MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis L1/224 complete genome

Total Repeats: 20300

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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3002	NC_020973	GCA	2	6	153489	153494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478462298
3003	NC_020973	AG	3	6	153795	153800	50 %	0 %	50 %	0 %	478462298
3004	NC_020973	CTTT	2	8	153824	153831	0 %	75 %	0 %	25 %	478462298
3005	NC_020973	AT	3	6	153949	153954	50 %	50 %	0 %	0 %	478462299
3006	NC_020973	T	7	7	153964	153970	0 %	100 %	0 %	0 %	478462299
3007	NC_020973	T	6	6	154035	154040	0 %	100 %	0 %	0 %	478462299
3008	NC_020973	ATC	2	6	154065	154070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478462299
3009	NC_020973	T	6	6	154075	154080	0 %	100 %	0 %	0 %	478462299
3010	NC_020973	TGTGCG	2	12	154089	154100	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	478462299
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3012	NC_020973	CAG	2	6	154253	154258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478462299
3013	NC_020973	GATC	2	8	154325	154332	25 %	25 %	25 %	25 %	478462299
3014	NC_020973	ATT	2	6	154340	154345	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478462299
3015	NC_020973	ATG	2	6	154367	154372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478462299
3016	NC_020973	ACG	2	6	154373	154378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478462299
3017	NC_020973	TCT	2	6	154391	154396	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478462299
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3019	NC_020973	AATC	2	8	154445	154452	50 %	25 %	0 %	25 %	478462299
3020	NC_020973	GAA	2	6	154457	154462	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478462299
3021	NC_020973	TA	3	6	154490	154495	50 %	50 %	0 %	0 %	478462299
3022	NC_020973	GAT	2	6	154511	154516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478462299
3023	NC_020973	TA	3	6	154548	154553	50 %	50 %	0 %	0 %	478462299
3024	NC_020973	CTT	2	6	154566	154571	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478462299
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3033	NC_020973	ATA	2	6	154962	154967	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478462300
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3039	NC_020973	TGT	2	6	155311	155316	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478462300
3040	NC_020973	CCTCAT	2	12	155387	155398	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	478462300
3041	NC_020973	AGGC	2	8	155417	155424	25 %	0 %	50 %	25 %	478462300
3042	NC_020973	GAGT	2	8	155505	155512	25 %	25 %	50 %	0 %	478462300
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3045	NC_020973	GACT	2	8	155713	155720	25 %	25 %	25 %	25 %	478462301
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3053	NC_020973	TTA	2	6	156111	156116	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478462301
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3081	NC_020973	AG	3	6	157561	157566	50 %	0 %	50 %	0 %	478462302
3082	NC_020973	AG	3	6	157626	157631	50 %	0 %	50 %	0 %	478462302
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3092	NC_020973	A	7	7	158156	158162	100 %	0 %	0 %	0 %	478462303
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3122	NC_020973	GT	3	6	160159	160164	0 %	50 %	50 %	0 %	478462305
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3494	NC_020973	AGA	2	6	179103	179108	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478462317
3495	NC_020973	CAA	2	6	179190	179195	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478462317
3496	NC_020973	TTTC	2	8	179223	179230	0 %	75 %	0 %	25 %	478462317
3497	NC_020973	AGT	2	6	179262	179267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478462317
3498	NC_020973	GAT	2	6	179297	179302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478462317
3499	NC_020973	CTC	2	6	179317	179322	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478462317
3500	NC_020973	AAG	2	6	179346	179351	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478462317

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