MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis L2/434/Bu(f)

Total Repeats: 20436

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_021052	AGA	2	6	185223	185228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482546177
3502	NC_021052	T	6	6	185250	185255	0 %	100 %	0 %	0 %	482546177
3503	NC_021052	ATT	2	6	185276	185281	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482546177
3504	NC_021052	AGA	2	6	185295	185300	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482546177
3505	NC_021052	TGA	2	6	185367	185372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482546177
3506	NC_021052	AAG	2	6	185402	185407	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482546177
3507	NC_021052	CTT	2	6	185627	185632	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482546178
3508	NC_021052	T	6	6	185631	185636	0 %	100 %	0 %	0 %	482546178
3509	NC_021052	CAATTT	2	12	185651	185662	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	482546178
3510	NC_021052	TCT	2	6	185761	185766	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482546178
3511	NC_021052	ATC	2	6	185784	185789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482546178
3512	NC_021052	GAT	2	6	185802	185807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482546178
3513	NC_021052	ATC	2	6	185811	185816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482546178
3514	NC_021052	CTT	2	6	185819	185824	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482546178
3515	NC_021052	T	7	7	185890	185896	0 %	100 %	0 %	0 %	482546178
3516	NC_021052	AC	3	6	185903	185908	50 %	0 %	0 %	50 %	482546178
3517	NC_021052	ATCGCC	2	12	185922	185933	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	482546178
3518	NC_021052	TC	3	6	185942	185947	0 %	50 %	0 %	50 %	482546178
3519	NC_021052	TTG	2	6	185955	185960	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482546178
3520	NC_021052	TA	3	6	186117	186122	50 %	50 %	0 %	0 %	482546178
3521	NC_021052	CAA	2	6	186124	186129	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482546178
3522	NC_021052	ATC	2	6	186141	186146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482546178
3523	NC_021052	TCT	2	6	186278	186283	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482546179
3524	NC_021052	TTTTA	2	10	186300	186309	20 %	80 %	0 %	0 %	482546179
3525	NC_021052	CTTT	2	8	186318	186325	0 %	75 %	0 %	25 %	482546179
3526	NC_021052	AGA	2	6	186471	186476	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482546180
3527	NC_021052	AGTT	2	8	186530	186537	25 %	50 %	25 %	0 %	482546180
3528	NC_021052	TCA	2	6	186552	186557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482546180
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3530	NC_021052	CAG	2	6	186672	186677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482546180
3531	NC_021052	TGC	2	6	186746	186751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482546180
3532	NC_021052	ATT	2	6	186835	186840	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482546180
3533	NC_021052	CAGT	2	8	186875	186882	25 %	25 %	25 %	25 %	482546180
3534	NC_021052	TCT	2	6	187071	187076	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482546180
3535	NC_021052	AGT	2	6	187083	187088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482546180
3536	NC_021052	ATC	2	6	187120	187125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482546180
3537	NC_021052	ATT	2	6	187168	187173	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482546180
3538	NC_021052	TTG	2	6	187211	187216	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482546180
3539	NC_021052	CAAC	2	8	187220	187227	50 %	0 %	0 %	50 %	482546180
3540	NC_021052	AGG	2	6	187308	187313	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482546180
3541	NC_021052	AAG	2	6	187358	187363	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482546180
3542	NC_021052	TAG	2	6	187489	187494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482546180
3543	NC_021052	TCTA	2	8	187613	187620	25 %	50 %	0 %	25 %	482546181
3544	NC_021052	AT	3	6	187660	187665	50 %	50 %	0 %	0 %	482546181
3545	NC_021052	CTT	2	6	187684	187689	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482546181
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3547	NC_021052	GAA	2	6	187757	187762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482546181
3548	NC_021052	TAT	2	6	187771	187776	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482546181
3549	NC_021052	AGG	2	6	187888	187893	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482546181
3550	NC_021052	GGAA	2	8	187942	187949	50 %	0 %	50 %	0 %	482546181
3551	NC_021052	AGA	2	6	188018	188023	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482546181
3552	NC_021052	GA	3	6	188040	188045	50 %	0 %	50 %	0 %	482546181
3553	NC_021052	GTT	2	6	188092	188097	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482546181
3554	NC_021052	TGA	2	6	188098	188103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482546181
3555	NC_021052	GA	3	6	188164	188169	50 %	0 %	50 %	0 %	482546181
3556	NC_021052	GCT	2	6	188209	188214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482546181
3557	NC_021052	TCT	2	6	188271	188276	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482546181
3558	NC_021052	ATA	2	6	188324	188329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482546181
