MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis L2/434/Bu(f)

Total Repeats: 20436

< Previous12...678910111213141516...4041Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_021052	TTAAGC	2	12	262213	262224	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	482546248
5002	NC_021052	GAT	2	6	262233	262238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482546248
5003	NC_021052	AAAGC	2	10	262254	262263	60 %	0 %	20 %	20 %	482546248
5004	NC_021052	TAAAG	2	10	262292	262301	60 %	20 %	20 %	0 %	482546248
5005	NC_021052	GTT	2	6	262356	262361	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482546248
5006	NC_021052	TTG	2	6	262396	262401	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482546248
5007	NC_021052	A	6	6	262470	262475	100 %	0 %	0 %	0 %	482546248
5008	NC_021052	GCG	2	6	262519	262524	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482546249
5009	NC_021052	ATG	2	6	262669	262674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482546249
5010	NC_021052	CGT	2	6	262738	262743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482546250
5011	NC_021052	TGT	2	6	262982	262987	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482546250
5012	NC_021052	GTA	2	6	263023	263028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482546250
5013	NC_021052	AGC	2	6	263055	263060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482546250
5014	NC_021052	CAG	2	6	263113	263118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482546251
5015	NC_021052	TTC	2	6	263145	263150	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482546251
5016	NC_021052	AAG	2	6	263188	263193	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482546251
5017	NC_021052	GGA	2	6	263289	263294	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482546251
5018	NC_021052	GA	3	6	263305	263310	50 %	0 %	50 %	0 %	482546251
5019	NC_021052	AGA	2	6	263331	263336	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482546251
5020	NC_021052	AGA	2	6	263340	263345	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482546251
5021	NC_021052	AGAT	2	8	263360	263367	50 %	25 %	25 %	0 %	482546251
5022	NC_021052	GAA	2	6	263386	263391	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482546251
5023	NC_021052	GCT	2	6	263392	263397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482546251
5024	NC_021052	TGG	2	6	263400	263405	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482546251
5025	NC_021052	TGA	2	6	263430	263435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482546251
5026	NC_021052	TGT	2	6	263436	263441	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482546251
5027	NC_021052	A	7	7	263498	263504	100 %	0 %	0 %	0 %	482546251
5028	NC_021052	TCT	2	6	263514	263519	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482546251
5029	NC_021052	GAA	2	6	263527	263532	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482546251
5030	NC_021052	ATC	2	6	263534	263539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482546251
5031	NC_021052	CAC	2	6	263577	263582	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482546251
5032	NC_021052	AAAC	2	8	263631	263638	75 %	0 %	0 %	25 %	482546251
5033	NC_021052	TCT	2	6	263792	263797	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482546251
5034	NC_021052	TGGT	2	8	263916	263923	0 %	50 %	50 %	0 %	482546251
5035	NC_021052	AGA	2	6	263985	263990	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482546251
5036	NC_021052	A	6	6	264469	264474	100 %	0 %	0 %	0 %	482546252
5037	NC_021052	ATT	2	6	264486	264491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482546252
5038	NC_021052	CAA	2	6	264520	264525	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482546252
5039	NC_021052	CT	3	6	264528	264533	0 %	50 %	0 %	50 %	482546252
5040	NC_021052	GAA	2	6	264541	264546	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482546252
5041	NC_021052	TA	3	6	264557	264562	50 %	50 %	0 %	0 %	482546252
5042	NC_021052	CAAG	2	8	264574	264581	50 %	0 %	25 %	25 %	482546252
5043	NC_021052	CT	4	8	264588	264595	0 %	50 %	0 %	50 %	482546252
5044	NC_021052	AGAC	2	8	264624	264631	50 %	0 %	25 %	25 %	482546252
5045	NC_021052	TCTTT	2	10	264657	264666	0 %	80 %	0 %	20 %	482546252
5046	NC_021052	AGA	2	6	264682	264687	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482546252
