MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis L3/404/LN complete genome

Total Repeats: 20290

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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502	NC_020974	CTA	2	6	27743	27748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478463085
503	NC_020974	T	8	8	27750	27757	0 %	100 %	0 %	0 %	478463085
504	NC_020974	GAA	2	6	27808	27813	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478463085
505	NC_020974	T	6	6	27890	27895	0 %	100 %	0 %	0 %	478463085
506	NC_020974	TGA	2	6	27903	27908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478463085
507	NC_020974	GGAGA	2	10	27911	27920	40 %	0 %	60 %	0 %	478463085
508	NC_020974	GGATA	2	10	27937	27946	40 %	20 %	40 %	0 %	478463085
509	NC_020974	A	7	7	27961	27967	100 %	0 %	0 %	0 %	478463085
510	NC_020974	AAG	2	6	27978	27983	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478463085
511	NC_020974	T	6	6	27998	28003	0 %	100 %	0 %	0 %	478463085
512	NC_020974	A	8	8	28095	28102	100 %	0 %	0 %	0 %	478463086
513	NC_020974	TTC	2	6	28139	28144	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478463086
514	NC_020974	GTTT	2	8	28157	28164	0 %	75 %	25 %	0 %	478463086
515	NC_020974	CAGA	2	8	28179	28186	50 %	0 %	25 %	25 %	478463086
516	NC_020974	TTC	2	6	28257	28262	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478463086
517	NC_020974	AAG	2	6	28272	28277	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478463086
518	NC_020974	TTC	2	6	28372	28377	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478463086
519	NC_020974	AAG	2	6	28386	28391	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478463086
520	NC_020974	AAG	2	6	28404	28409	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478463086
521	NC_020974	A	6	6	28410	28415	100 %	0 %	0 %	0 %	478463086
522	NC_020974	GAA	2	6	28642	28647	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478463087
523	NC_020974	ATCCG	2	10	28662	28671	20 %	20 %	20 %	40 %	478463087
524	NC_020974	TTC	2	6	28775	28780	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478463087
525	NC_020974	TAG	2	6	28823	28828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478463087
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527	NC_020974	GAT	3	9	28918	28926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478463087
528	NC_020974	GAG	2	6	28961	28966	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478463087
529	NC_020974	TG	3	6	28993	28998	0 %	50 %	50 %	0 %	478463087
530	NC_020974	GCA	2	6	29017	29022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478463087
531	NC_020974	TC	3	6	29046	29051	0 %	50 %	0 %	50 %	478463087
532	NC_020974	AGGGT	2	10	29180	29189	20 %	20 %	60 %	0 %	478463087
533	NC_020974	TTC	2	6	29216	29221	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478463087
534	NC_020974	CAG	2	6	29228	29233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478463087
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536	NC_020974	TGA	2	6	29256	29261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478463087
537	NC_020974	TTC	2	6	29289	29294	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478463087
538	NC_020974	GC	4	8	29460	29467	0 %	0 %	50 %	50 %	478463087
539	NC_020974	AAG	2	6	29468	29473	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478463087
540	NC_020974	TA	3	6	29582	29587	50 %	50 %	0 %	0 %	478463087
541	NC_020974	GAA	2	6	29671	29676	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478463087
542	NC_020974	TGT	2	6	29703	29708	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478463088
543	NC_020974	TCT	2	6	29771	29776	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478463088
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547	NC_020974	TTTG	2	8	30166	30173	0 %	75 %	25 %	0 %	478463088
548	NC_020974	TTGT	2	8	30201	30208	0 %	75 %	25 %	0 %	478463088
549	NC_020974	CCTAT	2	10	30220	30229	20 %	40 %	0 %	40 %	478463088
550	NC_020974	T	6	6	30236	30241	0 %	100 %	0 %	0 %	478463088
551	NC_020974	ATC	2	6	30315	30320	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478463088
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553	NC_020974	T	8	8	30470	30477	0 %	100 %	0 %	0 %	478463088
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557	NC_020974	AG	3	6	30631	30636	50 %	0 %	50 %	0 %	478463089
558	NC_020974	GTT	2	6	30712	30717	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478463089
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560	NC_020974	TC	3	6	30740	30745	0 %	50 %	0 %	50 %	478463089
561	NC_020974	TCT	2	6	30787	30792	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478463089
562	NC_020974	CTG	2	6	30809	30814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478463089
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568	NC_020974	T	6	6	31011	31016	0 %	100 %	0 %	0 %	478463089
569	NC_020974	GAAGG	2	10	31019	31028	40 %	0 %	60 %	0 %	478463089
570	NC_020974	GGC	2	6	31047	31052	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	478463089
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593	NC_020974	GAGCT	2	10	32059	32068	20 %	20 %	40 %	20 %	478463090
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595	NC_020974	A	6	6	32164	32169	100 %	0 %	0 %	0 %	478463090
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602	NC_020974	CTT	2	6	32505	32510	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478463091
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612	NC_020974	T	6	6	33176	33181	0 %	100 %	0 %	0 %	478463091
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