MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chthonomonas calidirosea T49 complete genome

Total Repeats: 59046

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_021487	TGA	2	6	374450	374455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512550404
6502	NC_021487	CAGCC	2	10	374469	374478	20 %	0 %	20 %	60 %	512550404
6503	NC_021487	CGA	2	6	374483	374488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550404
6504	NC_021487	TGGG	2	8	374532	374539	0 %	25 %	75 %	0 %	512550404
6505	NC_021487	CAA	2	6	374631	374636	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512550404
6506	NC_021487	AGA	2	6	374661	374666	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512550404
6507	NC_021487	ATC	2	6	374671	374676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512550404
6508	NC_021487	TGC	2	6	374781	374786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550404
6509	NC_021487	TC	3	6	374864	374869	0 %	50 %	0 %	50 %	512550405
6510	NC_021487	ACG	2	6	375048	375053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550405
6511	NC_021487	AGC	2	6	375064	375069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550405
6512	NC_021487	CGG	2	6	375071	375076	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512550405
6513	NC_021487	CGAG	2	8	375091	375098	25 %	0 %	50 %	25 %	512550405
6514	NC_021487	GAT	2	6	375150	375155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512550405
6515	NC_021487	GAA	2	6	375216	375221	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512550405
6516	NC_021487	TA	3	6	375234	375239	50 %	50 %	0 %	0 %	512550405
6517	NC_021487	CAG	2	6	375401	375406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550405
6518	NC_021487	TGA	2	6	375436	375441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512550405
6519	NC_021487	GGA	2	6	375509	375514	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512550405
6520	NC_021487	TCT	2	6	375526	375531	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512550405
6521	NC_021487	CAC	2	6	375594	375599	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512550405
6522	NC_021487	T	6	6	375611	375616	0 %	100 %	0 %	0 %	512550405
6523	NC_021487	GCT	2	6	375698	375703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550405
6524	NC_021487	TAT	2	6	375914	375919	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512550406
6525	NC_021487	CGGTG	2	10	375974	375983	0 %	20 %	60 %	20 %	512550406
6526	NC_021487	GA	3	6	375991	375996	50 %	0 %	50 %	0 %	512550406
6527	NC_021487	GGAGCG	2	12	376028	376039	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	512550406
6528	NC_021487	TAT	2	6	376074	376079	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512550406
6529	NC_021487	CTTG	2	8	376184	376191	0 %	50 %	25 %	25 %	512550406
6530	NC_021487	ATT	2	6	376275	376280	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512550406
6531	NC_021487	TCC	2	6	376430	376435	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512550406
6532	NC_021487	GA	3	6	376630	376635	50 %	0 %	50 %	0 %	512550406
6533	NC_021487	GA	3	6	376820	376825	50 %	0 %	50 %	0 %	512550406
6534	NC_021487	CT	3	6	376860	376865	0 %	50 %	0 %	50 %	512550406
6535	NC_021487	T	6	6	376913	376918	0 %	100 %	0 %	0 %	512550406
6536	NC_021487	TGC	2	6	376924	376929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550406
6537	NC_021487	ACGG	2	8	377019	377026	25 %	0 %	50 %	25 %	512550406
6538	NC_021487	CGA	3	9	377068	377076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550406
6539	NC_021487	TAT	2	6	377141	377146	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512550406
6540	NC_021487	GCG	2	6	377162	377167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512550406
6541	NC_021487	TGA	2	6	377350	377355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512550406
6542	NC_021487	GC	3	6	377411	377416	0 %	0 %	50 %	50 %	512550406
6543	NC_021487	AGG	2	6	377440	377445	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512550406
6544	NC_021487	CAG	2	6	377457	377462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550406
6545	NC_021487	ATC	2	6	377499	377504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512550406
6546	NC_021487	TGG	2	6	377555	377560	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512550406
6547	NC_021487	GCA	2	6	377629	377634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550406
6548	NC_021487	AAG	2	6	377647	377652	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512550406
6549	NC_021487	CTT	2	6	377654	377659	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512550406
6550	NC_021487	TCT	2	6	377760	377765	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512550407
6551	NC_021487	GA	3	6	377838	377843	50 %	0 %	50 %	0 %	512550407
6552	NC_021487	GCA	2	6	378033	378038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550407
6553	NC_021487	CTG	2	6	378112	378117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550407
6554	NC_021487	CTT	2	6	378283	378288	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512550407
6555	NC_021487	TTC	2	6	378293	378298	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512550407
6556	NC_021487	GAG	3	9	378346	378354	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512550407
6557	NC_021487	AATGG	2	10	378406	378415	40 %	20 %	40 %	0 %	512550408
6558	NC_021487	TTGG	2	8	378469	378476	0 %	50 %	50 %	0 %	512550408
6559	NC_021487	ACG	2	6	378554	378559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550408
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6561	NC_021487	AGAT	2	8	378615	378622	50 %	25 %	25 %	0 %	512550408
6562	NC_021487	CCA	2	6	378642	378647	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512550408
6563	NC_021487	ATT	2	6	378795	378800	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512550408
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6565	NC_021487	GAG	2	6	378860	378865	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512550408
6566	NC_021487	ACT	2	6	378907	378912	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512550408
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6573	NC_021487	TTG	2	6	379612	379617	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512550409
6574	NC_021487	GCTTT	2	10	379651	379660	0 %	60 %	20 %	20 %	512550409
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6577	NC_021487	AGCC	2	8	379784	379791	25 %	0 %	25 %	50 %	512550409
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6582	NC_021487	ATG	2	6	379991	379996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512550409
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6585	NC_021487	ACG	2	6	380227	380232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550409
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6587	NC_021487	CA	3	6	380299	380304	50 %	0 %	0 %	50 %	512550409
6588	NC_021487	GTA	2	6	380401	380406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512550409
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6590	NC_021487	AG	3	6	380446	380451	50 %	0 %	50 %	0 %	512550409
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6593	NC_021487	CTAA	2	8	380720	380727	50 %	25 %	0 %	25 %	512550409
6594	NC_021487	GCT	2	6	380775	380780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550409
6595	NC_021487	GTAG	2	8	380820	380827	25 %	25 %	50 %	0 %	512550409
6596	NC_021487	GA	3	6	380881	380886	50 %	0 %	50 %	0 %	512550409
6597	NC_021487	GGCGA	2	10	380941	380950	20 %	0 %	60 %	20 %	512550409
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6600	NC_021487	AGCC	2	8	381610	381617	25 %	0 %	25 %	50 %	512550410
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6604	NC_021487	GAG	2	6	381799	381804	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512550410
6605	NC_021487	GAGATG	2	12	381883	381894	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	512550410
6606	NC_021487	TAGG	2	8	381896	381903	25 %	25 %	50 %	0 %	512550410
6607	NC_021487	GA	4	8	382196	382203	50 %	0 %	50 %	0 %	512550411
6608	NC_021487	GTCT	2	8	382332	382339	0 %	50 %	25 %	25 %	512550411
6609	NC_021487	CGG	2	6	382374	382379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512550411
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6611	NC_021487	CCGCC	2	10	382497	382506	0 %	0 %	20 %	80 %	512550411
6612	NC_021487	T	6	6	382518	382523	0 %	100 %	0 %	0 %	512550411
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6622	NC_021487	CGT	2	6	383359	383364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550412
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6990	NC_021487	GAT	2	6	404519	404524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512550428
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