MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis L2/434/Bu(i)

Total Repeats: 20434

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_021050	TTG	2	6	47906	47911	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482545129
1002	NC_021050	GCT	2	6	47925	47930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482545129
1003	NC_021050	GGAG	2	8	48003	48010	25 %	0 %	75 %	0 %	482545129
1004	NC_021050	TTG	2	6	48033	48038	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482545129
1005	NC_021050	AGA	2	6	48111	48116	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545129
1006	NC_021050	AGA	3	9	48201	48209	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545129
1007	NC_021050	GTT	2	6	48220	48225	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482545129
1008	NC_021050	T	7	7	48312	48318	0 %	100 %	0 %	0 %	482545129
1009	NC_021050	AGA	2	6	48384	48389	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545129
1010	NC_021050	GAA	2	6	48397	48402	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545129
1011	NC_021050	AGG	2	6	48411	48416	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482545129
1012	NC_021050	CAA	2	6	48440	48445	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482545129
1013	NC_021050	ATT	2	6	48556	48561	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482545129
1014	NC_021050	CAT	2	6	48591	48596	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482545129
1015	NC_021050	TCC	2	6	48798	48803	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482545130
1016	NC_021050	TGT	2	6	48893	48898	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482545130
1017	NC_021050	TTC	2	6	48940	48945	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482545130
1018	NC_021050	GAA	3	9	48954	48962	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545130
1019	NC_021050	GGA	2	6	49007	49012	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482545130
1020	NC_021050	AT	3	6	49283	49288	50 %	50 %	0 %	0 %	482545130
1021	NC_021050	GAGCA	2	10	49296	49305	40 %	0 %	40 %	20 %	482545130
1022	NC_021050	TTG	2	6	49350	49355	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482545130
1023	NC_021050	GCA	2	6	49461	49466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482545130
1024	NC_021050	AAGA	2	8	49542	49549	75 %	0 %	25 %	0 %	482545130
1025	NC_021050	TGT	2	6	49553	49558	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482545130
1026	NC_021050	AG	3	6	49585	49590	50 %	0 %	50 %	0 %	482545130
1027	NC_021050	ATA	2	6	49672	49677	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482545130
1028	NC_021050	ATG	2	6	49761	49766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482545130
1029	NC_021050	GAG	2	6	49788	49793	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482545130
1030	NC_021050	AAG	2	6	49867	49872	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545130
1031	NC_021050	TTG	2	6	49880	49885	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482545130
1032	NC_021050	AGA	2	6	49904	49909	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545130
1033	NC_021050	A	6	6	49949	49954	100 %	0 %	0 %	0 %	482545130
1034	NC_021050	G	7	7	49962	49968	0 %	0 %	100 %	0 %	482545130
1035	NC_021050	GGA	2	6	50003	50008	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482545130
1036	NC_021050	AC	3	6	50069	50074	50 %	0 %	0 %	50 %	482545130
1037	NC_021050	TATATT	2	12	50095	50106	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482545130
1038	NC_021050	CTT	2	6	50110	50115	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482545130
1039	NC_021050	AT	3	6	50146	50151	50 %	50 %	0 %	0 %	482545130
1040	NC_021050	GTT	2	6	50327	50332	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482545131
1041	NC_021050	GCG	2	6	50339	50344	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482545131
1042	NC_021050	CTT	2	6	50394	50399	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482545131
1043	NC_021050	CAG	2	6	50423	50428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482545131
1044	NC_021050	GCT	2	6	50432	50437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482545131
1045	NC_021050	TC	3	6	50604	50609	0 %	50 %	0 %	50 %	482545131
1046	NC_021050	AGA	2	6	50654	50659	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545131
1047	NC_021050	GCAG	2	8	50698	50705	25 %	0 %	50 %	25 %	482545131
1048	NC_021050	CTG	2	6	50706	50711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482545131
1049	NC_021050	A	7	7	50718	50724	100 %	0 %	0 %	0 %	482545131
