MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis L2/434/Bu(f)

Total Repeats: 20436

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_021052	GT	3	6	236128	236133	0 %	50 %	50 %	0 %	482546226
4502	NC_021052	TTC	2	6	236166	236171	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482546226
4503	NC_021052	T	6	6	236199	236204	0 %	100 %	0 %	0 %	482546226
4504	NC_021052	GGA	2	6	236227	236232	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482546226
4505	NC_021052	AGTA	2	8	236240	236247	50 %	25 %	25 %	0 %	482546226
4506	NC_021052	ATTT	2	8	236296	236303	25 %	75 %	0 %	0 %	482546226
4507	NC_021052	T	8	8	236301	236308	0 %	100 %	0 %	0 %	482546226
4508	NC_021052	T	7	7	236356	236362	0 %	100 %	0 %	0 %	482546227
4509	NC_021052	GGC	2	6	236418	236423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482546227
4510	NC_021052	TGC	2	6	236424	236429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482546227
4511	NC_021052	CTT	2	6	236497	236502	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482546227
4512	NC_021052	T	6	6	236524	236529	0 %	100 %	0 %	0 %	482546227
4513	NC_021052	CAAT	2	8	236532	236539	50 %	25 %	0 %	25 %	482546227
4514	NC_021052	AGA	2	6	236575	236580	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482546227
4515	NC_021052	AAAG	2	8	236660	236667	75 %	0 %	25 %	0 %	482546227
4516	NC_021052	TTA	2	6	237071	237076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482546228
4517	NC_021052	GTT	2	6	237104	237109	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482546228
4518	NC_021052	CT	3	6	237125	237130	0 %	50 %	0 %	50 %	482546228
4519	NC_021052	AT	3	6	237133	237138	50 %	50 %	0 %	0 %	482546228
4520	NC_021052	TTA	2	6	237225	237230	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482546228
4521	NC_021052	GGAT	2	8	237316	237323	25 %	25 %	50 %	0 %	482546228
4522	NC_021052	TGA	2	6	237394	237399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482546228
4523	NC_021052	AT	3	6	237445	237450	50 %	50 %	0 %	0 %	482546228
4524	NC_021052	GAA	2	6	237557	237562	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482546228
4525	NC_021052	TGA	2	6	237724	237729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482546228
4526	NC_021052	ACG	2	6	237787	237792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482546228
4527	NC_021052	TGA	2	6	237828	237833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482546228
4528	NC_021052	GCA	2	6	237913	237918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482546228
4529	NC_021052	GGA	2	6	237944	237949	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482546228
4530	NC_021052	TACAA	2	10	237980	237989	60 %	20 %	0 %	20 %	482546228
4531	NC_021052	GGGAT	2	10	237993	238002	20 %	20 %	60 %	0 %	482546228
4532	NC_021052	TAT	2	6	238027	238032	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482546228
4533	NC_021052	AAG	2	6	238161	238166	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482546228
4534	NC_021052	TTG	2	6	238287	238292	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482546228
4535	NC_021052	TGT	2	6	238294	238299	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482546228
4536	NC_021052	TG	3	6	238345	238350	0 %	50 %	50 %	0 %	482546229
4537	NC_021052	TTGT	2	8	238467	238474	0 %	75 %	25 %	0 %	482546229
4538	NC_021052	CTG	2	6	238510	238515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482546229
4539	NC_021052	TCT	2	6	238518	238523	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482546229
4540	NC_021052	AC	3	6	238566	238571	50 %	0 %	0 %	50 %	482546229
4541	NC_021052	ATT	2	6	238644	238649	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482546229
4542	NC_021052	AGA	2	6	238670	238675	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482546229
4543	NC_021052	GTA	2	6	238692	238697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482546229
4544	NC_021052	TCA	2	6	238701	238706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482546229
4545	NC_021052	ATC	2	6	238837	238842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482546229
4546	NC_021052	TAT	2	6	238852	238857	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482546229
4547	NC_021052	TGC	2	6	238859	238864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482546229
4548	NC_021052	TCT	2	6	238914	238919	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482546229
4549	NC_021052	T	6	6	238931	238936	0 %	100 %	0 %	0 %	482546229
4550	NC_021052	AGA	2	6	239066	239071	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482546229
4551	NC_021052	A	6	6	239082	239087	100 %	0 %	0 %	0 %	482546229
4552	NC_021052	ATT	2	6	239095	239100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482546229
4553	NC_021052	T	6	6	239186	239191	0 %	100 %	0 %	0 %	482546229
4554	NC_021052	CTT	2	6	239245	239250	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482546229
4555	NC_021052	AT	3	6	239345	239350	50 %	50 %	0 %	0 %	482546229
4556	NC_021052	GCTA	2	8	239363	239370	25 %	25 %	25 %	25 %	482546229
4557	NC_021052	TCA	2	6	239374	239379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482546229
4558	NC_021052	GTCA	2	8	239380	239387	25 %	25 %	25 %	25 %	482546229
4559	NC_021052	CAGCT	2	10	239557	239566	20 %	20 %	20 %	40 %	482546229
4560	NC_021052	GCAA	2	8	239636	239643	50 %	0 %	25 %	25 %	482546229
4561	NC_021052	GAG	2	6	239724	239729	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482546229
4562	NC_021052	AGC	2	6	239780	239785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482546229
4563	NC_021052	TTAAAA	2	12	239787	239798	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482546229
4564	NC_021052	TTA	2	6	239863	239868	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482546229
