MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Clostridium pasteurianum BC1

Total Repeats: 2073

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021182	AATATA	2	12	3515	3526	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	488769003
2	NC_021182	ATAAGG	2	12	3609	3620	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	488769003
3	NC_021182	AGACAA	2	12	5851	5862	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	488769005
4	NC_021182	AGCTAG	2	12	8043	8054	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	488769006
5	NC_021182	TCAAGT	2	12	17551	17562	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	488769009
6	NC_021182	TTATAA	2	12	17926	17937	50 %	50 %	0 %	0 %	488769009
7	NC_021182	GCTTAA	2	12	19849	19860	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	488769010
8	NC_021182	TACTGT	2	12	21672	21683	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	488769011
9	NC_021182	TGAAAT	2	12	21860	21871	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	488769011
10	NC_021182	TGCAGA	2	12	25617	25628	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	488769014
11	NC_021182	ATTACT	2	12	27635	27646	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	488769015
12	NC_021182	TTATAT	2	12	27944	27955	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	488769016
13	NC_021182	TATTGT	2	12	28673	28684	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	488769016
14	NC_021182	TTTAAT	2	12	34533	34544	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	488769019
15	NC_021182	GTATCA	2	12	40335	40346	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	488769024
16	NC_021182	ATGCTA	2	12	41985	41996	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	488769027
17	NC_021182	ATATCT	2	12	45736	45747	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	488769033
18	NC_021182	CAGATG	2	12	47451	47462	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	488769034
19	NC_021182	ATGAAA	2	12	51434	51445	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	488769036
20	NC_021182	TTCTAT	2	12	52457	52468	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	488769037
21	NC_021182	TGGTTT	2	12	56476	56487	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	488769040
22	NC_021182	CTTCTA	2	12	59136	59147	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	488769042
23	NC_021182	TTATAG	2	12	61852	61863	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	488769044
24	NC_021182	TTTTTA	2	12	62881	62892	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	488769045
25	NC_021182	TGGAAT	2	12	65446	65457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488769047
26	NC_021182	AAAAAT	2	12	68407	68418	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	488769048
27	NC_021182	GATCAA	2	12	69811	69822	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	488769049
28	NC_021182	ATAAAA	2	12	69862	69873	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	488769049
29	NC_021182	ACTATG	2	12	71061	71072	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	488769050
30	NC_021182	GTATTA	2	12	71400	71411	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	488769050
31	NC_021182	TATTTT	2	12	76437	76448	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	488769056
32	NC_021182	AAATTG	2	12	85180	85191	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	488769070
33	NC_021182	TTTTAG	2	12	87080	87091	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	488769073
34	NC_021182	AAAACT	2	12	87330	87341	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	488769073
35	NC_021182	ATAAAT	2	12	88944	88955	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	488769074
36	NC_021182	TACTGA	2	12	98771	98782	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	488769085
37	NC_021182	CCGAAG	2	12	108467	108478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488769090
38	NC_021182	TTTTCT	2	12	109387	109398	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	488769091
39	NC_021182	CAAGAC	2	12	109700	109711	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	488769091
40	NC_021182	ATTTTC	2	12	114538	114549	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	488769097
41	NC_021182	CCACAA	2	12	115052	115063	50 %	0 %	0 %	50 %	488769097
42	NC_021182	TACTTT	2	12	131959	131970	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	488769103
43	NC_021182	TATACT	2	12	133664	133675	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	488769105
44	NC_021182	ATAGTA	2	12	133848	133859	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	488769105
45	NC_021182	CTTATG	2	12	133914	133925	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	488769105
46	NC_021182	TAAATT	2	12	134699	134710	50 %	50 %	0 %	0 %	488769106
47	NC_021182	TATAAA	2	12	137721	137732	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	488769108
48	NC_021182	TAAATT	2	12	149477	149488	50 %	50 %	0 %	0 %	488769114
49	NC_021182	AAAAAT	2	12	155825	155836	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	488769120
50	NC_021182	ATTATA	2	12	155988	155999	50 %	50 %	0 %	0 %	488769120
51	NC_021182	ATAAAT	2	12	161275	161286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	488769123
52	NC_021182	AGTAAT	2	12	176846	176857	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	488769131
53	NC_021182	TAGGTG	2	12	177273	177284	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	488769131
54	NC_021182	TAAACT	2	12	177468	177479	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	488769131
55	NC_021182	ATCACA	2	12	187012	187023	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	488769135
56	NC_021182	AAATTA	2	12	190378	190389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	488769138
57	NC_021182	TCACCT	2	12	191582	191593	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	488769140
58	NC_021182	GAAATA	2	12	193880	193891	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	488769143
59	NC_021182	CGATTA	2	12	197338	197349	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	488769148
60	NC_021182	AAGAAA	2	12	197624	197635	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	488769149
61	NC_021182	GAAAGA	2	12	199793	199804	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488769151
62	NC_021182	TAGATG	2	12	206431	206442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488769156
63	NC_021182	GAATAA	2	12	207277	207288	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	488769157
64	NC_021182	GTATAG	2	12	210205	210216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488769160
65	NC_021182	CAGAAG	2	12	212069	212080	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	488769162
66	NC_021182	TAATAT	2	12	213436	213447	50 %	50 %	0 %	0 %	488769163
67	NC_021182	GCATAA	2	12	215728	215739	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	488769166
68	NC_021182	TGAGGA	2	12	217101	217112	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	488769167
69	NC_021182	TCAGAG	2	12	218684	218695	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	488769169
70	NC_021182	TACTTA	2	12	229204	229215	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	488769180
71	NC_021182	TAAATA	2	12	233602	233613	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	488769186
72	NC_021182	ATAAAA	2	12	234132	234143	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	488769187
73	NC_021182	GAAGAG	2	12	239583	239594	50 %	0 %	50 %	0 %	488769192
74	NC_021182	AATGAT	2	12	239718	239729	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	488769192
75	NC_021182	CAGAAA	2	12	240211	240222	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	488769192