1050	NC_021050	AGG	2	6	50736	50741	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482545131
1051	NC_021050	AAG	4	12	50751	50762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545131
1052	NC_021050	TCG	2	6	50797	50802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482545131
1053	NC_021050	AGA	2	6	50842	50847	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545131
1054	NC_021050	GAA	2	6	50896	50901	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545131
1055	NC_021050	AAG	3	9	50961	50969	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545131
1056	NC_021050	A	6	6	50972	50977	100 %	0 %	0 %	0 %	482545131
1057	NC_021050	AAAC	2	8	50992	50999	75 %	0 %	0 %	25 %	482545131
1058	NC_021050	AAG	2	6	51024	51029	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545131
1059	NC_021050	GAT	2	6	51173	51178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482545131
1060	NC_021050	GTA	2	6	51326	51331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482545131
1061	NC_021050	CTG	2	6	51369	51374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482545131
1062	NC_021050	ATT	2	6	51383	51388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482545131
1063	NC_021050	GCT	2	6	51394	51399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482545131
1064	NC_021050	CT	3	6	51398	51403	0 %	50 %	0 %	50 %	482545131
1065	NC_021050	ATG	2	6	51405	51410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482545131
1066	NC_021050	ATT	2	6	51413	51418	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482545131
1067	NC_021050	ATG	2	6	51537	51542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482545131
1068	NC_021050	GCT	2	6	51560	51565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482545131
1069	NC_021050	CAATT	2	10	51687	51696	40 %	40 %	0 %	20 %	482545131
1070	NC_021050	CTG	3	9	51753	51761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482545131
1071	NC_021050	GCT	2	6	51779	51784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482545131
1072	NC_021050	CTT	2	6	51802	51807	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482545131
1073	NC_021050	ACA	2	6	51884	51889	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482545131
1074	NC_021050	TCA	2	6	51906	51911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482545131
1075	NC_021050	AAC	2	6	51944	51949	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482545131
1076	NC_021050	CCTC	2	8	52015	52022	0 %	25 %	0 %	75 %	482545131
1077	NC_021050	TTG	2	6	52142	52147	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482545131
1078	NC_021050	AATC	2	8	52178	52185	50 %	25 %	0 %	25 %	482545131
1079	NC_021050	ATG	2	6	52256	52261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482545131
1080	NC_021050	ATT	2	6	52289	52294	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482545131
1081	NC_021050	G	6	6	52337	52342	0 %	0 %	100 %	0 %	482545131
1082	NC_021050	ACA	2	6	52414	52419	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482545131
1083	NC_021050	TTG	2	6	52530	52535	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482545131
1084	NC_021050	TAA	2	6	52555	52560	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482545131
1085	NC_021050	GGAT	2	8	52669	52676	25 %	25 %	50 %	0 %	482545131
1086	NC_021050	TCA	2	6	52833	52838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482545131
1087	NC_021050	AGGA	2	8	52848	52855	50 %	0 %	50 %	0 %	482545131
1088	NC_021050	AAT	2	6	53004	53009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482545131
1089	NC_021050	CT	3	6	53317	53322	0 %	50 %	0 %	50 %	482545132
1090	NC_021050	AAT	2	6	53331	53336	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482545132
1091	NC_021050	TTG	2	6	53357	53362	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482545132
1092	NC_021050	GGT	2	6	53477	53482	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482545132
1093	NC_021050	ACA	2	6	53562	53567	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482545132
1094	NC_021050	T	6	6	53605	53610	0 %	100 %	0 %	0 %	482545132
1095	NC_021050	TTTC	2	8	53624	53631	0 %	75 %	0 %	25 %	482545132
1096	NC_021050	CAG	2	6	53657	53662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482545132
1097	NC_021050	ACT	2	6	53677	53682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482545132
1098	NC_021050	AGA	2	6	53784	53789	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545132
1099	NC_021050	GAA	2	6	53929	53934	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545132
