MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis L3/404/LN complete genome

Total Repeats: 20290

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1502	NC_020974	TTC	2	6	78876	78881	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478463128
1503	NC_020974	CATG	2	8	78886	78893	25 %	25 %	25 %	25 %	478463128
1504	NC_020974	ATT	2	6	79363	79368	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478463129
1505	NC_020974	AATT	2	8	79381	79388	50 %	50 %	0 %	0 %	478463129
1506	NC_020974	T	6	6	79411	79416	0 %	100 %	0 %	0 %	478463129
1507	NC_020974	GAG	2	6	79530	79535	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478463129
1508	NC_020974	TTC	2	6	79622	79627	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478463129
1509	NC_020974	T	8	8	79629	79636	0 %	100 %	0 %	0 %	478463129
1510	NC_020974	GCC	2	6	79657	79662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	478463129
1511	NC_020974	TCC	2	6	79705	79710	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478463129
1512	NC_020974	GCT	2	6	79737	79742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478463129
1513	NC_020974	TCT	2	6	79748	79753	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478463129
1514	NC_020974	T	7	7	80445	80451	0 %	100 %	0 %	0 %	478463130
1515	NC_020974	TGA	2	6	80550	80555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478463130
1516	NC_020974	TGTCT	2	10	80565	80574	0 %	60 %	20 %	20 %	478463130
1517	NC_020974	TGAT	2	8	80639	80646	25 %	50 %	25 %	0 %	478463130
1518	NC_020974	TCAT	2	8	80661	80668	25 %	50 %	0 %	25 %	478463130
1519	NC_020974	T	6	6	80717	80722	0 %	100 %	0 %	0 %	478463130
1520	NC_020974	GGTTTA	2	12	80728	80739	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	478463130
1521	NC_020974	TCT	2	6	80829	80834	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478463130
1522	NC_020974	GAA	2	6	80839	80844	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478463130
1523	NC_020974	TGC	2	6	80889	80894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478463130
1524	NC_020974	CAA	2	6	80923	80928	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478463130
1525	NC_020974	GAA	2	6	80941	80946	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478463130
1526	NC_020974	GGA	2	6	80985	80990	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478463130
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1528	NC_020974	A	7	7	81032	81038	100 %	0 %	0 %	0 %	478463130
1529	NC_020974	TTACT	2	10	81072	81081	20 %	60 %	0 %	20 %	478463130
1530	NC_020974	TATC	2	8	81088	81095	25 %	50 %	0 %	25 %	478463130
1531	NC_020974	GA	3	6	81106	81111	50 %	0 %	50 %	0 %	478463130
1532	NC_020974	TAT	2	6	81186	81191	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478463130
1533	NC_020974	TA	3	6	81326	81331	50 %	50 %	0 %	0 %	478463130
1534	NC_020974	TG	4	8	81339	81346	0 %	50 %	50 %	0 %	478463130
1535	NC_020974	AGA	2	6	81390	81395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478463130
1536	NC_020974	GGGA	2	8	81399	81406	25 %	0 %	75 %	0 %	478463130
1537	NC_020974	CTGC	2	8	81503	81510	0 %	25 %	25 %	50 %	478463131
1538	NC_020974	GCT	2	6	81521	81526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478463131
1539	NC_020974	ATT	2	6	81527	81532	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478463131
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1541	NC_020974	CTT	2	6	81591	81596	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478463131
1542	NC_020974	CAT	2	6	81638	81643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478463131
1543	NC_020974	TGA	2	6	81760	81765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478463131
1544	NC_020974	AGG	2	6	81771	81776	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478463131
1545	NC_020974	GGTT	2	8	81796	81803	0 %	50 %	50 %	0 %	478463131
1546	NC_020974	CT	3	6	81836	81841	0 %	50 %	0 %	50 %	478463131
1547	NC_020974	GGA	2	6	81842	81847	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478463131
1548	NC_020974	CAA	2	6	81848	81853	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478463131
1549	NC_020974	AG	3	6	81855	81860	50 %	0 %	50 %	0 %	478463131
1550	NC_020974	T	6	6	81862	81867	0 %	100 %	0 %	0 %	478463131
1551	NC_020974	CGAT	2	8	81924	81931	25 %	25 %	25 %	25 %	478463131
1552	NC_020974	TCAT	2	8	81999	82006	25 %	50 %	0 %	25 %	478463131
1553	NC_020974	TTA	2	6	82049	82054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478463131
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1555	NC_020974	AGA	2	6	82084	82089	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478463131
