MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis L2b/CV204 high quality draft genome sequence

Total Repeats: 20291

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_020976	TCCAT	2	10	635000	635009	20 %	40 %	0 %	40 %	478464532
12502	NC_020976	AGAA	2	8	635010	635017	75 %	0 %	25 %	0 %	478464532
12503	NC_020976	CCT	2	6	635051	635056	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478464532
12504	NC_020976	CT	3	6	635055	635060	0 %	50 %	0 %	50 %	478464532
12505	NC_020976	CTA	2	6	635069	635074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478464532
12506	NC_020976	GAAA	2	8	635163	635170	75 %	0 %	25 %	0 %	478464532
12507	NC_020976	A	6	6	635168	635173	100 %	0 %	0 %	0 %	478464532
12508	NC_020976	CTCTTT	2	12	635271	635282	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478464532
12509	NC_020976	ATATCC	2	12	635288	635299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478464532
12510	NC_020976	AGC	2	6	635326	635331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478464532
12511	NC_020976	T	6	6	635386	635391	0 %	100 %	0 %	0 %	478464532
12512	NC_020976	TAAACA	2	12	635399	635410	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	478464532
12513	NC_020976	AGG	2	6	635508	635513	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478464533
12514	NC_020976	CAA	2	6	635575	635580	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478464533
12515	NC_020976	GA	3	6	635601	635606	50 %	0 %	50 %	0 %	478464533
12516	NC_020976	TCC	2	6	635637	635642	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478464533
12517	NC_020976	A	7	7	635648	635654	100 %	0 %	0 %	0 %	478464533
12518	NC_020976	ATGC	2	8	635664	635671	25 %	25 %	25 %	25 %	478464533
12519	NC_020976	ACGA	2	8	635704	635711	50 %	0 %	25 %	25 %	478464533
12520	NC_020976	GA	4	8	635763	635770	50 %	0 %	50 %	0 %	478464533
12521	NC_020976	AAG	2	6	635771	635776	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478464533
12522	NC_020976	CTA	2	6	635782	635787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478464533
12523	NC_020976	A	6	6	635790	635795	100 %	0 %	0 %	0 %	478464533
12524	NC_020976	ACA	2	6	635866	635871	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478464534
12525	NC_020976	TCAT	2	8	635887	635894	25 %	50 %	0 %	25 %	478464534
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12528	NC_020976	AAG	2	6	635928	635933	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478464534
12529	NC_020976	TTTC	2	8	635934	635941	0 %	75 %	0 %	25 %	478464534
12530	NC_020976	CAC	2	6	635950	635955	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478464534
12531	NC_020976	TCT	2	6	635962	635967	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478464534
12532	NC_020976	CAT	2	6	636027	636032	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478464534
12533	NC_020976	CCA	2	6	636121	636126	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478464534
12534	NC_020976	ATA	2	6	636127	636132	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478464534
12535	NC_020976	CAT	2	6	636153	636158	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478464534
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12537	NC_020976	TTC	2	6	636196	636201	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478464534
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12539	NC_020976	AATC	2	8	636268	636275	50 %	25 %	0 %	25 %	478464535
12540	NC_020976	ACC	2	6	636383	636388	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478464535
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12549	NC_020976	TCC	2	6	636739	636744	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478464535
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12551	NC_020976	AGAA	2	8	636863	636870	75 %	0 %	25 %	0 %	478464535
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12559	NC_020976	TC	4	8	637252	637259	0 %	50 %	0 %	50 %	478464535
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12563	NC_020976	CGT	2	6	637346	637351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478464535
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12565	NC_020976	CGGAA	2	10	637616	637625	40 %	0 %	40 %	20 %	478464536
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12589	NC_020976	A	6	6	638851	638856	100 %	0 %	0 %	0 %	478464536
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12602	NC_020976	C	6	6	639235	639240	0 %	0 %	0 %	100 %	478464537
12603	NC_020976	AAT	2	6	639241	639246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478464537
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12611	NC_020976	T	7	7	639771	639777	0 %	100 %	0 %	0 %	478464537
12612	NC_020976	CAA	2	6	639796	639801	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478464537
12613	NC_020976	ATCTTG	2	12	639803	639814	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	478464537
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12619	NC_020976	CT	3	6	640109	640114	0 %	50 %	0 %	50 %	478464537
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12983	NC_020976	GAA	2	6	659630	659635	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478464552
12984	NC_020976	GAC	2	6	659696	659701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478464552
12985	NC_020976	ATTG	2	8	659722	659729	25 %	50 %	25 %	0 %	478464552
12986	NC_020976	TCA	2	6	659766	659771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478464552
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12988	NC_020976	GCTAC	2	10	659835	659844	20 %	20 %	20 %	40 %	478464552
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