MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis L2/434/Bu(f)

Total Repeats: 20436

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_021052	TTCT	2	8	22374	22381	0 %	75 %	0 %	25 %	482546042
502	NC_021052	AGGG	2	8	22426	22433	25 %	0 %	75 %	0 %	482546042
503	NC_021052	GCT	2	6	22483	22488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482546043
504	NC_021052	CAG	2	6	22529	22534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482546043
505	NC_021052	GA	3	6	22563	22568	50 %	0 %	50 %	0 %	482546043
506	NC_021052	TCT	2	6	22591	22596	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482546043
507	NC_021052	AGC	2	6	22626	22631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482546043
508	NC_021052	GA	3	6	22670	22675	50 %	0 %	50 %	0 %	482546043
509	NC_021052	GTG	2	6	22735	22740	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482546043
510	NC_021052	AGA	2	6	22776	22781	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482546043
511	NC_021052	GA	3	6	22814	22819	50 %	0 %	50 %	0 %	482546043
512	NC_021052	GTT	2	6	22827	22832	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482546043
513	NC_021052	TAT	2	6	22877	22882	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482546043
514	NC_021052	TCTT	2	8	22926	22933	0 %	75 %	0 %	25 %	482546043
515	NC_021052	TCA	2	6	22957	22962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482546043
516	NC_021052	TG	3	6	23008	23013	0 %	50 %	50 %	0 %	482546043
517	NC_021052	TC	4	8	23183	23190	0 %	50 %	0 %	50 %	482546044
518	NC_021052	TACA	2	8	23216	23223	50 %	25 %	0 %	25 %	482546044
519	NC_021052	GCA	2	6	23229	23234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482546044
520	NC_021052	ACG	2	6	23256	23261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482546044
521	NC_021052	AAT	2	6	23304	23309	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482546044
522	NC_021052	GTT	2	6	23417	23422	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482546044
523	NC_021052	AAC	2	6	23429	23434	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482546044
524	NC_021052	GGAA	2	8	23536	23543	50 %	0 %	50 %	0 %	482546044
525	NC_021052	GAA	2	6	23592	23597	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482546044
526	NC_021052	AAAC	2	8	23613	23620	75 %	0 %	0 %	25 %	482546044
527	NC_021052	TTG	2	6	23679	23684	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482546044
528	NC_021052	AGA	3	9	23687	23695	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482546044
529	NC_021052	GAA	2	6	23748	23753	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482546044
530	NC_021052	TGA	2	6	23864	23869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482546044
531	NC_021052	GAA	2	6	23925	23930	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482546044
532	NC_021052	TTA	2	6	23967	23972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482546044
533	NC_021052	TCT	2	6	24131	24136	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482546044
534	NC_021052	AGG	2	6	24227	24232	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482546044
535	NC_021052	AAAG	2	8	24239	24246	75 %	0 %	25 %	0 %	482546044
536	NC_021052	GTT	2	6	24309	24314	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482546045
537	NC_021052	CGA	2	6	24317	24322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482546045
538	NC_021052	AGC	2	6	24342	24347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482546045
539	NC_021052	AGC	2	6	24370	24375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482546045
540	NC_021052	CTC	2	6	24497	24502	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482546045
541	NC_021052	GGAT	2	8	24519	24526	25 %	25 %	50 %	0 %	482546045
542	NC_021052	AG	3	6	24559	24564	50 %	0 %	50 %	0 %	482546045
543	NC_021052	CTA	2	6	24691	24696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482546045
544	NC_021052	T	6	6	24703	24708	0 %	100 %	0 %	0 %	482546045
545	NC_021052	AGC	2	6	24753	24758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482546045
546	NC_021052	ATG	2	6	24786	24791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482546045
547	NC_021052	AG	3	6	24913	24918	50 %	0 %	50 %	0 %	482546046
548	NC_021052	A	7	7	24936	24942	100 %	0 %	0 %	0 %	482546046
549	NC_021052	T	7	7	24951	24957	0 %	100 %	0 %	0 %	482546046
550	NC_021052	TGT	2	6	24976	24981	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482546046
551	NC_021052	TCT	2	6	25050	25055	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482546046
552	NC_021052	CAA	2	6	25064	25069	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482546046
553	NC_021052	CCGA	2	8	25090	25097	25 %	0 %	25 %	50 %	482546047
554	NC_021052	TTC	2	6	25175	25180	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482546047
555	NC_021052	GAA	2	6	25258	25263	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482546047
556	NC_021052	AAC	2	6	25298	25303	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482546047
557	NC_021052	GGC	2	6	25349	25354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482546047
558	NC_021052	TGC	2	6	25391	25396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482546047
559	NC_021052	TGTGAT	2	12	25499	25510	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	482546047
560	NC_021052	AGC	2	6	25520	25525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482546047
561	NC_021052	ATG	2	6	25590	25595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482546047
562	NC_021052	GGA	2	6	25713	25718	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482546047
563	NC_021052	TTC	2	6	25736	25741	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482546047
