MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Clostridium cf. saccharolyticum K10

Total Repeats: 1674

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021047	AGGGA	2	10	2234	2243	40 %	0 %	60 %	0 %	479336700
2	NC_021047	GGTAA	2	10	3970	3979	40 %	20 %	40 %	0 %	479336703
3	NC_021047	ACAGG	2	10	6198	6207	40 %	0 %	40 %	20 %	479336705
4	NC_021047	CGAGC	2	10	6910	6919	20 %	0 %	40 %	40 %	479336705
5	NC_021047	ACAGC	2	10	12651	12660	40 %	0 %	20 %	40 %	479336711
6	NC_021047	AAAGG	2	10	13593	13602	60 %	0 %	40 %	0 %	479336712
7	NC_021047	GCATT	2	10	13969	13978	20 %	40 %	20 %	20 %	479336712
8	NC_021047	ACGGC	2	10	15572	15581	20 %	0 %	40 %	40 %	479336713
9	NC_021047	GGCAC	2	10	17336	17345	20 %	0 %	40 %	40 %	479336715
10	NC_021047	AGCGA	2	10	17474	17483	40 %	0 %	40 %	20 %	479336715
11	NC_021047	AGGAG	2	10	20055	20064	40 %	0 %	60 %	0 %	479336717
12	NC_021047	AGAGG	2	10	20796	20805	40 %	0 %	60 %	0 %	479336718
13	NC_021047	GAAAG	2	10	23087	23096	60 %	0 %	40 %	0 %	479336719
14	NC_021047	GAAGA	2	10	23613	23622	60 %	0 %	40 %	0 %	479336719
15	NC_021047	GGACG	2	10	26231	26240	20 %	0 %	60 %	20 %	479336724
16	NC_021047	CAGAA	2	10	27549	27558	60 %	0 %	20 %	20 %	479336725
17	NC_021047	GGGGC	2	10	27692	27701	0 %	0 %	80 %	20 %	479336725
18	NC_021047	GAAGC	2	10	27966	27975	40 %	0 %	40 %	20 %	479336725
19	NC_021047	TCTCA	2	10	28192	28201	20 %	40 %	0 %	40 %	479336725
20	NC_021047	GAAGC	2	10	31619	31628	40 %	0 %	40 %	20 %	479336727
21	NC_021047	GAAAA	2	10	32940	32949	80 %	0 %	20 %	0 %	479336728
22	NC_021047	GGGAT	2	10	34033	34042	20 %	20 %	60 %	0 %	479336729
23	NC_021047	TGCTG	2	10	36258	36267	0 %	40 %	40 %	20 %	479336730
24	NC_021047	GACGG	2	10	36543	36552	20 %	0 %	60 %	20 %	479336730
25	NC_021047	AGGGG	2	10	45405	45414	20 %	0 %	80 %	0 %	479336735
26	NC_021047	CTGTT	2	10	53064	53073	0 %	60 %	20 %	20 %	479336739
27	NC_021047	TCCTC	2	10	53567	53576	0 %	40 %	0 %	60 %	479336739
28	NC_021047	GAAAA	2	10	54052	54061	80 %	0 %	20 %	0 %	479336740
29	NC_021047	GCCCT	2	10	56589	56598	0 %	20 %	20 %	60 %	479336742
30	NC_021047	GGAAA	2	10	61905	61914	60 %	0 %	40 %	0 %	479336748
31	NC_021047	GCAGA	2	10	62144	62153	40 %	0 %	40 %	20 %	479336749
32	NC_021047	AAAGG	2	10	65633	65642	60 %	0 %	40 %	0 %	479336750
33	NC_021047	GCCGT	2	10	66839	66848	0 %	20 %	40 %	40 %	479336751
34	NC_021047	CTGGC	2	10	68372	68381	0 %	20 %	40 %	40 %	479336752
35	NC_021047	TTCTC	2	10	69720	69729	0 %	60 %	0 %	40 %	479336753
36	NC_021047	CGAGG	2	10	69845	69854	20 %	0 %	60 %	20 %	479336753
37	NC_021047	CTCCG	2	10	71431	71440	0 %	20 %	20 %	60 %	479336754
38	NC_021047	GCGCT	2	10	77401	77410	0 %	20 %	40 %	40 %	479336756
39	NC_021047	AGGAG	2	10	79022	79031	40 %	0 %	60 %	0 %	479336758
40	NC_021047	GCCTG	2	10	79713	79722	0 %	20 %	40 %	40 %	479336758
41	NC_021047	CCTTT	2	10	79846	79855	0 %	60 %	0 %	40 %	479336758
42	NC_021047	TTCTG	2	10	80178	80187	0 %	60 %	20 %	20 %	479336758
43	NC_021047	GACAG	2	10	83660	83669	40 %	0 %	40 %	20 %	479336765
44	NC_021047	ATAAA	2	10	86084	86093	80 %	20 %	0 %	0 %	479336766
45	NC_021047	ATTAC	2	10	86129	86138	40 %	40 %	0 %	20 %	479336766
