MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Candidatus Moranella endobia PCVAL

Total Repeats: 147

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021057	TAAGCA	2	12	5456	5467	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	479324023
2	NC_021057	GCGGTA	2	12	13753	13764	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	479324028
3	NC_021057	TGGCAG	2	12	19967	19978	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	479324032
4	NC_021057	TTTATG	2	12	25139	25150	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	479324036
5	NC_021057	GCCTAT	2	12	29218	29229	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	479324039
6	NC_021057	TGAAGT	2	12	29952	29963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479324040
7	NC_021057	AGCTCT	2	12	33895	33906	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	479324043
8	NC_021057	ATGGTC	2	12	38282	38293	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	479324046
9	NC_021057	ATCCCC	2	12	38588	38599	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	479324046
10	NC_021057	TTTACC	2	12	41174	41185	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	479324048
11	NC_021057	GTAGCA	2	12	47665	47676	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	479324051
12	NC_021057	TTACGG	2	12	57219	57230	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	479324058
13	NC_021057	ATCGTA	2	12	66963	66974	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	479324065
14	NC_021057	ACTGGC	2	12	66982	66993	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	479324065
15	NC_021057	TGAAAA	2	12	68732	68743	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	479324066
16	NC_021057	GATCTT	2	12	74218	74229	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	479324068
17	NC_021057	GCTTAT	2	12	76051	76062	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	479324069
18	NC_021057	TGATAC	2	12	76305	76316	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	479324069
19	NC_021057	GCGCCA	2	12	80438	80449	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	479324072
20	NC_021057	TTTTGT	2	12	93123	93134	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	479324084
21	NC_021057	CACTCC	2	12	98507	98518	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	479324089
22	NC_021057	TGTATC	2	12	100419	100430	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	479324090
23	NC_021057	GCTCGT	2	12	103203	103214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479324093
24	NC_021057	GTTAAT	2	12	108420	108431	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	479324097
25	NC_021057	TACCAA	2	12	112972	112983	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	479324098
26	NC_021057	CTTCAT	2	12	117171	117182	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	479324101
27	NC_021057	TAAATC	2	12	118477	118488	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	479324102
28	NC_021057	CTTGAG	2	12	122117	122128	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	479324105
29	NC_021057	AGCTAC	2	12	123417	123428	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	479324107
30	NC_021057	CGGCGC	2	12	132026	132037	0 %	0 %	50 %	50 %	479324113
31	NC_021057	AGCAAT	2	12	134600	134611	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	479324115
32	NC_021057	ATTGGA	2	12	140458	140469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479324119
33	NC_021057	ATGCTG	2	12	149318	149329	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	479324125
34	NC_021057	TAAAAA	2	12	151001	151012	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	479324126
35	NC_021057	AGCGTG	2	12	151462	151473	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	479324126
36	NC_021057	AGCAAC	2	12	151594	151605	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	479324126
37	NC_021057	GAAGCA	2	12	151995	152006	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	479324126
38	NC_021057	AGCTTT	2	12	157413	157424	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	479324131
39	NC_021057	GCAAAA	2	12	163303	163314	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	479324135
40	NC_021057	AGGTAA	2	12	168068	168079	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	479324137
41	NC_021057	TACACT	2	12	169585	169596	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479324139
42	NC_021057	AAAAGA	2	12	172092	172103	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	479324141
43	NC_021057	TAGAAG	2	12	173963	173974	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	479324142
44	NC_021057	TATAGA	2	12	175961	175972	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	479324144
45	NC_021057	AGAATG	2	12	180928	180939	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	479324149
46	NC_021057	TGCTGT	2	12	181426	181437	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	479324149
47	NC_021057	AGATAC	2	12	185771	185782	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	479324154
48	NC_021057	GTTTTG	2	12	188695	188706	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479324156
49	NC_021057	GAACAC	2	12	190804	190815	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	479324158
50	NC_021057	TAAACT	2	12	191017	191028	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	479324158
51	NC_021057	TGAAGA	2	12	192671	192682	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	479324160
52	NC_021057	TCGCGC	2	12	200925	200936	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	479324166
53	NC_021057	ATGGTA	2	12	209260	209271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479324170
54	NC_021057	TACATG	2	12	214177	214188	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	479324173
55	NC_021057	AACGAC	2	12	217884	217895	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	479324177
56	NC_021057	CATTAT	2	12	219530	219541	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	479324178
57	NC_021057	GCCAAT	2	12	220412	220423	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	479324179
58	NC_021057	TGGTGT	2	12	225189	225200	0 %	50 %	50 %	0 %	479324182
59	NC_021057	GCACAG	2	12	228931	228942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479324184
60	NC_021057	TTGGTA	2	12	233036	233047	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	479324188
61	NC_021057	AGGCTG	2	12	233460	233471	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	479324188
62	NC_021057	GCACCG	2	12	234552	234563	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	479324188
63	NC_021057	TGCTGG	2	12	234612	234623	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	479324188
64	NC_021057	CTTTGC	2	12	237377	237388	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	479324190
65	NC_021057	GCCGCG	2	12	247495	247506	0 %	0 %	50 %	50 %	479324196
66	NC_021057	ATTTAA	2	12	249562	249573	50 %	50 %	0 %	0 %	479324198
67	NC_021057	TGGTAT	2	12	253924	253935	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	479324202
68	NC_021057	CCGGAG	2	12	257574	257585	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	479324206
69	NC_021057	TCGCCA	2	12	260018	260029	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	479324208
70	NC_021057	CACCGG	2	12	264413	264424	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	479324210
71	NC_021057	GCGGTG	2	12	265418	265429	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	479324210
72	NC_021057	CTGCTA	2	12	270835	270846	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	479324217
73	NC_021057	TAAAGG	2	12	275264	275275	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	479324227
74	NC_021057	TTGGCT	2	12	275852	275863	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	479324229