4565	NC_021052	GCT	2	6	240000	240005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482546229
4566	NC_021052	CGA	2	6	240011	240016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482546229
4567	NC_021052	TGC	2	6	240047	240052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482546229
4568	NC_021052	AG	3	6	240106	240111	50 %	0 %	50 %	0 %	482546229
4569	NC_021052	TAGA	2	8	240121	240128	50 %	25 %	25 %	0 %	482546229
4570	NC_021052	CTTG	2	8	240293	240300	0 %	50 %	25 %	25 %	482546230
4571	NC_021052	AAC	2	6	240308	240313	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482546230
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4573	NC_021052	AAGA	2	8	240455	240462	75 %	0 %	25 %	0 %	482546230
4574	NC_021052	TGGT	2	8	240522	240529	0 %	50 %	50 %	0 %	482546230
4575	NC_021052	TGG	2	6	240556	240561	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482546230
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4577	NC_021052	GTA	2	6	240648	240653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482546230
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4579	NC_021052	ATT	2	6	240674	240679	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482546230
4580	NC_021052	ATTTT	2	10	240834	240843	20 %	80 %	0 %	0 %	482546230
4581	NC_021052	GTT	2	6	240864	240869	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482546230
4582	NC_021052	GAA	2	6	240911	240916	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482546230
4583	NC_021052	CAT	2	6	240956	240961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482546230
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4587	NC_021052	T	6	6	241149	241154	0 %	100 %	0 %	0 %	482546230
4588	NC_021052	GAAA	2	8	241345	241352	75 %	0 %	25 %	0 %	482546230
4589	NC_021052	TTA	2	6	241355	241360	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482546230
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4591	NC_021052	CT	3	6	241393	241398	0 %	50 %	0 %	50 %	482546230
4592	NC_021052	CTT	2	6	241419	241424	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482546230
4593	NC_021052	ATG	2	6	241534	241539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482546231
4594	NC_021052	GTT	2	6	241559	241564	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482546231
4595	NC_021052	A	6	6	241627	241632	100 %	0 %	0 %	0 %	482546231
4596	NC_021052	GT	3	6	241663	241668	0 %	50 %	50 %	0 %	482546232
4597	NC_021052	AGG	2	6	241669	241674	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482546232
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4599	NC_021052	GT	3	6	241710	241715	0 %	50 %	50 %	0 %	482546232
4600	NC_021052	GTG	2	6	241760	241765	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482546232
4601	NC_021052	TTGG	2	8	241780	241787	0 %	50 %	50 %	0 %	482546232
4602	NC_021052	GAA	2	6	241871	241876	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482546232
4603	NC_021052	GGA	2	6	241961	241966	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482546232
4604	NC_021052	TTCT	2	8	241971	241978	0 %	75 %	0 %	25 %	482546232
4605	NC_021052	GA	3	6	241989	241994	50 %	0 %	50 %	0 %	482546232
4606	NC_021052	ATT	2	6	242088	242093	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482546232
4607	NC_021052	GTTT	2	8	242104	242111	0 %	75 %	25 %	0 %	482546232
4608	NC_021052	CT	3	6	242200	242205	0 %	50 %	0 %	50 %	482546232
4609	NC_021052	TCT	2	6	242223	242228	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482546232
4610	NC_021052	ACT	2	6	242268	242273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482546232
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4612	NC_021052	ATT	2	6	242473	242478	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482546232
4613	NC_021052	T	6	6	242483	242488	0 %	100 %	0 %	0 %	482546232
4614	NC_021052	CTT	2	6	242499	242504	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482546232
4615	NC_021052	TA	3	6	242537	242542	50 %	50 %	0 %	0 %	482546232
4616	NC_021052	T	6	6	242622	242627	0 %	100 %	0 %	0 %	482546232
4617	NC_021052	ATGGA	2	10	242713	242722	40 %	20 %	40 %	0 %	482546232
4618	NC_021052	AGG	2	6	242764	242769	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482546232
4619	NC_021052	TAT	2	6	242825	242830	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482546232
4620	NC_021052	AGAA	2	8	242838	242845	75 %	0 %	25 %	0 %	482546232
4621	NC_021052	TGG	2	6	243037	243042	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482546233
4622	NC_021052	CTG	2	6	243110	243115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482546233
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4624	NC_021052	CTG	2	6	243227	243232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482546233
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4990	NC_021052	AGC	2	6	261337	261342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482546247
4991	NC_021052	T	6	6	261347	261352	0 %	100 %	0 %	0 %	482546247
4992	NC_021052	TCA	2	6	261369	261374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482546247
4993	NC_021052	GA	3	6	261385	261390	50 %	0 %	50 %	0 %	482546247
4994	NC_021052	CG	3	6	261475	261480	0 %	0 %	50 %	50 %	482546247
4995	NC_021052	AATA	2	8	261968	261975	75 %	25 %	0 %	0 %	482546248
4996	NC_021052	AGC	2	6	262021	262026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482546248
4997	NC_021052	TTG	2	6	262084	262089	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482546248
4998	NC_021052	CCT	2	6	262110	262115	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482546248
4999	NC_021052	A	6	6	262161	262166	100 %	0 %	0 %	0 %	482546248
5000	NC_021052	AGCAC	2	10	262184	262193	40 %	0 %	20 %	40 %	482546248

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