MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis L1/1322/p2 high quality draft genome

Total Repeats: 20319

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_020972	CTC	2	6	207645	207650	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478468653
4002	NC_020972	AGC	2	6	207652	207657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478468653
4003	NC_020972	AGC	2	6	207754	207759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478468653
4004	NC_020972	CAT	2	6	207774	207779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478468653
4005	NC_020972	T	6	6	207802	207807	0 %	100 %	0 %	0 %	478468653
4006	NC_020972	ACA	2	6	207845	207850	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478468653
4007	NC_020972	CTT	2	6	207853	207858	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478468653
4008	NC_020972	GCA	2	6	207911	207916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478468653
4009	NC_020972	TTCC	2	8	207936	207943	0 %	50 %	0 %	50 %	478468653
4010	NC_020972	TAA	2	6	207951	207956	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478468653
4011	NC_020972	AGTA	2	8	208040	208047	50 %	25 %	25 %	0 %	478468653
4012	NC_020972	TTC	2	6	208094	208099	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478468653
4013	NC_020972	CGC	2	6	208125	208130	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	478468653
4014	NC_020972	ATC	2	6	208174	208179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478468653
4015	NC_020972	TGA	2	6	208191	208196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478468653
4016	NC_020972	ATA	2	6	208214	208219	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478468653
4017	NC_020972	TCT	2	6	208220	208225	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478468653
4018	NC_020972	ACG	2	6	208264	208269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478468653
4019	NC_020972	TTC	2	6	208303	208308	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478468653
4020	NC_020972	TAAC	2	8	208323	208330	50 %	25 %	0 %	25 %	478468653
4021	NC_020972	TCT	2	6	208331	208336	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478468653
4022	NC_020972	ATA	2	6	208354	208359	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478468653
4023	NC_020972	TGT	2	6	208490	208495	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478468653
4024	NC_020972	TAC	2	6	208534	208539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478468653
4025	NC_020972	AAG	2	6	208565	208570	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478468653
4026	NC_020972	TTTA	2	8	208600	208607	25 %	75 %	0 %	0 %	478468653
4027	NC_020972	TTC	3	9	208620	208628	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478468653
4028	NC_020972	AAC	2	6	208768	208773	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478468653
4029	NC_020972	T	6	6	208789	208794	0 %	100 %	0 %	0 %	478468653
4030	NC_020972	ATTT	2	8	208905	208912	25 %	75 %	0 %	0 %	478468653
4031	NC_020972	AAT	2	6	208936	208941	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478468653
4032	NC_020972	GC	3	6	208985	208990	0 %	0 %	50 %	50 %	478468653
4033	NC_020972	AAT	2	6	209047	209052	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478468653
4034	NC_020972	CCT	2	6	209054	209059	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478468653
4035	NC_020972	AATT	2	8	209143	209150	50 %	50 %	0 %	0 %	478468653
4036	NC_020972	TTG	2	6	209175	209180	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478468653
4037	NC_020972	GAG	2	6	209201	209206	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478468653
4038	NC_020972	GCA	2	6	209360	209365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478468653
4039	NC_020972	CAA	2	6	209406	209411	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478468653
4040	NC_020972	AAT	2	6	209626	209631	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478468653
4041	NC_020972	GAT	2	6	209692	209697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478468653
4042	NC_020972	TTC	2	6	209698	209703	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478468653
4043	NC_020972	TTTA	2	8	209704	209711	25 %	75 %	0 %	0 %	478468653
4044	NC_020972	ATT	2	6	209742	209747	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478468654
4045	NC_020972	TTG	2	6	209888	209893	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478468654
4046	NC_020972	TC	3	6	209918	209923	0 %	50 %	0 %	50 %	478468654
4047	NC_020972	TTC	2	6	209957	209962	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478468654
4048	NC_020972	AGT	2	6	209975	209980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478468654
4049	NC_020972	AACA	2	8	210002	210009	75 %	0 %	0 %	25 %	478468654
4050	NC_020972	TCT	2	6	210028	210033	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478468654
4051	NC_020972	TGGA	2	8	210060	210067	25 %	25 %	50 %	0 %	478468654
4052	NC_020972	TTC	2	6	210114	210119	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478468654
4053	NC_020972	TA	3	6	210134	210139	50 %	50 %	0 %	0 %	478468654
4054	NC_020972	TTC	2	6	210162	210167	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478468654
4055	NC_020972	GCA	2	6	210172	210177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478468654
4056	NC_020972	GCT	2	6	210181	210186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478468654
4057	NC_020972	GGA	2	6	210238	210243	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478468654
4058	NC_020972	T	6	6	210306	210311	0 %	100 %	0 %	0 %	478468654
4059	NC_020972	AACG	2	8	210354	210361	50 %	0 %	25 %	25 %	478468654
4060	NC_020972	TCA	2	6	210397	210402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478468654
4061	NC_020972	CTTT	2	8	210415	210422	0 %	75 %	0 %	25 %	478468654
4062	NC_020972	CCAT	2	8	210445	210452	25 %	25 %	0 %	50 %	478468654
4063	NC_020972	GA	3	6	210463	210468	50 %	0 %	50 %	0 %	478468654
4064	NC_020972	T	6	6	210483	210488	0 %	100 %	0 %	0 %	478468654
4065	NC_020972	AGG	2	6	210507	210512	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478468654
4066	NC_020972	CATT	2	8	210529	210536	25 %	50 %	0 %	25 %	478468654
4067	NC_020972	AGA	2	6	210563	210568	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478468654
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4069	NC_020972	ATA	4	12	210619	210630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478468654
4070	NC_020972	GCT	2	6	210688	210693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478468654
