 %	50 %	50 %	512550168
1590	NC_021487	CGC	2	6	92309	92314	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512550168
1591	NC_021487	CCA	3	9	92352	92360	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512550168
1592	NC_021487	GCG	2	6	92387	92392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512550168
1593	NC_021487	AGG	2	6	92395	92400	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512550168
1594	NC_021487	TGA	2	6	92410	92415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512550168
1595	NC_021487	AAAG	2	8	92462	92469	75 %	0 %	25 %	0 %	512550168
1596	NC_021487	A	6	6	92553	92558	100 %	0 %	0 %	0 %	512550168
1597	NC_021487	CAG	2	6	92565	92570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550168
1598	NC_021487	ATATG	2	10	92626	92635	40 %	40 %	20 %	0 %	512550168
1599	NC_021487	CG	3	6	92700	92705	0 %	0 %	50 %	50 %	512550168
1600	NC_021487	CGAG	2	8	92723	92730	25 %	0 %	50 %	25 %	512550168
1601	NC_021487	G	6	6	92741	92746	0 %	0 %	100 %	0 %	512550168
1602	NC_021487	TTCAG	2	10	92810	92819	20 %	40 %	20 %	20 %	512550169
1603	NC_021487	GAT	2	6	92851	92856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512550169
1604	NC_021487	CAG	2	6	92865	92870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550169
1605	NC_021487	TCTGC	2	10	92913	92922	0 %	40 %	20 %	40 %	512550169
1606	NC_021487	AGA	2	6	92952	92957	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512550169
1607	NC_021487	CCAA	2	8	92993	93000	50 %	0 %	0 %	50 %	512550169
1608	NC_021487	AGC	2	6	93068	93073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550169
1609	NC_021487	AAC	2	6	93076	93081	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512550169
1610	NC_021487	GCCA	2	8	93082	93089	25 %	0 %	25 %	50 %	512550169
1611	NC_021487	AC	3	6	93144	93149	50 %	0 %	0 %	50 %	512550169
1612	NC_021487	CAA	2	6	93180	93185	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512550169
1613	NC_021487	TTG	2	6	93276	93281	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512550169
1614	NC_021487	CTA	2	6	93384	93389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512550169
1615	NC_021487	CGA	2	6	93399	93404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550169
1616	NC_021487	TGA	2	6	93438	93443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512550169
1617	NC_021487	C	6	6	93486	93491	0 %	0 %	0 %	100 %	512550169
1618	NC_021487	CA	3	6	93515	93520	50 %	0 %	0 %	50 %	512550169
1619	NC_021487	ACC	2	6	93551	93556	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512550169
1620	NC_021487	CGC	2	6	93612	93617	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512550169
1621	NC_021487	GCCAC	2	10	93639	93648	20 %	0 %	20 %	60 %	512550169
1622	NC_021487	CCG	2	6	93731	93736	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512550169
1623	NC_021487	TGT	2	6	93746	93751	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512550169
1624	NC_021487	GAT	2	6	93823	93828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512550169
1625	NC_021487	CCT	2	6	93917	93922	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512550170
1626	NC_021487	CAC	2	6	93932	93937	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512550170
1627	NC_021487	AGC	2	6	93940	93945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550170
1628	NC_021487	TCG	2	6	94039	94044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550170
1629	NC_021487	GTT	2	6	94079	94084	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512550170
1630	NC_021487	GGT	2	6	94172	94177	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512550170
1631	NC_021487	CGA	3	9	94190	94198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550170
1632	NC_021487	CCA	2	6	94213	94218	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512550170
1633	NC_021487	ACG	2	6	94305	94310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550170
1634	NC_021487	CGATA	2	10	94322	94331	40 %	20 %	20 %	20 %	512550170
1635	NC_021487	CCT	2	6	94337	94342	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512550170
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1640	NC_021487	CCAT	2	8	94721	94728	25 %	25 %	0 %	50 %	512550170
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1642	NC_021487	GCA	2	6	94790	94795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550170
1643	NC_021487	TGA	2	6	94841	94846	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512550170
1644	NC_021487	CTC	2	6	94896	94901	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512550170
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1646	NC_021487	CGTG	2	8	95020	95027	0 %	25 %	50 %	25 %	512550170
1647	NC_021487	GT	3	6	95104	95109	0 %	50 %	50 %	0 %	512550170
1648	NC_021487	CT	3	6	95208	95213	0 %	50 %	0 %	50 %	512550170
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1669	NC_021487	TGCA	2	8	96555	96562	25 %	25 %	25 %	25 %	512550171
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1672	NC_021487	TTC	2	6	96870	96875	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512550172
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1742	NC_021487	AG	3	6	101668	101673	50 %	0 %	50 %	0 %	512550176
1743	NC_021487	CAG	2	6	101725	101730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550176
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1749	NC_021487	CTA	2	6	101995	102000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512550176
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1751	NC_021487	GGC	2	6	102036	102041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512550176
1752	NC_021487	GGC	2	6	102090	102095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512550176
1753	NC_021487	CG	3	6	102237	102242	0 %	0 %	50 %	50 %	512550176
1754	NC_021487	TGC	2	6	102245	102250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550176
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1759	NC_021487	GC	3	6	102475	102480	0 %	0 %	50 %	50 %	512550176
1760	NC_021487	GAT	2	6	102529	102534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512550176
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1763	NC_021487	TCA	2	6	102804	102809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512550176
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1768	NC_021487	ATCT	2	8	103031	103038	25 %	50 %	0 %	25 %	512550176
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1991	NC_021487	AG	3	6	114695	114700	50 %	0 %	50 %	0 %	512550184
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1993	NC_021487	GCC	2	6	114720	114725	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512550184
1994	NC_021487	GGA	2	6	114735	114740	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512550184
1995	NC_021487	GAAG	2	8	114829	114836	50 %	0 %	50 %	0 %	512550184
1996	NC_021487	GTC	2	6	114873	114878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550184
1997	NC_021487	TGCC	2	8	114904	114911	0 %	25 %	25 %	50 %	512550184
1998	NC_021487	CGA	2	6	114939	114944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550184
1999	NC_021487	G	6	6	114990	114995	0 %	0 %	100 %	0 %	512550184
2000	NC_021487	CAG	2	6	115076	115081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550184

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