MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis L1/224 complete genome

Total Repeats: 20300

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1502	NC_020973	AGA	2	6	78688	78693	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478462229
1503	NC_020973	TTC	2	6	78717	78722	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478462229
1504	NC_020973	CATG	2	8	78727	78734	25 %	25 %	25 %	25 %	478462229
1505	NC_020973	ATT	2	6	79204	79209	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478462230
1506	NC_020973	AATT	2	8	79222	79229	50 %	50 %	0 %	0 %	478462230
1507	NC_020973	T	6	6	79252	79257	0 %	100 %	0 %	0 %	478462230
1508	NC_020973	GAG	2	6	79371	79376	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478462230
1509	NC_020973	TTC	2	6	79463	79468	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478462230
1510	NC_020973	T	8	8	79470	79477	0 %	100 %	0 %	0 %	478462230
1511	NC_020973	GCC	2	6	79498	79503	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	478462230
1512	NC_020973	TCC	2	6	79546	79551	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478462230
1513	NC_020973	GCT	2	6	79578	79583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478462230
1514	NC_020973	TCT	2	6	79589	79594	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478462230
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1516	NC_020973	TGA	2	6	80391	80396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478462231
1517	NC_020973	TGTCT	2	10	80406	80415	0 %	60 %	20 %	20 %	478462231
1518	NC_020973	TGAT	2	8	80480	80487	25 %	50 %	25 %	0 %	478462231
1519	NC_020973	TCAT	2	8	80502	80509	25 %	50 %	0 %	25 %	478462231
1520	NC_020973	T	6	6	80558	80563	0 %	100 %	0 %	0 %	478462231
1521	NC_020973	GGTTTA	2	12	80569	80580	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	478462231
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1523	NC_020973	GAA	2	6	80680	80685	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478462231
1524	NC_020973	TGC	2	6	80730	80735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478462231
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1526	NC_020973	GAA	2	6	80782	80787	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478462231
1527	NC_020973	GGA	2	6	80826	80831	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478462231
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1529	NC_020973	A	7	7	80873	80879	100 %	0 %	0 %	0 %	478462231
1530	NC_020973	TTACT	2	10	80913	80922	20 %	60 %	0 %	20 %	478462231
1531	NC_020973	TATC	2	8	80929	80936	25 %	50 %	0 %	25 %	478462231
1532	NC_020973	GA	3	6	80947	80952	50 %	0 %	50 %	0 %	478462231
1533	NC_020973	TAT	2	6	81027	81032	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478462231
1534	NC_020973	TA	3	6	81167	81172	50 %	50 %	0 %	0 %	478462231
1535	NC_020973	TG	4	8	81180	81187	0 %	50 %	50 %	0 %	478462231
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1537	NC_020973	GGGA	2	8	81240	81247	25 %	0 %	75 %	0 %	478462231
1538	NC_020973	CTGC	2	8	81344	81351	0 %	25 %	25 %	50 %	478462232
1539	NC_020973	GCT	2	6	81362	81367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478462232
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1542	NC_020973	CTT	2	6	81432	81437	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478462232
1543	NC_020973	CAT	2	6	81479	81484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478462232
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1546	NC_020973	GGTT	2	8	81637	81644	0 %	50 %	50 %	0 %	478462232
1547	NC_020973	CT	3	6	81677	81682	0 %	50 %	0 %	50 %	478462232
1548	NC_020973	GGA	2	6	81683	81688	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478462232
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1554	NC_020973	TTA	2	6	81890	81895	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478462232
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1559	NC_020973	T	6	6	82075	82080	0 %	100 %	0 %	0 %	478462233
1560	NC_020973	GAC	2	6	82102	82107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478462233
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1562	NC_020973	TTA	2	6	82148	82153	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478462233
1563	NC_020973	CTT	2	6	82202	82207	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478462233
1564	NC_020973	TTA	2	6	82245	82250	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478462233
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1567	NC_020973	T	6	6	82358	82363	0 %	100 %	0 %	0 %	478462233
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1569	NC_020973	TGC	2	6	82400	82405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478462233
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1571	NC_020973	GCG	2	6	82448	82453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	478462233
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1573	NC_020973	TGG	3	9	82517	82525	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478462233
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1592	NC_020973	GA	3	6	83349	83354	50 %	0 %	50 %	0 %	478462233
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1595	NC_020973	T	7	7	83436	83442	0 %	100 %	0 %	0 %	478462234
1596	NC_020973	T	6	6	83449	83454	0 %	100 %	0 %	0 %	478462234
1597	NC_020973	GTA	2	6	83535	83540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478462234
1598	NC_020973	T	6	6	83546	83551	0 %	100 %	0 %	0 %	478462234
1599	NC_020973	TATG	2	8	83570	83577	25 %	50 %	25 %	0 %	478462234
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1602	NC_020973	TCAT	2	8	83641	83648	25 %	50 %	0 %	25 %	478462234
1603	NC_020973	CAA	2	6	83683	83688	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478462234
1604	NC_020973	CATT	2	8	83708	83715	25 %	50 %	0 %	25 %	478462234
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1606	NC_020973	AGCA	2	8	83747	83754	50 %	0 %	25 %	25 %	478462234
1607	NC_020973	TC	3	6	83769	83774	0 %	50 %	0 %	50 %	478462234
1608	NC_020973	TTA	2	6	83790	83795	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478462234
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1610	NC_020973	TTTG	2	8	83940	83947	0 %	75 %	25 %	0 %	478462234
1611	NC_020973	TTG	2	6	84037	84042	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478462234
1612	NC_020973	GAT	2	6	84134	84139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478462234
1613	NC_020973	TCTA	2	8	84224	84231	25 %	50 %	0 %	25 %	478462234
1614	NC_020973	CTA	2	6	84252	84257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478462234
1615	NC_020973	TAT	2	6	84305	84310	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478462234
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1618	NC_020973	TAT	2	6	84445	84450	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478462235
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1622	NC_020973	AG	3	6	84503	84508	50 %	0 %	50 %	0 %	478462235
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1627	NC_020973	TTC	2	6	84789	84794	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478462235
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