MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Chlamydia trachomatis L1/1322/p2 high quality draft genome

Total Repeats: 2510

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020972	GGAT	2	8	57	64	25 %	25 %	50 %	0 %	478468470
2	NC_020972	GGGA	2	8	394	401	25 %	0 %	75 %	0 %	478468470
3	NC_020972	AGTG	2	8	544	551	25 %	25 %	50 %	0 %	478468470
4	NC_020972	TGGC	2	8	578	585	0 %	25 %	50 %	25 %	478468470
5	NC_020972	AATG	2	8	1063	1070	50 %	25 %	25 %	0 %	478468470
6	NC_020972	CTAT	2	8	1397	1404	25 %	50 %	0 %	25 %	478468470
7	NC_020972	AGTA	2	8	2086	2093	50 %	25 %	25 %	0 %	478468471
8	NC_020972	ATGA	2	8	2490	2497	50 %	25 %	25 %	0 %	478468472
9	NC_020972	GATA	2	8	2528	2535	50 %	25 %	25 %	0 %	478468472
10	NC_020972	CATG	2	8	3706	3713	25 %	25 %	25 %	25 %	478468473
11	NC_020972	TTCC	2	8	4011	4018	0 %	50 %	0 %	50 %	478468473
12	NC_020972	TTTA	2	8	4409	4416	25 %	75 %	0 %	0 %	478468474
13	NC_020972	ATCC	2	8	4709	4716	25 %	25 %	0 %	50 %	478468474
14	NC_020972	GACG	2	8	5456	5463	25 %	0 %	50 %	25 %	478468474
15	NC_020972	TTGG	2	8	5559	5566	0 %	50 %	50 %	0 %	478468474
16	NC_020972	TGGA	2	8	5920	5927	25 %	25 %	50 %	0 %	478468475
17	NC_020972	CTTT	2	8	6297	6304	0 %	75 %	0 %	25 %	478468475
18	NC_020972	GGGA	2	8	6812	6819	25 %	0 %	75 %	0 %	478468475
19	NC_020972	GGTG	2	8	7115	7122	0 %	25 %	75 %	0 %	478468476
20	NC_020972	AAAT	2	8	7181	7188	75 %	25 %	0 %	0 %	478468476
21	NC_020972	AAGC	2	8	8419	8426	50 %	0 %	25 %	25 %	478468477
22	NC_020972	ATTG	2	8	8817	8824	25 %	50 %	25 %	0 %	478468478
23	NC_020972	AGCG	2	8	9284	9291	25 %	0 %	50 %	25 %	478468478
24	NC_020972	AAAG	2	8	9305	9312	75 %	0 %	25 %	0 %	478468478
25	NC_020972	CTTT	2	8	9645	9652	0 %	75 %	0 %	25 %	478468478
26	NC_020972	TTCG	2	8	10019	10026	0 %	50 %	25 %	25 %	478468479
27	NC_020972	AATT	2	8	10124	10131	50 %	50 %	0 %	0 %	478468479
28	NC_020972	ATGG	2	8	10183	10190	25 %	25 %	50 %	0 %	478468479
29	NC_020972	CTTT	2	8	10808	10815	0 %	75 %	0 %	25 %	478468480
30	NC_020972	GCAA	2	8	11025	11032	50 %	0 %	25 %	25 %	478468480
31	NC_020972	AGCC	2	8	11255	11262	25 %	0 %	25 %	50 %	478468480
32	NC_020972	GAAA	2	8	11398	11405	75 %	0 %	25 %	0 %	478468480
33	NC_020972	AATG	2	8	12141	12148	50 %	25 %	25 %	0 %	478468481
34	NC_020972	GTTT	2	8	13173	13180	0 %	75 %	25 %	0 %	478468482
35	NC_020972	ATGC	2	8	13603	13610	25 %	25 %	25 %	25 %	478468482
36	NC_020972	TTGT	2	8	14639	14646	0 %	75 %	25 %	0 %	478468483
37	NC_020972	TTCT	2	8	14810	14817	0 %	75 %	0 %	25 %	478468483
38	NC_020972	ATTT	2	8	15016	15023	25 %	75 %	0 %	0 %	478468483
39	NC_020972	TTTC	2	8	15678	15685	0 %	75 %	0 %	25 %	478468484
40	NC_020972	AAAT	2	8	16160	16167	75 %	25 %	0 %	0 %	478468484
41	NC_020972	CTAT	2	8	16859	16866	25 %	50 %	0 %	25 %	478468485
42	NC_020972	GTAA	2	8	17002	17009	50 %	25 %	25 %	0 %	478468485
43	NC_020972	CTAA	2	8	17195	17202	50 %	25 %	0 %	25 %	478468485
44	NC_020972	AGAA	2	8	17458	17465	75 %	0 %	25 %	0 %	478468485
45	NC_020972	ATTT	2	8	17604	17611	25 %	75 %	0 %	0 %	478468485
