MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis L1/224 complete genome

Total Repeats: 20300

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_020973	CTC	2	6	207446	207451	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478462347
4002	NC_020973	AGC	2	6	207453	207458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478462347
4003	NC_020973	AGC	2	6	207555	207560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478462347
4004	NC_020973	CAT	2	6	207575	207580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478462347
4005	NC_020973	T	6	6	207603	207608	0 %	100 %	0 %	0 %	478462347
4006	NC_020973	ACA	2	6	207646	207651	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478462347
4007	NC_020973	CTT	2	6	207654	207659	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478462347
4008	NC_020973	GCA	2	6	207712	207717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478462347
4009	NC_020973	TTCC	2	8	207737	207744	0 %	50 %	0 %	50 %	478462347
4010	NC_020973	TAA	2	6	207752	207757	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478462347
4011	NC_020973	AGTA	2	8	207841	207848	50 %	25 %	25 %	0 %	478462347
4012	NC_020973	TTC	2	6	207895	207900	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478462347
4013	NC_020973	CGC	2	6	207926	207931	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	478462347
4014	NC_020973	ATC	2	6	207975	207980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478462347
4015	NC_020973	TGA	2	6	207992	207997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478462347
4016	NC_020973	ATA	2	6	208015	208020	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478462347
4017	NC_020973	TCT	2	6	208021	208026	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478462347
4018	NC_020973	ACG	2	6	208065	208070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478462347
4019	NC_020973	TTC	2	6	208104	208109	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478462347
4020	NC_020973	TAAC	2	8	208124	208131	50 %	25 %	0 %	25 %	478462347
4021	NC_020973	TCT	2	6	208132	208137	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478462347
4022	NC_020973	ATA	2	6	208155	208160	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478462347
4023	NC_020973	TGT	2	6	208291	208296	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478462347
4024	NC_020973	TAC	2	6	208335	208340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478462347
4025	NC_020973	AAG	2	6	208366	208371	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478462347
4026	NC_020973	TTTA	2	8	208401	208408	25 %	75 %	0 %	0 %	478462347
4027	NC_020973	TTC	3	9	208421	208429	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478462347
4028	NC_020973	AAC	2	6	208569	208574	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478462347
4029	NC_020973	T	6	6	208590	208595	0 %	100 %	0 %	0 %	478462347
4030	NC_020973	ATTT	2	8	208706	208713	25 %	75 %	0 %	0 %	478462347
4031	NC_020973	AAT	2	6	208737	208742	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478462347
4032	NC_020973	GC	3	6	208786	208791	0 %	0 %	50 %	50 %	478462347
4033	NC_020973	AAT	2	6	208848	208853	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478462347
4034	NC_020973	CCT	2	6	208855	208860	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478462347
4035	NC_020973	AATT	2	8	208944	208951	50 %	50 %	0 %	0 %	478462347
4036	NC_020973	TTG	2	6	208976	208981	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478462347
4037	NC_020973	GAG	2	6	209002	209007	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478462347
4038	NC_020973	GCA	2	6	209161	209166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478462347
4039	NC_020973	CAA	2	6	209207	209212	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478462347
4040	NC_020973	AAT	2	6	209427	209432	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478462347
4041	NC_020973	GAT	2	6	209493	209498	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478462347
4042	NC_020973	TTC	2	6	209499	209504	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478462347
4043	NC_020973	TTTA	2	8	209505	209512	25 %	75 %	0 %	0 %	478462347
4044	NC_020973	ATT	2	6	209543	209548	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478462348
4045	NC_020973	TTG	2	6	209689	209694	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478462348
4046	NC_020973	TC	3	6	209719	209724	0 %	50 %	0 %	50 %	478462348
4047	NC_020973	TTC	2	6	209758	209763	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478462348
4048	NC_020973	AGT	2	6	209776	209781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478462348
4049	NC_020973	AACA	2	8	209803	209810	75 %	0 %	0 %	25 %	478462348
4050	NC_020973	TCT	2	6	209829	209834	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478462348
4051	NC_020973	TGGA	2	8	209861	209868	25 %	25 %	50 %	0 %	478462348
4052	NC_020973	TTC	2	6	209915	209920	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478462348
4053	NC_020973	TA	3	6	209935	209940	50 %	50 %	0 %	0 %	478462348
4054	NC_020973	TTC	2	6	209963	209968	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478462348
4055	NC_020973	GCA	2	6	209973	209978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478462348
4056	NC_020973	GCT	2	6	209982	209987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478462348
4057	NC_020973	GGA	2	6	210039	210044	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478462348
