MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis L2b/Ams3 high quality draft genome sequence

Total Repeats: 20278

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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4002	NC_020977	CGC	2	6	208125	208130	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	478465044
4003	NC_020977	ATC	2	6	208174	208179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478465044
4004	NC_020977	TGA	2	6	208191	208196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478465044
4005	NC_020977	ATA	2	6	208214	208219	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478465044
4006	NC_020977	TCT	2	6	208220	208225	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478465044
4007	NC_020977	ACG	2	6	208264	208269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478465044
4008	NC_020977	TTC	2	6	208303	208308	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478465044
4009	NC_020977	TAAC	2	8	208323	208330	50 %	25 %	0 %	25 %	478465044
4010	NC_020977	TCT	2	6	208331	208336	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478465044
4011	NC_020977	ATA	2	6	208354	208359	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478465044
4012	NC_020977	TGT	2	6	208490	208495	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478465044
4013	NC_020977	TAC	2	6	208534	208539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478465044
4014	NC_020977	AAG	2	6	208565	208570	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478465044
4015	NC_020977	TTTA	2	8	208600	208607	25 %	75 %	0 %	0 %	478465044
4016	NC_020977	TTC	3	9	208620	208628	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478465044
4017	NC_020977	AAC	2	6	208768	208773	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478465044
4018	NC_020977	T	6	6	208789	208794	0 %	100 %	0 %	0 %	478465044
4019	NC_020977	ATTT	2	8	208905	208912	25 %	75 %	0 %	0 %	478465044
4020	NC_020977	AAT	2	6	208936	208941	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478465044
4021	NC_020977	GC	3	6	208985	208990	0 %	0 %	50 %	50 %	478465044
4022	NC_020977	AAT	2	6	209047	209052	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478465044
4023	NC_020977	CCT	2	6	209054	209059	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478465044
4024	NC_020977	AATT	2	8	209143	209150	50 %	50 %	0 %	0 %	478465044
4025	NC_020977	TTG	2	6	209175	209180	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478465044
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4029	NC_020977	AAT	2	6	209626	209631	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478465044
4030	NC_020977	GAT	2	6	209692	209697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478465044
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4032	NC_020977	TTTA	2	8	209704	209711	25 %	75 %	0 %	0 %	478465044
4033	NC_020977	ATT	2	6	209742	209747	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478465045
4034	NC_020977	TTG	2	6	209888	209893	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478465045
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4040	NC_020977	TGGA	2	8	210060	210067	25 %	25 %	50 %	0 %	478465045
4041	NC_020977	TTC	2	6	210114	210119	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478465045
4042	NC_020977	TA	3	6	210134	210139	50 %	50 %	0 %	0 %	478465045
4043	NC_020977	TTC	2	6	210162	210167	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478465045
4044	NC_020977	GCA	2	6	210172	210177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478465045
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4048	NC_020977	AACG	2	8	210354	210361	50 %	0 %	25 %	25 %	478465045
4049	NC_020977	TCA	2	6	210397	210402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478465045
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4051	NC_020977	CCAT	2	8	210445	210452	25 %	25 %	0 %	50 %	478465045
4052	NC_020977	GA	3	6	210463	210468	50 %	0 %	50 %	0 %	478465045
4053	NC_020977	T	6	6	210483	210488	0 %	100 %	0 %	0 %	478465045
4054	NC_020977	AGG	2	6	210507	210512	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478465045
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4056	NC_020977	AGA	2	6	210563	210568	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478465045
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4058	NC_020977	ATA	4	12	210619	210630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478465045
4059	NC_020977	GCT	2	6	210688	210693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478465045
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4063	NC_020977	CT	3	6	210936	210941	0 %	50 %	0 %	50 %	478465045
4064	NC_020977	CT	3	6	210944	210949	0 %	50 %	0 %	50 %	478465045
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4071	NC_020977	TAGA	2	8	211196	211203	50 %	25 %	25 %	0 %	478465045
4072	NC_020977	CTTGT	2	10	211274	211283	0 %	60 %	20 %	20 %	478465045
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4078	NC_020977	CTGGAT	2	12	211601	211612	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	478465045
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4081	NC_020977	CTTG	2	8	211868	211875	0 %	50 %	25 %	25 %	478465045
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4087	NC_020977	TAA	2	6	212153	212158	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478465046
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4092	NC_020977	AATA	2	8	212752	212759	75 %	25 %	0 %	0 %	478465047
4093	NC_020977	CTT	2	6	212802	212807	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478465047
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4097	NC_020977	AAG	2	6	212985	212990	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478465047
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4103	NC_020977	CCA	2	6	213179	213184	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478465047
4104	NC_020977	GCA	2	6	213191	213196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478465047
4105	NC_020977	CAA	2	6	213204	213209	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478465047
4106	NC_020977	TAC	2	6	213255	213260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478465047
4107	NC_020977	CTT	2	6	213318	213323	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478465047
4108	NC_020977	TA	3	6	213444	213449	50 %	50 %	0 %	0 %	478465048
4109	NC_020977	ATG	2	6	213497	213502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478465048
4110	NC_020977	TGT	2	6	213505	213510	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478465048
4111	NC_020977	GC	3	6	213570	213575	0 %	0 %	50 %	50 %	478465048
4112	NC_020977	AGA	2	6	213632	213637	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478465048
4113	NC_020977	ATT	2	6	213647	213652	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478465048
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4117	NC_020977	C	6	6	213941	213946	0 %	0 %	0 %	100 %	478465048
4118	NC_020977	ATGA	2	8	213947	213954	50 %	25 %	25 %	0 %	478465048
4119	NC_020977	T	6	6	213981	213986	0 %	100 %	0 %	0 %	478465048
4120	NC_020977	GCA	2	6	214069	214074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478465048
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4122	NC_020977	GAAA	2	8	214140	214147	75 %	0 %	25 %	0 %	478465048
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4246	NC_020977	TAC	2	6	219872	219877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478465053
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4491	NC_020977	TAA	2	6	232197	232202	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478465063
4492	NC_020977	ACG	2	6	232258	232263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478465063
4493	NC_020977	AAC	2	6	232297	232302	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478465063
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4495	NC_020977	AAG	2	6	232339	232344	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478465063
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4498	NC_020977	A	6	6	232482	232487	100 %	0 %	0 %	0 %	478465063
4499	NC_020977	A	7	7	232504	232510	100 %	0 %	0 %	0 %	478465063
4500	NC_020977	CAT	2	6	232527	232532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478465063

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