46	NC_021047	TGACA	2	10	89949	89958	40 %	20 %	20 %	20 %	479336768
47	NC_021047	GAGAC	2	10	90827	90836	40 %	0 %	40 %	20 %	479336768
48	NC_021047	ATTTT	2	10	91457	91466	20 %	80 %	0 %	0 %	479336769
49	NC_021047	AAGAA	2	10	93246	93255	80 %	0 %	20 %	0 %	479336770
50	NC_021047	AGAGA	2	10	97293	97302	60 %	0 %	40 %	0 %	479336774
51	NC_021047	TCAGC	2	10	99895	99904	20 %	20 %	20 %	40 %	479336776
52	NC_021047	AGCGC	2	10	101572	101581	20 %	0 %	40 %	40 %	479336777
53	NC_021047	CGTGC	2	10	103211	103220	0 %	20 %	40 %	40 %	479336778
54	NC_021047	GCTCT	2	10	107514	107523	0 %	40 %	20 %	40 %	479336783
55	NC_021047	CATCT	2	10	109543	109552	20 %	40 %	0 %	40 %	479336784
56	NC_021047	TTTCT	2	10	113588	113597	0 %	80 %	0 %	20 %	479336786
57	NC_021047	GTCCA	2	10	114004	114013	20 %	20 %	20 %	40 %	479336787
58	NC_021047	GCTTT	2	10	118610	118619	0 %	60 %	20 %	20 %	479336792
59	NC_021047	CAGCA	2	10	121874	121883	40 %	0 %	20 %	40 %	479336796
60	NC_021047	GCTGG	2	10	123490	123499	0 %	20 %	60 %	20 %	479336798
61	NC_021047	CCATA	2	10	127989	127998	40 %	20 %	0 %	40 %	479336802
62	NC_021047	GATGG	2	10	130388	130397	20 %	20 %	60 %	0 %	479336804
63	NC_021047	GTTCT	2	10	139538	139547	0 %	60 %	20 %	20 %	479336805
64	NC_021047	CAACA	2	10	139644	139653	60 %	0 %	0 %	40 %	479336805
65	NC_021047	GTTCT	2	10	140690	140699	0 %	60 %	20 %	20 %	479336807
66	NC_021047	AGCGT	2	10	141143	141152	20 %	20 %	40 %	20 %	479336808
67	NC_021047	CCATG	2	10	142710	142719	20 %	20 %	20 %	40 %	479336809
68	NC_021047	ACAGA	2	10	143684	143693	60 %	0 %	20 %	20 %	479336811
69	NC_021047	AGGGA	2	10	144756	144765	40 %	0 %	60 %	0 %	479336812
70	NC_021047	TGGAA	2	10	148024	148033	40 %	20 %	40 %	0 %	479336814
71	NC_021047	CATGG	2	10	148344	148353	20 %	20 %	40 %	20 %	479336814
72	NC_021047	GAAAA	2	10	148997	149006	80 %	0 %	20 %	0 %	479336814
73	NC_021047	GGCAG	2	10	149024	149033	20 %	0 %	60 %	20 %	479336814
74	NC_021047	GCAAG	2	10	151883	151892	40 %	0 %	40 %	20 %	479336816
75	NC_021047	CCTGC	2	10	154345	154354	0 %	20 %	20 %	60 %	479336819
76	NC_021047	CTTGT	2	10	158149	158158	0 %	60 %	20 %	20 %	479336823
77	NC_021047	GAGCA	2	10	159205	159214	40 %	0 %	40 %	20 %	479336825
78	NC_021047	GGCCG	2	10	160244	160253	0 %	0 %	60 %	40 %	479336827
79	NC_021047	GCCGC	2	10	160309	160318	0 %	0 %	40 %	60 %	479336827
80	NC_021047	ACGGC	2	10	160471	160480	20 %	0 %	40 %	40 %	479336827
81	NC_021047	GGAGC	2	10	161070	161079	20 %	0 %	60 %	20 %	479336828
82	NC_021047	TGGCA	2	10	162726	162735	20 %	20 %	40 %	20 %	479336830
83	NC_021047	GCTGT	2	10	162781	162790	0 %	40 %	40 %	20 %	479336830
84	NC_021047	GCTGG	2	10	163431	163440	0 %	20 %	60 %	20 %	479336830
85	NC_021047	CTAAG	2	10	163536	163545	40 %	20 %	20 %	20 %	479336830
86	NC_021047	CTGGT	2	10	164922	164931	0 %	40 %	40 %	20 %	479336831
87	NC_021047	GAGAG	2	10	167335	167344	40 %	0 %	60 %	0 %	479336834
88	NC_021047	GCCAG	2	10	167783	167792	20 %	0 %	40 %	40 %	479336834
89	NC_021047	GGAAG	2	10	168093	168102	40 %	0 %	60 %	0 %	479336834
90	NC_021047	CCAGG	2	10	169698	169707	20 %	0 %	40 %	40 %	479336837