4058	NC_020973	T	6	6	210107	210112	0 %	100 %	0 %	0 %	478462348
4059	NC_020973	AACG	2	8	210155	210162	50 %	0 %	25 %	25 %	478462348
4060	NC_020973	TCA	2	6	210198	210203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478462348
4061	NC_020973	CTTT	2	8	210216	210223	0 %	75 %	0 %	25 %	478462348
4062	NC_020973	CCAT	2	8	210246	210253	25 %	25 %	0 %	50 %	478462348
4063	NC_020973	GA	3	6	210264	210269	50 %	0 %	50 %	0 %	478462348
4064	NC_020973	T	6	6	210284	210289	0 %	100 %	0 %	0 %	478462348
4065	NC_020973	AGG	2	6	210308	210313	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478462348
4066	NC_020973	CATT	2	8	210330	210337	25 %	50 %	0 %	25 %	478462348
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4069	NC_020973	ATA	4	12	210420	210431	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478462348
4070	NC_020973	GCT	2	6	210489	210494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478462348
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4072	NC_020973	ACG	2	6	210590	210595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478462348
4073	NC_020973	AGCG	2	8	210700	210707	25 %	0 %	50 %	25 %	478462348
4074	NC_020973	CT	3	6	210737	210742	0 %	50 %	0 %	50 %	478462348
4075	NC_020973	CT	3	6	210745	210750	0 %	50 %	0 %	50 %	478462348
4076	NC_020973	AGC	2	6	210752	210757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478462348
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4080	NC_020973	CTA	2	6	210946	210951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478462348
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4082	NC_020973	TAGA	2	8	210997	211004	50 %	25 %	25 %	0 %	478462348
4083	NC_020973	CTTGT	2	10	211075	211084	0 %	60 %	20 %	20 %	478462348
4084	NC_020973	ATT	2	6	211091	211096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478462348
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4088	NC_020973	CG	3	6	211370	211375	0 %	0 %	50 %	50 %	478462348
4089	NC_020973	CTGGAT	2	12	211402	211413	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	478462348
4090	NC_020973	GTA	2	6	211627	211632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478462348
4091	NC_020973	ACC	2	6	211641	211646	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478462348
4092	NC_020973	CTTG	2	8	211669	211676	0 %	50 %	25 %	25 %	478462348
4093	NC_020973	GAAATA	2	12	211725	211736	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	478462348
4094	NC_020973	AAC	2	6	211757	211762	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478462348
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4096	NC_020973	CGT	2	6	211918	211923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478462348
4097	NC_020973	TTTCT	2	10	211925	211934	0 %	80 %	0 %	20 %	478462348
4098	NC_020973	TAA	2	6	211954	211959	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478462349
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4101	NC_020973	ACG	2	6	212260	212265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478462349
4102	NC_020973	ACA	2	6	212508	212513	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478462350
4103	NC_020973	AATA	2	8	212553	212560	75 %	25 %	0 %	0 %	478462350
4104	NC_020973	CTT	2	6	212603	212608	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478462350
4105	NC_020973	CAG	2	6	212613	212618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478462350
4106	NC_020973	TTG	2	6	212736	212741	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478462350
4107	NC_020973	TCC	2	6	212746	212751	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478462350
4108	NC_020973	AAG	2	6	212786	212791	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478462350
4109	NC_020973	CTT	2	6	212792	212797	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478462350
4110	NC_020973	CTT	2	6	212819	212824	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478462350
4111	NC_020973	CTG	2	6	212878	212883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478462350
4112	NC_020973	CCA	2	6	212941	212946	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478462350
4113	NC_020973	CAAA	2	8	212961	212968	75 %	0 %	0 %	25 %	478462350
4114	NC_020973	CCA	2	6	212980	212985	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478462350
4115	NC_020973	GCA	2	6	212992	212997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478462350
4116	NC_020973	CAA	2	6	213005	213010	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478462350
4117	NC_020973	TAC	2	6	213056	213061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478462350
4118	NC_020973	CTT	2	6	213119	213124	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478462350
4119	NC_020973	TA	3	6	213245	213250	50 %	50 %	0 %	0 %	478462351
4120	NC_020973	ATG	2	6	213298	213303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478462351
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4122	NC_020973	GC	3	6	213371	213376	0 %	0 %	50 %	50 %	478462351
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4232	NC_020973	GA	4	8	218985	218992	50 %	0 %	50 %	0 %	478462355
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4243	NC_020973	A	6	6	219328	219333	100 %	0 %	0 %	0 %	478462356
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4491	NC_020973	TCC	2	6	231369	231374	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478462366
4492	NC_020973	CTG	2	6	231389	231394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478462366
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