MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis L1/1322/p2 high quality draft genome

Total Repeats: 20319

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_020972	GCA	2	6	153619	153624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478468603
3002	NC_020972	GCA	2	6	153637	153642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478468603
3003	NC_020972	AG	3	6	153943	153948	50 %	0 %	50 %	0 %	478468603
3004	NC_020972	CTTT	2	8	153972	153979	0 %	75 %	0 %	25 %	478468603
3005	NC_020972	AT	3	6	154097	154102	50 %	50 %	0 %	0 %	478468604
3006	NC_020972	T	7	7	154112	154118	0 %	100 %	0 %	0 %	478468604
3007	NC_020972	T	6	6	154183	154188	0 %	100 %	0 %	0 %	478468604
3008	NC_020972	ATC	2	6	154213	154218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478468604
3009	NC_020972	T	6	6	154223	154228	0 %	100 %	0 %	0 %	478468604
3010	NC_020972	TGTGCG	2	12	154237	154248	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	478468604
3011	NC_020972	TCT	2	6	154362	154367	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478468604
3012	NC_020972	CAG	2	6	154401	154406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478468604
3013	NC_020972	GATC	2	8	154473	154480	25 %	25 %	25 %	25 %	478468604
3014	NC_020972	ATT	2	6	154488	154493	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478468604
3015	NC_020972	ATG	2	6	154515	154520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478468604
3016	NC_020972	ACG	2	6	154521	154526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478468604
3017	NC_020972	TCT	2	6	154539	154544	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478468604
3018	NC_020972	AGC	2	6	154580	154585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478468604
3019	NC_020972	AATC	2	8	154593	154600	50 %	25 %	0 %	25 %	478468604
3020	NC_020972	GAA	2	6	154605	154610	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478468604
3021	NC_020972	TA	3	6	154638	154643	50 %	50 %	0 %	0 %	478468604
3022	NC_020972	GAT	2	6	154659	154664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478468604
3023	NC_020972	TA	3	6	154696	154701	50 %	50 %	0 %	0 %	478468604
3024	NC_020972	CTT	2	6	154714	154719	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478468604
3025	NC_020972	GGA	2	6	154746	154751	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478468604
3026	NC_020972	TGT	2	6	154763	154768	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478468604
3027	NC_020972	ATG	2	6	154770	154775	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478468604
3028	NC_020972	AGTC	2	8	154806	154813	25 %	25 %	25 %	25 %	478468604
3029	NC_020972	GAG	2	6	154857	154862	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478468605
3030	NC_020972	ATT	2	6	154952	154957	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478468605
3031	NC_020972	AGA	2	6	155012	155017	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478468605
3032	NC_020972	TTC	2	6	155077	155082	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478468605
3033	NC_020972	ATA	2	6	155110	155115	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478468605
3034	NC_020972	ATC	2	6	155158	155163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478468605
3035	NC_020972	GCA	2	6	155171	155176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478468605
3036	NC_020972	CTG	2	6	155245	155250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478468605
3037	NC_020972	GAA	2	6	155274	155279	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478468605
3038	NC_020972	GAG	2	6	155340	155345	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478468605
3039	NC_020972	TGT	2	6	155459	155464	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478468605
3040	NC_020972	CCTCAT	2	12	155535	155546	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	478468605
3041	NC_020972	AGGC	2	8	155565	155572	25 %	0 %	50 %	25 %	478468605
3042	NC_020972	GAGT	2	8	155653	155660	25 %	25 %	50 %	0 %	478468605
3043	NC_020972	CAC	2	6	155805	155810	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478468606
3044	NC_020972	TTCTT	2	10	155833	155842	0 %	80 %	0 %	20 %	478468606
3045	NC_020972	GACT	2	8	155861	155868	25 %	25 %	25 %	25 %	478468606
3046	NC_020972	GTA	2	6	155915	155920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478468606
3047	NC_020972	TGT	2	6	155984	155989	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478468606
3048	NC_020972	TA	3	6	156013	156018	50 %	50 %	0 %	0 %	478468606
3049	NC_020972	TGG	3	9	156048	156056	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478468606
3050	NC_020972	TTG	2	6	156106	156111	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478468606
3051	NC_020972	GAT	2	6	156163	156168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478468606
3052	NC_020972	CG	3	6	156232	156237	0 %	0 %	50 %	50 %	478468606
3053	NC_020972	TTA	2	6	156259	156264	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478468606
3054	NC_020972	GGA	2	6	156345	156350	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478468606
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3056	NC_020972	GAA	2	6	156433	156438	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478468606
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3059	NC_020972	ATT	2	6	156921	156926	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478468607
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3062	NC_020972	TGGAGA	2	12	156993	157004	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	478468607
3063	NC_020972	GCTT	2	8	157036	157043	0 %	50 %	25 %	25 %	478468607
3064	NC_020972	GCA	2	6	157066	157071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478468607
3065	NC_020972	TAGA	2	8	157088	157095	50 %	25 %	25 %	0 %	478468607
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3067	NC_020972	CCCA	2	8	157216	157223	25 %	0 %	0 %	75 %	478468607
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3081	NC_020972	AG	3	6	157709	157714	50 %	0 %	50 %	0 %	478468607
3082	NC_020972	AG	3	6	157774	157779	50 %	0 %	50 %	0 %	478468607
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3091	NC_020972	GA	3	6	158277	158282	50 %	0 %	50 %	0 %	478468608
3092	NC_020972	A	7	7	158304	158310	100 %	0 %	0 %	0 %	478468608
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3095	NC_020972	CTCCAT	2	12	158362	158373	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	478468608
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3101	NC_020972	ATG	2	6	158638	158643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478468608
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3111	NC_020972	AGA	2	6	159225	159230	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478468609
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3117	NC_020972	CAT	2	6	159948	159953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478468610
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3122	NC_020972	GT	3	6	160307	160312	0 %	50 %	50 %	0 %	478468610
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3494	NC_020972	AGA	2	6	179251	179256	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478468622
3495	NC_020972	CAA	2	6	179389	179394	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478468622
3496	NC_020972	TTTC	2	8	179422	179429	0 %	75 %	0 %	25 %	478468622
3497	NC_020972	AGT	2	6	179461	179466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478468622
3498	NC_020972	GAT	2	6	179496	179501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478468622
3499	NC_020972	CTC	2	6	179516	179521	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478468622
3500	NC_020972	AAG	2	6	179545	179550	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478468622

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