MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chthonomonas calidirosea T49 complete genome

Total Repeats: 59046

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_021487	TGA	2	6	59246	59251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512550135
1002	NC_021487	CGA	2	6	59282	59287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550135
1003	NC_021487	TGC	2	6	59302	59307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550135
1004	NC_021487	GCG	3	9	59320	59328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512550135
1005	NC_021487	TTG	2	6	59397	59402	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512550135
1006	NC_021487	GGGCAA	2	12	59435	59446	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	512550135
1007	NC_021487	CCG	2	6	59464	59469	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512550135
1008	NC_021487	CTG	2	6	59484	59489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550135
1009	NC_021487	GGC	2	6	59502	59507	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512550135
1010	NC_021487	AGTTGC	2	12	59554	59565	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	512550135
1011	NC_021487	TGT	2	6	59590	59595	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512550135
1012	NC_021487	T	7	7	59608	59614	0 %	100 %	0 %	0 %	512550135
1013	NC_021487	GCA	2	6	59659	59664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550135
1014	NC_021487	GTT	2	6	59676	59681	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512550135
1015	NC_021487	CG	3	6	59694	59699	0 %	0 %	50 %	50 %	512550135
1016	NC_021487	CTG	2	6	59715	59720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550135
1017	NC_021487	TTG	2	6	59727	59732	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512550135
1018	NC_021487	TTG	2	6	59736	59741	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512550135
1019	NC_021487	GCGCG	2	10	59828	59837	0 %	0 %	60 %	40 %	512550135
1020	NC_021487	AAC	2	6	59889	59894	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512550135
1021	NC_021487	TGG	2	6	59951	59956	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512550135
1022	NC_021487	TCGG	2	8	59979	59986	0 %	25 %	50 %	25 %	512550135
1023	NC_021487	AG	3	6	60073	60078	50 %	0 %	50 %	0 %	512550135
1024	NC_021487	AGA	2	6	60087	60092	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512550135
1025	NC_021487	GA	3	6	60102	60107	50 %	0 %	50 %	0 %	512550135
1026	NC_021487	CGC	2	6	60116	60121	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512550135
1027	NC_021487	TTC	2	6	60123	60128	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512550135
1028	NC_021487	CT	3	6	60156	60161	0 %	50 %	0 %	50 %	512550135
1029	NC_021487	ATA	2	6	60211	60216	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512550135
1030	NC_021487	CGG	3	9	60220	60228	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512550135
1031	NC_021487	TCT	2	6	60247	60252	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512550136
1032	NC_021487	T	6	6	60375	60380	0 %	100 %	0 %	0 %	512550136
1033	NC_021487	GTGCC	2	10	60388	60397	0 %	20 %	40 %	40 %	512550136
1034	NC_021487	TGC	2	6	60442	60447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550136
1035	NC_021487	CTG	2	6	60497	60502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550136
1036	NC_021487	GTTGC	2	10	60718	60727	0 %	40 %	40 %	20 %	512550136
1037	NC_021487	GGC	2	6	60755	60760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512550136
1038	NC_021487	AAG	3	9	60776	60784	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512550136
1039	NC_021487	GCGTT	2	10	60794	60803	0 %	40 %	40 %	20 %	512550136
1040	NC_021487	GGC	2	6	60837	60842	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512550136
1041	NC_021487	AGG	2	6	60857	60862	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512550136
1042	NC_021487	AGC	2	6	61040	61045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550136
1043	NC_021487	CTC	2	6	61070	61075	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512550136
1044	NC_021487	GCC	2	6	61077	61082	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512550136
1045	NC_021487	GGCC	2	8	61087	61094	0 %	0 %	50 %	50 %	512550136
1046	NC_021487	T	6	6	61200	61205	0 %	100 %	0 %	0 %	512550136
1047	NC_021487	AG	3	6	61228	61233	50 %	0 %	50 %	0 %	512550136
1048	NC_021487	GGA	2	6	61281	61286	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512550136
1049	NC_021487	GC	3	6	61355	61360	0 %	0 %	50 %	50 %	512550136
1050	NC_021487	CCG	2	6	61390	61395	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512550136
1051	NC_021487	GCT	2	6	61413	61418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550136
1052	NC_021487	GA	3	6	61459	61464	50 %	0 %	50 %	0 %	512550136
1053	NC_021487	GA	3	6	61469	61474	50 %	0 %	50 %	0 %	512550136
1054	NC_021487	GCA	2	6	61572	61577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550137
1055	NC_021487	ACA	2	6	61781	61786	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512550137
1056	NC_021487	TG	3	6	61800	61805	0 %	50 %	50 %	0 %	512550137
1057	NC_021487	TGC	2	6	61819	61824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550137
