MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis L2/434/Bu(i)

Total Repeats: 20434

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_021050	TTCT	2	8	22374	22381	0 %	75 %	0 %	25 %	482545100
502	NC_021050	AGGG	2	8	22426	22433	25 %	0 %	75 %	0 %	482545100
503	NC_021050	GCT	2	6	22483	22488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482545101
504	NC_021050	CAG	2	6	22529	22534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482545101
505	NC_021050	GA	3	6	22563	22568	50 %	0 %	50 %	0 %	482545101
506	NC_021050	TCT	2	6	22591	22596	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482545101
507	NC_021050	AGC	2	6	22626	22631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482545101
508	NC_021050	GA	3	6	22670	22675	50 %	0 %	50 %	0 %	482545101
509	NC_021050	GTG	2	6	22735	22740	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482545101
510	NC_021050	AGA	2	6	22776	22781	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545101
511	NC_021050	GA	3	6	22814	22819	50 %	0 %	50 %	0 %	482545101
512	NC_021050	GTT	2	6	22827	22832	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482545101
513	NC_021050	TAT	2	6	22877	22882	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482545101
514	NC_021050	TCTT	2	8	22926	22933	0 %	75 %	0 %	25 %	482545101
515	NC_021050	TCA	2	6	22957	22962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482545101
516	NC_021050	TG	3	6	23008	23013	0 %	50 %	50 %	0 %	482545101
517	NC_021050	TC	4	8	23183	23190	0 %	50 %	0 %	50 %	482545102
518	NC_021050	TACA	2	8	23216	23223	50 %	25 %	0 %	25 %	482545102
519	NC_021050	GCA	2	6	23229	23234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482545102
520	NC_021050	ACG	2	6	23256	23261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482545102
521	NC_021050	AAT	2	6	23304	23309	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482545102
522	NC_021050	GTT	2	6	23417	23422	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482545102
523	NC_021050	AAC	2	6	23429	23434	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482545102
524	NC_021050	GGAA	2	8	23536	23543	50 %	0 %	50 %	0 %	482545102
525	NC_021050	GAA	2	6	23592	23597	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545102
526	NC_021050	AAAC	2	8	23613	23620	75 %	0 %	0 %	25 %	482545102
527	NC_021050	TTG	2	6	23679	23684	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482545102
528	NC_021050	AGA	3	9	23687	23695	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545102
529	NC_021050	GAA	2	6	23748	23753	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545102
530	NC_021050	TGA	2	6	23864	23869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482545102
531	NC_021050	GAA	2	6	23925	23930	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545102
532	NC_021050	TTA	2	6	23967	23972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482545102
533	NC_021050	TCT	2	6	24131	24136	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482545102
534	NC_021050	AGG	2	6	24227	24232	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482545102
535	NC_021050	AAAG	2	8	24239	24246	75 %	0 %	25 %	0 %	482545102
536	NC_021050	GTT	2	6	24309	24314	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482545103
537	NC_021050	CGA	2	6	24317	24322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482545103
538	NC_021050	AGC	2	6	24342	24347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482545103
539	NC_021050	AGC	2	6	24370	24375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482545103
540	NC_021050	CTC	2	6	24497	24502	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482545103
541	NC_021050	GGAT	2	8	24519	24526	25 %	25 %	50 %	0 %	482545103
542	NC_021050	AG	3	6	24559	24564	50 %	0 %	50 %	0 %	482545103
543	NC_021050	CTA	2	6	24691	24696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482545103
544	NC_021050	T	6	6	24703	24708	0 %	100 %	0 %	0 %	482545103
545	NC_021050	AGC	2	6	24753	24758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482545103
546	NC_021050	ATG	2	6	24786	24791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482545103
547	NC_021050	AG	3	6	24913	24918	50 %	0 %	50 %	0 %	482545104
548	NC_021050	A	7	7	24936	24942	100 %	0 %	0 %	0 %	482545104
549	NC_021050	T	7	7	24951	24957	0 %	100 %	0 %	0 %	482545104
550	NC_021050	TGT	2	6	24976	24981	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482545104
551	NC_021050	TCT	2	6	25050	25055	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482545104
552	NC_021050	CAA	2	6	25064	25069	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482545104
553	NC_021050	CCGA	2	8	25090	25097	25 %	0 %	25 %	50 %	482545105
554	NC_021050	TTC	2	6	25175	25180	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482545105
555	NC_021050	GAA	2	6	25258	25263	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545105
556	NC_021050	AAC	2	6	25298	25303	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482545105
557	NC_021050	GGC	2	6	25349	25354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482545105
558	NC_021050	TGC	2	6	25391	25396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482545105
559	NC_021050	TGTGAT	2	12	25499	25510	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	482545105
560	NC_021050	AGC	2	6	25520	25525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482545105
561	NC_021050	ATG	2	6	25590	25595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482545105
562	NC_021050	GGA	2	6	25713	25718	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482545105
