MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis L2b/LST high quality draft genome sequence

Total Repeats: 20290

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_020975	TTCC	2	8	207936	207943	0 %	50 %	0 %	50 %	478471343
4002	NC_020975	TAA	2	6	207951	207956	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478471343
4003	NC_020975	AGTA	2	8	208040	208047	50 %	25 %	25 %	0 %	478471343
4004	NC_020975	TTC	2	6	208094	208099	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478471343
4005	NC_020975	CGC	2	6	208125	208130	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	478471343
4006	NC_020975	ATC	2	6	208174	208179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478471343
4007	NC_020975	TGA	2	6	208191	208196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478471343
4008	NC_020975	ATA	2	6	208214	208219	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478471343
4009	NC_020975	TCT	2	6	208220	208225	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478471343
4010	NC_020975	ACG	2	6	208264	208269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478471343
4011	NC_020975	TTC	2	6	208303	208308	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478471343
4012	NC_020975	TAAC	2	8	208323	208330	50 %	25 %	0 %	25 %	478471343
4013	NC_020975	TCT	2	6	208331	208336	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478471343
4014	NC_020975	ATA	2	6	208354	208359	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478471343
4015	NC_020975	TGT	2	6	208490	208495	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478471343
4016	NC_020975	TAC	2	6	208534	208539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478471343
4017	NC_020975	AAG	2	6	208565	208570	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478471343
4018	NC_020975	TTTA	2	8	208600	208607	25 %	75 %	0 %	0 %	478471343
4019	NC_020975	TTC	3	9	208620	208628	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478471343
4020	NC_020975	AAC	2	6	208768	208773	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478471343
4021	NC_020975	T	6	6	208789	208794	0 %	100 %	0 %	0 %	478471343
4022	NC_020975	ATTT	2	8	208905	208912	25 %	75 %	0 %	0 %	478471343
4023	NC_020975	AAT	2	6	208936	208941	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478471343
4024	NC_020975	GC	3	6	208985	208990	0 %	0 %	50 %	50 %	478471343
4025	NC_020975	AAT	2	6	209047	209052	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478471343
4026	NC_020975	CCT	2	6	209054	209059	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478471343
4027	NC_020975	AATT	2	8	209143	209150	50 %	50 %	0 %	0 %	478471343
4028	NC_020975	TTG	2	6	209175	209180	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478471343
4029	NC_020975	GAG	2	6	209201	209206	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478471343
4030	NC_020975	GCA	2	6	209360	209365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478471343
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4032	NC_020975	AAT	2	6	209626	209631	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478471343
4033	NC_020975	GAT	2	6	209692	209697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478471343
4034	NC_020975	TTC	2	6	209698	209703	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478471343
4035	NC_020975	TTTA	2	8	209704	209711	25 %	75 %	0 %	0 %	478471343
4036	NC_020975	ATT	2	6	209742	209747	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478471344
4037	NC_020975	TTG	2	6	209888	209893	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478471344
4038	NC_020975	TC	3	6	209918	209923	0 %	50 %	0 %	50 %	478471344
4039	NC_020975	TTC	2	6	209957	209962	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478471344
4040	NC_020975	AGT	2	6	209975	209980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478471344
4041	NC_020975	AACA	2	8	210002	210009	75 %	0 %	0 %	25 %	478471344
4042	NC_020975	TCT	2	6	210028	210033	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478471344
4043	NC_020975	TGGA	2	8	210060	210067	25 %	25 %	50 %	0 %	478471344
4044	NC_020975	TTC	2	6	210114	210119	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478471344
4045	NC_020975	TA	3	6	210134	210139	50 %	50 %	0 %	0 %	478471344
4046	NC_020975	TTC	2	6	210162	210167	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478471344
4047	NC_020975	GCA	2	6	210172	210177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478471344
4048	NC_020975	GCT	2	6	210181	210186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478471344
4049	NC_020975	GGA	2	6	210238	210243	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478471344
4050	NC_020975	T	6	6	210306	210311	0 %	100 %	0 %	0 %	478471344
4051	NC_020975	AACG	2	8	210354	210361	50 %	0 %	25 %	25 %	478471344
4052	NC_020975	TCA	2	6	210397	210402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478471344
4053	NC_020975	CTTT	2	8	210415	210422	0 %	75 %	0 %	25 %	478471344
4054	NC_020975	CCAT	2	8	210445	210452	25 %	25 %	0 %	50 %	478471344
4055	NC_020975	GA	3	6	210463	210468	50 %	0 %	50 %	0 %	478471344
4056	NC_020975	T	6	6	210483	210488	0 %	100 %	0 %	0 %	478471344
4057	NC_020975	AGG	2	6	210507	210512	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478471344
4058	NC_020975	CATT	2	8	210529	210536	25 %	50 %	0 %	25 %	478471344
4059	NC_020975	AGA	2	6	210563	210568	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478471344