3559	NC_021052	GAG	2	6	188471	188476	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482546181
3560	NC_021052	GT	3	6	188816	188821	0 %	50 %	50 %	0 %	482546182
3561	NC_021052	TTTC	2	8	188918	188925	0 %	75 %	0 %	25 %	482546182
3562	NC_021052	ATT	2	6	189006	189011	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482546182
3563	NC_021052	AAT	2	6	189017	189022	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482546182
3564	NC_021052	CGT	2	6	189073	189078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482546182
3565	NC_021052	GAT	2	6	189089	189094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482546182
3566	NC_021052	TATG	2	8	189125	189132	25 %	50 %	25 %	0 %	482546182
3567	NC_021052	GCTT	2	8	189162	189169	0 %	50 %	25 %	25 %	482546182
3568	NC_021052	AGA	2	6	189205	189210	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482546182
3569	NC_021052	CAG	2	6	189221	189226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482546182
3570	NC_021052	TTG	2	6	189371	189376	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482546182
3571	NC_021052	TTC	2	6	189389	189394	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482546182
3572	NC_021052	G	8	8	189508	189515	0 %	0 %	100 %	0 %	482546182
3573	NC_021052	ATA	2	6	189559	189564	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482546183
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3577	NC_021052	ATG	2	6	189768	189773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482546183
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3580	NC_021052	TGA	2	6	189835	189840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482546183
3581	NC_021052	TGGT	2	8	189886	189893	0 %	50 %	50 %	0 %	482546183
3582	NC_021052	GAT	2	6	190061	190066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482546183
3583	NC_021052	ACT	2	6	190172	190177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482546183
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3588	NC_021052	GAT	2	6	190352	190357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482546183
3589	NC_021052	TGA	2	6	190358	190363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482546183
3590	NC_021052	TAT	2	6	190409	190414	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482546183
3591	NC_021052	TGC	2	6	190418	190423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482546183
3592	NC_021052	CTTC	2	8	190443	190450	0 %	50 %	0 %	50 %	482546183
3593	NC_021052	GTT	3	9	190461	190469	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482546183
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3598	NC_021052	GAC	2	6	190840	190845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482546183
3599	NC_021052	TAT	3	9	190901	190909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482546183
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3601	NC_021052	ATC	2	6	190936	190941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482546183
3602	NC_021052	TGG	2	6	190945	190950	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482546183
3603	NC_021052	A	6	6	191033	191038	100 %	0 %	0 %	0 %	482546183
3604	NC_021052	ATT	2	6	191150	191155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482546183
3605	NC_021052	GAAG	2	8	191210	191217	50 %	0 %	50 %	0 %	482546184
3606	NC_021052	TC	3	6	191257	191262	0 %	50 %	0 %	50 %	482546184
3607	NC_021052	CG	3	6	191350	191355	0 %	0 %	50 %	50 %	482546184
3608	NC_021052	TTG	2	6	191449	191454	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482546184
3609	NC_021052	ATCT	2	8	191476	191483	25 %	50 %	0 %	25 %	482546184
3610	NC_021052	ATCT	2	8	191539	191546	25 %	50 %	0 %	25 %	482546184
3611	NC_021052	T	7	7	191548	191554	0 %	100 %	0 %	0 %	482546184
3612	NC_021052	ATC	2	6	191593	191598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482546184
3613	NC_021052	TTA	2	6	191607	191612	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482546184
3614	NC_021052	TCTGT	2	10	191656	191665	0 %	60 %	20 %	20 %	482546184
3615	NC_021052	TCA	2	6	191717	191722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482546184
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3618	NC_021052	TCT	2	6	191877	191882	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482546184
3619	NC_021052	TC	3	6	191981	191986	0 %	50 %	0 %	50 %	482546184
3620	NC_021052	AAG	2	6	191989	191994	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482546184
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3622	NC_021052	A	6	6	192043	192048	100 %	0 %	0 %	0 %	482546184
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3993	NC_021052	AG	3	6	211835	211840	50 %	0 %	50 %	0 %	482546204
3994	NC_021052	TCTAT	2	10	211848	211857	20 %	60 %	0 %	20 %	482546204
3995	NC_021052	TAA	2	6	211868	211873	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482546204
3996	NC_021052	GCT	2	6	211941	211946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482546204
3997	NC_021052	GTAA	2	8	211966	211973	50 %	25 %	25 %	0 %	482546204
3998	NC_021052	GAG	2	6	212084	212089	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482546204
3999	NC_021052	CTGT	2	8	212280	212287	0 %	50 %	25 %	25 %	482546204
4000	NC_021052	CA	3	6	212299	212304	50 %	0 %	0 %	50 %	482546204

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