5047	NC_021052	ATG	2	6	264735	264740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482546252
5048	NC_021052	AAT	2	6	264758	264763	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482546252
5049	NC_021052	TAA	2	6	264832	264837	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482546252
5050	NC_021052	ATA	2	6	264894	264899	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482546252
5051	NC_021052	TG	3	6	264994	264999	0 %	50 %	50 %	0 %	482546252
5052	NC_021052	TGA	2	6	265006	265011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482546252
5053	NC_021052	CTT	2	6	265026	265031	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482546252
5054	NC_021052	GTT	2	6	265063	265068	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482546252
5055	NC_021052	CAG	2	6	265161	265166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482546252
5056	NC_021052	AGAAA	2	10	265181	265190	80 %	0 %	20 %	0 %	482546252
5057	NC_021052	TGAA	2	8	265245	265252	50 %	25 %	25 %	0 %	482546252
5058	NC_021052	TCT	2	6	265258	265263	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482546252
5059	NC_021052	GCT	2	6	265346	265351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482546252
5060	NC_021052	AGA	2	6	265390	265395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482546252
5061	NC_021052	ATG	2	6	265440	265445	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482546252
5062	NC_021052	ATT	2	6	265483	265488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482546252
5063	NC_021052	TAGA	2	8	265497	265504	50 %	25 %	25 %	0 %	482546252
5064	NC_021052	TTA	2	6	265541	265546	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482546252
5065	NC_021052	ATT	2	6	265763	265768	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482546252
5066	NC_021052	GAA	2	6	265769	265774	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482546252
5067	NC_021052	CCAGAA	2	12	265814	265825	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	482546252
5068	NC_021052	T	6	6	265828	265833	0 %	100 %	0 %	0 %	482546252
5069	NC_021052	TTTCT	2	10	265879	265888	0 %	80 %	0 %	20 %	482546252
5070	NC_021052	TTC	2	6	265935	265940	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482546252
5071	NC_021052	AGA	2	6	265942	265947	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482546252
5072	NC_021052	CTT	2	6	265989	265994	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482546252
5073	NC_021052	GAA	2	6	265996	266001	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482546252
5074	NC_021052	TCT	2	6	266007	266012	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482546252
5075	NC_021052	A	7	7	266018	266024	100 %	0 %	0 %	0 %	482546252
5076	NC_021052	TGT	2	6	266074	266079	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482546252
5077	NC_021052	TAG	2	6	266247	266252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482546252
5078	NC_021052	A	6	6	266317	266322	100 %	0 %	0 %	0 %	482546252
5079	NC_021052	AAC	2	6	266509	266514	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482546253
5080	NC_021052	ATA	2	6	266622	266627	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482546253
5081	NC_021052	AGT	2	6	266908	266913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482546253
5082	NC_021052	T	6	6	266923	266928	0 %	100 %	0 %	0 %	482546253
5083	NC_021052	GAA	2	6	266999	267004	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482546253
5084	NC_021052	A	6	6	267003	267008	100 %	0 %	0 %	0 %	482546253
5085	NC_021052	T	6	6	267045	267050	0 %	100 %	0 %	0 %	482546253
5086	NC_021052	AGA	3	9	267143	267151	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482546253
5087	NC_021052	GAAT	2	8	267291	267298	50 %	25 %	25 %	0 %	482546253
5088	NC_021052	AG	3	6	267308	267313	50 %	0 %	50 %	0 %	482546253
5089	NC_021052	GA	4	8	267318	267325	50 %	0 %	50 %	0 %	482546253
5090	NC_021052	ATG	2	6	267397	267402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482546253
5091	NC_021052	AGA	2	6	267439	267444	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482546253
5092	NC_021052	AGA	2	6	267467	267472	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482546253
5093	NC_021052	ATGC	2	8	267497	267504	25 %	25 %	25 %	25 %	482546254
5094	NC_021052	A	6	6	267533	267538	100 %	0 %	0 %	0 %	482546254