76	NC_021182	TTAAAT	2	12	246323	246334	50 %	50 %	0 %	0 %	488769196
77	NC_021182	ATAAAT	2	12	249968	249979	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	488769198
78	NC_021182	GAACTT	2	12	254369	254380	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	488769203
79	NC_021182	AGTAAT	2	12	259973	259984	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	488769206
80	NC_021182	TATAAA	2	12	261606	261617	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	488769208
81	NC_021182	ATTTAG	2	12	262794	262805	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	488769209
82	NC_021182	GTAAAC	2	12	264357	264368	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	488769211
83	NC_021182	AATTCT	2	12	264891	264902	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	488769211
84	NC_021182	GCTGTA	2	12	265581	265592	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	488769211
85	NC_021182	CAGCTG	2	12	269157	269168	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	488769214
86	NC_021182	GTAAGG	2	12	271623	271634	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	488769215
87	NC_021182	AGAACT	2	12	281497	281508	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	488769221
88	NC_021182	TACAAT	2	12	281587	281598	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	488769221
89	NC_021182	AAATAA	2	12	283395	283406	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	488769223
90	NC_021182	AAGAGG	2	12	284647	284658	50 %	0 %	50 %	0 %	488769225
91	NC_021182	TAAAAG	2	12	285271	285282	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	488769225
92	NC_021182	GAAAAA	2	12	287103	287114	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	488769225
93	NC_021182	TAAATG	2	12	287779	287790	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	488769225
94	NC_021182	TGGCTA	2	12	289131	289142	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	488769226
95	NC_021182	TACATT	2	12	291452	291463	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	488769228
96	NC_021182	TATGGA	2	12	295364	295375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488769231
97	NC_021182	TAAATA	2	12	295640	295651	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	488769232
98	NC_021182	AATAGG	2	12	297381	297392	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	488769233
99	NC_021182	AGATGA	2	12	298646	298657	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	488769235
100	NC_021182	TAGAAA	2	12	299591	299602	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	488769236
101	NC_021182	TTACAA	2	12	303462	303473	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	488769238
102	NC_021182	CAGATG	2	12	303828	303839	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	488769238
103	NC_021182	GGAAAT	2	12	305620	305631	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	488769239
104	NC_021182	CATAGC	2	12	311639	311650	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	488769244
105	NC_021182	TATGAG	2	12	316076	316087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488769246
106	NC_021182	AATAAA	2	12	319074	319085	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	488769248
107	NC_021182	AAAAAT	2	12	319225	319236	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	488769248
108	NC_021182	GAAATA	2	12	320697	320708	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	488769250
109	NC_021182	GATTTT	2	12	321723	321734	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	488769251
110	NC_021182	TACAGA	2	12	324732	324743	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	488769254
111	NC_021182	TAAAAG	2	12	324975	324986	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	488769254
112	NC_021182	CTTCAT	2	12	326999	327010	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	488769255
113	NC_021182	CCAATA	2	12	327566	327577	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	488769256
114	NC_021182	TAATTT	2	12	327582	327593	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	488769256
115	NC_021182	CTTTTT	2	12	328755	328766	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	488769257
116	NC_021182	CGGTGG	2	12	332787	332798	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	488769266
117	NC_021182	GAAAAT	2	12	333663	333674	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	488769267
118	NC_021182	TGTAAA	2	12	336471	336482	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	488769272
119	NC_021182	AAAATA	2	12	337510	337521	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	488769275
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232	NC_021182	TTAGTT	2	12	612121	612132	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	488769540
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235	NC_021182	ACAGAT	2	12	616021	616032	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	488769542
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462	NC_021182	AGTAAT	2	12	1220479	1220490	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	488770063
463	NC_021182	ATAGTA	2	12	1220561	1220572	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	488770063
464	NC_021182	TACTTA	2	12	1221821	1221832	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	488770064
465	NC_021182	TAATTT	2	12	1222724	1222735	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	488770065
466	NC_021182	ACAAAG	2	12	1225987	1225998	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	488770065
467	NC_021182	AAAGGC	2	12	1226854	1226865	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	488770065
468	NC_021182	AGTGGA	2	12	1227586	1227597	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	488770065
469	NC_021182	GAGTCA	2	12	1228371	1228382	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	488770065
470	NC_021182	AAGAGA	2	12	1228473	1228484	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488770065
471	NC_021182	TATACC	2	12	1234040	1234051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488770069
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473	NC_021182	AAAGCT	2	12	1253812	1253823	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	488770083
474	NC_021182	TAAAGT	2	12	1253949	1253960	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	488770083
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476	NC_021182	TATGTA	2	12	1257620	1257631	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	488770087
477	NC_021182	TCTGTA	2	12	1258686	1258697	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	488770089
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480	NC_021182	TTTAAA	2	12	1262698	1262709	50 %	50 %	0 %	0 %	488770094
481	NC_021182	ATAGCT	2	12	1268581	1268592	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	488770102
482	NC_021182	CTAATC	2	12	1269114	1269125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488770102
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484	NC_021182	CTTATG	2	12	1270402	1270413	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	488770104
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488	NC_021182	TGTATT	2	12	1279431	1279442	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	488770111
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497	NC_021182	CATGAG	2	12	1295019	1295030	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	488770123
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499	NC_021182	TAATAT	2	12	1303547	1303558	50 %	50 %	0 %	0 %	488770135
500	NC_021182	TTTACA	2	12	1304069	1304080	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	488770135

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