MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis L3/404/LN complete genome

Total Repeats: 20290

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5502	NC_020974	AAC	2	6	282917	282922	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478463311
5503	NC_020974	GAA	2	6	282946	282951	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478463311
5504	NC_020974	GAA	2	6	283024	283029	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478463311
5505	NC_020974	T	6	6	283033	283038	0 %	100 %	0 %	0 %	478463311
5506	NC_020974	TTC	2	6	283057	283062	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478463311
5507	NC_020974	TGT	2	6	283089	283094	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478463311
5508	NC_020974	CTT	2	6	283133	283138	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478463311
5509	NC_020974	TTTG	2	8	283164	283171	0 %	75 %	25 %	0 %	478463311
5510	NC_020974	TCTTT	2	10	283172	283181	0 %	80 %	0 %	20 %	478463311
5511	NC_020974	TTTA	2	8	283192	283199	25 %	75 %	0 %	0 %	478463311
5512	NC_020974	CGC	2	6	283218	283223	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	478463311
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5514	NC_020974	TTA	2	6	283486	283491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478463312
5515	NC_020974	T	6	6	283497	283502	0 %	100 %	0 %	0 %	478463312
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5517	NC_020974	GAG	2	6	283575	283580	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478463312
5518	NC_020974	CGA	2	6	283583	283588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478463312
5519	NC_020974	CTT	2	6	283617	283622	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478463312
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5522	NC_020974	TA	3	6	283762	283767	50 %	50 %	0 %	0 %	478463312
5523	NC_020974	TTC	2	6	283864	283869	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478463312
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5542	NC_020974	TAT	2	6	284948	284953	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478463313
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5545	NC_020974	TGA	2	6	285017	285022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478463313
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5547	NC_020974	TGT	2	6	285074	285079	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478463313
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5551	NC_020974	TA	3	6	285279	285284	50 %	50 %	0 %	0 %	478463313
5552	NC_020974	AACT	2	8	285300	285307	50 %	25 %	0 %	25 %	478463313
5553	NC_020974	CCT	2	6	285333	285338	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478463314
5554	NC_020974	ATG	2	6	285367	285372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478463314
5555	NC_020974	TAC	2	6	285412	285417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478463314
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5557	NC_020974	TTA	2	6	285458	285463	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478463314
5558	NC_020974	TCA	2	6	285532	285537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478463314
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5560	NC_020974	GTC	2	6	285601	285606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478463314
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5594	NC_020974	TGCT	2	8	287320	287327	0 %	50 %	25 %	25 %	478463315
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5599	NC_020974	TA	3	6	287627	287632	50 %	50 %	0 %	0 %	478463315
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5993	NC_020974	TTC	2	6	307540	307545	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478463336
5994	NC_020974	TA	3	6	307593	307598	50 %	50 %	0 %	0 %	478463336
5995	NC_020974	CTC	2	6	307632	307637	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478463336
5996	NC_020974	TCTT	2	8	307714	307721	0 %	75 %	0 %	25 %	478463336
5997	NC_020974	AGA	2	6	307747	307752	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478463336
5998	NC_020974	CAAC	2	8	307763	307770	50 %	0 %	0 %	50 %	478463336
5999	NC_020974	A	6	6	307861	307866	100 %	0 %	0 %	0 %	478463336
6000	NC_020974	TTC	2	6	307890	307895	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478463336

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