MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chthonomonas calidirosea T49 complete genome

Total Repeats: 59046

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_021487	TGC	2	6	257001	257006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550306
4502	NC_021487	ACG	2	6	257094	257099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550306
4503	NC_021487	TAGC	2	8	257106	257113	25 %	25 %	25 %	25 %	512550306
4504	NC_021487	GAT	2	6	257203	257208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512550306
4505	NC_021487	ACA	2	6	257213	257218	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512550306
4506	NC_021487	G	6	6	257229	257234	0 %	0 %	100 %	0 %	512550306
4507	NC_021487	GAC	2	6	257253	257258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550306
4508	NC_021487	TGT	2	6	257282	257287	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512550306
4509	NC_021487	CCT	2	6	257337	257342	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512550306
4510	NC_021487	GTT	2	6	257382	257387	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512550306
4511	NC_021487	GCT	2	6	257396	257401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550306
4512	NC_021487	GTT	2	6	257415	257420	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512550306
4513	NC_021487	CAC	2	6	257430	257435	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512550306
4514	NC_021487	TTG	2	6	257474	257479	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512550306
4515	NC_021487	CTT	2	6	257505	257510	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512550306
4516	NC_021487	AT	3	6	257606	257611	50 %	50 %	0 %	0 %	512550306
4517	NC_021487	AAAGT	2	10	258063	258072	60 %	20 %	20 %	0 %	512550307
4518	NC_021487	AAC	2	6	258078	258083	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512550307
4519	NC_021487	ACT	2	6	258136	258141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512550307
4520	NC_021487	GAT	2	6	258255	258260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512550307
4521	NC_021487	AAG	2	6	258282	258287	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512550308
4522	NC_021487	CAAA	2	8	258323	258330	75 %	0 %	0 %	25 %	512550308
4523	NC_021487	CT	3	6	258379	258384	0 %	50 %	0 %	50 %	512550308
4524	NC_021487	ATC	2	6	258390	258395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512550308
4525	NC_021487	TG	3	6	258482	258487	0 %	50 %	50 %	0 %	512550308
4526	NC_021487	CGA	2	6	258529	258534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550308
4527	NC_021487	GC	3	6	258688	258693	0 %	0 %	50 %	50 %	512550308
4528	NC_021487	AGT	2	6	259036	259041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512550309
4529	NC_021487	TGC	2	6	259065	259070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550309
4530	NC_021487	TCGTA	2	10	259084	259093	20 %	40 %	20 %	20 %	512550309
4531	NC_021487	TCA	2	6	259120	259125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512550309
4532	NC_021487	GCTGG	2	10	259136	259145	0 %	20 %	60 %	20 %	512550309
4533	NC_021487	GC	3	6	259172	259177	0 %	0 %	50 %	50 %	512550309
4534	NC_021487	T	7	7	259197	259203	0 %	100 %	0 %	0 %	512550309
4535	NC_021487	GT	3	6	259212	259217	0 %	50 %	50 %	0 %	512550309
4536	NC_021487	CAT	2	6	259243	259248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512550309
4537	NC_021487	CGGC	2	8	259263	259270	0 %	0 %	50 %	50 %	512550309
4538	NC_021487	T	7	7	259330	259336	0 %	100 %	0 %	0 %	512550309
4539	NC_021487	ATA	2	6	259347	259352	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512550309
4540	NC_021487	GA	3	6	259365	259370	50 %	0 %	50 %	0 %	512550309
4541	NC_021487	GTG	2	6	259397	259402	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512550309
4542	NC_021487	GCT	2	6	259535	259540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550309
4543	NC_021487	AGC	2	6	259587	259592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550309
4544	NC_021487	GAA	2	6	259618	259623	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512550309
4545	NC_021487	TAT	2	6	259642	259647	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512550309
4546	NC_021487	TC	3	6	259705	259710	0 %	50 %	0 %	50 %	512550309
4547	NC_021487	CATT	2	8	259749	259756	25 %	50 %	0 %	25 %	512550309
4548	NC_021487	AAG	2	6	259831	259836	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512550310
4549	NC_021487	GCCGAA	2	12	259855	259866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550310
4550	NC_021487	GA	3	6	259874	259879	50 %	0 %	50 %	0 %	512550310
4551	NC_021487	CGGC	2	8	259893	259900	0 %	0 %	50 %	50 %	512550310
4552	NC_021487	TTTG	2	8	259906	259913	0 %	75 %	25 %	0 %	512550310
4553	NC_021487	TGG	2	6	259959	259964	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512550310
4554	NC_021487	AGA	2	6	259998	260003	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512550310