1100	NC_021050	TGT	2	6	53953	53958	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482545132
1101	NC_021050	AAC	2	6	54061	54066	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482545132
1102	NC_021050	TGCC	2	8	54068	54075	0 %	25 %	25 %	50 %	482545132
1103	NC_021050	AAC	2	6	54104	54109	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482545132
1104	NC_021050	AAT	2	6	54131	54136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482545132
1105	NC_021050	TAA	2	6	54141	54146	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482545132
1106	NC_021050	GTTT	2	8	54248	54255	0 %	75 %	25 %	0 %	482545132
1107	NC_021050	AG	3	6	54306	54311	50 %	0 %	50 %	0 %	482545132
1108	NC_021050	GGCGT	2	10	54323	54332	0 %	20 %	60 %	20 %	482545132
1109	NC_021050	GTA	2	6	54395	54400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482545133
1110	NC_021050	T	6	6	54407	54412	0 %	100 %	0 %	0 %	482545133
1111	NC_021050	CTG	2	6	54438	54443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482545133
1112	NC_021050	TGA	2	6	54516	54521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482545133
1113	NC_021050	GTT	2	6	54525	54530	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482545133
1114	NC_021050	GGATA	2	10	54616	54625	40 %	20 %	40 %	0 %	482545133
1115	NC_021050	TACA	2	8	54795	54802	50 %	25 %	0 %	25 %	482545133
1116	NC_021050	CTT	2	6	55294	55299	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482545134
1117	NC_021050	TCT	2	6	55357	55362	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482545134
1118	NC_021050	CTT	2	6	55453	55458	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482545134
1119	NC_021050	GCT	2	6	55474	55479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482545134
1120	NC_021050	TCG	2	6	55490	55495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482545134
1121	NC_021050	TTC	2	6	55499	55504	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482545134
1122	NC_021050	TGC	2	6	55568	55573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482545134
1123	NC_021050	A	6	6	55763	55768	100 %	0 %	0 %	0 %	482545134
1124	NC_021050	TCC	2	6	55819	55824	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482545135
1125	NC_021050	AGA	2	6	55831	55836	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545135
1126	NC_021050	CCT	2	6	55866	55871	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482545135
1127	NC_021050	GATC	2	8	55944	55951	25 %	25 %	25 %	25 %	482545135
1128	NC_021050	GA	3	6	55967	55972	50 %	0 %	50 %	0 %	482545135
1129	NC_021050	GTT	2	6	56117	56122	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482545135
1130	NC_021050	TA	3	6	56199	56204	50 %	50 %	0 %	0 %	482545135
1131	NC_021050	CCATT	2	10	56283	56292	20 %	40 %	0 %	40 %	482545135
1132	NC_021050	GA	3	6	56360	56365	50 %	0 %	50 %	0 %	482545135
1133	NC_021050	GGA	2	6	56370	56375	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482545135
1134	NC_021050	ACC	2	6	56393	56398	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482545135
1135	NC_021050	GAC	2	6	56422	56427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482545135
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1137	NC_021050	TCTT	2	8	56455	56462	0 %	75 %	0 %	25 %	482545135
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1142	NC_021050	ATCA	2	8	56629	56636	50 %	25 %	0 %	25 %	482545136
1143	NC_021050	TAA	2	6	56680	56685	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482545136
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1159	NC_021050	TAAA	2	8	57286	57293	75 %	25 %	0 %	0 %	482545136
1160	NC_021050	TCT	2	6	57302	57307	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482545136
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1167	NC_021050	GTT	2	6	57807	57812	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482545137
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1255	NC_021050	TCT	2	6	62995	63000	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482545139
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1367	NC_021050	AGGGA	2	10	67793	67802	40 %	0 %	60 %	0 %	482545144
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1375	NC_021050	TTA	2	6	68256	68261	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482545144
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1377	NC_021050	GT	3	6	68580	68585	0 %	50 %	50 %	0 %	482545145
1378	NC_021050	TTC	2	6	68613	68618	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482545145
1379	NC_021050	A	7	7	68889	68895	100 %	0 %	0 %	0 %	482545145
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