MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis L2/434/Bu(i)

Total Repeats: 20434

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_021050	TTA	2	6	311795	311800	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482545349
6002	NC_021050	GCT	2	6	311888	311893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482545349
6003	NC_021050	CTGC	2	8	311963	311970	0 %	25 %	25 %	50 %	482545349
6004	NC_021050	TAA	2	6	311980	311985	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482545349
6005	NC_021050	CGA	2	6	312000	312005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482545349
6006	NC_021050	TATT	2	8	312031	312038	25 %	75 %	0 %	0 %	482545349
6007	NC_021050	AAT	2	6	312062	312067	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482545349
6008	NC_021050	AGT	2	6	312205	312210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482545349
6009	NC_021050	TGC	2	6	312289	312294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482545349
6010	NC_021050	GCA	2	6	312307	312312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482545349
6011	NC_021050	TCA	2	6	312320	312325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482545349
6012	NC_021050	AGA	2	6	312337	312342	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545349
6013	NC_021050	AGT	2	6	312346	312351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482545349
6014	NC_021050	AGG	3	9	312403	312411	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482545349
6015	NC_021050	AAT	2	6	312443	312448	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482545349
6016	NC_021050	CAA	2	6	312466	312471	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482545349
6017	NC_021050	TGC	2	6	312493	312498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482545349
6018	NC_021050	CAAC	2	8	312503	312510	50 %	0 %	0 %	50 %	482545349
6019	NC_021050	TAA	2	6	312535	312540	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482545349
6020	NC_021050	GGA	2	6	312551	312556	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482545349
6021	NC_021050	TCT	2	6	312561	312566	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482545349
6022	NC_021050	AGT	2	6	312628	312633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482545349
6023	NC_021050	TAG	2	6	312640	312645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482545349
6024	NC_021050	GCT	2	6	312653	312658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482545349
6025	NC_021050	ATG	2	6	312738	312743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482545349
6026	NC_021050	ATTT	2	8	312752	312759	25 %	75 %	0 %	0 %	482545349
6027	NC_021050	CTG	2	6	312786	312791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482545349
6028	NC_021050	ATT	2	6	312803	312808	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482545349
6029	NC_021050	TGC	2	6	312844	312849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482545349
6030	NC_021050	GGGA	2	8	312898	312905	25 %	0 %	75 %	0 %	482545349
6031	NC_021050	CCAG	2	8	312982	312989	25 %	0 %	25 %	50 %	482545349
6032	NC_021050	AAGG	2	8	313095	313102	50 %	0 %	50 %	0 %	482545349
6033	NC_021050	TTC	2	6	313107	313112	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482545349
6034	NC_021050	ACC	2	6	313207	313212	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482545349
6035	NC_021050	ACA	2	6	313213	313218	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482545349
6036	NC_021050	CCT	2	6	313220	313225	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482545349
6037	NC_021050	TCTT	2	8	313267	313274	0 %	75 %	0 %	25 %	482545349
6038	NC_021050	TCC	2	6	313303	313308	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482545349
6039	NC_021050	TCC	2	6	313315	313320	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482545349
6040	NC_021050	CTG	2	6	313359	313364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482545349
6041	NC_021050	T	6	6	313391	313396	0 %	100 %	0 %	0 %	482545349
6042	NC_021050	GAT	2	6	313406	313411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482545349
6043	NC_021050	A	6	6	313449	313454	100 %	0 %	0 %	0 %	482545349
6044	NC_021050	AAT	2	6	313586	313591	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482545349
6045	NC_021050	CTT	2	6	313656	313661	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482545349
6046	NC_021050	CAAG	2	8	313721	313728	50 %	0 %	25 %	25 %	482545349
6047	NC_021050	TCT	2	6	313782	313787	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482545349
6048	NC_021050	ATC	2	6	313867	313872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482545349
6049	NC_021050	GT	3	6	313925	313930	0 %	50 %	50 %	0 %	482545349
6050	NC_021050	ATC	2	6	313938	313943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482545349
6051	NC_021050	TATC	2	8	313964	313971	25 %	50 %	0 %	25 %	482545349
6052	NC_021050	CAA	2	6	313976	313981	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482545349
6053	NC_021050	GCTA	2	8	314024	314031	25 %	25 %	25 %	25 %	482545349
6054	NC_021050	ATA	2	6	314097	314102	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482545349
6055	NC_021050	CTGG	2	8	314108	314115	0 %	25 %	50 %	25 %	482545349
6056	NC_021050	TAA	2	6	314326	314331	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482545349
6057	NC_021050	GGC	2	6	314344	314349	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482545349
6058	NC_021050	ACA	2	6	314420	314425	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482545349
6059	NC_021050	TATG	2	8	314470	314477	25 %	50 %	25 %	0 %	482545349
6060	NC_021050	CAT	2	6	314634	314639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482545350
6061	NC_021050	T	6	6	314644	314649	0 %	100 %	0 %	0 %	482545350
6062	NC_021050	TTGT	2	8	314653	314660	0 %	75 %	25 %	0 %	482545350
6063	NC_021050	CTC	2	6	314688	314693	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482545350