46	NC_020972	TGCG	2	8	19126	19133	0 %	25 %	50 %	25 %	478468487
47	NC_020972	GAAG	2	8	20110	20117	50 %	0 %	50 %	0 %	478468487
48	NC_020972	GATG	2	8	22244	22251	25 %	25 %	50 %	0 %	478468489
49	NC_020972	CATT	2	8	23303	23310	25 %	50 %	0 %	25 %	478468489
50	NC_020972	GCTT	2	8	23646	23653	0 %	50 %	25 %	25 %	478468489
51	NC_020972	GGTT	2	8	23694	23701	0 %	50 %	50 %	0 %	478468489
52	NC_020972	TTCT	2	8	24064	24071	0 %	75 %	0 %	25 %	478468489
53	NC_020972	TAAC	2	8	24166	24173	50 %	25 %	0 %	25 %	478468489
54	NC_020972	CATT	2	8	24289	24296	25 %	50 %	0 %	25 %	478468489
55	NC_020972	GGTA	2	8	24659	24666	25 %	25 %	50 %	0 %	478468489
56	NC_020972	TTGA	2	8	25653	25660	25 %	50 %	25 %	0 %	478468490
57	NC_020972	TAGG	2	8	25877	25884	25 %	25 %	50 %	0 %	478468490
58	NC_020972	TTCC	2	8	26001	26008	0 %	50 %	0 %	50 %	478468490
59	NC_020972	TAGG	2	8	26115	26122	25 %	25 %	50 %	0 %	478468490
60	NC_020972	GCTT	2	8	26887	26894	0 %	50 %	25 %	25 %	478468490
61	NC_020972	GGAA	2	8	27470	27477	50 %	0 %	50 %	0 %	478468491
62	NC_020972	TTAA	2	8	27543	27550	50 %	50 %	0 %	0 %	478468491
63	NC_020972	AAAG	2	8	27593	27600	75 %	0 %	25 %	0 %	478468491
64	NC_020972	GGGC	2	8	27873	27880	0 %	0 %	75 %	25 %	478468491
65	NC_020972	GTTT	2	8	28156	28163	0 %	75 %	25 %	0 %	478468492
66	NC_020972	CAGA	2	8	28178	28185	50 %	0 %	25 %	25 %	478468492
67	NC_020972	CTTT	2	8	30150	30157	0 %	75 %	0 %	25 %	478468494
68	NC_020972	TTTG	2	8	30165	30172	0 %	75 %	25 %	0 %	478468494
69	NC_020972	TTGT	2	8	30200	30207	0 %	75 %	25 %	0 %	478468494
70	NC_020972	TGGC	2	8	30363	30370	0 %	25 %	50 %	25 %	478468494
71	NC_020972	AAAG	2	8	30923	30930	75 %	0 %	25 %	0 %	478468495
72	NC_020972	AAAC	2	8	30993	31000	75 %	0 %	0 %	25 %	478468495
73	NC_020972	GATG	2	8	31136	31143	25 %	25 %	50 %	0 %	478468495
74	NC_020972	GATA	2	8	32245	32252	50 %	25 %	25 %	0 %	478468497
75	NC_020972	TGAT	2	8	34740	34747	25 %	50 %	25 %	0 %	478468500
76	NC_020972	AAGA	3	12	34868	34879	75 %	0 %	25 %	0 %	478468500
77	NC_020972	AAGC	2	8	35088	35095	50 %	0 %	25 %	25 %	478468501
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79	NC_020972	GGCA	2	8	35500	35507	25 %	0 %	50 %	25 %	478468502
80	NC_020972	TGCT	2	8	35910	35917	0 %	50 %	25 %	25 %	478468502
81	NC_020972	TTGG	2	8	36142	36149	0 %	50 %	50 %	0 %	478468502
82	NC_020972	AGAT	2	8	36862	36869	50 %	25 %	25 %	0 %	478468502
83	NC_020972	CTTT	2	8	37234	37241	0 %	75 %	0 %	25 %	478468503
84	NC_020972	ATGA	2	8	37724	37731	50 %	25 %	25 %	0 %	478468503
85	NC_020972	TAGG	2	8	37883	37890	25 %	25 %	50 %	0 %	478468503
86	NC_020972	CAAT	2	8	38067	38074	50 %	25 %	0 %	25 %	478468503
87	NC_020972	AATG	2	8	38854	38861	50 %	25 %	25 %	0 %	478468503
88	NC_020972	AGAA	2	8	39691	39698	75 %	0 %	25 %	0 %	478468504
89	NC_020972	AAGA	2	8	39743	39750	75 %	0 %	25 %	0 %	478468504
90	NC_020972	ATCC	2	8	39751	39758	25 %	25 %	0 %	50 %	478468504
91	NC_020972	TAAT	2	8	39962	39969	50 %	50 %	0 %	0 %	478468504
92	NC_020972	GTGC	2	8	42050	42057	0 %	25 %	50 %	25 %	478468506
93	NC_020972	AGAA	2	8	42469	42476	75 %	0 %	25 %	0 %	478468506