91	NC_021047	GGAGT	2	10	172517	172526	20 %	20 %	60 %	0 %	479336839
92	NC_021047	CTGGA	2	10	176979	176988	20 %	20 %	40 %	20 %	479336842
93	NC_021047	CTTAT	2	10	180448	180457	20 %	60 %	0 %	20 %	479336844
94	NC_021047	CCATC	2	10	183629	183638	20 %	20 %	0 %	60 %	479336849
95	NC_021047	GAAAA	2	10	184193	184202	80 %	0 %	20 %	0 %	479336849
96	NC_021047	TAAAA	2	10	186146	186155	80 %	20 %	0 %	0 %	479336850
97	NC_021047	TCTGA	2	10	187858	187867	20 %	40 %	20 %	20 %	479336853
98	NC_021047	ACAGG	2	10	189285	189294	40 %	0 %	40 %	20 %	479336854
99	NC_021047	ATGAG	2	10	191077	191086	40 %	20 %	40 %	0 %	479336856
100	NC_021047	AAAGC	2	10	192860	192869	60 %	0 %	20 %	20 %	479336858
101	NC_021047	AATTT	2	10	194522	194531	40 %	60 %	0 %	0 %	479336860
102	NC_021047	GCACT	2	10	194870	194879	20 %	20 %	20 %	40 %	479336861
103	NC_021047	AGGGA	2	10	196326	196335	40 %	0 %	60 %	0 %	479336862
104	NC_021047	CCATA	2	10	197314	197323	40 %	20 %	0 %	40 %	479336863
105	NC_021047	GGAAA	2	10	203368	203377	60 %	0 %	40 %	0 %	479336866
106	NC_021047	AGGCG	2	10	203424	203433	20 %	0 %	60 %	20 %	479336866
107	NC_021047	GAGCC	2	10	206485	206494	20 %	0 %	40 %	40 %	479336867
108	NC_021047	GTTCC	2	10	208859	208868	0 %	40 %	20 %	40 %	479336869
109	NC_021047	AACGG	2	10	209222	209231	40 %	0 %	40 %	20 %	479336870
110	NC_021047	GCAGG	2	10	211304	211313	20 %	0 %	60 %	20 %	479336871
111	NC_021047	CGGCT	2	10	212291	212300	0 %	20 %	40 %	40 %	479336872
112	NC_021047	AGTAC	2	10	212773	212782	40 %	20 %	20 %	20 %	479336872
113	NC_021047	TGGGA	2	10	212851	212860	20 %	20 %	60 %	0 %	479336872
114	NC_021047	AGGGG	2	10	213312	213321	20 %	0 %	80 %	0 %	479336873
115	NC_021047	GAAAG	2	10	214571	214580	60 %	0 %	40 %	0 %	479336874
116	NC_021047	GTACA	2	10	215023	215032	40 %	20 %	20 %	20 %	479336874
117	NC_021047	AGAGA	2	10	215381	215390	60 %	0 %	40 %	0 %	479336874
118	NC_021047	AAGAT	2	10	217154	217163	60 %	20 %	20 %	0 %	479336875
119	NC_021047	AGAAA	2	10	219866	219875	80 %	0 %	20 %	0 %	479336879
120	NC_021047	TGTTT	2	10	224762	224771	0 %	80 %	20 %	0 %	479336883
121	NC_021047	AGGGG	2	10	227557	227566	20 %	0 %	80 %	0 %	479336886
122	NC_021047	GCAGA	2	10	232760	232769	40 %	0 %	40 %	20 %	479336889
123	NC_021047	ATCAT	2	10	235154	235163	40 %	40 %	0 %	20 %	479336891
124	NC_021047	TTTTG	2	10	235266	235275	0 %	80 %	20 %	0 %	479336891
125	NC_021047	GATCC	2	10	244082	244091	20 %	20 %	20 %	40 %	479336894
126	NC_021047	ATCCA	2	10	246808	246817	40 %	20 %	0 %	40 %	479336895
127	NC_021047	GACAG	2	10	247604	247613	40 %	0 %	40 %	20 %	479336896
128	NC_021047	AGAAA	2	10	247841	247850	80 %	0 %	20 %	0 %	479336897
129	NC_021047	GCAGA	2	10	249676	249685	40 %	0 %	40 %	20 %	479336900
130	NC_021047	AGAGA	2	10	250440	250449	60 %	0 %	40 %	0 %	479336900
131	NC_021047	GTCAG	2	10	251198	251207	20 %	20 %	40 %	20 %	479336902
132	NC_021047	TTTTC	2	10	253971	253980	0 %	80 %	0 %	20 %	479336905
133	NC_021047	TGAGC	2	10	258569	258578	20 %	20 %	40 %	20 %	479336908
134	NC_021047	GGACG	2	10	259124	259133	20 %	0 %	60 %	20 %	479336908
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