6064	NC_021050	GAA	2	6	314786	314791	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545350
6065	NC_021050	TTC	2	6	314877	314882	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482545350
6066	NC_021050	CAG	2	6	314901	314906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482545350
6067	NC_021050	GA	3	6	314907	314912	50 %	0 %	50 %	0 %	482545350
6068	NC_021050	GA	3	6	314923	314928	50 %	0 %	50 %	0 %	482545350
6069	NC_021050	TCA	3	9	315074	315082	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482545350
6070	NC_021050	T	6	6	315126	315131	0 %	100 %	0 %	0 %	482545350
6071	NC_021050	A	6	6	315164	315169	100 %	0 %	0 %	0 %	482545350
6072	NC_021050	ATA	2	6	315183	315188	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482545350
6073	NC_021050	AAT	4	12	315224	315235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482545350
6074	NC_021050	TGG	3	9	315238	315246	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482545350
6075	NC_021050	TTTC	2	8	315309	315316	0 %	75 %	0 %	25 %	482545350
6076	NC_021050	GCGGAG	2	12	315336	315347	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	482545350
6077	NC_021050	AGG	2	6	315385	315390	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482545350
6078	NC_021050	TTC	2	6	315395	315400	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482545350
6079	NC_021050	GAT	2	6	315419	315424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482545350
6080	NC_021050	TGC	2	6	315436	315441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482545350
6081	NC_021050	AGG	2	6	315469	315474	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482545350
6082	NC_021050	GGA	2	6	315479	315484	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482545350
6083	NC_021050	GAT	2	6	315500	315505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482545350
6084	NC_021050	GAT	2	6	315608	315613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482545350
6085	NC_021050	CAG	2	6	315636	315641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482545350
6086	NC_021050	CTA	2	6	315669	315674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482545350
6087	NC_021050	GAAA	2	8	315710	315717	75 %	0 %	25 %	0 %	482545350
6088	NC_021050	AGG	2	6	315730	315735	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482545350
6089	NC_021050	T	6	6	315810	315815	0 %	100 %	0 %	0 %	482545350
6090	NC_021050	AGCGC	2	10	315846	315855	20 %	0 %	40 %	40 %	482545350
6091	NC_021050	AAC	2	6	315877	315882	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482545350
6092	NC_021050	GTA	2	6	315932	315937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482545350
6093	NC_021050	CAG	2	6	315948	315953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482545350
6094	NC_021050	ACCATC	2	12	315967	315978	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	482545350
6095	NC_021050	TTC	3	9	315979	315987	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482545350
6096	NC_021050	CTG	2	6	315993	315998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482545350
6097	NC_021050	CCG	2	6	316041	316046	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482545350
6098	NC_021050	AGG	2	6	316120	316125	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482545350
6099	NC_021050	GTTG	2	8	316129	316136	0 %	50 %	50 %	0 %	482545350
6100	NC_021050	ACT	2	6	316157	316162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482545350
6101	NC_021050	TGC	2	6	316231	316236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482545350
6102	NC_021050	ATA	2	6	316239	316244	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482545350
6103	NC_021050	GATT	2	8	316273	316280	25 %	50 %	25 %	0 %	482545350
6104	NC_021050	TCT	2	6	316445	316450	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482545350
6105	NC_021050	AGT	2	6	316451	316456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482545350
6106	NC_021050	ATG	2	6	316494	316499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482545350
6107	NC_021050	TGC	2	6	316504	316509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482545350
6108	NC_021050	CCT	2	6	316586	316591	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482545350
6109	NC_021050	CT	3	6	316687	316692	0 %	50 %	0 %	50 %	482545350
6110	NC_021050	GAT	2	6	316817	316822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482545350
6111	NC_021050	CTG	2	6	316863	316868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482545350
6112	NC_021050	CAAA	2	8	316925	316932	75 %	0 %	0 %	25 %	482545350
6113	NC_021050	TGT	2	6	316974	316979	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482545350
6114	NC_021050	GAA	2	6	316989	316994	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545350
6115	NC_021050	TGT	2	6	317023	317028	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482545350
6116	NC_021050	CAA	2	6	317128	317133	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482545350
6117	NC_021050	TAT	2	6	317138	317143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482545350
6118	NC_021050	GGA	2	6	317246	317251	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482545350
6119	NC_021050	GAG	2	6	317301	317306	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482545350
6120	NC_021050	ATA	2	6	317313	317318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482545350
6121	NC_021050	TC	3	6	317321	317326	0 %	50 %	0 %	50 %	482545350
6122	NC_021050	ATT	2	6	317447	317452	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482545350
6123	NC_021050	CTT	3	9	317503	317511	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482545350
6124	NC_021050	TCA	2	6	317536	317541	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482545350
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6242	NC_021050	AGTA	2	8	323734	323741	50 %	25 %	25 %	0 %	482545355
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