75	NC_021057	ATAAAA	2	12	281265	281276	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	479324238
76	NC_021057	TCAGGC	2	12	284222	284233	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	479324241
77	NC_021057	GGTGAC	2	12	290575	290586	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	479324247
78	NC_021057	CACGCG	2	12	305883	305894	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	479324255
79	NC_021057	CGCTTG	2	12	306082	306093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479324255
80	NC_021057	CCCAGC	2	12	310422	310433	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	479324260
81	NC_021057	CAGCCA	2	12	310759	310770	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	479324261
82	NC_021057	GGCGAA	2	12	317628	317639	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	479324265
83	NC_021057	AAAGGG	2	12	324482	324493	50 %	0 %	50 %	0 %	479324268
84	NC_021057	CTACTT	2	12	324915	324926	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	479324268
85	NC_021057	TCGATC	2	12	325869	325880	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	479324269
86	NC_021057	AAACCT	2	12	327784	327795	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	479324270
87	NC_021057	GATGCT	2	12	328166	328177	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	479324270
88	NC_021057	GTGATA	2	12	331159	331170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479324272
89	NC_021057	GCTCCT	2	12	331175	331186	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	479324272
90	NC_021057	GAGGCA	2	12	334938	334949	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	479324278
91	NC_021057	GCAAAA	2	12	340937	340948	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	479324280
92	NC_021057	ATTGGA	2	12	342776	342787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479324282
93	NC_021057	TAAAAT	2	12	343555	343566	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479324283
94	NC_021057	GTAAAA	2	12	343634	343645	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	479324283
95	NC_021057	GGTGTA	2	12	350642	350653	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	479324285
96	NC_021057	AATTTT	2	12	351010	351021	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479324285
97	NC_021057	CTGATG	2	12	360262	360273	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	479324292
98	NC_021057	TTAGCA	2	12	360441	360452	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	479324292
99	NC_021057	GGTTTT	2	12	363650	363661	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479324294
100	NC_021057	ATTTTT	2	12	364401	364412	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	479324295
101	NC_021057	TTTCAT	2	12	374968	374979	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	479324301
102	NC_021057	CATCTT	2	12	375907	375918	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	479324302
103	NC_021057	CATTTT	2	12	383460	383471	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	479324309
104	NC_021057	TGGCGC	2	12	384567	384578	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	479324309
105	NC_021057	TAACTA	2	12	389724	389735	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	479324313
106	NC_021057	AGTAGC	2	12	390005	390016	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	479324313
107	NC_021057	TCAGCC	2	12	390736	390747	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	479324314
108	NC_021057	AATCAT	2	12	393606	393617	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	479324317
109	NC_021057	CCGCGC	2	12	395451	395462	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479324319
110	NC_021057	CTTTCA	2	12	396066	396077	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	479324320
111	NC_021057	CTAGGA	2	12	396846	396857	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	479324320
112	NC_021057	CGTAGC	2	12	415644	415655	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	479324335
113	NC_021057	TGACCG	2	12	416778	416789	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	479324336
114	NC_021057	TGGCAA	2	12	418236	418247	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	479324337
115	NC_021057	AGTAGC	2	12	420441	420452	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	479324339
116	NC_021057	ACCAAT	2	12	421073	421084	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	479324340
117	NC_021057	GGCGCT	2	12	422466	422477	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	479324341
118	NC_021057	TTATCA	2	12	426488	426499	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	479324344
119	NC_021057	CAGGAT	2	12	429310	429321	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	479324344
120	NC_021057	ACCAGT	2	12	434014	434025	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	479324348
121	NC_021057	TACTCT	2	12	445655	445666	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	479324356
122	NC_021057	GATAAA	2	12	447638	447649	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	479324358
123	NC_021057	AACTAA	2	12	451004	451015	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	479324361
124	NC_021057	ATTGCT	2	12	460281	460292	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	479324366
125	NC_021057	CCATTG	2	12	464525	464536	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	479324371
126	NC_021057	CGAGCG	2	12	470229	470240	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	479324376
127	NC_021057	CCGCAC	2	12	470313	470324	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	479324376
128	NC_021057	CTATCA	2	12	478554	478565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479324382
129	NC_021057	GTTGCC	2	12	478597	478608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479324382
130	NC_021057	CCATAA	2	12	481008	481019	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	479324385
131	NC_021057	CGGCAG	2	12	481155	481166	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	479324385
132	NC_021057	TTCATT	2	12	484882	484893	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	479324390
133	NC_021057	TTCAAT	2	12	486898	486909	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	479324391
134	NC_021057	CCCTGG	2	12	487554	487565	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	479324392
135	NC_021057	GCGTTG	2	12	488988	488999	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	479324393
136	NC_021057	ATAGCA	2	12	496267	496278	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	479324396
137	NC_021057	CTTCAT	2	12	496306	496317	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	479324396
138	NC_021057	TATGGT	2	12	497246	497257	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	479324397
139	NC_021057	TAGCCA	2	12	500789	500800	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	479324399
140	NC_021057	CAGGCC	2	12	508652	508663	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	479324408
141	NC_021057	AATTAA	2	12	514943	514954	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479324413
142	NC_021057	CGCCGT	2	12	520927	520938	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	479324416
143	NC_021057	GCAGAT	2	12	528445	528456	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	479324425
144	NC_021057	ACTTTA	2	12	532307	532318	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	479324428
145	NC_021057	TCCCTA	2	12	535359	535370	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	479324430
146	NC_021057	ATAACC	2	12	536985	536996	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	479324430
147	NC_021057	GCAGAA	2	12	537250	537261	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	479324430

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.