4555	NC_021487	GCA	2	6	260021	260026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550310
4556	NC_021487	CCA	2	6	260028	260033	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512550310
4557	NC_021487	TTG	2	6	260052	260057	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512550310
4558	NC_021487	GCG	2	6	260198	260203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512550310
4559	NC_021487	AGG	2	6	260236	260241	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512550310
4560	NC_021487	ACT	2	6	260282	260287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512550310
4561	NC_021487	GGC	2	6	260440	260445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512550310
4562	NC_021487	GGC	2	6	260476	260481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512550310
4563	NC_021487	TGA	2	6	260523	260528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512550310
4564	NC_021487	GGT	2	6	260572	260577	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512550310
4565	NC_021487	GAT	2	6	260641	260646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512550310
4566	NC_021487	CCG	2	6	260726	260731	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512550310
4567	NC_021487	CGCT	2	8	260759	260766	0 %	25 %	25 %	50 %	512550310
4568	NC_021487	CGG	2	6	260904	260909	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512550310
4569	NC_021487	GAA	2	6	260938	260943	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512550310
4570	NC_021487	AGC	2	6	260964	260969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550310
4571	NC_021487	TCT	2	6	260993	260998	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512550310
4572	NC_021487	CAC	2	6	261040	261045	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512550310
4573	NC_021487	TCG	2	6	261206	261211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550311
4574	NC_021487	AG	3	6	261293	261298	50 %	0 %	50 %	0 %	512550311
4575	NC_021487	AGC	2	6	261341	261346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550311
4576	NC_021487	CCA	2	6	261531	261536	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512550312
4577	NC_021487	TGA	2	6	261544	261549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512550312
4578	NC_021487	CT	3	6	261608	261613	0 %	50 %	0 %	50 %	512550312
4579	NC_021487	TGC	2	6	261650	261655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550312
4580	NC_021487	GTT	2	6	261661	261666	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512550312
4581	NC_021487	GCCC	2	8	261814	261821	0 %	0 %	25 %	75 %	512550312
4582	NC_021487	CTA	2	6	261837	261842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512550312
4583	NC_021487	CGC	2	6	261856	261861	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512550312
4584	NC_021487	AAGA	2	8	261872	261879	75 %	0 %	25 %	0 %	512550312
4585	NC_021487	CAGCA	2	10	261929	261938	40 %	0 %	20 %	40 %	512550312
4586	NC_021487	TCT	2	6	261945	261950	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512550312
4587	NC_021487	GTT	2	6	261992	261997	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512550312
4588	NC_021487	CCT	2	6	262093	262098	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512550312
4589	NC_021487	CT	3	6	262104	262109	0 %	50 %	0 %	50 %	512550312
4590	NC_021487	TCT	2	6	262128	262133	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512550312
4591	NC_021487	GCA	2	6	262140	262145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550312
4592	NC_021487	TAA	2	6	262159	262164	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512550312
4593	NC_021487	GGCT	2	8	262219	262226	0 %	25 %	50 %	25 %	512550312
4594	NC_021487	GA	3	6	262310	262315	50 %	0 %	50 %	0 %	512550313
4595	NC_021487	CAC	2	6	262386	262391	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512550313
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4597	NC_021487	CGG	2	6	262566	262571	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512550313
4598	NC_021487	GCC	2	6	262624	262629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512550313
4599	NC_021487	ACG	2	6	262646	262651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550313
4600	NC_021487	TCT	2	6	262686	262691	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512550313
4601	NC_021487	GCA	2	6	262697	262702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550313
4602	NC_021487	GCG	2	6	262772	262777	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512550313
4603	NC_021487	GAG	2	6	262813	262818	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512550313
4604	NC_021487	GCC	2	6	262820	262825	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512550313
4605	NC_021487	CGG	3	9	262871	262879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512550313
4606	NC_021487	GAAA	2	8	262900	262907	75 %	0 %	25 %	0 %	512550313