1058	NC_021487	T	6	6	61896	61901	0 %	100 %	0 %	0 %	512550137
1059	NC_021487	GCAG	2	8	61950	61957	25 %	0 %	50 %	25 %	512550137
1060	NC_021487	GCG	3	9	61962	61970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512550137
1061	NC_021487	TGT	2	6	61976	61981	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512550137
1062	NC_021487	GCC	2	6	62030	62035	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512550137
1063	NC_021487	CAA	3	9	62056	62064	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512550137
1064	NC_021487	CCT	2	6	62079	62084	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512550137
1065	NC_021487	CCG	2	6	62096	62101	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512550137
1066	NC_021487	AAG	2	6	62137	62142	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512550137
1067	NC_021487	CTG	2	6	62143	62148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550137
1068	NC_021487	TGC	2	6	62158	62163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550137
1069	NC_021487	TC	3	6	62168	62173	0 %	50 %	0 %	50 %	512550137
1070	NC_021487	TTG	2	6	62203	62208	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512550137
1071	NC_021487	CTTT	2	8	62233	62240	0 %	75 %	0 %	25 %	512550137
1072	NC_021487	CT	3	6	62280	62285	0 %	50 %	0 %	50 %	512550137
1073	NC_021487	GGT	2	6	62323	62328	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512550138
1074	NC_021487	CGA	2	6	62366	62371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550138
1075	NC_021487	ATGG	2	8	62460	62467	25 %	25 %	50 %	0 %	512550138
1076	NC_021487	ATC	2	6	62539	62544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512550138
1077	NC_021487	TGA	2	6	62612	62617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512550138
1078	NC_021487	CAT	2	6	62634	62639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512550138
1079	NC_021487	TGA	2	6	62651	62656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512550138
1080	NC_021487	GAT	2	6	62826	62831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512550138
1081	NC_021487	CAC	2	6	62832	62837	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512550138
1082	NC_021487	GGC	2	6	62865	62870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512550138
1083	NC_021487	GC	3	6	62878	62883	0 %	0 %	50 %	50 %	512550138
1084	NC_021487	CTT	2	6	62933	62938	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512550138
1085	NC_021487	GTTTTT	2	12	63204	63215	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	512550138
1086	NC_021487	GC	3	6	63302	63307	0 %	0 %	50 %	50 %	512550139
1087	NC_021487	GT	3	6	63358	63363	0 %	50 %	50 %	0 %	512550139
1088	NC_021487	T	7	7	63370	63376	0 %	100 %	0 %	0 %	512550139
1089	NC_021487	ATA	2	6	63647	63652	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512550139
1090	NC_021487	CTG	2	6	63729	63734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550139
1091	NC_021487	CCT	2	6	63750	63755	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512550139
1092	NC_021487	GT	3	6	63810	63815	0 %	50 %	50 %	0 %	512550139
1093	NC_021487	T	6	6	63917	63922	0 %	100 %	0 %	0 %	512550139
1094	NC_021487	CGC	2	6	64050	64055	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512550139
1095	NC_021487	CGA	2	6	64100	64105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550139
1096	NC_021487	TCG	2	6	64107	64112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550139
1097	NC_021487	CGA	2	6	64173	64178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550139
1098	NC_021487	TTTA	2	8	64214	64221	25 %	75 %	0 %	0 %	512550140
1099	NC_021487	TGG	2	6	64355	64360	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512550140
1100	NC_021487	AAGA	2	8	64578	64585	75 %	0 %	25 %	0 %	512550140
1101	NC_021487	TTCGTA	2	12	64602	64613	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	512550140
1102	NC_021487	GGT	2	6	64704	64709	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512550140
1103	NC_021487	TAG	2	6	64723	64728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512550140
1104	NC_021487	CGG	2	6	64736	64741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512550140
1105	NC_021487	TCA	2	6	64748	64753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512550140
1106	NC_021487	AC	3	6	64772	64777	50 %	0 %	0 %	50 %	512550140
1107	NC_021487	CA	3	6	64789	64794	50 %	0 %	0 %	50 %	512550140
1108	NC_021487	TGG	2	6	64851	64856	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512550140
1109	NC_021487	CG	3	6	64919	64924	0 %	0 %	50 %	50 %	512550140
1110	NC_021487	TCA	2	6	65008	65013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512550140
1111	NC_021487	CAT	2	6	65187	65192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512550140
1112	NC_021487	CGA	2	6	65431	65436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550141
1113	NC_021487	CGG	3	9	65467	65475	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512550141
1114	NC_021487	ATG	2	6	65502	65507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512550141
1115	NC_021487	GGA	2	6	65566	65571	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512550141