4060	NC_020975	CAA	2	6	210576	210581	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478471344
4061	NC_020975	ATA	4	12	210619	210630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478471344
4062	NC_020975	GCT	2	6	210688	210693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478471344
4063	NC_020975	GAA	2	6	210773	210778	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478471344
4064	NC_020975	ACG	2	6	210789	210794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478471344
4065	NC_020975	AGCG	2	8	210899	210906	25 %	0 %	50 %	25 %	478471344
4066	NC_020975	CT	3	6	210936	210941	0 %	50 %	0 %	50 %	478471344
4067	NC_020975	CT	3	6	210944	210949	0 %	50 %	0 %	50 %	478471344
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4071	NC_020975	TGTTT	2	10	211093	211102	0 %	80 %	20 %	0 %	478471344
4072	NC_020975	CTA	2	6	211145	211150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478471344
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4074	NC_020975	TAGA	2	8	211196	211203	50 %	25 %	25 %	0 %	478471344
4075	NC_020975	CTTGT	2	10	211274	211283	0 %	60 %	20 %	20 %	478471344
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4081	NC_020975	CTGGAT	2	12	211601	211612	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	478471344
4082	NC_020975	GTA	2	6	211826	211831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478471344
4083	NC_020975	ACC	2	6	211840	211845	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478471344
4084	NC_020975	CTTG	2	8	211868	211875	0 %	50 %	25 %	25 %	478471344
4085	NC_020975	GAAATA	2	12	211924	211935	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	478471344
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4088	NC_020975	CGT	2	6	212117	212122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478471344
4089	NC_020975	TTTCT	2	10	212124	212133	0 %	80 %	0 %	20 %	478471344
4090	NC_020975	TAA	2	6	212153	212158	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478471345
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4092	NC_020975	CTT	2	6	212321	212326	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478471345
4093	NC_020975	ACG	2	6	212459	212464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478471345
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4095	NC_020975	AATA	2	8	212752	212759	75 %	25 %	0 %	0 %	478471346
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4098	NC_020975	TTG	2	6	212935	212940	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478471346
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4100	NC_020975	AAG	2	6	212985	212990	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478471346
4101	NC_020975	CTT	2	6	212991	212996	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478471346
4102	NC_020975	CTT	2	6	213018	213023	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478471346
4103	NC_020975	CTG	2	6	213077	213082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478471346
4104	NC_020975	CCA	2	6	213140	213145	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478471346
4105	NC_020975	CAAA	2	8	213160	213167	75 %	0 %	0 %	25 %	478471346
4106	NC_020975	CCA	2	6	213179	213184	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478471346
4107	NC_020975	GCA	2	6	213191	213196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478471346
4108	NC_020975	CAA	2	6	213204	213209	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478471346
4109	NC_020975	TAC	2	6	213255	213260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478471346
4110	NC_020975	CTT	2	6	213318	213323	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478471346
4111	NC_020975	TA	3	6	213444	213449	50 %	50 %	0 %	0 %	478471347
4112	NC_020975	ATG	2	6	213497	213502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478471347
4113	NC_020975	TGT	2	6	213505	213510	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478471347
4114	NC_020975	GC	3	6	213570	213575	0 %	0 %	50 %	50 %	478471347
4115	NC_020975	AGA	2	6	213632	213637	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478471347
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4118	NC_020975	CAC	2	6	213827	213832	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478471347
4119	NC_020975	TCT	2	6	213897	213902	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478471347
4120	NC_020975	C	6	6	213941	213946	0 %	0 %	0 %	100 %	478471347
4121	NC_020975	ATGA	2	8	213947	213954	50 %	25 %	25 %	0 %	478471347
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4123	NC_020975	GCA	2	6	214069	214074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478471347
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4240	NC_020975	T	6	6	219665	219670	0 %	100 %	0 %	0 %	478471352
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4247	NC_020975	AGA	2	6	219831	219836	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478471352
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4492	NC_020975	A	6	6	232043	232048	100 %	0 %	0 %	0 %	478471362
4493	NC_020975	A	6	6	232127	232132	100 %	0 %	0 %	0 %	478471362
4494	NC_020975	TAA	2	6	232197	232202	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478471362
4495	NC_020975	ACG	2	6	232258	232263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478471362
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