563	NC_021050	TTC	2	6	25736	25741	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482545105
564	NC_021050	TCG	2	6	25757	25762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482545105
565	NC_021050	GAG	2	6	25780	25785	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482545105
566	NC_021050	A	6	6	25826	25831	100 %	0 %	0 %	0 %	482545105
567	NC_021050	CTC	2	6	25840	25845	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482545105
568	NC_021050	TTC	2	6	25889	25894	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482545105
569	NC_021050	A	7	7	25924	25930	100 %	0 %	0 %	0 %	482545105
570	NC_021050	TAT	2	6	25931	25936	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482545105
571	NC_021050	GTT	2	6	26027	26032	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482545105
572	NC_021050	AAG	2	6	26172	26177	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545106
573	NC_021050	TCT	2	6	26182	26187	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482545106
574	NC_021050	TTTCT	2	10	26200	26209	0 %	80 %	0 %	20 %	482545106
575	NC_021050	TGT	2	6	26220	26225	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482545106
576	NC_021050	T	6	6	26300	26305	0 %	100 %	0 %	0 %	482545106
577	NC_021050	T	7	7	26493	26499	0 %	100 %	0 %	0 %	482545107
578	NC_021050	GA	3	6	26504	26509	50 %	0 %	50 %	0 %	482545107
579	NC_021050	AG	3	6	26559	26564	50 %	0 %	50 %	0 %	482545107
580	NC_021050	TGT	2	6	26619	26624	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482545107
581	NC_021050	AAAG	2	8	26647	26654	75 %	0 %	25 %	0 %	482545107
582	NC_021050	T	6	6	26674	26679	0 %	100 %	0 %	0 %	482545107
583	NC_021050	TTTTG	2	10	26711	26720	0 %	80 %	20 %	0 %	482545107
584	NC_021050	GTT	2	6	26729	26734	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482545107
585	NC_021050	T	6	6	26759	26764	0 %	100 %	0 %	0 %	482545107
586	NC_021050	T	6	6	26838	26843	0 %	100 %	0 %	0 %	482545107
587	NC_021050	GGT	2	6	26902	26907	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482545107
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590	NC_021050	TTA	2	6	27040	27045	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482545107
591	NC_021050	CAA	2	6	27056	27061	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482545107
592	NC_021050	TAT	2	6	27180	27185	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482545107
593	NC_021050	T	6	6	27196	27201	0 %	100 %	0 %	0 %	482545107
594	NC_021050	GCA	2	6	27281	27286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482545107
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597	NC_021050	A	6	6	27462	27467	100 %	0 %	0 %	0 %	482545107
598	NC_021050	T	6	6	27508	27513	0 %	100 %	0 %	0 %	482545107
599	NC_021050	CTT	2	6	27583	27588	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482545107
600	NC_021050	GTT	2	6	27599	27604	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482545107
601	NC_021050	GAT	2	6	27642	27647	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482545107
602	NC_021050	GAG	2	6	27687	27692	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482545107
603	NC_021050	TTC	2	6	27738	27743	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482545107
604	NC_021050	GAG	2	6	27763	27768	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482545107
605	NC_021050	AGG	2	6	27772	27777	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482545107
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607	NC_021050	TAT	2	6	27808	27813	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482545107
608	NC_021050	T	6	6	27923	27928	0 %	100 %	0 %	0 %	482545107
609	NC_021050	CTAG	2	8	27954	27961	25 %	25 %	25 %	25 %	482545107
610	NC_021050	T	6	6	28003	28008	0 %	100 %	0 %	0 %	482545107
611	NC_021050	TGGC	2	8	28047	28054	0 %	25 %	50 %	25 %	482545107
612	NC_021050	ACT	2	6	28085	28090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482545107
613	NC_021050	TAG	2	6	28102	28107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482545107
614	NC_021050	GGA	2	6	28160	28165	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482545107
615	NC_021050	TTC	2	6	28302	28307	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482545108
616	NC_021050	ATT	2	6	28396	28401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482545108
617	NC_021050	TGA	2	6	28432	28437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482545108
618	NC_021050	AAC	2	6	28473	28478	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482545108
619	NC_021050	TGT	2	6	28497	28502	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482545108
620	NC_021050	AGA	2	6	28516	28521	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545108
621	NC_021050	GTT	2	6	28532	28537	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482545108
622	NC_021050	ATT	2	6	28561	28566	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482545108
623	NC_021050	TGCTC	2	10	28648	28657	0 %	40 %	20 %	40 %	482545108
624	NC_021050	AGA	2	6	28660	28665	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545108
625	NC_021050	TC	4	8	28704	28711	0 %	50 %	0 %	50 %	482545108
626	NC_021050	GGA	2	6	28718	28723	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482545108
627	NC_021050	GAT	2	6	28756	28761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482545108
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629	NC_021050	TGA	2	6	28951	28956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482545108
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