564	NC_021052	TCG	2	6	25757	25762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482546047
565	NC_021052	GAG	2	6	25780	25785	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482546047
566	NC_021052	A	6	6	25826	25831	100 %	0 %	0 %	0 %	482546047
567	NC_021052	CTC	2	6	25840	25845	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482546047
568	NC_021052	TTC	2	6	25889	25894	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482546047
569	NC_021052	A	7	7	25924	25930	100 %	0 %	0 %	0 %	482546047
570	NC_021052	TAT	2	6	25931	25936	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482546047
571	NC_021052	GTT	2	6	26027	26032	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482546047
572	NC_021052	AAG	2	6	26172	26177	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482546048
573	NC_021052	TCT	2	6	26182	26187	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482546048
574	NC_021052	TTTCT	2	10	26200	26209	0 %	80 %	0 %	20 %	482546048
575	NC_021052	TGT	2	6	26220	26225	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482546048
576	NC_021052	T	6	6	26300	26305	0 %	100 %	0 %	0 %	482546048
577	NC_021052	T	7	7	26493	26499	0 %	100 %	0 %	0 %	482546049
578	NC_021052	GA	3	6	26504	26509	50 %	0 %	50 %	0 %	482546049
579	NC_021052	AG	3	6	26559	26564	50 %	0 %	50 %	0 %	482546049
580	NC_021052	TGT	2	6	26619	26624	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482546049
581	NC_021052	AAAG	2	8	26647	26654	75 %	0 %	25 %	0 %	482546049
582	NC_021052	T	6	6	26674	26679	0 %	100 %	0 %	0 %	482546049
583	NC_021052	TTTTG	2	10	26711	26720	0 %	80 %	20 %	0 %	482546049
584	NC_021052	GTT	2	6	26729	26734	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482546049
585	NC_021052	T	6	6	26759	26764	0 %	100 %	0 %	0 %	482546049
586	NC_021052	T	6	6	26838	26843	0 %	100 %	0 %	0 %	482546049
587	NC_021052	GGT	2	6	26902	26907	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482546049
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589	NC_021052	AGC	2	6	26990	26995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482546049
590	NC_021052	TTA	2	6	27040	27045	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482546049
591	NC_021052	CAA	2	6	27056	27061	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482546049
592	NC_021052	TAT	2	6	27180	27185	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482546049
593	NC_021052	T	6	6	27196	27201	0 %	100 %	0 %	0 %	482546049
594	NC_021052	GCA	2	6	27281	27286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482546049
595	NC_021052	GTT	2	6	27332	27337	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482546049
596	NC_021052	A	6	6	27427	27432	100 %	0 %	0 %	0 %	482546049
597	NC_021052	A	6	6	27462	27467	100 %	0 %	0 %	0 %	482546049
598	NC_021052	T	6	6	27508	27513	0 %	100 %	0 %	0 %	482546049
599	NC_021052	CTT	2	6	27583	27588	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482546049
600	NC_021052	GTT	2	6	27599	27604	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482546049
601	NC_021052	GAT	2	6	27642	27647	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482546049
602	NC_021052	GAG	2	6	27687	27692	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482546049
603	NC_021052	TTC	2	6	27738	27743	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482546049
604	NC_021052	GAG	2	6	27763	27768	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482546049
605	NC_021052	AGG	2	6	27772	27777	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482546049
606	NC_021052	GCCT	2	8	27780	27787	0 %	25 %	25 %	50 %	482546049
607	NC_021052	TAT	2	6	27808	27813	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482546049
608	NC_021052	T	6	6	27923	27928	0 %	100 %	0 %	0 %	482546049
609	NC_021052	CTAG	2	8	27954	27961	25 %	25 %	25 %	25 %	482546049
610	NC_021052	T	6	6	28003	28008	0 %	100 %	0 %	0 %	482546049
611	NC_021052	TGGC	2	8	28047	28054	0 %	25 %	50 %	25 %	482546049
612	NC_021052	ACT	2	6	28085	28090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482546049
613	NC_021052	TAG	2	6	28102	28107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482546049
614	NC_021052	GGA	2	6	28160	28165	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482546049
615	NC_021052	TTC	2	6	28302	28307	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482546050
616	NC_021052	ATT	2	6	28396	28401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482546050
617	NC_021052	TGA	2	6	28432	28437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482546050
618	NC_021052	AAC	2	6	28473	28478	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482546050
619	NC_021052	TGT	2	6	28497	28502	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482546050
620	NC_021052	AGA	2	6	28516	28521	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482546050
621	NC_021052	GTT	2	6	28532	28537	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482546050
622	NC_021052	ATT	2	6	28561	28566	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482546050
623	NC_021052	TGCTC	2	10	28648	28657	0 %	40 %	20 %	40 %	482546050
624	NC_021052	AGA	2	6	28660	28665	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482546050
625	NC_021052	TC	4	8	28704	28711	0 %	50 %	0 %	50 %	482546050
626	NC_021052	GGA	2	6	28718	28723	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482546050
627	NC_021052	GAT	2	6	28756	28761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482546050
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629	NC_021052	TGA	2	6	28951	28956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482546050
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