1116	NC_021487	GTTG	2	8	65576	65583	0 %	50 %	50 %	0 %	512550141
1117	NC_021487	GAC	2	6	65647	65652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550141
1118	NC_021487	CTT	2	6	65767	65772	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512550141
1119	NC_021487	GAA	2	6	65815	65820	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512550141
1120	NC_021487	TGC	2	6	65825	65830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550141
1121	NC_021487	CTC	2	6	65834	65839	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512550141
1122	NC_021487	CGA	2	6	65878	65883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550141
1123	NC_021487	GGA	2	6	65939	65944	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512550141
1124	NC_021487	TCG	2	6	66048	66053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550141
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1126	NC_021487	G	6	6	66122	66127	0 %	0 %	100 %	0 %	512550141
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1252	NC_021487	CTA	2	6	72958	72963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512550148
1253	NC_021487	CCT	2	6	72980	72985	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512550148
1254	NC_021487	AGC	2	6	72997	73002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550148
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1256	NC_021487	AGA	2	6	73442	73447	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512550149
1257	NC_021487	T	6	6	73510	73515	0 %	100 %	0 %	0 %	512550149
1258	NC_021487	TGC	2	6	73530	73535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550150
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1260	NC_021487	TGA	2	6	73725	73730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512550150
1261	NC_021487	GC	3	6	73769	73774	0 %	0 %	50 %	50 %	512550150
1262	NC_021487	TCCA	2	8	73791	73798	25 %	25 %	0 %	50 %	512550150
1263	NC_021487	GCAAAT	2	12	73807	73818	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	512550150
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1265	NC_021487	TCA	2	6	73953	73958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512550150
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1269	NC_021487	GAT	2	6	74042	74047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512550150
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1273	NC_021487	CAA	3	9	74219	74227	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512550150
1274	NC_021487	TGC	2	6	74283	74288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550150
1275	NC_021487	GAG	2	6	74342	74347	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512550150
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1278	NC_021487	AG	3	6	74527	74532	50 %	0 %	50 %	0 %	512550150
1279	NC_021487	TTG	2	6	74592	74597	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512550150
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1281	NC_021487	AGC	2	6	74712	74717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550150
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1283	NC_021487	CGG	2	6	74881	74886	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512550150
1284	NC_021487	CCT	2	6	75132	75137	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512550151
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1292	NC_021487	GT	3	6	75924	75929	0 %	50 %	50 %	0 %	512550152
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1330	NC_021487	CATC	2	8	78141	78148	25 %	25 %	0 %	50 %	512550155
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1336	NC_021487	GATC	2	8	78574	78581	25 %	25 %	25 %	25 %	512550155
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1349	NC_021487	AT	3	6	79210	79215	50 %	50 %	0 %	0 %	512550156
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1362	NC_021487	TTC	2	6	80220	80225	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512550156
1363	NC_021487	CT	3	6	80227	80232	0 %	50 %	0 %	50 %	512550156
1364	NC_021487	GA	4	8	80235	80242	50 %	0 %	50 %	0 %	512550156
1365	NC_021487	GAA	2	6	80294	80299	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512550156
1366	NC_021487	TAA	2	6	80573	80578	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512550156
1367	NC_021487	AGCCG	2	10	80615	80624	20 %	0 %	40 %	40 %	512550156
1368	NC_021487	GGGCAA	2	12	80672	80683	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	512550156
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1370	NC_021487	TC	3	6	80886	80891	0 %	50 %	0 %	50 %	512550156
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1372	NC_021487	AT	3	6	80954	80959	50 %	50 %	0 %	0 %	512550156
1373	NC_021487	ACG	2	6	80985	80990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550156
1374	NC_021487	AAAG	2	8	81048	81055	75 %	0 %	25 %	0 %	512550156
1375	NC_021487	AAG	2	6	81106	81111	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512550156
1376	NC_021487	TTG	2	6	81150	81155	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512550156
1377	NC_021487	GCC	2	6	81185	81190	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512550157
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