5095	NC_021052	GAG	2	6	267549	267554	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482546254
5096	NC_021052	TGGA	2	8	267588	267595	25 %	25 %	50 %	0 %	482546254
5097	NC_021052	TAC	2	6	267716	267721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482546254
5098	NC_021052	ATA	2	6	267722	267727	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482546254
5099	NC_021052	TAGA	2	8	267885	267892	50 %	25 %	25 %	0 %	482546254
5100	NC_021052	AG	3	6	267926	267931	50 %	0 %	50 %	0 %	482546254
5101	NC_021052	AAT	2	6	267990	267995	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482546254
5102	NC_021052	AAT	2	6	268044	268049	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482546254
5103	NC_021052	T	6	6	268110	268115	0 %	100 %	0 %	0 %	482546254
5104	NC_021052	ATA	2	6	268232	268237	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482546254
5105	NC_021052	TTA	2	6	268312	268317	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482546254
5106	NC_021052	TGA	2	6	268472	268477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482546254
5107	NC_021052	ATG	2	6	268558	268563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482546254
5108	NC_021052	T	8	8	268698	268705	0 %	100 %	0 %	0 %	482546255
5109	NC_021052	CTT	2	6	268706	268711	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482546255
5110	NC_021052	A	9	9	268720	268728	100 %	0 %	0 %	0 %	482546255
5111	NC_021052	CTG	2	6	268805	268810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482546255
5112	NC_021052	ATGG	2	8	268823	268830	25 %	25 %	50 %	0 %	482546255
5113	NC_021052	GA	3	6	268832	268837	50 %	0 %	50 %	0 %	482546255
5114	NC_021052	CTT	2	6	268838	268843	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482546255
5115	NC_021052	GCT	2	6	268864	268869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482546255
5116	NC_021052	ATTT	2	8	268893	268900	25 %	75 %	0 %	0 %	482546255
5117	NC_021052	ATT	2	6	268974	268979	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482546255
5118	NC_021052	TCTT	2	8	269015	269022	0 %	75 %	0 %	25 %	482546255
5119	NC_021052	TCA	2	6	269025	269030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482546255
5120	NC_021052	TTA	2	6	269146	269151	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482546255
5121	NC_021052	GA	3	6	269253	269258	50 %	0 %	50 %	0 %	482546255
5122	NC_021052	GA	3	6	269343	269348	50 %	0 %	50 %	0 %	482546255
5123	NC_021052	T	6	6	269373	269378	0 %	100 %	0 %	0 %	482546255
5124	NC_021052	GA	3	6	269398	269403	50 %	0 %	50 %	0 %	482546255
5125	NC_021052	T	6	6	269508	269513	0 %	100 %	0 %	0 %	482546255
5126	NC_021052	ATC	2	6	269528	269533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482546255
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5129	NC_021052	A	7	7	269816	269822	100 %	0 %	0 %	0 %	482546256
5130	NC_021052	T	6	6	269836	269841	0 %	100 %	0 %	0 %	482546256
5131	NC_021052	TCA	2	6	269923	269928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482546256
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5134	NC_021052	CTG	2	6	270036	270041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482546256
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5137	NC_021052	TGC	2	6	270295	270300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482546256
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5227	NC_021052	CTGGC	2	10	274744	274753	0 %	20 %	40 %	40 %	482546257
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5231	NC_021052	TCAG	2	8	275024	275031	25 %	25 %	25 %	25 %	482546258
5232	NC_021052	T	6	6	275083	275088	0 %	100 %	0 %	0 %	482546258
5233	NC_021052	TCT	2	6	275096	275101	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482546258
5234	NC_021052	ATTT	2	8	275366	275373	25 %	75 %	0 %	0 %	482546259
5235	NC_021052	GAA	2	6	275379	275384	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482546259
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5237	NC_021052	ATC	2	6	275440	275445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482546259
5238	NC_021052	ATC	2	6	275461	275466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482546259
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5240	NC_021052	GCA	3	9	275536	275544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482546259
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5242	NC_021052	G	6	6	275654	275659	0 %	0 %	100 %	0 %	482546259