1556	NC_020974	AAG	2	6	82101	82106	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478463131
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1558	NC_020974	T	6	6	82234	82239	0 %	100 %	0 %	0 %	478463132
1559	NC_020974	GAC	2	6	82261	82266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478463132
1560	NC_020974	GA	3	6	82295	82300	50 %	0 %	50 %	0 %	478463132
1561	NC_020974	TTA	2	6	82307	82312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478463132
1562	NC_020974	CTT	2	6	82361	82366	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478463132
1563	NC_020974	TTA	2	6	82404	82409	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478463132
1564	NC_020974	T	6	6	82412	82417	0 %	100 %	0 %	0 %	478463132
1565	NC_020974	AGAAA	2	10	82462	82471	80 %	0 %	20 %	0 %	478463132
1566	NC_020974	T	6	6	82517	82522	0 %	100 %	0 %	0 %	478463132
1567	NC_020974	GTTA	2	8	82541	82548	25 %	50 %	25 %	0 %	478463132
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1569	NC_020974	ACA	2	6	82575	82580	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478463132
1570	NC_020974	GCG	2	6	82607	82612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	478463132
1571	NC_020974	T	6	6	82650	82655	0 %	100 %	0 %	0 %	478463132
1572	NC_020974	TGG	3	9	82676	82684	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478463132
1573	NC_020974	CAG	2	6	82752	82757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478463132
1574	NC_020974	GTT	2	6	82763	82768	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478463132
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1578	NC_020974	GGAAG	2	10	82975	82984	40 %	0 %	60 %	0 %	478463132
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1581	NC_020974	TTC	2	6	83024	83029	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478463132
1582	NC_020974	T	6	6	83058	83063	0 %	100 %	0 %	0 %	478463132
1583	NC_020974	GAA	2	6	83126	83131	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478463132
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1588	NC_020974	CAT	2	6	83411	83416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478463132
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1591	NC_020974	TAC	2	6	83559	83564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478463133
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1593	NC_020974	T	7	7	83595	83601	0 %	100 %	0 %	0 %	478463133
1594	NC_020974	T	6	6	83608	83613	0 %	100 %	0 %	0 %	478463133
1595	NC_020974	GTA	2	6	83694	83699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478463133
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1599	NC_020974	TCA	2	6	83792	83797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478463133
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1601	NC_020974	CAA	2	6	83842	83847	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478463133
1602	NC_020974	CATT	2	8	83867	83874	25 %	50 %	0 %	25 %	478463133
1603	NC_020974	AGA	2	6	83900	83905	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478463133
1604	NC_020974	AGCA	2	8	83906	83913	50 %	0 %	25 %	25 %	478463133
1605	NC_020974	TC	3	6	83928	83933	0 %	50 %	0 %	50 %	478463133
1606	NC_020974	TTA	2	6	83949	83954	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478463133
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1608	NC_020974	TTTG	2	8	84099	84106	0 %	75 %	25 %	0 %	478463133
1609	NC_020974	TTG	2	6	84196	84201	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478463133
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1612	NC_020974	CTA	2	6	84411	84416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478463133
1613	NC_020974	TAT	2	6	84464	84469	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478463133
1614	NC_020974	TAAG	2	8	84488	84495	50 %	25 %	25 %	0 %	478463133
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1616	NC_020974	TAT	2	6	84604	84609	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478463134
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1620	NC_020974	AG	3	6	84662	84667	50 %	0 %	50 %	0 %	478463134
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1622	NC_020974	CAG	2	6	84834	84839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478463134
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1624	NC_020974	AG	3	6	84929	84934	50 %	0 %	50 %	0 %	478463134
1625	NC_020974	TTC	2	6	84948	84953	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478463134
1626	NC_020974	GAAG	2	8	84992	84999	50 %	0 %	50 %	0 %	478463134
1627	NC_020974	A	6	6	85016	85021	100 %	0 %	0 %	0 %	478463134
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