94	NC_020972	GGAT	2	8	42621	42628	25 %	25 %	50 %	0 %	478468506
95	NC_020972	AAAC	2	8	43760	43767	75 %	0 %	0 %	25 %	478468508
96	NC_020972	CAAT	2	8	43964	43971	50 %	25 %	0 %	25 %	478468508
97	NC_020972	ATTT	2	8	44720	44727	25 %	75 %	0 %	0 %	478468509
98	NC_020972	GCTC	2	8	45028	45035	0 %	25 %	25 %	50 %	478468509
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100	NC_020972	TTGA	2	8	45770	45777	25 %	50 %	25 %	0 %	478468510
101	NC_020972	TGTT	2	8	45942	45949	0 %	75 %	25 %	0 %	478468510
102	NC_020972	CTAT	2	8	45972	45979	25 %	50 %	0 %	25 %	478468510
103	NC_020972	TGTT	2	8	46001	46008	0 %	75 %	25 %	0 %	478468510
104	NC_020972	CTAT	2	8	46297	46304	25 %	50 %	0 %	25 %	478468510
105	NC_020972	AAGA	2	8	46792	46799	75 %	0 %	25 %	0 %	478468511
106	NC_020972	AAGA	2	8	46849	46856	75 %	0 %	25 %	0 %	478468511
107	NC_020972	AAAG	2	8	46889	46896	75 %	0 %	25 %	0 %	478468511
108	NC_020972	AAGA	2	8	47004	47011	75 %	0 %	25 %	0 %	478468511
109	NC_020972	ACTT	2	8	47265	47272	25 %	50 %	0 %	25 %	478468511
110	NC_020972	ATGG	2	8	47891	47898	25 %	25 %	50 %	0 %	478468511
111	NC_020972	AGGA	2	8	47922	47929	50 %	0 %	50 %	0 %	478468511
112	NC_020972	GAAC	2	8	48469	48476	50 %	0 %	25 %	25 %	478468511
113	NC_020972	AACA	2	8	48714	48721	75 %	0 %	0 %	25 %	478468512
114	NC_020972	CTTT	2	8	48910	48917	0 %	75 %	0 %	25 %	478468512
115	NC_020972	CTTT	2	8	49795	49802	0 %	75 %	0 %	25 %	478468513
116	NC_020972	GTAG	2	8	49813	49820	25 %	25 %	50 %	0 %	478468513
117	NC_020972	GAAG	2	8	51243	51250	50 %	0 %	50 %	0 %	478468514
118	NC_020972	TTCA	2	8	51665	51672	25 %	50 %	0 %	25 %	478468514
119	NC_020972	TCTA	2	8	51882	51889	25 %	50 %	0 %	25 %	478468514
120	NC_020972	GGAA	2	8	52999	53006	50 %	0 %	50 %	0 %	478468516
121	NC_020972	TTAA	2	8	53740	53747	50 %	50 %	0 %	0 %	478468516
122	NC_020972	CCTT	2	8	53947	53954	0 %	50 %	0 %	50 %	478468517
123	NC_020972	TTTA	2	8	54114	54121	25 %	75 %	0 %	0 %	478468517
124	NC_020972	AAAG	2	8	54338	54345	75 %	0 %	25 %	0 %	478468517
125	NC_020972	GATT	2	8	54475	54482	25 %	50 %	25 %	0 %	478468517
126	NC_020972	AATC	2	8	54530	54537	50 %	25 %	0 %	25 %	478468517
127	NC_020972	TATT	2	8	54591	54598	25 %	75 %	0 %	0 %	478468517
128	NC_020972	TCGA	2	8	54979	54986	25 %	25 %	25 %	25 %	478468518
129	NC_020972	CTTC	2	8	55073	55080	0 %	50 %	0 %	50 %	478468518
130	NC_020972	GAAT	2	8	55108	55115	50 %	25 %	25 %	0 %	478468518
131	NC_020972	TTGA	2	8	55178	55185	25 %	50 %	25 %	0 %	478468518
132	NC_020972	GGAA	2	8	55534	55541	50 %	0 %	50 %	0 %	478468518
133	NC_020972	AGAA	2	8	55880	55887	75 %	0 %	25 %	0 %	478468518
134	NC_020972	CTGG	3	12	56445	56456	0 %	25 %	50 %	25 %	478468519
135	NC_020972	TTGC	2	8	56579	56586	0 %	50 %	25 %	25 %	478468519
136	NC_020972	AGCG	2	8	56619	56626	25 %	0 %	50 %	25 %	478468519
137	NC_020972	AGCT	2	8	57078	57085	25 %	25 %	25 %	25 %	478468519
138	NC_020972	GGTT	2	8	57784	57791	0 %	50 %	50 %	0 %	478468519
139	NC_020972	GAAA	2	8	58713	58720	75 %	0 %	25 %	0 %	478468520
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