5243	NC_021052	GGAG	2	8	275683	275690	25 %	0 %	75 %	0 %	482546259
5244	NC_021052	T	7	7	275702	275708	0 %	100 %	0 %	0 %	482546259
5245	NC_021052	GTT	2	6	275738	275743	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482546259
5246	NC_021052	T	8	8	275785	275792	0 %	100 %	0 %	0 %	482546259
5247	NC_021052	AGAGA	2	10	275793	275802	60 %	0 %	40 %	0 %	482546259
5248	NC_021052	GAAG	2	8	275815	275822	50 %	0 %	50 %	0 %	482546259
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5255	NC_021052	T	8	8	276022	276029	0 %	100 %	0 %	0 %	482546260
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5353	NC_021052	CAAG	2	8	281254	281261	50 %	0 %	25 %	25 %	482546268
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5362	NC_021052	GAAA	2	8	281592	281599	75 %	0 %	25 %	0 %	482546268
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5369	NC_021052	GAA	2	6	281829	281834	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482546269
5370	NC_021052	TCA	2	6	281850	281855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482546269
5371	NC_021052	CAG	2	6	281872	281877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482546269
5372	NC_021052	TGC	2	6	281903	281908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482546269
5373	NC_021052	GAA	2	6	282033	282038	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482546269
5374	NC_021052	ACA	2	6	282077	282082	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482546269
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5378	NC_021052	CTG	2	6	282255	282260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482546269
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5382	NC_021052	GAA	2	6	282508	282513	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482546270
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5385	NC_021052	AGAA	2	8	282885	282892	75 %	0 %	25 %	0 %	482546270
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5389	NC_021052	CTGC	2	8	283180	283187	0 %	25 %	25 %	50 %	482546270
5390	NC_021052	CTC	2	6	283202	283207	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482546270
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5393	NC_021052	T	7	7	283300	283306	0 %	100 %	0 %	0 %	482546270
5394	NC_021052	A	6	6	283335	283340	100 %	0 %	0 %	0 %	482546270
5395	NC_021052	TCCAA	2	10	283388	283397	40 %	20 %	0 %	40 %	482546270
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5399	NC_021052	T	6	6	283529	283534	0 %	100 %	0 %	0 %	482546270
5400	NC_021052	A	8	8	283546	283553	100 %	0 %	0 %	0 %	482546270
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5408	NC_021052	AC	3	6	283996	284001	50 %	0 %	0 %	50 %	482546270
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5480	NC_021052	GTTT	2	8	288378	288385	0 %	75 %	25 %	0 %	482546275
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5486	NC_021052	TGC	2	6	288550	288555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482546275
5487	NC_021052	CTTT	2	8	288573	288580	0 %	75 %	0 %	25 %	482546275
5488	NC_021052	TTTCC	2	10	288581	288590	0 %	60 %	0 %	40 %	482546275
5489	NC_021052	ATT	5	15	288615	288629	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482546275
5490	NC_021052	GCT	2	6	288668	288673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482546275
5491	NC_021052	AGG	2	6	288707	288712	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482546275
5492	NC_021052	TAT	2	6	288782	288787	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482546275
5493	NC_021052	TAC	2	6	288788	288793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482546275
5494	NC_021052	TTC	2	6	288799	288804	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482546275
5495	NC_021052	ATT	2	6	288845	288850	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482546275
5496	NC_021052	A	7	7	288854	288860	100 %	0 %	0 %	0 %	482546275
5497	NC_021052	CGT	2	6	288861	288866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482546275
5498	NC_021052	TCC	2	6	288986	288991	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482546275
5499	NC_021052	TGGT	2	8	289026	289033	0 %	50 %	50 %	0 %	482546275
5500	NC_021052	CTC	2	6	289051	289056	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482546275

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