4607	NC_021487	ATG	2	6	263247	263252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512550313
4608	NC_021487	C	6	6	263257	263262	0 %	0 %	0 %	100 %	512550313
4609	NC_021487	AAGC	2	8	263263	263270	50 %	0 %	25 %	25 %	512550313
4610	NC_021487	CTG	2	6	263284	263289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550314
4611	NC_021487	CAC	2	6	263291	263296	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512550314
4612	NC_021487	AGG	2	6	263313	263318	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512550314
4613	NC_021487	TGT	2	6	263322	263327	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512550314
4614	NC_021487	AGGC	2	8	263493	263500	25 %	0 %	50 %	25 %	512550314
4615	NC_021487	CCGCA	2	10	263537	263546	20 %	0 %	20 %	60 %	512550314
4616	NC_021487	ATG	2	6	263571	263576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512550314
4617	NC_021487	TGAA	2	8	263835	263842	50 %	25 %	25 %	0 %	512550314
4618	NC_021487	GCG	2	6	263883	263888	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512550314
4619	NC_021487	CCCG	2	8	263904	263911	0 %	0 %	25 %	75 %	512550314
4620	NC_021487	CAC	2	6	263933	263938	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512550314
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4622	NC_021487	GCA	2	6	264048	264053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550314
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4852	NC_021487	TAC	2	6	277196	277201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512550329
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4865	NC_021487	CCTG	2	8	278017	278024	0 %	25 %	25 %	50 %	512550329
4866	NC_021487	GAG	2	6	278204	278209	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512550329
4867	NC_021487	ATT	2	6	278219	278224	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512550329
4868	NC_021487	CGA	2	6	278254	278259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550329
4869	NC_021487	GA	3	6	278268	278273	50 %	0 %	50 %	0 %	512550329
4870	NC_021487	GAG	3	9	278276	278284	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512550329
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4873	NC_021487	GCT	3	9	278383	278391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550329
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4877	NC_021487	TGG	2	6	278556	278561	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512550329
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4879	NC_021487	AAC	2	6	278611	278616	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512550329
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4883	NC_021487	AACG	2	8	278984	278991	50 %	0 %	25 %	25 %	512550330
4884	NC_021487	GCAAAT	2	12	279021	279032	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	512550330
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4886	NC_021487	AC	3	6	279183	279188	50 %	0 %	0 %	50 %	512550330
4887	NC_021487	GGT	2	6	279202	279207	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512550330
4888	NC_021487	GA	3	6	279386	279391	50 %	0 %	50 %	0 %	512550330
4889	NC_021487	AG	4	8	279611	279618	50 %	0 %	50 %	0 %	512550330
4890	NC_021487	GTA	2	6	279690	279695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512550330
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4895	NC_021487	CG	3	6	279826	279831	0 %	0 %	50 %	50 %	512550330
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4937	NC_021487	TAG	2	6	282236	282241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512550332
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4971	NC_021487	GGC	2	6	284366	284371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512550334
4972	NC_021487	ATCGT	2	10	284406	284415	20 %	40 %	20 %	20 %	512550334
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4976	NC_021487	G	6	6	284535	284540	0 %	0 %	100 %	0 %	512550334
4977	NC_021487	GAT	2	6	284550	284555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512550334
4978	NC_021487	CTG	2	6	284653	284658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550334
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4983	NC_021487	AAGG	2	8	285154	285161	50 %	0 %	50 %	0 %	512550335
4984	NC_021487	AGC	2	6	285167	285172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550335
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4987	NC_021487	CGG	2	6	285513	285518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512550335
4988	NC_021487	AG	4	8	285561	285568	50 %	0 %	50 %	0 %	512550335
4989	NC_021487	TTC	2	6	285570	285575	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512550335
4990	NC_021487	C	6	6	285621	285626	0 %	0 %	0 %	100 %	512550335
4991	NC_021487	CGC	2	6	285693	285698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512550335
4992	NC_021487	GAC	2	6	285724	285729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550335
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