4071	NC_020972	GAA	2	6	210773	210778	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478468654
4072	NC_020972	ACG	2	6	210789	210794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478468654
4073	NC_020972	AGCG	2	8	210899	210906	25 %	0 %	50 %	25 %	478468654
4074	NC_020972	CT	3	6	210936	210941	0 %	50 %	0 %	50 %	478468654
4075	NC_020972	CT	3	6	210944	210949	0 %	50 %	0 %	50 %	478468654
4076	NC_020972	AGC	2	6	210951	210956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478468654
4077	NC_020972	A	6	6	211023	211028	100 %	0 %	0 %	0 %	478468654
4078	NC_020972	CAC	2	6	211043	211048	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478468654
4079	NC_020972	TGTTT	2	10	211093	211102	0 %	80 %	20 %	0 %	478468654
4080	NC_020972	CTA	2	6	211145	211150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478468654
4081	NC_020972	TCT	2	6	211165	211170	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478468654
4082	NC_020972	TAGA	2	8	211196	211203	50 %	25 %	25 %	0 %	478468654
4083	NC_020972	CTTGT	2	10	211274	211283	0 %	60 %	20 %	20 %	478468654
4084	NC_020972	ATT	2	6	211290	211295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478468654
4085	NC_020972	AGC	2	6	211341	211346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478468654
4086	NC_020972	CAT	2	6	211364	211369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478468654
4087	NC_020972	AGA	2	6	211466	211471	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478468654
4088	NC_020972	CG	3	6	211569	211574	0 %	0 %	50 %	50 %	478468654
4089	NC_020972	CTGGAT	2	12	211601	211612	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	478468654
4090	NC_020972	GTA	2	6	211826	211831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478468654
4091	NC_020972	ACC	2	6	211840	211845	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478468654
4092	NC_020972	CTTG	2	8	211868	211875	0 %	50 %	25 %	25 %	478468654
4093	NC_020972	GAAATA	2	12	211924	211935	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	478468654
4094	NC_020972	AAC	2	6	211956	211961	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478468654
4095	NC_020972	CCA	2	6	212006	212011	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478468654
4096	NC_020972	CGT	2	6	212117	212122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478468654
4097	NC_020972	TTTCT	2	10	212124	212133	0 %	80 %	0 %	20 %	478468654
4098	NC_020972	TAA	2	6	212153	212158	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478468655
4099	NC_020972	CTG	2	6	212191	212196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478468655
4100	NC_020972	CTT	2	6	212321	212326	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478468655
4101	NC_020972	ACG	2	6	212459	212464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478468655
4102	NC_020972	ACA	2	6	212707	212712	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478468656
4103	NC_020972	AATA	2	8	212752	212759	75 %	25 %	0 %	0 %	478468656
4104	NC_020972	CTT	2	6	212802	212807	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478468656
4105	NC_020972	CAG	2	6	212812	212817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478468656
4106	NC_020972	TTG	2	6	212935	212940	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478468656
4107	NC_020972	TCC	2	6	212945	212950	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478468656
4108	NC_020972	AAG	2	6	212985	212990	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478468656
4109	NC_020972	CTT	2	6	212991	212996	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478468656
4110	NC_020972	CTT	2	6	213018	213023	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478468656
4111	NC_020972	CTG	2	6	213077	213082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478468656
4112	NC_020972	CCA	2	6	213140	213145	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478468656
4113	NC_020972	CAAA	2	8	213160	213167	75 %	0 %	0 %	25 %	478468656
4114	NC_020972	CCA	2	6	213179	213184	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478468656
4115	NC_020972	GCA	2	6	213191	213196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478468656
4116	NC_020972	CAA	2	6	213204	213209	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478468656
4117	NC_020972	TAC	2	6	213255	213260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478468656
4118	NC_020972	CTT	2	6	213318	213323	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478468656
4119	NC_020972	TA	3	6	213444	213449	50 %	50 %	0 %	0 %	478468657
4120	NC_020972	ATG	2	6	213497	213502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478468657
4121	NC_020972	TGT	2	6	213505	213510	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478468657
4122	NC_020972	GC	3	6	213570	213575	0 %	0 %	50 %	50 %	478468657
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4233	NC_020972	CA	3	6	219206	219211	50 %	0 %	0 %	50 %	478468661
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4242	NC_020972	A	7	7	219503	219509	100 %	0 %	0 %	0 %	478468662
4243	NC_020972	A	6	6	219527	219532	100 %	0 %	0 %	0 %	478468662
4244	NC_020972	TTA	2	6	219555	219560	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478468662
4245	NC_020972	GTTC	2	8	219575	219582	0 %	50 %	25 %	25 %	478468662
4246	NC_020972	ATG	2	6	219588	219593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478468662
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4248	NC_020972	T	6	6	219665	219670	0 %	100 %	0 %	0 %	478468662
4249	NC_020972	GAT	2	6	219677	219682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478468662
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4491	NC_020972	TCC	2	6	231568	231573	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478468672
4492	NC_020972	CTG	2	6	231588	231593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478468672
4493	NC_020972	AAG	2	6	231654	231659	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478468672
4494	NC_020972	TAG	2	6	231700	231705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478468672
4495	NC_020972	AGA	2	6	231760	231765	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478468672
4496	NC_020972	AG	3	6	231896	231901	50 %	0 %	50 %	0 %	478468672
4497	NC_020972	GTT	2	6	231972	231977	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478468672
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4499	NC_020972	TTCC	2	8	232025	232032	0 %	50 %	0 %	50 %	478468672
4500	NC_020972	A	6	6	232043	232048	100 %	0 %	0 %	0 %	478468672

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